HG10013735 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGGACCTCAAGAATGTCAATTAGAATTGAATTGGCCAACGAGACAAAAAATTTGCATTAGTTTAGCCAAAGGTTTAGCTTTTCTTCATGAGGAGTCAGGATTGAAGATTGTTCACCGAGACATCAAAGGTACTAATGTATTGTTAGATGAAAATCTCAATCCAAAGATATCTGACTTTGGTTTGGCCAAGCTTGATGTGGAAGAGAATACCCACATGACCACTCGGGTCGCTGGAACATTGTGAGTCATTATGATTAAATGGTTCTTTCTGCATTATCCAAATAATTCTTTTGCTGTTTTTTCCAATTTAGCTGTCAATATAAGTATAGTCATTAACAAATAGTCATTTATGCTTTTGTGGATTCAATCCACCAATCCCAAGCCTAAACCAACGTGAGCAGCCCCTTGGAACGGAATATAATAAATAATAGTTATTTGATGTCAAGATCAAGTTTAATGGAGTTAAAATTTCTTAGGCTTGGTGCTCCTAACATGAACGATGTTTGAAGTTTTGGCATTTATGTTTAATGATCTTACAAATGTTAGATAGCTAGTATTTATGCCTAATATCATACTTTTGCAGCGGATATATGGTCCCAGAATATGCAACACGAGGCTACTTAACTGATAAAGCAGATGTTTATAGCTTTGGTATTGTAACATTGGAAATAGTTAGTGGAAGGAACAACACTATATATCGGTCAAAGGAAAAGCGTCTTTATCTTTTTGATTGGGTAACTTGATTTCATTTTTGTATAATTGTATAATTGACTCAGGTCTTATGTGACTCGTCTTTGGACATGCCATGTACCAGTTCTTCCACTTCCATTTAGACTTGGATAAGGTATGTGGTATATCTAAGCTTTGATTTTCTTTTCTTTTTTTCTCGTTTATTGATTTAAATACTATTTTTGTCTTAGTACTTTCGGTCTCAGTTTATTTTGGTCTATGTATTTTCAATTATTTTTCTTTTTAGTCCATGTTCAAAACATCGGTATTGGTCCCTTGAAAAAGTTTACTACTTTTATCCTTGTTTTGCAAAATTTTAACACATTTTATGCACGATCAAAACTCTTTATTACAAATTTAAGGCTACATTTTAAGAAAGTGAGTGAAGTGTTGTGCTAAAGTTTTGATGGAGAGAAATGAAGTGAGGTAAAAATTAAAATGAAGGGACTAAAATTGTCACTTTTTAAAAGTATAGGGACTTAAACAAATATTTTGAAAGTACAATAACCAAAATGAACGAAAGTTGAAAGTACATGGACTAAAATGGACGTTTTGAAAGTATAGGATCCAAACGAAACTAGAGTCGATAAATGACCAAAATAGTATTTAAATTTATAATGATCAAAGCTTAGACATACACGTAACATATTCAAGACATTGTAAATGCAGTTTCAGAGTCTAGTTTCTACTCTAAATTGATGTGGAAGAACTGATACACTTAAAATATAGGAGAAATTAAATTTTCTTGTACTTTGTTCTACTTGAATATGCTTTTGAGATCTGCAAGCTACAGTTTCAACAAGCTAAGGCAACTCTTGGGTGATTAAACTAAAGAAGATGGTTTTTGGTCCCTGTTTACCATGCTTATTATTGGCTTTAATTTTGTAGAAACCATAGTTCTTGTGTGTAAAAGCATTCCTTAAAATTGTTATCCACTTTTTCTGTCTTTATTAATAAGAGGTGTATATCCAAATTTTAATTTGAACAAATTTTGTATTTTCTTGTTTGTTAAATCAACCTTTTGAATTTTTGTAAATTGTGTAGTTTAATTGGCATATTAGACATCTTGATGTTCATAGTGCTTTTTTGAATGGTGATCTCCATTAGGATGTTTATATGGTTTAGCTACTTGGGTTTGTTGATAAGGATAGACTCTAAAAGACATTTGTACGGTTTGAAGAAAAGTCCTTGTGAATGGTTTATAAAACTGAGTAATTGGTCTTTTGGGCTACAATTTCTCTGCTTCTAAATTAGATTCATCTATGTTTACTCTAGAAATTTTCTTATTGAATATGTGCAATCTAGGTCTTCTTAGGTATGTGAAAGACCTCTTACAAATATGGAAAAAGAAATAAAGACAATAAAGGAAAGATATTTGAGAATTAATATTTATACATAAATATTCATAAATAATAAAAATTCCAACACTCTCCCTCAAGCTGGTTTAAAAATGTCTTCCATAGCCAGCTTGTCAATCAATCTGTCAAATTGTGTCCTTGGAAGACCTTCAGTTAGTACATATGCAATTTGCTATGACGTAGGAAAATAAAGAATATATATTGTTCTTGCTTCAATCTTCTCCTTAATAAAATTCTTATCTACCTCGATATGTTTTATTCTATCATGTAGAACTGGATTATGGACAATAGAGATGGAATAAATCTTTATAGGTGTCTTCAACGAAATCTTAATTCTTCTAGTATTCTTTTGATTCATATGCCTTCACAAATTCTATGAGTTAAATCTCTAAACTCTGATTTTGCACTAGTTCTGGTCACTACATTCTATTTTTTACTTCTCCAAGTAACAAGGTTTCCTCTAACAAAAAAACAATAACCAGAGTTAGATAGTCTATTGTAGCATTAGTATAAACTTCTATTAGAAAATGATTATTATGTTTTTTTTTTTTTAATAAAATACATTTTTTAGGAGATCCTTTCAAATACCTCAAAATTCTATAAGCGGCTTCAAAATGAATCAGTCCAGGAGCATGCATAAGCTGACTAACCATGCTTACGACATATGCAATATCAAGACGTGTATGGAACAAATAAATTAATCTTCCAACAAGTCTTTGATATCGTTCCTTATTCTTTATTTCTTCAGCCCCAGTGAGCACAAAAAGTTGTCGGGAACTCGCGTTAGATCTAGAACCGCAAATAAGAGGATTCTAAAATGGTGAATTTCCCTGGGACAACAAGGCAACCTTCGACGAGCACTAGTACTCGGATATCCACTTCCGACGAGTGATAATCAAACAGTTGCGAGTACTGACGGCGGCGTTGGGTTATTATTGACATGTGGCTAGGGTTCGAATTTGCAAACACAAAGACTCCAACCAAAAGTAGGTTGCGCCATTGAGGTTGGCGGCTAGGATTCTGGTGGAGGTAGAGGGTAGGTTTTTGTGGTGGCTAAAAATTTTTAGGATTTTTTTTTAAAAAGCTAAATCTGCTTTGATACCATCTAAAAATTAAAGAAATAAAATTGTTATTCTCCTTTTCTTATTGAATAGGTGCAATCTAGGTCTTCTTATATAGAAGAAAGACCTCTCACAAATATGAAAAAGAATATAGTCAATAAAGGAAAGATATTTGACCATTAATATTTATACATAAATATTCATAAATAACAAAAATTCCAACATTTACAATGTCCGCAGCATTTTGTGTTGATCATTATACTAGTTTATGTTGATGACATATTAGTTGTTGGGAAATCCTTTGCAGCTCGATCAACATTTCATTTCCTTCCTTAATTCTTTGTTTGCTCTTAAAGACTTGACAATCTTTCTTATTTCTTAGGCATTGAAGTAAAGAGAACTCCCTTAATATATATAATATTAAATTTATTTTCTTTTAAAGTAAACTAGTCGTTAGATACAAACATATATAATATTAAATTCATTTTCTTTTTAAAACGAATTCAAAAATCAAAAGCCCACTATGTATATTCCTCTCTTGCTCCAAGTGGTACCTTTCAATTGATCCACTTTGATTATTAAAACTAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATCTCCCACGTCATCAGCTTGGGATTTTACCGTTAAGCTTGTTTAGGCTATATCTTCTTCGCTTGAGCTCCGATTTGAGTGATTCAAATTGTGTTGGAATCGTTGTTCCGAGCTTTACACAATGAACTCTTCAAAATACTCAAATTATTAGTGAATATAAACAAGTTTGTTGTCATCAAAATATTAATTAATTAATGAATTAATTTGGGCTTAAGGGCCAAAAAGTTAACAAATATTTTTAGGTTTGTTTATCATTTATTTTTTGCTATATTTTCTGTCATTCATTGGTCTATCATGTGGCTTGTATTTTTCCTATATATGTTGGTCTCTACTCTCTCCTTCGAATCAATAAAGAATACTGACCTTTACTCGATATATTGATTATTACAGATATAACAATAATCCTTGAAGTATATATGCAATATGATTGTATTTTCTTTAGTGCAATAAGTGGGGTATAGTAGTTTGAACCACTCGAATAAGGTAGAACATGACAATTACTATTAAGTTATGCTCATAATATATATGTGTGAGATCATCAAATGATTTGCTTTATTTCATTTTTAATTCTAAAATAGAATATAATTTAGTCATTACAATAATAAAAGTTCTATTCTTTACACTGATTTTATTTGGATTGTCATCTAATTTGTTGTGTGAAACCATTCTTTTATAGGATAAAGTGGTATATTAACTCAAGATTATTCAAGTTTAGAAAATAGTCACAAAAGAAAATCAAGAAAATCATATAGTAATTAATGAAGATTAACAAAAGTTAACATAGATACATTGACTTTGACAATTTAATATCAATAATTCGACCATGTCAACTAAACATACTTTTAAATATGAAAATATTTAATTTCTTTGAGCTTCATTTTTTGCCTTTAGACTTTATGTTTGTATAAAGTTTTGCATTACCAAATAAACAAAGAACTATGCATACAATTCTCACCTAATGAATCAACTTGAATTTAATAAAATCCTTTTATTTTTTCTAATAAATTCAAGTCCAAAGTTTGCAATTTTGTCTCTAATGACTAATTCTTCACTTAATTTTAATCGGTCAACGTCCCAAATGGATAAGTTTCTACAATTAGTTGAAATGGCATTAACCTCTTAAATATTTAATGCAAATTTTATAAATTTTCTTTTATGATTAACTATTATAGTTTTAATTTGGATTTTTAAAAATAGAAAAATAGGAAAAATTGTTTAAACAAAATAACA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BLAST of HG10013735 vs. NCBI nr
Match: XP_008463778.1 (PREDICTED: probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 5.3e-120 Identity = 255/468 (54.49%), Postives = 264/468 (56.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. NCBI nr
Match: XP_022134083.1 (probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 432.2 bits (1110), Expect = 5.5e-117 Identity = 246/468 (52.56%), Postives = 264/468 (56.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. NCBI nr
Match: XP_022981274.1 (probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 426.4 bits (1095), Expect = 3.0e-115 Identity = 244/468 (52.14%), Postives = 263/468 (56.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. NCBI nr
Match: KAG6607942.1 (putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 422.2 bits (1084), Expect = 5.7e-114 Identity = 244/468 (52.14%), Postives = 260/468 (55.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. NCBI nr
Match: XP_022941244.1 (probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 420.6 bits (1080), Expect = 1.7e-113 Identity = 243/468 (51.92%), Postives = 259/468 (55.34%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SUM2 (Probable small nuclear ribonucleoprotein F OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g30220 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 163.7 bits (413), Expect = 4.8e-39 Identity = 75/86 (87.21%), Postives = 83/86 (96.