HG10013854 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAGTTTCTTCAAGGTTTGGATTGTTTTCGTTCCTTTAATTTACTATTAAGATCTGGAAAATCCATCTCTAGGAGATTCGTTATCGAATTTCGAAGGTTTAATACTCTTCTGGGCTCTGGATTTTGAACGTTATGTTGTTGGTGAATCAATGCGTGTTTATATGACAATTGTTTTGTACGAGTAGCTGAATATTGATTACTTTGTCGAAGATTTTTTTTGTGTGTGTTCTTGAGTTTTGATTTGGCAAAAACAGAATCGGTTTATGCTATTGCCTGATCTGATGTTCTCTCTGTTCGAAAAGTAAATAGTAATGGAACTAAAAGTGCTTTCGGTCAATTTGAACAAATCGTTGTTTGTGCAGTGCGTTTACTGTGGTCCACGTTTGCGTCATTCGCTTTTCTTGATTCTTCCATTTTGCAATTATTCCATGGATTCACAGTGCGTTTCGAGTAAAATTCCATTAACAATGATTCTTGTTTCTTATTATTGTTGTTTTTTTAATCTCTGCTCTTCCTCCGGTGGCTTTTAGCATCCTCCCTCTTTATCTAAGTACTTTGCAGTCTGGCACCACACCATCGTCGAATCTTTTCGTGTTTCTTTTCCGACCCAGCTCAGTAGAGTGTACGTTTTATTCTCTATATGTAGTAACTTTTTTTCTGTGCATCTTTCTGAAGATGCTTATCCACTATCCATTCCAAATTTCCTGGTTACCCGTTGTTACTCTCTTTGTCTTTGATAGGCATTTTAGAAAACCGTTAAGGCCTTTTTTTCCTTTTCAAATGCTCGACTTGGAATCTTTCTCTGATGATCAACAACACACAGAGTCGTACTTTTTTTCTTTTTTTTTGCATTTTCTGTTTATCTTTTTCTTAGTGTTATTAATCTGTTTGTTCATCTTGGGAAATTTTATACTGAATTGCTTCTGGTTGGAAACTAGTTATGTACTTAATTATAAGTATAGCCTGATTTCTTATATGGAAGTTACCGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTTTGCAGATGAACTGAATTGGTTAAATTTGTATCAATTTCTTTCATATTAGATTTTATGCGCAATCTACTCCCTTGCATTTTGTATCTTATTACACTATTTTTACCACTAATTTTAGCTAACCGTTTCTAACGGAATCCTCAATCTCTCCCTTTTAAAAATGTTAAAGTTTTATCAATCAAATTTTTCCCAAGAAATTTTTGTAGTAGGACCTTTCGTTGTCATCCTGGAATCTGATCAACTTTGGCGACAGAAGTAAATCCAAAATGTAAGTAGCTGCTCAGCGAAAAGAATTGGTGGAAATCTAATCAAGGTTAGTCAGCTATGTTTAAAGTTTTTTTCTTTTTTCTTTTTTTGATTTGAAATATACGAAGTTGTTTCTGCTAGATTTTTATTTTTTTATTTTTAAGTTTTGAATGTTTACATTTTAGTAATAATGTTTTTACGCTTTTAGTCGGTCTTATTTTAAAAGTAATTTAGTTGTAAGAATAATGTTCTTCATACATGTCTTTTTAAGATCAAAATCCACTAATTTTTTCCTTGGGCCAATTAGAAGCTAAATAAATACATGCATTATATGTAAAAGATCGTTTTGACAGATGCCAACCAAGGCATATCGATACTCTTAGCCCCACATCAAGGCCGCTTGTGCAGCCTAGTCAGATGTCCAATTGTCCAATAAATATTGCCTTGTGGCAATTTTTTTTTCTTTTTAATTTTTTTAAAAACTGTCTGCAAGCACCTGATCATTGTCCATAACAAAAGGGTAAAGAAATGGGTTTGATTATTTAATCTTTTCTATAATATGAAATTAGGAAGAGCCTTTGTAGTGAAGATACCTAATACATACTGCTTGATTTCTTTCAAGCAAAAGAAACAAAAACAAAAACGTCAAAAAAACAATTTTAAGTAAGAAGAAAAAGAGTTTCTCACAAACAAATTGTGGTGGTAGAAGTTAATGATGCATAGAAGTATTTTTCAATTCTTTTATTTCACGTTAAATCAAACTTACAGAGGTAGATATTATGAACAGAATTTGAAATTACATTTTTCAGTTTAGGGAATTTGGCTACGAACCCTTTTGTGGAAGAATACAAAAACAAAACAAGTGGAGATATTTCCCCAAGTTTAGTATAATATTCCTTTCTACAGTAACAAAACTGTGGCATGAGTAGGCAGGGTATGGCTTTATAGAACACAGGATCGTGGGTGTGGGCCTGATTTTGGGCCCTTGAATGAGCTTTGTACTGTTTGGAAGGTTTGTTGGCCCAGTCTGATGGGCCACGGCTCTTCAATCAGTTATGTACAGTTCGAATTTCTAGTTGGCGCTGTTCGTATTTGGTTTTGGTTCGATAAAATTGACAACTTCAAATTGATTTTCAAACATCAATAAATAAAGTCATCTACATAGTATATAAACACAGATGAACTTAATGTTCAATATATATCATAAAACAAAAAATATAAATATATAAACGAATATTTATATCACAGTATACATCGAAAAGTTGAAGAATATATATATCACAATATATATCGAAAAATTGATCAAACCATGATGGTTAGATTTTGGCAGGTGCATTGCCGGAGGGAGAACCACGGCGGCAAGACTTGAAGAAGAAATCCATGGCAGCGAGATATGAGGAAGAAGCCAACGACGACGAGATCTTGGCAGGTTGTCAAAGGGAGGTGCCTCGTCAGAAGATTGGAAGCTTTGGTGAAGATGGAAGTGAGGTTTGTGAAGGGGAGAGAAGTCATTTTTGGAGGAAGAAGATGAGGAGAGTGAGGAGAAAGTTATTTTGAGTATTTGTCGAACACTCCAATTTTTTCTATAATGACTTATTTTTTAAATTAAATATTTAAAAATGTATTTCAAACACCATTAACTTTAGGTTTCTCGTTTTTTTATGTAACACACTAGTAGAAGTTGTAATAACGTTGTTTGTATTTTGTTTGGACGGTAATTTCTCATTCTCAATCTATCATACATAGACATATTTGGAATTTTTTTTAAACAATAAATTTGAAATTCTCATTTTAGTTTCATTATTCTTAGATTTTATTTTTGTATTTTTTTAGGAGAGATTTTATTTTTTCTTTTGTATTATTCTAAAAGTGAGGCAGCAAAAACAGAAAAGTTTGTGGCATTTTTGTTAGAGAGCAAATGCTCTTTCCACATTCACACAAGATGATGGAGAACATGTGGAGGAGAAAGTGGAAGTGGGCTGCCCACCCTTGTTTTGTTTTGTTTTATATTCCTTACAAATAAATTAATTGTAATTTTTTTTAATAAAAGAATTAAAATATCATTTTTGGTCTTTATATTTGAGTATCATTCTATTTTAATCTATATATATAATTTTAAAAGCTAAATTATAACAAGTAACAATTTTATGAATAATAACCAAGTGTGTAGCAACATTTAAAAAAAATTGCAAATATAACAAAGTCTATTGTTGACAAACTTTTATGGTCTAAGTAGTGATAGACTATCAGTGATAGAATTAATTTATTCCGATAGACCAACTGATAACTACTTAGACTACTTAGACCATAAAAGTCTATGAATGATAGAAGTCTATCACTGATAGATTTTGTTATATTTGCAATTTTTAAAAAAATATTGCTATATATGCTAATATTTTGAATCTAATTGCTATTTGCAACGGTCCTTACAACAATATCCTTAAACTTCATCATTTGTCCCAAAATACTTTTATACTTTAGAATAAAAATCGAAACTCAGTACTATGTGGTAATAACCTAAAATGTTGTAGTCATTGTCCGTCACACTATTTCATATCTTAACTTTTGTTGAAAATTCTAAAAAAAAATCTACTCTAATGGTATGTTTGAAATGTTTATGAAAACTCAAGGGTAATATTACAACTTTTGAAAGTATAGAGGAATTTTTAAAATAAATGGTCGAATATATATATATTTATTTAGCCCATGCAAATGGAAGAGTTGTTTTCAAAGGGCTAATTTAGTGGAGAAAAAGGCTCCTCAATTTCATTGTCTTTGCCTGCCAATGGAAATGACAAAACTACACAATGCTCCCATTCTCATAAATGTGATGTTTCCATTGCACATTGTCCTTTTGAAATTCAACTTACACAATAATATATCATTGCTTTTATTGAAACCAATCTTCTATTTATGGTTCTCATTGTTTCATTTGTCTAGCATAATTGAAATATTCAGTGATACATCGATATATTTGTAAATCGATATTAAAGTTTAATTAATATCTTTTATACACTCAAACATCAAAATGAAATATTACTAATATTATCTATAATTGAATTTGGAGGTAAAAAATAGCTTACTTAAATTTCTTTATTTATAGAACATCTGTGATGTCGATAATTTGTCATATATCCATAAAATTTAAGTGTCGGTATCGATGTTGACATCGATAGGTTAATTATGGAAGATATGAATTTAGGGATGTCATCTGTTGTTGGATGATTCATGTAGTGTGGACGGTTTCTAAAATATGATTTTAATCATTTTAAATTTTATATTTGAAAATTAAACTTATAAATGTGAATGCGAGTTCGAGTCAGTGACTTGTGAGTTTATTTGTTTTGCTATGTAATCCCTAATAATGTTTTCAAGATTAATGTGAAGTTTTGAGAACTATGAGACAAACAAAAAACAATAGTTTCAAAAATAGCTTTTATTGATTTTTTTTTTTAAATCTGGACAATAATTTCTTTAGAAAATGTTAAAATTATTATAAAATAAGGGTAAAAAAACTAAACGCTTAGGGTCTATTTGATTTGCAATCCATATTTTGTTTTATGTTTTTATGTTTTCAGATTCACTGAATTCAGCGAATATGTGTTTGTCATACAACTCGAATTCTATGTCTGAAAACTATTTTCGAATTCTGTGATTAAAAAAAATGTAAATTCTGAAAACAACATTTTTATGTTTTTATCGTATCTAGAATTTGAATGTTAAAATTTAAAATGCATA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ATGCAGTTTCTTCAAGGTGCATTGCCGGAGGGAGAACCACGGCGGCAAGACTTGAAGAAGAAATCCATGGCAGCGAGATATGAGGAAGAAGCCAACGACGACGAGATCTTGGCAGGTTGTCAAAGGGAGGTGCCTCGTCAGAAGATTGGAAGCTTTGGTGAAGATGGAAGGTTCAGTGGAGCTTCCGGTGAAGTAGCTTTTGAGATTGAGTTTGTTGAGAGATGCTGTTCCGGTTCCGCAGTGAAACGCCGCTGCGAAATCCGTTTCTGGACTCAGGGGTTCTACGAGTCTATTGAAGTCCGTGACCTTTCTCGGCGCCCAACCTTGTGTGCTTGCCTTTTCCGGTTTTCCTCCTTAAGTTTCCTTAATGCAACTTTTGAGAACTGGCGAAAATCATCCAAACACATACCTTCAGACAAGTATCCAAATTGCCAGAAAAGACGGACAAACATTGCGGTGTATCTTGTTGAGCCAGTTGGCTTTGGAGCAGTTCTGGATGTCTTATTCTTTCTTGGAAGTAGTATGATAGTATCTGACTACGGTCCAAATAACAATAATTACCGAAGTTTCTGCTTTCGTTTGGGCTGGATTATGACTTTTAATGGTCTTGAGAGTTGCGTTTTAAACAATCAAACCTTCGAAAATGAAAGCAGATCGAGCAGAGCAGATGAATGTACAACTGACTCACTAGAAGATCATGATTCAAGCTCTTCTTCTAGCAAGGATGCTAGTGGATCTTTCTCCTCAAAATGGTTGGCAATGCATAGGGACGAGCAGGATTTGGATGAGTGGGAACAACCAGAAAGCCCTCAGCATTTTTACATGAAAGAGAAACATGATTACACTCTTCAGGTTTCAGACATAGAAGCAATGAAAGAAAAGTTCACAAAACTATTGCTTGGTGAAGATGTCACAGGAGGGCAGAAAGGGCTGAGCTCTGCGTTGTCACTGTCAAATGCCATCACCAACCTAGCAGCGTCTGTCTTTGGAGAACTATGGAAATTGGAACCTCTTCCTGAGGAGAGGAAGAGTAAATGGAGAAGGGAAATGGACTGGTTGCTCTCTCCTACCCACTATATGGTTGAATTGGTTCCTACAAAGCAAAATGGTACGGGCGGTAGAGTGATGGAGATAATGACTCCAAAGGTTCGGGGAGACGTTCACATGAATCTTCCCGCTCTCCAGAAGTTAGACTCCATGTTAATTGGAACATTGGATTCCATGGTGAAGACAGAGTTTTGGTATGCAGAAGTTGGTAGCAGGGCTGAAGGAAAAAGCAAGAGTATGGGCCAAAGCACGAGATGGTGGCTTCCATTACCACAAGTACCATCCACTGGGCTATCTGAGAATGAGAGGAAGAAATTGCTCAACCATGGCAGGGTTGTACATCAAGTATTCAAAGCTGCCAAATCCATCAATGAAAGTATTTTGCATGAAATGCCCGTACCAACTGCTGTAAGGGAGGCAGTCCGAGCTTCTGGAAAAGCAAGTATGAGCGAAGAACTCTACAAGATTTTGACATCAGAATCTGGTCCAGCTGAGAACATGCTGAATCAGCTTAATCTGAAATCCGAACATGACGTTCTCGAGGCCATAAACCGCCTTGAAGCTGCAATATTCTCCTTGAAAGAGAAATATACCGAACAAAGTGGCAATAAATCTCCAGTTCGAACTTCTTGGCCTTTTGTCAAGGACCCAACGGCTGGGATTGATAAGTTGAAATTACTCACTGATCAAGCCGAGGTTCTTCTACAGCTACTGAAAAATAAATATCCAAATCATCCCCAAACGTTTCTGGATGTTTCAAAAATCCAATATGAGAAGGATGTTGGGCATTTGATTCTGGAAGCGTATTCGCGGGTGCTCGGAAACTTAGCTTACAGCATACTGTCTAGAATTGGAGATGTTCTGCAAGTGGATGCTATGTGCAACCCAAATTCACCTGCACCAACATGTTGTTTTCCAGGGATGAGTCTGTTGAACAATCGCAGCGATCAAATGTCCGCTCTTCATTCGTGGCAGCCGCTTATCGGTCACTCGAACAGTCCCAATATGACTTTGCCATCCAGCAAAGTTAGTGGAAACTCTCCGACCGCAACCCCGAGCCGAAACCGAGCATGGTGCATTGGCAGAGAGATCAAATTCACCCGCCAACTTTTCCCTGCAATCGAATTGGTTGGTGTATTAATTGAGTTCATATTTATTTTATTTCCTTCTCCAAATCCTTCTCTTCCCCTGCAAATGGACTTGCCAAGATTCGGCCGTCCAAAGGAAGACAATGGATCCTCTTCTTCTAGCCCTAATCTTTACGTTGCAAACTGTGGACCGGCCGTCGGAATCAGCCACCGCACAGTTGCGGCGGTTTTCGGCGATTTTGGGCTCGTGAAAGGGGTTCATGCCGCCGACGAAACGGGCGCTCGCGTCATCGTATGTTTTTCAGAAGAATCGAGTGCCCGAGCCGCCCTTGAGGCGCTTCACGGCCGCCCTTGCGCTCTCCTTGGAGGCCGGACTTTGCACATACGTTATTCGATCATCAGACCATCCATTTCGCACCCCAATGATTCTGTTTCAGTTTCTTTGTCGGCTTCGGAGCTGGACATTCCCGGACTTTTCTTATTGCACGACTTCGTCAGTGCTAAAGAAGAGGAGGATTTGCTTATGGAAGTTGATGCTCGTCCTTGGAATAATCTGGCGAAACGTAGAGTTCAGCATTATGGGTATGAGTTTTGTTATCAAACGAGGAATGTTAATACTAAACATCAGTTGGGGGAACTTCCATCATTTGTTTCCCATGTAGTTGATAGGATCTCCATGTTTCCAAACGTTGAGAATGTTGCAGATGCTTCTCTTGATCAATTGACGTATGAGACTGAAATCAATACCACATTACAGGTTAATGAATACCCACCTGGGGTGGGTTTGTCCCCTCATATAGACACCCATTCTGCATTTGAAGGATTAATTTTCAGCCTTTCCTTAGCAGGGCCATGCATTATGGAGTTTAGGAGATATCCCGAAGGCACTTGGCACAAATGCCCTTCAAGTATAGATTTGAAAATGGGGAATTCTGTAAACGACTCAAATTATCTAAGGAGAGCCATTTACCTTCCACCTCGGTCTATGCTATTACTGTCTGGAGAGGCACGTTATGCTTGGCATCATTACATTCCTCACCACAAGATTGACATGGTGAAGGACAGTGCTATCAGAAGGGGTCCTAGGAGAGTTTCTTTTACATTTCGCAAGGTTTATGTGAAGAGTCGTTTTTTCCCACATTCTCCATCCTCTTGCCTTAGGTGGAAAGCTCGATCGCAGGCAATTTTAGCAGTTCTTAAGAATCTTGAGGCTGATTTTCTCTGTCTACAGGAAGTTGATGAATATGATAGCTTTTACAAAGGAAATTTGGAAAAATGTGGATATTCCAGCTTATATATCCAGAGAAGTGGGCAGAAACGTGATGGATGTGGGATTTTCTTCAAGCATGAAAAAGCTGACTTGATCATAGAGGATAGAATTGAATACAATGATCTTGTAAACTCTATACAAGATGATGGTTGTTCTTGTGAAGATAAGTCTGAAGATGTGGTAACCAGTGCTAGTAATGATGTTGAATCAAACAAGGGTTCGTCACCAAAAGCTACTGTCGCCGATCGTGGGGATCCTAACGATCCCCGAGTAAGATTAAAACGTGATTGCGTTGGAATTATGGCTGCTTTCAAACTCAAGAAGCCTTTTCATCATGTTGTAATTGTAGCAAACACTCATCTTTACTGGGATCCAGAATGGGCTGATGTCAAGATCGCCCAAGCCAAATATCTTTTATCGCGCCTAGCTCGATTCAAAACTTTAGTAGCTGAAAAGTTTGAATGCACACCCTCAATACTTTTGGCTGGCGACTTCAATTCAACCCCAGGAGATAAGGTATACCAATACCTTGTTTCAGGCAGCTCTTCTTCTGGATTTTCCCCTGAAAGCTTGGAAGAGCTTCCTTTACCCCTTTGTAGTGTGTATGCTTCTATACTAGGGAGTGAACCTTCCTTTACAAACTTCACTCCTGGCTTCACTGGTACTCTTGATTATATATTTCTCTCACCTTCTGACTCTATGAGACCAACTAGCTTTCTAGAACTCCCAGAATCAGAATGGCCAGAGGTTATTGGTGGGTTACCCAATTTTAACTACCCAAGTGATCATCTTCCTATTGGTGCTGAATTTGAAATCACAATGGAATAA