HG10019070 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATGAAGATAGCAGTGGTCGGAGCGGGAATCAGTGGTCTGGTTTCGGCTTATGTTTTGACAAAAGCTGGAGTGGAAGTAGTGTTGTTTGAGAAGGAAGAGTACTTAGATAGTGATTTCAAAATGGTTAACTTTAGTGGCATTGATTTGGACCTCGACTTCACGGTCTTCAATCCAGTAATCTCTCTCTTATCTCAATGAATTACAATCTTGGTTGGTAATAATATTGTTTTTCGTTTTATGTTTTTAAAATTTATATATATTTACTTTCACTAAATTTTATACTATGATTCAGATAATTCTGAAAGAAGCACCTGAATTCATAGTCAAATTATAAAAAAAAAAAAACTATTTTTTTTAGTTTTCAAAATTTGACTTGGTTTTTTTAAAACATTAGTGAATAAACAAAATAAATAAAAACTAAAAATCAAGCTCTCGTTTGTTAACCATTTGGTTGTTGTTTAAAAAAATTAAGTCTATAAACACTACTCCCATCTATTAGTTTTCTTATGTGTGTTGTTGTCTCATGTTAGGAGCGTTTTCAGAATCAAAACCAAAATTTAAAAACTAACAAAAAAAATATATATATATATATATATATAGCTTTCAAAAACTTATTTCTATTTTTGAAAAGTAATTTAGAATTCAAGCATTTACTAGGAAATTTGAAAGCTATGAGTAAATAATTTTGAGAAAAAAAATATAATTTTCAAAAACAAAAAATGGAAAATCAAATTGCCACTCAACAAGACCCAAATGTTTACACAAATGGGTCGGGTTTACTTTAAAAGAATCACTCATACCAATGTATAATTAATGTTTTTTTTTTTTTGAGAGATCAATAATCACTGTTTGAATATTCAAAAGTTTTAATTATAGTTTTCAAATTTGACAAATTTGGCCCCTTTACACTGTCTAACTAACCAGTTCCTTTACATTTATGTTCTCATAATCATTACCTGTTGGACAAATTTTGGATGATAGTAGCGTGAGTGAACAACAATTAGTATAGATTTAAGTGATTCTTCGAGTAGGTAAAACTTTTTTTGAATTATTCAAAGATTTATTGGATTGAAAGTTGAAAACATTTTAGACATAAATGTTATAAATAAGGTTGAAAGTTGAATTATTTAATTTATTTTAAATAAATAAATACACAAAGGTGATGATTTCAATAATGTACGGCTATTGAAGAGGTTATGAAAAGTTATGTTTTGCTCAAGTTGGTATAGTTATTATCCATCTTTACTCTTTACTATCAATGAATATTTATTTTTCTTGAAAATTTTGTTATATTTTTAAAGAAATTTAATATTAAATGTCATGATTTTTTTTAAGAAATTATTAAAAATAGAAAAAATATCAAACTATTTATCAATATAGAAAATTTTTACTGCCTATCATGATAGACCACGGTAGACTTCTATCATTGACCGATAGAAGTCTATCGCGATTTATCACCCAGTGATAGTAGTTTGTCGTTGATAGACAATGAAATTTTTTTATATTTATAAATATTTTGACACATATAATGATTTTGATTAAATATCAAAATATGAACAGGTAACATCTCCAAATATGATGGAGCTTTTTGAGAATTTGGGAGTTGAAATGGAAACATCAAATATGTCATTCTCAGTGAGTTTAGACAAAGGAAGAGGCTATGAATGGGGCACCCAAAATGGCCTTTCAAGTTTATTTGCACAAAAGAAGAACATTTTCAATCCACTTTTTTGAAAAATGATTCAAGAAATTATCAAATTTAAAGACAATGTTATCAAGTAAGTCTAGTTAATTACGACAAATTTTTCAATTAGATTATTACGATATGATTATCTTTTAATAATCGTTAAATTAGAGAATCAGAAATCTGCATGATTCCTTCTTAACTATGAATACAAATTTAAAACTACTTTTGCCCTTTTTTTCTTCTTAAATATAACGATGTAAAATTATCAATCATATTATTATGGTAGACTTTTCGAATAATTTCTCTTAATTAAATAAATTAAATCTCACATTTCAAAGTAACTAATTAGACACTAATTTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTGTATACAGTTATCTTGATGTTATGGACAATAAAAATTCAGAAATGGATCAAAATGAAACATTGGGACAATTTCTCAAGTCAAGGGGGTATTCCAAATTATTTGAGAAAGCTTATCTTGTGAGTTAAATTTTCATAATTATATTTTGGAAGAAATACCTTTTATGGTCTTTTAAGTTTTGAATTTTAATTTCAGTATCTATTTGGTTCGTAAATTTTATAATATTATAATTTTAATATAGAGTTTTGAGTTCAATTTTTATTTGACTATAAGTTTCAAAGTGGTATATTTTTACATTGAAATATACTGTGTTTTGTTTCCATTTAAGTTTTAATACACTTCTATTCTTAATTTTTATTAAATACTCACTTTCGTTCGTTAGTATTAATGTCTCTTAATTAATTTAAGATAATTAAATAAATTAGTTTATATTAATATTTCATCGACATTAAAATTACATTGATAATAATATTTCATCAATATTGAAATTTCACTTGATACATGTAGAAAATATCAAACTATTTACAAATATGGAAAATTTTCACTGTCTATCAGCGATAGACCGTGATAGACTTCTATCGCTCAATAGAAGTCTATCACTGATAGACAGTGAAATTTTTATATATTTGTAAATATTTTGGCTCATTCTCTATATTTGAAAACAACCCTTATAATATTGTAAATTAATTAATAGAAGTTAAAGCCATGAGTATTAATGAAAGTTGATTGAACTAAAATGGTAGATTATTGAAACCTAAGAGTCACATTAAGACTAAATTCAAAACTGAAGAGTAAAAATATAACGTTTTAAAATATAAGTATCAAATAGAAATTAAATTTGAAACTCACGATTAAAAATGTAGTAAAATTTGAAACCTAATGAGTAAGAACTATGCTTAAAATTTAGGGACCGAAAATGCATTTCTTCCATAGTAATTTTTAGTTATTTGTTATCAACTTCATATGACAAAGTTTTTAATTTAACTTTAGTGGGTTAGGATATTAATGTTTCTTATGTTTTTGTAGGCTCCAATGTTATGTTCAATTTGGTCATGTCCCTCAGCCAAAGTTCTCAACTTTTCAGCTTACTCAGTTCTTTCATTTCTTCAAAATCATTTTTCACTTCAGGTTATTCTTTTTTTCATCAACTTTTGTACCTTTTAAGAATTTATTTTTTCATTGCAATAATATGCTTAAACCTGCCATTATTTTAATAAATTTTCAATTTTTTTTGGTTCTTTTTTAAAGTTATTTGGAGATTCAGAATGGATTACTATCAAACAACAATCACAATCTTATATAAAGAAGGTGATCCTTGAAACTATATATATGTGGAAGAACTGGTTGTTTTTGTTTTTTTTGGTTACTATTGTTATTTTTAGGTTAATATTTTATTTTAGCTCCTATATTTTAGAATTTAATTTCATTTTAATCTAAGTACTTTTAATTATCTAAATTTATTATATGGTAAGTAATTTATTATTTGATACTTACCATAGATCTCAAATTCAGTCCCTCTCTTATTTGTTTGTTGTTTATTCTCAAAAGAAAAAAATTAGGTCTTTGAGTTTTTCAATGTAGCTCAAGAATATGTTTCTTCAAGATGGTGTCTATTTAGGTTTACTATTCATAATTCGGATTTTTTTTTTAGATTACATGAGATTCCATCTCAAAGTCAATTGACAATAAGAGTAACCTATTTTATCTTATAATGAGCATAACGTCTCATGGTTTTTCAAATACGGAAATGTTGGGTTTACTATTTTTGTTCTTGGATAGGATACCAATTTTCATTTTTGGGTCGTATGCCTGGTTTAATTTAGATTTCATGATATCATATCACATACCATGAGGTTCCATCTTAAAACCAATTTGCAATAGGAGGATCAGTTCATGTATTTTATAAACATTATGAGATCCCTTGGTTTTTCCAAGGAGAATCCTTAGTAGTATCAACATTCACTTTATAAATTTTAAAAAGATATTCACATGGTCTATTTTCTTACATGAAAATTATTATTATTGTTCAACAAATTTCGATAAAAATCAACTTCAAAAGACTAAATATAAGGTTTATTAATAGTATAGAGACTAAATTTATATTGTATACAAAGATTAATTTAGACAATTGAAAGTATATAGACCAAAATGAAATAGAATTTACAATATAGAGATTAAAATGATATTTTAACCATATTTTTATTTTGATGCATAGAACTAATTCAACTATCCGTGAATATTTATCGACTATTATCTATGAAAAATACTTGGGTGCATCTGGAACTACACTCATCTTTGTGCAATTCATTGAAATGTCCAATTGCAAGTCGTCGCGTGGAAAACTTTTCTGTTTTAGAAAAAAGATAATCTTAATTTTTTAAATATATTTTTTCCTTTATTATTGAAGGAATAATGCATAAACATGGGTGTATCATGAACTAGGACTAAGTATTACTCATTTTCTAATAATATTTTTTTTCAAACATATTGGCTTTTAAAAAAATCAGATCCAAGAAGTACTTGAGAGTGGAGGTTGTGAAATAAGAATGAGTTCTAAAGTTGATTCCATCTCAACAACCAATGAAGGTGAGTGCTTTATTAATTATATAAAATATAATGATCATACATGTTATTGTGTTTATTATTTGTAATTAAATTGAAGCCTATATATATATATATATATATTATAGATTTTTAATATTTTTACAAAATGTTTAATAGGCTGCATTGTAAGTTATGGGCATGGTTCTCAAGAAATATATGATGCATGCATAATAGCAACTCATGCTCCTGAGACTTTAAGAATACTGGGGAAACAAGCAACACCACAAGAATTCAAAGTTCTTGATGCCTTTCAATATGTTTATAGGTACATTCATTCATCATCATCATCTTCATCATCATCATCATCATCATC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Match: XP_038888566.1 (uncharacterized protein LOC120078371 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 714.9 bits (1844), Expect = 4.7e-202 Identity = 365/469 (77.83%), Postives = 384/469 (81.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. NCBI nr
Match: XP_038888566.1 (uncharacterized protein LOC120078371 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 3.7e-13 Identity = 68/179 (37.99%), Postives = 94/179 (52.51%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 656.8 bits (1693), Expect = 1.5e-184 Identity = 340/479 (70.98%), Postives = 371/479 (77.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. NCBI nr
