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HG10016938 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATGCCATGGTATGTTTGAATTTTTTTTTCATCCATTAATTAGGGGTGGATTGGGGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGGATAACCTCAATTTTTTGTGGTCGTGTGGGTTATAGATTTTAAAAATGATGAAGGTAGGACCGAACTTTTTCTAAAAATAATATTATTTTAATAAATAATGACAAAAATAGGGTTGGATTAGCAAAATCGTGACCACGTCCACTGGACCAGATCCACCAGTTACCCAGCCAAGTGTCAAAGGGTCCAAGTGGGTCAGCAAAATCATGTCATGTGAGCAAAATGAGTATAGTTGTGGTAGGGTTGACCAAGACATGTAAGTAAAATCGTAGATCCAGTCCATGGTTTGAGTGCCATGTGGGCTAATTTTATAAAATCGTGGACGTGTCAACGATTTTCTCACCTATTTTTTAAAATACTTATACCTCTACCCTATTTTTGTCATTATTTATTAAAGTAACATTATTTTTTTAAAAAAATCATGTATTAGAAGCATATTAATTATCTATATTGTCTCTCATTATTTTAGAGAGTGTGAAATTAAGGTCACCCGTATAATAGGACTCTTCCTCCATCTCTCGTGTTTGCGATCCTCGTCCCTCTCTTACTCTCGTGTTTAACTTATCCAATATATCAGTATTCTCATATCGTTAGTGCTCTAACTCTCTTCATATTCACTACTTTGAAACTTCATTAATACATTGTACGAGGAAAAGTATAGATAATTAACATGTTAGTGTGGTCTGATAATGGTAGAGGGTCATCCTTCATTATTGTAAAAATTGGGACAAACAAATGTTAACCATATGAAATTTAGGTCATCCTTCAAAAAAAAAAACTAGAGATTAAATTACTATTTTATCCATTGTTATTTTCTTTACAATAAATGCATATAGGGATAAAGATTTATTTGGCCGACTCTATTTTAGCTTTGTTGATAGGGTTTAAGAAGTCTTAATTTGATTGTGAGCTATATTGCAAAAATAAATAAACAAGTAAATAAAATACATCTTAATTTACCATTTGTTATAAAAATATATCTACCATTAGTTGAAATATTATTTTAGCCCGAGCGGTTTAGCCCACCAACTTCTTAAGTTAGTATTAAACAACAATTTAAATAGTAAAATTATTGAATTTTACATATTTATCGAGAAAATTCATTTTTCACTATTTCTCTATTTTACACGTTTATTATTAAATGATATAAGATTAAATTTTCTTTTAATATATATATATATATATATAAAAGATTGAATTTGCCTCCACCAATAAGTTTAAGCTTTTAAGTTCATCGGTGATTCAAAATGGTATCAAAATAGGTTGGTTTAGGAAGTCTTGTGTTCAAATCCCTGCATTGTTGTCATTCAATTTTACGGGTGTGGTGTGGTTCATTGTTCAACTATTCCAAATTTCAAAATTTTCCAACATTCTTATGAATTTCTATAAAAAAAAAAATAGGACAATTTGTTAAAGAAAGAAAAAAAAAGTTTAGGAGTATTTTTATGTATTGTTGAACTTTAAAAAATAATATAAAAATAGTAATTTAACCTCAAAATTTTTATTTTTTAACCCTTAAATGATTTTATTGACTTTTTCATTGAATTGGTCTCCTTGCAAATGTAGCCTTATTCATAGCTTTAAATAAATGTATATTAAATCTTCGTTTATTTTGTGGTAAAGGGTCATTTGTTTTGAATTTTAAATTTTCATTCAATACTTAGTTAATGTAATGTGAGACCATTTCATACGTGTTATGATACTTATTATATAACTTTATGTCTAATAACATTAGTCAAATTAAATTTTAATTTTAGAAAAAATTGCAAGAATTGCAAAATACACCCCTAAAGTATGGTAGTAGTTGCACTTATACCCTTAAACTTTTAATTTTAAAAATTGAGCCCTCAAACTTAAATGAGTGTTAAAATTAGGTCAAATTGATCATCAAACTTACATAATTATATAAATTGTAATATTTGTATAAGTTTGAGGGTTCAATTTTTAATATTTGTGGGTTCGATTTTAACTTTTGTAAAAGTTCAGGGGCCCAATTTTTACAATTGAAACTTTGAGGGTGTAATTACAACTATCACCATACTTCATGGGTGATTTTTGCAATTTAATTTTCACATTTGGCATACTTTAGAATTATTTAGAATTAAGGTTGTCTAAAAAAATGAATAAATAAATAAAATAAGAATTAAAGTATTACACGTTTTTTGTTTTTAAAAAATTACAAGTGAGGTTATGAATTCGACTAACTTGAACATAGCTCAATTAGTTAAGATGTATGTTCTAGATCAACCAGAGATTCGAATCTCCACTCCCACGTAACGATGACCTTAATAGAAAAATTAGAAATTTTGTGATGGTAAAGTTTGAGGAAAATAATGAAACATTCTTAAAAAGAAGTATTGTTTTTACTATTTAGATTCATGTTTAGCTTTTATCCAATGAGGTTTTTGTTTCTCTTCACAAACTTTCAAATTTTTAATTTTAATCCTTCCATTGTTTTCTTTTATCATTTTAGTCCATTCAAAATTTCAAATTATCTCTATTAATGAAATTTTGTGTTTAATCAAGTGCAAATTAGTATAAATGGTCTATTATAGGAATTCTAGATGATCGAGTTAATAGATAGACAAAGCATTAACGAGTTAGTTGTACAAAATGTTAGCATAATGCATATACGCATACTTTATCGTAGTAGGTAAGTGAATTCTTAAGATATTGAAATAATTAATGTGAATGTGGATTAATTGTCCAAGATTTGCACTAGGAATTGTGTTATTTGTGAGTAGAGTCGAACTATATCATTGTCAATTTGAGCGTAGCTTAACTGGTTAAAGTATATTCTCGACCAAGAGTCCGAAGTTTGAATTCTCACATCCACATATGTTATTGTACTAAAAAAAAAAATCAAAGTATATCATATTAAGATTTGGTAGGTTCCTTAACCAAGAAGATGAAAAGTTGACCTTGGAAGGTTTCTTCATGATGTTTAGTTGAGCTAAAATTGTTTTAACTGATATGATTAGAATGTCAATCTGATCATGTTAAATATATTTTTTTACTAAAAAAAATTAGATGTTTGAATCTCTATTCCTACGAGATTTGTTTTAAGAGATAGAAGAGATGGGTAACAACTATACGATCACTTATACATCACTCTTTGGTAGTATATGTGCAAATGTGGTCGTATAGATCAAAATAATTTAGTCCACCTAATTTATTATATTGTCTAAGGGTCATGTATCATCTCAAGTTGATTGTAAATGACCATATATTTTAAAAGATTCTTGAAGTTTGATAATCTTTAGTATATTTAATATTTAGGCTAACTTTTAGAGAAGGTTGAATATACCAAAAATTTATTAGATACAAAATTAAACCTAAGAGATTTTTAGTAAAACAAAATTTTCTTTTTTAGAAAACTATGTGATACGAAGATGAAAGTGTTTAGAGGGTCAATTAGAGAAACATTGTGGTTTTGAAAAAAAATATGGTTTAAAAATTATTTAGGAAAATAAGGTAGTTTTTTTTTTCTTTTTCATTTTTTGTCTTTTAGTAAAAGTCTTCTTGAAAATTGGAATGCGTCTTTTCTTTACAATTATTGTGATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTACAAATTCGTTTCCTTTATTTTTTTTAAAAAAAATATAATACCACTATTTTTTTTATAATTATTATCTTATTTTATCCTATGCTTTTTTTTTATTATTTTTTTAGCAAAATTTAATTTAATTAAGAAATATTACGGATTTAATCATTTTATTTGTAAAATAATAATCTATTATGTATATATATATATATATATATATAAAGAAATGATGCATTTCTTAAAAAGAAATGATGCATTCCAATTTTCAAGAAAACTCTTTAAAAAAAACTACTTTTTTTCCTAAATAATTTTAAAACCTTGATTCTCTAATTACCCCATGTTTAGAAGTTAAACATATAATTTAACCTAAAAATCGTATCAAATTTTTATGACCAATAAATAATATGGAATAGGTTTATTGCTCCAACTCATAATATGATTAATCTGGTATGGGCTACATGAACTCCTAGTAGTATACCGGATAATTATCGGGCATTCCTGACCCACCAAGTGAAACTCCAAGTGAAACTAATGGTTTCTTGGTTAAACGTTAGACTTGATGTCTTCTATCTTTAGTATATATATATATATAATTTTGGTTGAATATATTTAATCATCGCTAACCATCGAAGAAGTCTTTTTCGATATGTTTTTACCTTGAATTTATTAAAATTTCTTAAACAAGTCAACCATTAAAAAAATTATTAAAATCAGTTAATGCTGATTTTTTATTAGGTTATTTGTTTTGTTAATATATTTAGACGCGTTGACAATCTTTTTGTAAAAGAATTATTTTGCTTATTCAAATTAGATTGATTACAAATCATAGCTGAATTTCAAATATATTTCTAATAAAAAAAATAATTTTAGAAATATTGAATTGAACCAAAATTCTGAAATTTGAAATTTACAGAATATAATATAAAGCCGTTTCACCCACTTCATGCCATTGATCGTACATCAGAATAAAACAATTTAAAAAGAAAAAAGAAAAAAAAATGTAAATTCAAAATTTCAAAACCAAATCCCGTGTCATGGTGGGACCCATTTGCCGCCACGCTCCACTAACCGTAACAAATCGCATAGCGTACAATAAAATCTCTTCTCAAATTACGGTTTTTGGAAAAAGAAATTTTCAATTTTCAATTTCAAACAGTATAAAAAATTACACAAAAATATCAAATCAAAAGCACATGAATGATGAATTTCAACAATGAATTAAAAACAAAAAAATTGAATCCATAAGATTTCAGTAAGAACAGATATGAATGTAGAATTAATAATCACAGCAGATCAATCCAGAAAGGAAAAAGCAAAGAAGTAGGAAATTCAGATCTAACGATTACAAATCATAGCTGCACTTGGTGGTTTCGAACACACCATTTGAAGAAGTACCATTGGATCTCAAAGGAACCTTCAATGGACATCTTAGCTTCGGTTTATAGTGTCCAAATTTCACTAAACCGAACTTGAATCTGATCCGCAAGTTAAGTTTCACATCGATACTGAAAATCCCCGAGCTCTTCTGAGAATTATAAGTCGATATTCCATCCGTACCTAAAAGAATTATGTTCTGTCCAACGAACGAAGGACTGAGTAAACTGGTGTTCTTGTGCCCCTGGTAAAACTGGCTCAAATTCACCGTACTGAACCGCTGATCTTCGTAGAAGGCGCTAACCTCAATAACGTCGTAGTAGATCCCGATCCTCCGATTTGGATTTCTAGCGGTGATATTCAGAGCGAGATTGTAATGGAGGTTGTTATTGTTAGGCGTAGTGAAATTGAACTGCGTGAGAGAGGCATCGGTTGCGTGGAATTGAAGGAGATTTGGACGGAAGATGAGCCACAAGAGGAAGGCAGCAATGCCGAGGACGATGACGACGGTGATGATGATTTGACAGATGAGGTTGAGGATACAGCCGCAGCAGCAGTTGCAGAGGCAGCCGAGACAGCCGCAGCCGCCGTCGCCGCGGCCAGGGCGGTGGTAGGACTTGGAGGAGGGAGGAATGGAAGGGCCGTAGTAAGCTCCGTTGAGATTGGATGCCATTGTTGA ATGGATGCCATGGGTTGGATTAGCAAAATCGTGACCACGTCCACTGGACCAGATCCACCAGTTACCCAGCCAAGTGTCAAAGGGTCCAAGTGGGTCAGCAAAATCATGTCATGTGAGCAAAATGAGTATAGTTGTGGTAGGGTTGACCAAGACATCGGTGATATTCAGAGCGAGATTGTAATGGAGGTTGTTATTGTTAGGCGTAGTGAAATTGAACTGCGTGAGAGAGGCATCGGTTGCGTGGAATTGAAGGAGATTTGGACGGAAGATGAGCCACAAGAGGAAGGCAGCAATGCCGAGGACGATGACGACGGTGATGATGATTTGACAGATGAGGTTGAGGATACAGCCGCAGCAGCAGTTGCAGAGGCAGCCGAGACAGCCGCAGCCGCCGTCGCCGCGGCCAGGGCGGTGGTAGGACTTGGAGGAGGGAGGAATGGAAGGGCCGTAGTAAGCTCCGTTGAGATTGGATGCCATTGTTGA