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HG10018862 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTGGATGAAGGGTACTCGGTGGACATGCTTGAAGAGAGAGATAATGTTGTGAGAGGTATTCCAAAGGACATAGCATCGGGGAAAGGAAAATTCTGTTCGGTTGATGTGGAGATTAATGAAAAGACAAATGTGCTCGTTAATAGCCAATTAAATATGACCATTAATTTGGAGAGAGAAAATAACATTCAGGGTTTTGAGGTGTCTAATGATTGTTTACAGCTGGACACATTTATTGAAGAACCTTCACATCGGTTAGAAGAGCCTAAAGGCAATCACTACAACACTTTCCAAGGAGACAGCTCTAAGGATGAGTTCTTGAAGAGTTAGGCTGCTTCTTTAGAAGTTGAAAAGACACTCTCAGCAGCATGACTTGTTCATCAAACCGGTTTGGCAGGATGCTGTTAGGCCTTAGCCTCAATTTTATTTATCAACAGGCGGGGAAGAATTCAAGAGCTTCCCAATCTCTCCCAAAGTCCCATCAAAGACTGATTACACAATGATAAAAATCCTATGCCCCCTCCCACAACTCTCTCAGTATTAATAACAAATATTCTATAACAACCACTATTCCCAGGCCCACTTACTAACTAACTATTTCCTTTCTTTTATGCCTACGTGTATAAACCTTTATTCTTGGGAGTCTATCATTACCCGCCCGCCAAAGAGCCACCTTGTCCTCAAGGTGGAAGTCAGGAAACTGGGGTTTGATCAGGTCTGCTTGCTCCCACGTTGCATCCTCTGGAAAACTATTCGTCCACTGTATCAGGACCTCCAGAATACCCTCCTCTACTAAGGATTGGCGCAAGCCGAGAACAGTTTCTGGCGTGATGGCGATGGAGAGATCTGGTGACAATGCTGGTGGAATAGGAAAAACTGGCAAGTTGGTTCCGACTACTTTTAGCAAAACGGCTACATGAAAAACAGGGTGAATCCCAACGTTTGTAGGCAGGGCAAGTCGGTAAGCTACAGGCCCAACCCGTGCCGTGATCTGAAATGGGCCGACAAAACGCGGGGCCAGCTCTGGATGAGTATGCCTGCTGAGGGACGCTTGGCGGTATGGTCCCAGCTTTAAGTACACCCAGTCATTGACTTCGAACTGTACATCTCTCCTCTTAGTGTTTGCTGATTTGGTCATGCGTTGTTGGGCTCGTAATAACGAGGCTTTCAATTGTTGCAACATTGCATCTCGGGCACATAATAATTGATCAATCTCATGTACCATGCTCGACCCTTTGTCGTAAGGAAGTAAGGGTGGTGGAGGACGTCCGTAGACTGCCTCGAAGGGAGTGACGCGTGTGGAGGTATGATAAGACGTATTATAGCTAAATTCTGCCCATGGTAACCATTTATACCAATGTTTAGGTGTACCCATGGTGAAACAACGCAAGTACGTCTCAACCCCTCGATTGACCACTTCTGTCTGACCGTCGGTCTGTGGGTGATAAGCAGTGCTTCGTTTAAGCTGTGTTCCTAACAACTTCATAAGTTCTTCCCAGAATAAACTCGTGAATATTTTGTCGCGGTCAGAAACTATGCTTTGTGGACACCCATGTAATCGAATGACTTCACGAACAAAGACAGTAGCCACAGACATCGCAGTAAATGGGTGTTTAAGAGGAATGAAATGGGCGTACTTTGATAGTCGGTCCATTATGACCAAAATCGTGTCAAAACCCTCAGATTTAGATAAGCCTTCAATAAAGTCCATACTGTTATCCTCCCATATTTTGTCTGGGAACTGGAAGAGCTGTAGGAGACCCGCTGGAGATAAAGTTAAGTATTTCGCTTGCTGGCATATTGGGCTGTTGTGAAATTCCGCTAATAATAAGGGAATGGTTGGTGAAGTTGCTGGAAGAACTAAACGGCCCTGATACGTTAGTAGCTCACCCTGGATCGCATACCCCGCAGGAGCTGGCTGCCCATGGAGTAAGGCCTGAAAGATCCCATTAAGGGTGACGTCTTCTCGAATCTGAGCACTGAACTCTTCTGTGTTAATTCCTCCTACTACACTGAGAAGCCCAAACTCCATTGCAGGCGGTAATCTGGACAAGGCATCCGCTGCTGAATTTTCCAATCCTTTTTTGTATTCAATGGAGAAGTCATAACCCATTAACTTGGCAATCCATCGTTGATACTCGCCCGCAATAACTCTTTGTTCAAGTAAGAACTTAAGGCTTCGCTGGTCTGTACGAACAATGAAATGTTTTCCCAACAAATATGCTCGCCATTTCTGAACCACGAAGACGATCGCCATTAATTCCCGTTCATACATTGCCTTATATCGATGTGTCGGTGGAAGCGCTTGACTAAAATACGCAAGTGGTCTTTGGTTTTGCATCAGCACTACGCCCACTCCTATTCCTGAGGCATTAGTTTCCACAACGAAAGCTTGAGAGAAATCGGGTATCCCTAATACTGGAACGGACATCATGGCCGACTTCAATCGTTGAAACGCTTCCTCGGCCTCAGAATTCCAGAGAAAACCGCCTTTCTTTAGAAGTTGGCGGTAAAGCAATGGACCCATAATTGGCAACAAACTTACAGTAATATCCCGTGAGACCCAAGAATCCACGTAATTCCTTAATGTTCTTTGGGACAGGCCAGTTATTCATAGCTTCTAATTTAATTGGATCGGCTGCCACCTCATTGACTGATATGATATGGCCCAAATATTCAATGCTTTCAACGGCAAATTGACACTTTTTAAAATTTGCTACCAAGTGGTTCTCAAGTAACAGCCCCAGAACTAATTCCAAATTCTGGAGATGGTCCTCCTTCGACGCACTATAGATCAGAATGTCATCAAAGAAGACAAGCACAAACTTCCGTAGATATGGTCGGAGAATGTTATTCATGATTGATTGGAACGTGGCTGGTGCATTCTTCAACCCAAACGACATCACTACGAATTCATAATGACCTTCATGTGTATGGAAGGCAGTTTTATGGATGTCTGGTGGCCGAACCCTGATTTGGTGATAACCCGATTTTAAATCGATTTTAGAGAACATCACAGCCCCATTCAACTCATCCAATAATTCATCCACCACTGGGATTGGGTACTTATCTGGAATGGTTACCTGGTTCAATGCTCGATAATCAACGCAGGGACGCCAACTGCCATCTTTCCTTTTGACGAGTAACACCGGGCTAGAGAAAGCACTACGACTAGGTTGAATCACTCCTGCTGTTAACATTTCCTGCACCAACCTCTCAATTTCCTCCTTCTGAAACTGTGGGTAACGATATGGTCGGACATTGACCGGTCCTGCCCCAGGTTGTAGTTCAATCGCGTGATCATGTGGTCGCTTTGGCGGTAATGAATCCAATGGTTTGAAAACAATGGAAAATTTCAGCAGCAGGTTCTGAATGGCATCTGGAAAATAAGTAATGGCCTCAAGTTCATCCCCCTCTGGAACATCAAATTCCTCTCGCTGTAAAGTACTTAACTCAATCAATATGCCCTGACCTCCACTGGACAAAGACTTCATCATCGACTTGAGAGATACTTGCGATTTGATCAAAGTACGATCTCCACACAAATGCACGAGCCAGTCTCCTACCCAGAAATCCATCTCGGATAATTGAAATCAAATTGAATTTTTCCTCTCCAGCCAAGTAACCCCCAGAATTACATCTGCACTGCCTAGAGGTAAAGGAAGAAAATCATGTATAATTGATAATTCAGAGATAGTTAAGAGGACACCTTGACAAATGCCCGCGGCTCGGACAGTACCGCTAGTCTCGAGAACCACCCCATAATCCTTAGATGGTGATATCGCAAGCTGTAGTTCTGCCGCCACTTCTTCGGACATGAAACTATGGGTAGCCCCACCGTCAATTAAGACAATCACTTCTCTACCCCGAATTTCCCCTTTTACCTTAAGTGTCTTCAGGGAATCAAACCCAGCAAACGAATTTAAGGATAGCATGGCAACTTCGGCCTCCGTGGTTTCTTCTGCCTTCTCGTCGGTCATTACCCCTTCGAGTTCGCCCTGCTCCTCGCTCAAATCCTCCCCCTCTTGTACTACGAACACATTCAATTCTTTTTTAGGGCATCGATGTCTGGCACTAAATTTCCCGTTACATTTAAAACACATGCCTTTATCCTTCTTCATTTGCATCTCACTGTCGGTCAATTGGCAATAAGGAGGAGTTGGGGAGGCGAATTTTCCTCCAGGCGATCGTGCGGTGGATAGAGACGTGGAAGATGACGTTGAACTCCGATGAGGGCTGATTGTAATCGTGCGGGCTGCTTGATTTCCACTGGAATTATTAGTGGCGTTGGTATTGGGCCCATTTGCACTTACACCAGACGACCCGACAGGCCCATTTTTAGTTGAAGAAGGGCTGCCCGAAACCCCTTTAATCCTCTTCATTTCAACCATCAAATCGTCTTCTATTATTTGGGCCATTTCCATCTTGGCCGTGAGGCCTACTGGATTTAACTTTCTCATTTCACTTTGGATGTCTTCCTTGAGCCCGCAAACGAATTTGCTCTCTAGGGCTGCATCACTCATGTCTTTCAAGCCCGTCGAGAATTACTCAAATTGCCGGCAATACTCCCATACTGAGGTCTCTTGTTGCAACTTCATCAATCGCGCGTGCTTATCTCCTTGATCCGATGGTCGGAAATGTTTCCACAGAAGCTGTCGAAATTCCATCCAGTTTCCGATCTTCTCTCGGTTGTCTCGCCACTGATACCAATCAAGAGCTTCTCCTTCCAAGCATAAGACGACAGCATCGAGCTTATCCCTCTCAGTCAATCGATTAACCACAAAATACCGTTCCACTCTATGTAGCCAACCGTCTACGTTCTCCCCTACTTCTCCCTTTGAAAATTGGTACTTCCAGCTTCCCCAGGCGCATATCGAACAAAGGAACCTCCCGATTGCTCGAGGCATAAGGAGCATTAATACCTTCATTGCTTACTAGGTCAGTATGCTGGTCGTTGTTTACTCCCTGTATCGAACTTTCCTCCATCGGTTTTT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ATGTTGGATGAAGGGTACTCGGTGGACATGCTTGAAGAGAGAGATAATGTTGTGAGAGGTATTCCAAAGGACATAGCATCGGGGAAAGGAAAATTCTGTTCGGTTGATGTGGAGATTAATGAAAAGACAAATGTGCTCGTTAATAGCCAATTAAATATGACCATTAATTTGGAGAGAGAAAATAACATTCAGGGTTTTGAGGTGTCTAATGATTGTTTACAGCTGGACACATTTATTGAAGAACCTTCACATCGGTTAGAAGAGCCTAAAGGCAATCACTACAACACTTTCCAAGGAGACAGCTCTAAGGATGAGTTCTTGAAGAATGGTGTGTTATATCATGACTTCCAGATTGTTAATGAAGAAGCATTGAGTCCCAGAAATCCTCCAAGTCCATTCTCACAGAGTCGTTTTAAACATTTCACTCATACAGCTGATTCCTTGGTGCACCATTCTTCTAATCCTGATGATCTTGAAGATAAATTTGTTCGAGTTCTTGTTCAAGAAGGATCAAAACCTTCGAGAAAACGTCATTCTTCTCCAATAATCACTCAGCCCAATTTCAAAGTCACAGGGTCTAAAGTTTCCTTTGTTCAAGGAATCTTTTCTCAGAATTATCAGAAGCTTTCTTCTCAAGAATCAGAAGATGAATCCGATGTTAGTGTTAGTAGTGAAGAATCTGATTTTGAAAATCATGAAGATCATGAAAAAATAGAAGACTCCTCTCCGGATCACTTAGGGGAAGCATACAAAGCGCTTTTCCTTCATCAACAACAAGATTTTGTAAGTGCTCCACACCTATCTCCATCTCAAGTTCCTTCCAAATTTTCCTCTTTAGTGGCGGCTTGTGGTTTTCAATTGCAGGAAATTACACCTCCTAAGAAGATGAAGTTATTGGTTCCTTACTGTTTCCTTCTCAATGGGGATGGGGGTTTGATTATTGGGGCAGATGATGTTATTGTTACAGGAGTATTGAGTGCAAAGTGGTCCCCAGACCTCAAAGATGTTCGGTGTGACCTTGATCCAATGCTAATTGCGAATCATGTGAGAAGAACCAATGAACTAAAGGCCGAGGTTGACATCCCTGATGATATAATTATGAAATTTAGGCAGTTCTGGTCAGATTTCAAAGACACTCCTTTAAAAGGAAGAAATGCTATTCTGAGAGGTATATGCCCTCAAGTGTTTGGACTTTTTACTGTAAAGCTTGCAGTGGCTTTAACACTCATTGGAGGTGTACAACATGTGGATATTTCTGGTACTAAAGTTCGAGGAGAATCCCATCTACTGTTGGTTGGCGATCCTGGTACTGGAAAGTCACAGTTCTTGAAATTTGCTGCCAAATTGAGCAACCGAGCTGTTATTACCACTGGATTAGGAAGCACTAGTGCAGGATTGACTGTCGCTGCTGTTAAGGATGGAGGGGAATGGATGCTGGAAGCTGGGGCACTTGTACTGGCTGATGGAGGACTTTGTTGCATAGATGAAGTGGACAGCATGAGAGAACATGACAGAGCCACAATCCATGAAGCAATGGAGCAACAGACTATAAGTGTCGCAAAGGCTGGTCTTGTAACAACTCTCAGTACTAGAACGATAGTATTTGGAGCAACAAATCCTAAAGGACATTACGACCCTGAACAACCTCTCTCTGTCAATACAACACTCTCTGGTCCCCTATTGAGCAGATTTGATATCGTTCTTGTGCTTTTGGATACAAAAAACCCTGAATGGGATGCAGTTGTTTCATCTCATATTCTCTCCGAGTGCAAACAAGAAAAAGGAAAACGTGACAATGATCTTTCAAGTAACTGGCCTCTTACTATGCTTCGACGATACATCCAATTTGTAAAAGGATACTTCAGACCGGTCCTGACTATGGAAGCTGAGCAAATTATTTCAAACTATTATCAGCTTCAAAGAAGATCAGCCATGGATAATGCAGCCAGGACAACGGTACGCATGCTTGAAAGCTTGATACGCTTAGCACAAGCACATGCACGCCTCATGTTTAGAAATGAGGTTACCCGTCTCGATGCCATTACGGCTATTTTGTGCGTTGAATCATCCATGACAACCTCAGCTTTAGTGGATAGTGTTGGGAATGCCTTGCACTCTAATTTTACCGAGAACCCAGACGAGGAATGTATCCTTAATTGCTATGTTTAA MLDEGYSVDMLEERDNVVRGIPKDIASGKGKFCSVDVEINEKTNVLVNSQLNMTINLERENNIQGFEVSNDCLQLDTFIEEPSHRLEEPKGNHYNTFQGDSSKDEFLKNGVLYHDFQIVNEEALSPRNPPSPFSQSRFKHFTHTADSLVHHSSNPDDLEDKFVRVLVQEGSKPSRKRHSSPIITQPNFKVTGSKVSFVQGIFSQNYQKLSSQESEDESDVSVSSEESDFENHEDHEKIEDSSPDHLGEAYKALFLHQQQDFVSAPHLSPSQVPSKFSSLVAACGFQLQEITPPKKMKLLVPYCFLLNGDGGLIIGADDVIVTGVLSAKWSPDLKDVRCDLDPMLIANHVRRTNELKAEVDIPDDIIMKFRQFWSDFKDTPLKGRNAILRGICPQVFGLFTVKLAVALTLIGGVQHVDISGTKVRGESHLLLVGDPGTGKSQFLKFAAKLSNRAVITTGLGSTSAGLTVAAVKDGGEWMLEAGALVLADGGLCCIDEVDSMREHDRATIHEAMEQQTISVAKAGLVTTLSTRTIVFGATNPKGHYDPEQPLSVNTTLSGPLLSRFDIVLVLLDTKNPEWDAVVSSHILSECKQEKGKRDNDLSSNWPLTMLRRYIQFVKGYFRPVLTMEAEQIISNYYQLQRRSAMDNAARTTVRMLESLIRLAQAHARLMFRNEVTRLDAITAILCVESSMTTSALVDSVGNALHSNFTENPDEECILNCYV Homology