Match: XP_038891587.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC120080979 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 3.7e-13 Identity = 51/92 (55.43%), Postives = 64/92 (69.57%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 655.6 bits (1690), Expect = 3.4e-184 Identity = 321/372 (86.29%), Postives = 343/372 (92.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. NCBI nr
Match: XP_022138484.1 (uncharacterized protein LOC111009647 isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 652.9 bits (1683), Expect = 2.2e-183 Identity = 330/503 (65.61%), Postives = 380/503 (75.55%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. NCBI nr
Match: XP_022138483.1 (uncharacterized protein LOC111009647 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 652.9 bits (1683), Expect = 2.2e-183 Identity = 330/503 (65.61%), Postives = 380/503 (75.55%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O53732 (Tuberculostearic acid methyltransferase UfaA1 OS=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) OX=83332 GN=ufaA1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 197.2 bits (500), Expect = 4.3e-49 Identity = 109/285 (38.25%), Postives = 154/285 (54.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P31049 (Probable fatty acid methyltransferase OS=Pseudomonas putida OX=303 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 174.1 bits (440), Expect = 3.9e-42 Identity = 104/283 (36.75%), Postives = 147/283 (51.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0A9H8 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase OS=Escherichia coli O6:H1 (strain CFT073 / ATCC 700928 / UPEC) OX=199310 GN=cfa PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 1.4e-36 Identity = 101/297 (34.01%), Postives = 152/297 (51.18%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0A9H7 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=cfa PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 155.6 bits (392), Expect = 1.4e-36 Identity = 101/297 (34.01%), Postives = 152/297 (51.18%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O69687 (Probable fatty acid methyltransferase Rv3720 OS=Mycobacterium tuberculosis (strain ATCC 25618 / H37Rv) OX=83332 GN=Rv3720 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 139.0 bits (349), Expect = 1.4e-31 Identity = 88/289 (30.45%), Postives = 136/289 (47.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ICH0 (uncharacterized protein LOC111472470 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472470 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 655.6 bits (1690), Expect = 1.6e-184 Identity = 321/372 (86.29%), Postives = 343/372 (92.