HG10020168 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10020168
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr04: 29468799 .. 29477165 (-)
RNA-Seq ExpressionHG10020168
SyntenyHG10020168
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGAAGGATGGAGAGAGATGTATTTGGGAGGCGAAAAATGCCGTGGAAATTAACAAGACTGACCTAGATGTGAATAAGGACCATTCTGATGGAAAAAGGAAGAAAATTCAAGATCTCGACGATTTAGACCATTCTAAACTCGAAACTGCGCAAAAAAGAAAAGTTTGGAGTGTAGAGGTAGATAATTCTGAACTAACAATGCAAAATGCAGCTTGGAGAAATCAGAAAGGAAAAAAAAAAGGCTTGACATACCTTTCGTTCTTCATGGAGTTGCAATGAATGACGAGTTCTCTGCCCTATGACGTCTTCAAACTTGGACTCTAGTTCCACCTTCTCTTCAATACAATGTAGTTGGATGCAAATGGATTTTTCAACTCAAGCAAAATGCAGATGGGATAATCCAACGGCACAAAGCGAGGTTAGTTGCAAAAGGATTTCATCAAACTCTAGGAATAGATTTTTTTGATACTTTCAGCCCGGTGGTAAAATCCTCCCCAATTCGACTCATTCAACATCTGGCAATCTCAAATGGGTGGACACTAAGACAATTGGATTTCAATAACGCTTTCCTCGATGGAACACTAAAGGAGGCTGTTTACATGTGCCAACCACCGGGGTTTGAAGATCCTGAACGTCTCACACATGTTTGCAAACTAGACAAGGCCATCTACCGCTTGAGACAAGCCCCTCGGGCATGGAATGAAGAACTGAAAGCCTTCCTAATTACATGTGGCTTCTTTGTCAGCAGGTCAGATTCATCACTATATTATTTTCGCAGACCCACTATCACTGTTCTTTTCCTCCTCTATGTCGATGACATTATCCTTATCGGCAGTGATCCTCAATTTATTCAACGGCTTATAGTCACTCTTGACTCTCGCTTTGCCCTGAAAGATTTAGGTACTTGCATATTTCTTGGGGATCCAAATCACACATTTACCTAGTGGAATACGGTTAAGCCAGTCAAAATCTATAAATGATATGCTGGACAGTTCAAAATGTCTGACACTAAACCATGCCCCATGCCTGCAGTCTCTCGGCAAACTCTATCCATCTCAGATGGCAAGCTCCTTGATGATCCATCTCCATATGAGAGTGCTCTCGGCGCCATTCAGTATCTAGTCAACACCAGACCAGATATAGCTTTCATTGTAAACAAAATGAGCCAATTCATCAAGGCGCCCACTGACGCTCACTGGAGAGCAGTTAAGCGAATATTTCGCTACCTTAAAGGCACAGCATCCTAGGAATTCTCATTCAGCCAAGCAGTTCTCTAACCATTATAGTCTTTTTCGATGCTGATTGGGCCTCGAACGTTGATGATCGCAAGTCCGTTGCTGCTTATTGCGTATTCCTTGGCACTTCTTTAGTCTCCTAGTCCTCTAAGAAACAGAACGTTGTCACCCGATCTACTACGGAGTCTAAATACCGTGCTCTAGCACATGCCTCTACAGAAATCACCTGGAGTCGTCAACTTTTAGAGGAGATAGGCTACAGTTTGGCAAGAACTCCTATCCTCTGGTGTGATAACATTGGAGCAGGTGCCCTAGCTTCCAACCCGGTTTTCCATGCCAGAACGAAGCACATCGAGCTCGATGTTCACTATGTTTGAGATCTTGTTCTCAACAATAGATTGCAGGTTCGATATGTTCCAACTAATGAACAACTCGCCGACTGCCTCACCAAATCTCTTGGCCATACACAAATCATCTATCTCAGAACCAAACTTGGTCTGGCTGCTGCCACCCCGCGTTTGAGAGAGATGTAAAGAAGGATGACGAGGCCGATGATGAGTCAGTCAACAGATGACTAGGAAAATATTAACGATATGCTATTATTTTTCCTTTCTTGTAAGGAAGGATGATGAAACCGATAATGAGGCAGTCAACAGAAGACTAGAAAAACGTTAACGATATGCTATTATTATACCTTTCTTCCTTAACACGTGTAGAGTTTGTTATCTATTTTTTCTCTCTTGTAAGTATATATATTCACCCTATCGAATCTCCCTCTCATTTCATTTCACACTCTGTTAAGATGGATGCTATCTGCATGAACGAATGGTTAGCATTGAAGACAACTTAAAAAAATTTAGTCAGTGGATATAGAGTGAAGAAGGAAGAATCTGAAAAAATGAAAATCAATATAATCTCTCTGAAGAATCAAATTTCAGAGATCTTGACTTTGCTCATAGACGAGATGAAGGATAGAGAGAGATGTATTTAGGAGGCGGAAGGTGCCGTGGAAATTAACAAGACTGACCTAGATGTGAATAAGGACCATTCTGATGGAAAAAGGAAAAAAAATTCAAGATCTGGAGGATTTTGACCATTCTAAACTCGAAACTGCGCAAAAAAGAAAGGTTTGGAATATAGAGGTAGACAATTCTGAACTAACAATGCAAAATGCAGCTCGCAGAAATCGGAAAGGAAAAAAAAAGGCTTGACATACCTTTCGTTTTCGTGGAGCTACAATGAATGACGAGTTCTCTGCCCTACGACGTCTTCAAACTTGGACTCTAGTTCCACCTTCTCCTCAATACAACCTAGTTGGATGCAAATGAATTTTTCGGCTCAAGCAAAATGCAAATGAGACAATCCAACGATACAAAGCGAGGTTAGTTGCAAAAGGATTTCATCAAACTCCATGAATAGATTACATGTGGCTTCTCTGTCAGCAGGTCAGACTCATCATTATATTATTTTCGCAAACTCACTATCACTGTTCTTCTCCTACTCTATGTCGATGACGTTATCCTTATCGGCAGTGATCCTCAATTTATTCAACGGCTTATAGTCACTCTTGACTCTCGCTTTGCCCCGAAAGATTTAGGTACCTTGCATATTTCTTGGGGATCCAAATCACATATTTACCCAGTTGAATACGGTTAAGCCAGTCAAAATATATAAATGATCTGTTGGACAAGTTCAAAATGTTTGACACTAAACCATGCCCCACGCCTGCAGTCTCTGGGCAAACTCTATCCATCTCGGATGGAAGCTCCTTGATGATGCATCTCTATATCGGAGTGCTCTCGGCGCCCTTCAGTATCTAGTCAACACCAGACCAGATATATCTTTCATTGTAAACAAACTGAGCCAATTCATCAAGGCACCCACTGACGCTCACTGGAAAGCAGTTAAGCTAATATTTCGCTACCTTAAAGGCACAACATCCTACGGAATTCTCATTCAGCCAAGTAGTTCTCTAACCATTACAACCTTTTTCGATGATGATTGGACCTCGAACGTTAATGATCGCAAGTCCATTGCTGCTTATTGGATATTCCTTGGCAGTTCCTTAGTCTCTTGGTCCTCCAAGAAACAGAATGTTGTCGCCCGATCTAGTACGGAGTCCGAATACCGTGCTCTAGTACATGCCTCTGCAGAAATCACCTGGATTCGTCAACTTCTAGAGGAGATAGGCTACAGCCTGGTAGGAACCCCTATCCTCTAGTGTGATAACCTTGGAGCAGGTGCCCTTGCTCTAACCCGGTCTTCCATGCCATAACGAAGCACATCGAGCTCGATGTTCACTATGTTCAAGATCTTGTTCTCAACAATAGATTGCATGTTCGATATGTTCCACGCAATGAACAACTTGCTGACTGCCTCTCCAAATCTCTTGGCCATACACAAATCATCTATCTCAAAACCAAACTTGGTCTAGCTGTTGCCACCCCGCGTTTGAGGGGATGTAAAGAAGGATGACGAGACCGATGATGAGGCAGTCAATAGATGACTAGGAAAACATTAACGATTTGCTATTATTTTGCGTTTCTTCCTTCTGTTATGTTTTAGCCATTTATATGTTAATACGTGTAGAGTTTGTTATCTATTTTTATCTCTTGTAGGTGTATATATTCACCCTATCTAGAATTCATTTATTCAACAAAAGAAATACAGATTAGGAGAGAGAAGCTCAGCCTTGTTTTTACCCTAATTTCTCAAATCGTAATCTCGTGAAAATAATCATAAAACATACAACATAAGCAACAAAATGTCACTAATATAAGTAATAAATATTTTATTTTGTTTAAAAAGTGTAAAATGTTAATCGTCAATTTAAATATACTAGTCAAGAAATACATGCAATGTACGTGAAATCGTATAGTTCCAATTAGTTTTAAAATAGTGACTTTTTAGCATATAATAAATAAATATTATACAACCTTAATTTAGTTACCATCAATTTTAAAAAGTTAGATAATATAACAATTTTTATTTTAATGTTCTCGTATTATAGTTTTTTTTATAACAAAGAGAGAAATTGTTTTAGTAATTAAATTATCGAATTAAGATGTTAATATTCAAGTATTGTAATGTTTATAATGCAATAGTTTTATTTATAATGTTGTTATATATATACCCGTGAAGTCACATAAAGTGATGCATTGTTTCACTATATTAATTACTACTTTCATTCAATTAAATCCTCTAATGTTTTTTGCACTGCCTCTAGACTTTGGATCTCGTGAAATTATTTTGTTAAGAATTTAAATGCAAATATTTATTTTATTTTTCTTTTACACGTGCATGTCACATATACATTTGAGGCATCAATGCACCAATTTGTAACCACTTCCACCCCGAACAGATGCATCCAATTGACATCTATTGCATCATATCTCAAATAGTCGCGTTCCTTCAACATCAATTGCACTTATTCGACATAATATTTTATTTTTTAATATATAAATTTATTTTGTAATCTAAAAATTAGAAAAGCCACCTCCACTATCTTTCAAACATACACTCGAAAAGTCACAACCACTCGATGAAGGGTAGTATGAAAAATTCATGAAACATATAAGGACAAAAGGGGAATATAAAGATTCTCCTTACATGGTCTCTTTTAAGATAGTAGAGAGTAAAGATAGAGATTTTTGTACTAAAAACACTTAGAATATATTTTTTAAACTTTTAATTGTTTATAATATTTTAAAAAAAATATTTATAGATAAATCGATATTTACAGTACCATTCTTTAAAGTTAAGATC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mRNA sequence

ATGAAGGATGGAGAGAGATGTATTTGGGAGGCGAAAAATGCCGTGGAAATTAACAAGACTGACCTAGATGTGAATAAGGACCATTCTGATGGAAAAAGGAAGAAAATTCAAGATCTCGACGATTTAGACCATTCTAAACTCGAAACTGCGCAAAAAAGAAAAGTTTGGAGTGTAGAGATAAATCGATATTTACAGTACCATTCTTTAAAGTTAAGATCTAGACATTTATGTCGTCATGTTAAGTCAAAACTTCCCTCACTATTTTTCGTCCTATTGGTGGTGTTGGCCCATCTTCAAGAAATAGCCCGAAAAAAAAAGCTACCAGATCTAGTAGCTTCGAGCGAGGAGAAAGCTCGTCGGGCTCAATGGCCCATGTGGAGGAGCGAGTCGAAGAATTGGACAGCTCCCAGAAAGCGATAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAGGATGGAGAGAGATGTATTTGGGAGGCGAAAAATGCCGTGGAAATTAACAAGACTGACCTAGATGTGAATAAGGACCATTCTGATGGAAAAAGGAAGAAAATTCAAGATCTCGACGATTTAGACCATTCTAAACTCGAAACTGCGCAAAAAAGAAAAGTTTGGAGTGTAGAGATAAATCGATATTTACAGTACCATTCTTTAAAGTTAAGATCTAGACATTTATGTCGTCATGTTAAGTCAAAACTTCCCTCACTATTTTTCGTCCTATTGGTGGTGTTGGCCCATCTTCAAGAAATAGCCCGAAAAAAAAAGCTACCAGATCTAGTAGCTTCGAGCGAGGAGAAAGCTCGTCGGGCTCAATGGCCCATGTGGAGGAGCGAGTCGAAGAATTGGACAGCTCCCAGAAAGCGATAA

Protein sequence

MKDGERCIWEAKNAVEINKTDLDVNKDHSDGKRKKIQDLDDLDHSKLETAQKRKVWSVEINRYLQYHSLKLRSRHLCRHVKSKLPSLFFVLLVVLAHLQEIARKKKLPDLVASSEEKARRAQWPMWRSESKNWTAPRKR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 110..124
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 110..139

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10020168.1HG10020168.1mRNA