HG10013729 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTGGAAACCGGCTCAGTGGTCAGATTCCACAAGAAATTGGTGATATTGCTTCGCTTGAGGAATTGTAAGGGACAATTTTATAACATTCTTGTTTTTTATTTTGTTATTTTATTATCTATAAAAGATAAACTTTGAAGTGATGTGTTACATCTAATTATAATAACTTAAACTTTCAATTATATTTAGTAAATCTTTTAAATCTTTGACATTTTTTAAGGTCAAATAAGTCAATAACCTATTAGGCACAAATTTGAAACTTTAAGATATATTAGAAGAAACTAAAAATACGAAAAATTATTTGACATTTTTTTTTTAAAAAAAAATCATGGACTTAATATAAAAGTAAAAGTTTAAGCCATATTTGGTAACCATTTTATTTTAGAGTTTTTGATTTTTGAAAATTGTGTTTGTTTCCTCTCAAATTCTTATAATAGTTTTCTATCTTCTTTAAATAAAAAAAGTTGAATTCTTAGTTAGATTCCAAAAACAAAAACATATTTTTTAAAAACTATTTTTTTAGTTTTCAAAATTGACTTGATTTTTTTGAAAATAATGATAGAAAGTAAGCCAAACAAAAAAAACTTAGAGGATAGAAAGAATCTTTATAGGCTTAATTTAAAAAAAAAAAAAAATACTTACCCACCAAAGCTTATGGAGATATTTAGACATAAAGTTTGAAAATTAAGAAATAAACTATTTTTTTAAAATAATTTTTAGATATTTAGACATATTAAAAATAATTCTTCCATAATTTTAAGACAAGAAGAGAGAATTGATATAATATTAAATTAATCATAACCCATCCATTTAAATTTTTGAATCAATCGGTGATTTAATATTATCATTTTTCAATCAGGAACTTGGAAGAGAATATGCTTGAAGGAAATCTTCCTGAAAACCTTGGGAAACTCGGCAACTTGGGAAGACTGTAAGTCTGATAAAATGTGATTAATCTTTTCTTTGCAATACAAAAACTTTATAATATGGGTGTCATTATAATTAGAGACCATATATCCTCTCTATATCTCGACAATAGTATATTAATATCCACTTTAGATAAGACTTTATATTAAATAGAGATAATATTTCTCTTACTTTTGTGTTGGAATAAATTATAGTTTGTGATTATTCGTATAGAGTTGCATTGTTTCATGAATGAATGTATCTTTTTAAAATTTAACCAACTTGAAGAAGACACATGATTATTCGAATGGCCACGAATGAATGTGACTTTTCAAAATCTAACCAACTTCAAATTGTTTTTTAAACCCTTTTCATTTGCATTTCTCTCTTAGTGAAACTTTCTCCCTTTTTATAAAGTCGTTGAAGTTCAGTTTATTTCTACAAAATATAGTTCGTTGGACCTTGTGGATGAGGTAATACTTCCATAAGATAAGAAACAATTACTCATGAAACTCATACATTAGAATGATCAGTAAAATTGTCTTAGGAGACCACGTAAAGTCGTTGAGCTCAAATTCTCTCCTATATACAAGGTTATGTTTGAAAAAAAAAAAATATACAACGTTATGTATTTTCTCATATTTTATGATACTATTTATATAACAATTTTAAGACAATTTTTAGTACTTTATTGTGGTTCTTTTGAAAATATACAAAGAAAAAAAAATCTCTTCTTCTAGATTTTGTTTTATTATCCATGATGGCTGGCAGGATTTATATTTTGTTTATTAAATCTTGTGTTATAGATGTTCTGACCAAGTTTTAATGTGATTCTTTTAATTCTATTTTACCGTTCTTGTTTTATATTCATTGATTGTACTATAAAACAATAAATTTTAGAAGAATTATTATAAATAAAAAAATATCAAACTATTTACAAATATAAAAAAATTTGACTGTCTATTCACAATAGATTTCAAAGTCTATCACGATCCATCGCTGTTAGATACTAAATTTTTTTTTTATATTTGTAAATAGTTTTGCTCATTTTTCTATATTTAAAAACAACTTATATTTTTATATATCATATTTTTTTTATGTAGATATAAATATGTATTTGTACACCTGGCTTGTATTTATTTGTGTTTGCTTTTCCCCGTCTGGCAAAAGAAGAGAACATGAAAGGTTTTTTTTAATGAAATTTTAGAGATTTACAAAATAAAGCAAAGAACAAAAACAAAGCATATGTTATTTTAAAAAAATGGCACATATATTTTGGCATAAGTTCAACCTTTTGCATATGTGCAGTGGATTATTATTTGATGTTCTGCACTAATTTTGTGTTTATACAATTATATGTATGAGAATAGTGATTTAAGCCATGTGTATGGCAGTACTTCTGTTTTTTTTCTTTAATTTGCTTATTTTGTTTAATTGGCTTATTTCAGTCCATAATGGGTATTAAGCGAAATGTTCTCATGTCATTTTACATTTCAAGCAATGTCTTGAGTTTATTTGTTGCTTATTGATTTTATTTTGTGAAAACTTGTCCGATAAAGTTATTACTTTGTTTTACAAATATTTGGTGATCAGTTTCTCATAAATGTTATCAACGATACGAAATTGTTGTACCACATGTTAGTGAAAGTAATGGAGAAAAATTAGGCATGAGACATTTAGCAAGTAATGATTTCAAATGATGACAAGAGAAATTTTATTCTCCGTCACAACTTGAAATATGATAAGTTTTATGGGAAAAAAAATGCTATTGTAACATTGAAGGAGAAGCCAACAAATAAAAGTTACTTGCACTTTAGGCATAAAAACACATGCAAAATATTTATGCAAGAGCCACATTTTGAGTGGACTAGATAACACGCTATATAATGTTTATATTGGTAGATTTAGCAAAAATTTATGGGAATCATTAGAGTAGAGATGTCCATAGGGTGGGCCGGGGCGGGGATGGCTTCCCCACTCCCCGCTACCCGTTCCCCATTTCATTCCTTGACCCCGCCAAATTCCCCACAGGGGTCGGGGCGGGGATTCTCCGAGGGAAATTTTTTCCCGTTTGATTTTTTTTTTTTAAAAAAATGTTCGATTAACATAAATCACTATTATGGAAAATTTTAAATTAAATGGTTAACTTTTATATGATTAGTTCTACATGGACAATTAGAATTTAAAGAAAAATTACTCAAAATTTTCAAGTTGAAAGAAATAATTATCTATCAAATTATTCATATATATAATCTAAATTTATTAAAATTCAAACATATCATTTTTTTACACTAATTCAAACATGTTCATTATTTTGATCATTAAATAATAAATCTTGAAAATTAAATATAATATTTATAAAATAAAAATAAACAACATAACATTAAATTACTATAATAAATATAAGAAAAAAGCCTAAGGGGCGGGGGTGGGGAACGGGGCAGGGGCGGGGAATGCATTCCCCATCCACGTCCCCATTTAGCTTTTGGGAATTTTTTTCCCCCACTCCCTCCCTCATTTCCCGCCTAAACGGGAAATTCCCGCTCCGTTTGGTGGGGGTCCCTACGAGACCCGTCTCTGTGGGAAAAGTGGACATCTCTACATCAGAGAAAAACAATATATATAAGCCAGAAGATGTCATAACATTATAATATTGATGGTCGAAAAATTTATGTTCTATAAATGATTGATTCCAAAACCGTGATAAGACACATTCTGTGAATATGTCTAAACATTTGAAGGTCAATTATATTTTTGTATAATTTTTCATATACAAAAGCATAAAAATTCCTTGTAAATTATGGAAAGGTTGAAACCTTCTAAAACTTTATTTTAGTGTTGAGGTATTTAGAAGAAGTGACTATTCTCAAATTAGTAATTCATGTTTAGAACATTGCAAGGAATTTTAAAAGAGGTTGGGATATATTTGAATTTGCTACAAAATTTTGGAAGATATTCAACCTATATCTTGTTTTAATGAATAATAATATGTCTCAACATAGGTGAGAAAGACATTATACAATTAGACAACTACTTTCTAGTGGAATTATTACAATTGACTTTGTAAGTTCAGAAGATAATATCGTGAATCCGCTTATGAAAGGTTTGACTAGAGAGTTGGTTGATAGTTCATCAAAGAGAATGAGATTATAACCTATAATTTTAAAAAGTTAATCAGAGAGGCAATATAACCCAACCTAGTTGACTGGAGATCCCAAAATCTAGGTTCAACGGGTATAAACCGACCTTTGGATAACTTAATGAGCACTGCGCTGAAATTTTAATCTTTTACCCATTCTAGGATGATGAGACAGTGCATGTTTGGTTTTTAGGGTAAGCACTAATGCTTTTAATGATTTTTATAAGTGTTTGAGTATTTATGAGAAGAACATATACGATGTTCTTTATAGGTATCACCCATGTGAGTGTGAATGGGCCACTTCTATGAGAATTTTAAGGCGTATTCTCTACGACACTCATGAGACCAGGCGGTTTTCAAGGCCAAAATGAACACAATTATGAGAACTGACTTTGTTAGAATAAGAAATTATGTGACTTCTATTGTCTTAGTTTACTCCAAAATGGTTGATAGTTCAAGGCATCAAGTACTTTTCCTAATGCAAGTTCTTCGTTGGGAAATACCAAACACTTTATCTTTTATTTTAATTTATCAACTTACCATTTATGGAGATTGTTGGAATAAATGGTATATGACTATTCGTGTAGAGTTGCATTGTTTCATAAATGAATGTGTATATTTTCAAAATTTAACCAACTTGAAGAAGGGACATGACTATTTTTCAAATGATCACGAATGTGTCTATAAATATGTCTCTTCTTCAAATTGGTTTTTAACTCTTTTCATAAGTATTTTTCTCCAATTGAAACGTTCTCCCTTTTTATAAAGTCTTGTAGACGAGGTGTGCTGCTTCTACAAGCTAGGTAATCTGTTATATCTTATGAGATAATTACTCATAAAATTTAGACACTAAAATAAGTAAAATTGTCTTAAAGAAACAACTTAAAGTTACCAGACTCAGATTATTTCCTTTATATAAAGTTGTTTATTTTCTCATATTTTATGATA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ATGGTTGGAAACCGGCTCAGTGGTCAGATTCCACAAGAAATTGGTGATATTGCTTCGCTTGAGGAATTTGATGGATGGTGCCTAAGGAAGGATCTGCCTTGCCCAAGAGAAGCTCGGTTTTATTCATTGTTCATAAATTGTGGAGGAGAAAGAATAGAGGTCGATGGTAATACATACGAAGGCGACGAGACTTTGGGTGGCGAATCCAAATTTTTTTTCATTTCAGAAAGATGGGGTTACAGCAGTAGTGGGGTTTTCTTGATAAATACGGCTGATCAAGGTCCTCCTTTTAAAGTTAAAAAAACTACCAATGCTTCTGCTTCTGCTTCTGCTTCTCCTTCTGTTTCAGGCATCTATGCCACAGCTCGACTTGCTCCTGTTTCCCTCAAATACTATGGATTTTGCTTGCGATCTGGAAGTTACAATGTCAAGCTTCACTTCGCTGAAATTATGTTTAATTCTGATCCCCTCAACTCTACCTCCCTCGGAAGGCGCGTTTTCGACATCTCAATTCAAGAACGTGACCTGCAAGATGAGAAAGTTACACATCGAGAGCTATCAGGAGGAGCCATTGCTGGCATCGTTGTTGCTACTTTTACATTCGTCGTGTCGGTATTGGTTGTTCTTCGAAAGAAGGGTTACTGGGGTGGGAAGGAAACTGAAGACAATGGGTCTGAGAAGCACTTATTACATTTGGATTGGCCAGTAAGAATGAAGATATGTTTGGGAATAGCAAGAGGGTTGGCTTACCTTCATGAAGAATCTAGATTGAAAATTGTTCATAGAGATATAAAAGCTACAAATGTTCTACTTGATGGAAATTTGAATGCTAAGATCTCTGACTTTGGCTTGGCTAAGCTTGATGAAGAGGAGAAAACTCATATCAGCACAAGAATTGCAGGCACAATACGGCTAAAAGGTCAAAATCTAGTTGGAGTTCTACCTGTAGAATTTGCAAATCTAACTGAACTCCGAGTTGTAGATCTGGCTTATAATCTTATATCCGGATCAATCCCAAGAGACTTTGCTCGCATTCCTCTAGTTAGTTTTTCCATAGTTGGAAACCGACTCAGTGGTGAGATTCCTCCTGAAATTGGTGATATTGCTTCACTTGAGGAACTGGTCTTGGAAGACAATCAGATTGGAGGAAAACTTTCTGAAAGTCTAGGGAAACTAAGCCACTTGCGTCGATTACTTGTTTCTGCAAATAATATTACAGGGTCGATTCCAGAATCTTTTCGAAACTTGAGGAACTTGACTGAACTTCGAGTCGATGGAACTAACATATCAGGAAAGATACCTGAATATATTGGCAACTGGACCAAACTTCTTAAATTGTATGTTCAAGGAACTTCTATGGAGAACCCCATTCCTCCTGCCATATCCGAGTTGAAAACCTTAACCGAATTGGTAATAAGTGATTTGAAGGGACCAAGGATAAATTTCCCCAATTTGAGGCAATTGACATCTTTAAAAACATTGGTCTTGAGAAATTGTTTAATCGAGGGTCGTATCCCTGAATATATTGGATCGTTTATTGAATTAAGAACTTTAGATCTAAGTTTCAACAGATTAAGTGGTCCAATTCCAGACATATTTCAGAATCTTTTGGTCCAAAAAACTGAGTTCATAGTTTCCCCTCTCTCTCTCAATTACTATGGATTTTGCTTGTTGAATGGAAGCTACAATGTCAAGCTTCACTTTGCTGAAATTTTGTTTACTGCTGACCAAACTTATAGCAGCCATGGGAGGCGTATTTTCGATGTCTCCATTCAAGGAAAGTTGGTTAAGAAGGATTTTAACATAATGGAGGAAGCTGGAGGTGTTGACTTCAAAGTGGAAACTAATGTGGAAACTAGAGGGCTACCGGCTGGAGCTATTGCTGGCATTGTTGTTGGTATTTTCGTCTTTGTCGTCCTAGTATTTGTTGTTCTTCGATGGAAGGGTTATTTAGGTGGAAAGGAAACCGAAGACGATGTATCAAACATCAAGCGCAACACGACCAATCAAGATGCAAGGTTCAAAGCTTTTGATCAAAAGCTGTCACGAGATAGCCTAACAAGCATTTCAACCTCGACGCAATTGCAAGGCATTGAGATGCAAAAGAACATAGTAATGGATCGGTCATGGATTGACTCCTCATCTACTTCTACCCAAAACAAAGACGAGTATTCTTACAAGTCTCCTTACAGAGTCATTCAAATCAACTGA MVGNRLSGQIPQEIGDIASLEEFDGWCLRKDLPCPREARFYSLFINCGGERIEVDGNTYEGDETLGGESKFFFISERWGYSSSGVFLINTADQGPPFKVKKTTNASASASASPSVSGIYATARLAPVSLKYYGFCLRSGSYNVKLHFAEIMFNSDPLNSTSLGRRVFDISIQERDLQDEKVTHRELSGGAIAGIVVATFTFVVSVLVVLRKKGYWGGKETEDNGSEKHLLHLDWPVRMKICLGIARGLAYLHEESRLKIVHRDIKATNVLLDGNLNAKISDFGLAKLDEEEKTHISTRIAGTIRLKGQNLVGVLPVEFANLTELRVVDLAYNLISGSIPRDFARIPLVSFSIVGNRLSGEIPPEIGDIASLEELVLEDNQIGGKLSESLGKLSHLRRLLVSANNITGSIPESFRNLRNLTELRVDGTNISGKIPEYIGNWTKLLKLYVQGTSMENPIPPAISELKTLTELVISDLKGPRINFPNLRQLTSLKTLVLRNCLIEGRIPEYIGSFIELRTLDLSFNRLSGPIPDIFQNLLVQKTEFIVSPLSLNYYGFCLLNGSYNVKLHFAEILFTADQTYSSHGRRIFDVSIQGKLVKKDFNIMEEAGGVDFKVETNVETRGLPAGAIAGIVVGIFVFVVLVFVVLRWKGYLGGKETEDDVSNIKRNTTNQDARFKAFDQKLSRDSLTSISTSTQLQGIEMQKNIVMDRSWIDSSSTSTQNKDEYSYKSPYRVIQIN Homology