MQFLQGALPEGEPRRQDLKKKSMAARYEEEANDDEILAGCQREVPRQKIGSFGEDGRFSGASGEVAFEIEFVERCCSGSAVKRRCEIRFWTQGFYESIEVRDLSRRPTLCACLFRFSSLSFLNATFENWRKSSKHIPSDKYPNCQKRRTNIAVYLVEPVGFGAVLDVLFFLGSSMIVSDYGPNNNNYRSFCFRLGWIMTFNGLESCVLNNQTFENESRSSRADECTTDSLEDHDSSSSSSKDASGSFSSKWLAMHRDEQDLDEWEQPESPQHFYMKEKHDYTLQVSDIEAMKEKFTKLLLGEDVTGGQKGLSSALSLSNAITNLAASVFGELWKLEPLPEERKSKWRREMDWLLSPTHYMVELVPTKQNGTGGRVMEIMTPKVRGDVHMNLPALQKLDSMLIGTLDSMVKTEFWYAEVGSRAEGKSKSMGQSTRWWLPLPQVPSTGLSENERKKLLNHGRVVHQVFKAAKSINESILHEMPVPTAVREAVRASGKASMSEELYKILTSESGPAENMLNQLNLKSEHDVLEAINRLEAAIFSLKEKYTEQSGNKSPVRTSWPFVKDPTAGIDKLKLLTDQAEVLLQLLKNKYPNHPQTFLDVSKIQYEKDVGHLILEAYSRVLGNLAYSILSRIGDVLQVDAMCNPNSPAPTCCFPGMSLLNNRSDQMSALHSWQPLIGHSNSPNMTLPSSKVSGNSPTATPSRNRAWCIGREIKFTRQLFPAIELVGVLIEFIFILFPSPNPSLPLQMDLPRFGRPKEDNGSSSSSPNLYVANCGPAVGISHRTVAAVFGDFGLVKGVHAADETGARVIVCFSEESSARAALEALHGRPCALLGGRTLHIRYSIIRPSISHPNDSVSVSLSASELDIPGLFLLHDFVSAKEEEDLLMEVDARPWNNLAKRRVQHYGYEFCYQTRNVNTKHQLGELPSFVSHVVDRISMFPNVENVADASLDQLTYETEINTTLQVNEYPPGVGLSPHIDTHSAFEGLIFSLSLAGPCIMEFRRYPEGTWHKCPSSIDLKMGNSVNDSNYLRRAIYLPPRSMLLLSGEARYAWHHYIPHHKIDMVKDSAIRRGPRRVSFTFRKVYVKSRFFPHSPSSCLRWKARSQAILAVLKNLEADFLCLQEVDEYDSFYKGNLEKCGYSSLYIQRSGQKRDGCGIFFKHEKADLIIEDRIEYNDLVNSIQDDGCSCEDKSEDVVTSASNDVESNKGSSPKATVADRGDPNDPRVRLKRDCVGIMAAFKLKKPFHHVVIVANTHLYWDPEWADVKIAQAKYLLSRLARFKTLVAEKFECTPSILLAGDFNSTPGDKVYQYLVSGSSSSGFSPESLEELPLPLCSVYASILGSEPSFTNFTPGFTGTLDYIFLSPSDSMRPTSFLELPESEWPEVIGGLPNFNYPSDHLPIGAEFEITME Homology
BLAST of HG10013854 vs. NCBI nr
Match: CBI29214.3 (unnamed protein product, partial [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1118.6 bits (2892), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/903 (64.89%), Postives = 686/903 (75.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. NCBI nr
Match: CAN76404.1 (hypothetical protein VITISV_021238 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 1084.7 bits (2804), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/952 (60.50%), Postives = 683/952 (71.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. NCBI nr
Match: ESR46132.1 (hypothetical protein CICLE_v10004016mg [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 1057.7 bits (2734), Expect = 8.5e-305 Identity = 549/895 (61.34%), Postives = 670/895 (74.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. NCBI nr