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3T0Z8 (Small nuclear ribonucleoprotein F OS=Bos taurus OX=9913 GN=SNRPF PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 140.6 bits (353), Expect = 4.3e-32 Identity = 63/80 (78.75%), Postives = 73/80 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P62306 (Small nuclear ribonucleoprotein F OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SNRPF PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 140.6 bits (353), Expect = 4.3e-32 Identity = 63/80 (78.75%), Postives = 73/80 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P62307 (Small nuclear ribonucleoprotein F OS=Mus musculus OX=10090 GN=Snrpf PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 140.6 bits (353), Expect = 4.3e-32 Identity = 63/80 (78.75%), Postives = 73/80 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P62321 (Small nuclear ribonucleoprotein F OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=snrpf PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 140.6 bits (353), Expect = 4.3e-32 Identity = 63/80 (78.75%), Postives = 73/80 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CK33 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501841 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 442.2 bits (1136), Expect = 2.6e-120 Identity = 255/468 (54.49%), Postives = 264/468 (56.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L381 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G623400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 437.6 bits (1124), Expect = 6.3e-119 Identity = 251/453 (55.41%), Postives = 259/453 (57.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C115 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006439 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 432.2 bits (1110), Expect = 2.7e-117 Identity = 246/468 (52.56%), Postives = 264/468 (56.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J1F7 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480457 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 426.4 bits (1095), Expect = 1.5e-115 Identity = 244/468 (52.14%), Postives = 263/468 (56.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FMQ6 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446605 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 420.6 bits (1080), Expect = 8.0e-114 Identity = 243/468 (51.92%), Postives = 259/468 (55.34%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. TAIR 10
Match: AT4G30220.1 (small nuclear ribonucleoprotein F ) HSP 1 Score: 163.7 bits (413), Expect = 3.4e-40 Identity = 75/86 (87.21%), Postives = 83/86 (96.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. TAIR 10
Match: AT4G30220.2 (small nuclear ribonucleoprotein F ) HSP 1 Score: 163.7 bits (413), Expect = 3.4e-40 Identity = 75/86 (87.21%), Postives = 83/86 (96.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. TAIR 10
Match: AT3G14840.2 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 2.0e-32 Identity = 63/80 (78.75%), Postives = 72/80 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. TAIR 10
Match: AT1G53420.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 135.6 bits (340), Expect = 9.9e-32 Identity = 62/80 (77.50%), Postives = 73/80 (91.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013735 vs. TAIR 10
Match: AT1G53440.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 121.7 bits (304), Expect = 1.5e-27 Identity = 57/79 (72.15%), Postives = 68/79 (86.08%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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