BLAST of HG10018862 vs. NCBI nr
Match: KAG7011539.1 (putative DNA helicase MCM9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 784.3 bits (2024), Expect = 9.3e-223 Identity = 395/407 (97.05%), Postives = 401/407 (98.53%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. NCBI nr
Match: XP_038886880.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 779.2 bits (2011), Expect = 3.0e-221 Identity = 396/404 (98.02%), Postives = 399/404 (98.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. NCBI nr
Match: XP_038886882.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 779.2 bits (2011), Expect = 3.0e-221 Identity = 396/404 (98.02%), Postives = 399/404 (98.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. NCBI nr
Match: XP_023554772.1 (probable DNA helicase MCM9 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023554774.1 probable DNA helicase MCM9 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 777.7 bits (2007), Expect = 8.7e-221 Identity = 392/404 (97.03%), Postives = 399/404 (98.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. NCBI nr
Match: XP_022952900.1 (probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita moschata] >XP_022952901.1 probable DNA helicase MCM9 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 777.3 bits (2006), Expect = 1.1e-220 Identity = 392/404 (97.03%), Postives = 398/404 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IFF3 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 688.0 bits (1774), Expect = 1.2e-196 Identity = 344/402 (85.57%), Postives = 377/402 (93.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8B406 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MCM9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 653.3 bits (1684), Expect = 3.2e-186 Identity = 325/409 (79.46%), Postives = 366/409 (89.49%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69QA6 (Probable DNA helicase MCM9 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MCM9 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 653.3 bits (1684), Expect = 3.2e-186 Identity = 325/409 (79.46%), Postives = 366/409 (89.49%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NRM6 (DNA helicase MCM9 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=mcm9 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 459.9 bits (1182), Expect = 5.2e-128 Identity = 234/406 (57.64%), Postives = 302/406 (74.