BLAST of HG10013729 vs. NCBI nr
Match: KAG6607938.1 (putative LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 586.3 bits (1510), Expect = 3.8e-163 Identity = 417/1121 (37.20%), Postives = 499/1121 (44.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. NCBI nr
Match: KAE8649820.1 (hypothetical protein Csa_012931 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 485.0 bits (1247), Expect = 1.2e-132 Identity = 263/411 (63.99%), Postives = 300/411 (72.99%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. NCBI nr
Match: OVA14369.1 (Armadillo [Macleaya cordata]) HSP 1 Score: 469.9 bits (1208), Expect = 3.9e-128 Identity = 369/1205 (30.62%), Postives = 465/1205 (38.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. NCBI nr
Match: XP_023525944.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 465.3 bits (1196), Expect = 9.7e-127 Identity = 276/561 (49.20%), Postives = 317/561 (56.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. NCBI nr
Match: XP_022940854.1 (probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 463.4 bits (1191), Expect = 3.7e-126 Identity = 276/561 (49.20%), Postives = 316/561 (56.33%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGG8 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53430 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g53430 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 315.5 bits (807), Expect = 1.6e-84 Identity = 212/583 (36.36%), Postives = 273/583 (46.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGG9 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53440 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g53440 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 302.4 bits (773), Expect = 1.4e-80 Identity = 201/583 (34.48%), Postives = 273/583 (46.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGG7 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g53420 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g53420 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 242.3 bits (617), Expect = 1.8e-62 Identity = 146/435 (33.56%), Postives = 204/435 (46.90%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGE0 (Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g07650 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g07650 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 242.3 bits (617), Expect = 1.8e-62 Identity = 153/466 (32.83%), Postives = 209/466 (44.