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CD38 (uncharacterized protein LOC111009647 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111009647 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 652.9 bits (1683), Expect = 1.1e-183 Identity = 330/503 (65.61%), Postives = 380/503 (75.55%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CD38 (uncharacterized protein LOC111009647 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111009647 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 81.6 bits (200), Expect = 9.8e-12 Identity = 54/116 (46.55%), Postives = 66/116 (56.90%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 652.9 bits (1683), Expect = 1.1e-183 Identity = 330/503 (65.61%), Postives = 380/503 (75.55%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IB60 (uncharacterized protein LOC111473008 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111473008 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 652.5 bits (1682), Expect = 1.4e-183 Identity = 319/372 (85.75%), Postives = 343/372 (92.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H7H7 (uncharacterized protein LOC111460281 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460281 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 647.9 bits (1670), Expect = 3.4e-182 Identity = 318/462 (68.83%), Postives = 362/462 (78.35%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. TAIR 10
Match: AT3G23530.1 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase ) HSP 1 Score: 545.8 bits (1405), Expect = 3.5e-155 Identity = 261/381 (68.50%), Postives = 315/381 (82.68%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 74.3 bits (181), Expect = 3.0e-13 Identity = 53/117 (45.30%), Postives = 65/117 (55.56%), Query Frame = 0
HSP 3 Score: 51.6 bits (122), Expect = 2.1e-06 Identity = 23/42 (54.76%), Postives = 31/42 (73.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. TAIR 10
Match: AT3G23510.1 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase ) HSP 1 Score: 540.8 bits (1392), Expect = 1.1e-153 Identity = 257/381 (67.45%), Postives = 315/381 (82.68%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 73.9 bits (180), Expect = 3.9e-13 Identity = 53/117 (45.30%), Postives = 65/117 (55.56%), Query Frame = 0
HSP 3 Score: 51.6 bits (122), Expect = 2.1e-06 Identity = 23/42 (54.76%), Postives = 31/42 (73.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. TAIR 10
Match: AT3G23470.1 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase ) HSP 1 Score: 528.5 bits (1360), Expect = 5.8e-150 Identity = 247/383 (64.49%), Postives = 308/383 (80.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. TAIR 10
Match: AT3G23480.1 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase ) HSP 1 Score: 486.9 bits (1252), Expect = 1.9e-137 Identity = 230/366 (62.84%), Postives = 293/366 (80.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10019070 vs. TAIR 10
Match: AT3G23480.2 (Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase ) HSP 1 Score: 442.6 bits (1137), Expect = 4.2e-124 Identity = 219/383 (57.18%), Postives = 278/383 (72.58%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Pages
Pages
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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