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F6RIX4 (DNA helicase MCM9 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=mcm9 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 459.9 bits (1182), Expect = 5.2e-128 Identity = 235/406 (57.88%), Postives = 301/406 (74.14%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLI2 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455445 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 777.3 bits (2006), Expect = 5.5e-221 Identity = 392/404 (97.03%), Postives = 398/404 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SLG2 (DNA helicase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold139G002160 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 775.0 bits (2000), Expect = 2.7e-220 Identity = 393/407 (96.56%), Postives = 399/407 (98.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C4S8 (DNA helicase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold13G002190 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 771.2 bits (1990), Expect = 3.9e-219 Identity = 391/401 (97.51%), Postives = 396/401 (98.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4M2 (DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470623 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 770.8 bits (1989), Expect = 5.1e-219 Identity = 388/404 (96.04%), Postives = 397/404 (98.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLN8 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455445 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 770.8 bits (1989), Expect = 5.1e-219 Identity = 391/404 (96.78%), Postives = 397/404 (98.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. TAIR 10
Match: AT2G14050.1 (minichromosome maintenance 9 ) HSP 1 Score: 688.0 bits (1774), Expect = 8.4e-198 Identity = 344/402 (85.57%), Postives = 377/402 (93.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. TAIR 10
Match: AT1G44900.1 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 217.6 bits (553), Expect = 3.2e-56 Identity = 136/319 (42.63%), Postives = 192/319 (60.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. TAIR 10
Match: AT1G44900.2 (minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 217.6 bits (553), Expect = 3.2e-56 Identity = 136/319 (42.63%), Postives = 192/319 (60.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. TAIR 10
Match: AT3G09660.1 (minichromosome maintenance 8 ) HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 7.9e-55 Identity = 138/336 (41.07%), Postives = 194/336 (57.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10018862 vs. TAIR 10
Match: AT2G07690.1 (Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein ) HSP 1 Score: 205.3 bits (521), Expect = 1.7e-52 Identity = 126/319 (39.50%), Postives = 180/319 (56.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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