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: C0LGN2 (Probable leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g14840 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LRR-RLK PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 236.1 bits (601), Expect = 1.3e-60 Identity = 152/455 (33.41%), Postives = 209/455 (45.93%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A200QV80 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Macleaya cordata OX=56857 GN=BVC80_8559g1 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 469.9 bits (1208), Expect = 1.9e-128 Identity = 369/1205 (30.62%), Postives = 465/1205 (38.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J1M5 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480454 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 463.4 bits (1191), Expect = 1.8e-126 Identity = 276/561 (49.20%), Postives = 315/561 (56.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FLH5 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446321 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 463.4 bits (1191), Expect = 1.8e-126 Identity = 276/561 (49.20%), Postives = 316/561 (56.33%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C483 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008221 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 456.8 bits (1174), Expect = 1.7e-124 Identity = 281/586 (47.95%), Postives = 315/586 (53.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. ExPASy TrEMBL
Match: F6H1V3 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_19s0014g00830 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 451.1 bits (1159), Expect = 9.2e-123 Identity = 384/1270 (30.24%), Postives = 468/1270 (36.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. TAIR 10
Match: AT1G53440.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 302.4 bits (773), Expect = 1.0e-81 Identity = 201/583 (34.48%), Postives = 273/583 (46.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. TAIR 10
Match: AT1G53430.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 294.3 bits (752), Expect = 2.8e-79 Identity = 205/583 (35.16%), Postives = 266/583 (45.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. TAIR 10
Match: AT1G53430.2 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 294.3 bits (752), Expect = 2.8e-79 Identity = 205/583 (35.16%), Postives = 266/583 (45.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. TAIR 10
Match: AT1G53420.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 242.3 bits (617), Expect = 1.2e-63 Identity = 146/435 (33.56%), Postives = 204/435 (46.90%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013729 vs. TAIR 10
Match: AT1G07650.1 (Leucine-rich repeat transmembrane protein kinase ) HSP 1 Score: 242.3 bits (617), Expect = 1.2e-63 Identity = 153/466 (32.83%), Postives = 209/466 (44.85%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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