ATGGATGCCATGGGTTGGATTAGCAAAATCGTGACCACGTCCACTGGACCAGATCCACCAGTTACCCAGCCAAGTGTCAAAGGGTCCAAGTGGGTCAGCAAAATCATGTCATGTGAGCAAAATGAGTATAGTTGTGGTAGGGTTGACCAAGACATCGGTGATATTCAGAGCGAGATTGTAATGGAGGTTGTTATTGTTAGGCGTAGTGAAATTGAACTGCGTGAGAGAGGCATCGGTTGCGTGGAATTGAAGGAGATTTGGACGGAAGATGAGCCACAAGAGGAAGGCAGCAATGCCGAGGACGATGACGACGGTGATGATGATTTGACAGATGAGGTTGAGGATACAGCCGCAGCAGCAGTTGCAGAGGCAGCCGAGACAGCCGCAGCCGCCGTCGCCGCGGCCAGGGCGGTGGTAGGACTTGGAGGAGGGAGGAATGGAAGGGCCGTAGTAAGCTCCGTTGAGATTGGATGCCATTGTTGA MDAMGWISKIVTTSTGPDPPVTQPSVKGSKWVSKIMSCEQNEYSCGRVDQDIGDIQSEIVMEVVIVRRSEIELRERGIGCVELKEIWTEDEPQEEGSNAEDDDDGDDDLTDEVEDTAAAAVAEAAETAAAAVAAARAVVGLGGGRNGRAVVSSVEIGCHC Homology
BLAST of HG10016938 vs. NCBI nr
Match: KCW49000.1 (hypothetical protein EUGRSUZ_K02613 [Eucalyptus grandis]) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 7.8e-05 Identity = 47/105 (44.76%), Postives = 66/105 (62.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10016938 vs. NCBI nr
Match: KAA8516802.1 (hypothetical protein F0562_017088 [Nyssa sinensis]) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 3.9e-04 Identity = 45/103 (43.69%), Postives = 62/103 (60.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10016938 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A059A6N3 (Uncharacterized protein OS=Eucalyptus grandis OX=71139 GN=EUGRSUZ_K02613 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 3.8e-05 Identity = 47/105 (44.76%), Postives = 66/105 (62.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10016938 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5J4ZGS4 (Uncharacterized protein OS=Nyssa sinensis OX=561372 GN=F0562_017088 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 1.9e-04 Identity = 45/103 (43.69%), Postives = 62/103 (60.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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