Match: GAY53536.1 (hypothetical protein CUMW_149840, partial [Citrus unshiu]) HSP 1 Score: 1045.0 bits (2701), Expect = 5.7e-301 Identity = 545/895 (60.89%), Postives = 664/895 (74.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. NCBI nr
Match: GAY53535.1 (hypothetical protein CUMW_149840, partial [Citrus unshiu]) HSP 1 Score: 1037.3 bits (2681), Expect = 1.2e-298 Identity = 545/904 (60.29%), Postives = 664/904 (73.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q56WM6 (Rop guanine nucleotide exchange factor 14 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ROPGEF14 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 563.9 bits (1452), Expect = 5.0e-159 Identity = 306/545 (56.15%), Postives = 385/545 (70.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8MS41 (Carbon catabolite repressor protein 4 homolog 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CCR4-4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 421.0 bits (1081), Expect = 5.3e-116 Identity = 213/339 (62.83%), Postives = 260/339 (76.70%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RWY1 (Alkylated DNA repair protein ALKBH8 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ALKBH8 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 413.7 bits (1062), Expect = 8.4e-114 Identity = 220/339 (64.90%), Postives = 256/339 (75.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LZN0 (Rop guanine nucleotide exchange factor 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ROPGEF7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 320.9 bits (821), Expect = 7.4e-86 Identity = 198/503 (39.36%), Postives = 302/503 (60.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LV40 (Rho guanine nucleotide exchange factor 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ROPGEF8 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 310.1 bits (793), Expect = 1.3e-82 Identity = 173/426 (40.61%), Postives = 260/426 (61.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy TrEMBL
Match: D7TFE1 (Uncharacterized protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_02s0087g00460 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1118.6 bits (2892), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/903 (64.89%), Postives = 686/903 (75.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A5B3V2 (Uncharacterized protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VITISV_021238 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1084.7 bits (2804), Expect = 0.0e+00 Identity = 576/952 (60.50%), Postives = 683/952 (71.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy TrEMBL
Match: V4SZ85 (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina OX=85681 GN=CICLE_v10004016mg PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1057.7 bits (2734), Expect = 4.1e-305 Identity = 549/895 (61.34%), Postives = 670/895 (74.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2H5PME3 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Citrus unshiu OX=55188 GN=CUMW_149840 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1045.0 bits (2701), Expect = 2.8e-301 Identity = 545/895 (60.89%), Postives = 664/895 (74.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2H5PN53 (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Citrus unshiu OX=55188 GN=CUMW_149840 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1037.3 bits (2681), Expect = 5.7e-299 Identity = 545/904 (60.29%), Postives = 664/904 (73.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. TAIR 10
Match: AT1G31650.1 (RHO guanyl-nucleotide exchange factor 14 ) HSP 1 Score: 563.9 bits (1452), Expect = 3.6e-160 Identity = 306/545 (56.15%), Postives = 385/545 (70.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. TAIR 10
Match: AT1G31500.1 (DNAse I-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 421.0 bits (1081), Expect = 3.7e-117 Identity = 213/339 (62.83%), Postives = 260/339 (76.70%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. TAIR 10
Match: AT1G31500.2 (DNAse I-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 421.0 bits (1081), Expect = 3.7e-117 Identity = 213/339 (62.83%), Postives = 260/339 (76.70%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. TAIR 10
Match: AT1G31500.4 (DNAse I-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 421.0 bits (1081), Expect = 3.7e-117 Identity = 213/339 (62.83%), Postives = 260/339 (76.70%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013854 vs. TAIR 10
Match: AT1G31600.1 (RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein ) HSP 1 Score: 414.5 bits (1064), Expect = 3.5e-115 Identity = 221/343 (64.43%), Postives = 258/343 (75.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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