HG10013457 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10013457
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr02: 1697211 .. 1704606 (+)
RNA-Seq ExpressionHG10013457
SyntenyHG10013457
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATCCTTTGGCTCTCCTATCAAATTAATGGACCTTCGAGAGTGTTGGCTCCTGAATTTACTATCGGTTATTTGCAACTATGTTTCCTAAGCAATGGTCCACGAACTGCTAAGTATTCAAGAGAACAAAGTGGACTTGAGGAGGATTGCGAAGTTTCTAAAGGACTACCAGGTATAAGTTTTATGTTTAATTCTTAAATTTTTTCACCATTCTCACGGACCCCAAACATTTTTTTTTATAAGAAACAAATTTCATTGCTCCAAACATCTTTTGAAAGCACTCATGTTTAGCCCATAACTTATCTACCAAAATTTTGGATCAACCAACACTTTCGAAATATGAGATGGTAAGTTGATGACTATTGGCGGTTAATTTCTGCATGATCACCTTTGCTTGTGTGCTTTTTGAGCAGTTACGGTTCAAGTATTGGTCTAATTAAATTTACTGTAATTTGGCTATGATACTATGTTAACTCATAAGCTTAGCTGATAGGTTATGATACATTTAATTATGGCACTACTTCTTCAACAGTTACAAATTTTTGAAATGAGAGTATTTTTGTATAGACCCAATTACACCATAATGTTGTTGTATGCTTTGTGATACGAGAAAGAGAACTATGTCCAATTGATGCAGCTTTCAATAATTTGTATTTGTTTGTTCTGCCAAGTACAAAATAAGTTATTAACTTTTAGATGTCAAAGGCAAGCATTAAAAGAAGGGGGAAAAAACCAATATTCTTTTTACGTGACAGCATTTATATATTTGAGATTGTTTGTATCTACATTGATGAAAAACTGAGAATTGAACCTAACACCCCCAGCTCCGCCCTGTGCTCTCCTCTATTCTCCTACCCCCAAACCTTAACCTTCATCTGGTTTGTTGCTTCGTCTTGGATTTTGCTTTAGAGTTAAGCACCATCTTCTGGTTTAATTGTAAAAGACACATCTTTTATCAGAAAAAAATAAAAGAATATGAGAGCATACCCCAAAAGGAAGCAACGTAGAGAAAGGAGATCCAAATCAAGCAAAATGAGACCAACAAAATAGTTACAAAAGAAATTTGTCACTGAAGGCCAAAGAGAAACCATAAATCTCATGAGGGCTCGAACATCCATAGACTCCCTCTCAATCACCCTAAAATTCATGTTATATCTGTCCCCAAATACTCACAACAAAGAGCACTTTAACTTTTCATAAAAAACTCCATTTTTCTCAAAATGGCATAGGGAGGAGGAACTCCTCGATCATATCCTGAAAAGTTATGCGTTTTTTAGTTGTCTGGTTCTTTTTTGGGTTTCATCTTCTAGTAAGCAATTTCTTCAAGTGCTCAAGTTCAAAAAAAAGTTATGGTCAGCATGGAAAGTAACTTTTTTACCCCTTCATGAGAAAAAAGGTTACAGGTATAGTACTTTTTCCATTAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGATTTTTTGAAGATGGTTGCAGATTTATTTAAGGAATGTCTTGGCAGCAATGACTGCGATGGATTTTGCTTTCCCCTTACTTTCCAACAAGGGTTTTTGCAAAATAGAGAAGGAGGTGGTGATTCCAGAGTTTGAGAAAGTTTTTGTTGTAACAAGACATTCTTTTGAAGTTTGGGGGTATATTTCTGAAACTTTTGATATATTGGTGAAGAACTAGAATACGAGTTGACACTTATATTGAAGACAAAATATATAACAAAGGCAATGTAGTTGGTGCCAACTTGGTGGCCAGGTTGCGTCCCACATCTGATTCTTGGTCTTGGACTTTGGATACTTCTTCGACACCTTCTCTGTTAAATTCTTATTAGACGATTTGGCTGGGGTGGCTGAGCCTATTGTCAAAGACCTTTATTCCGTTATATGGAAAGACTTTTATCTTAAGAAGATTAAAATTTTCCTTTGGGAGCTCAATCTTGGTGTGGTTAATACAACTGATCGTTTACAATGTCGGAAGCCTTATATCTCTCTCGCCCTCTTGGTGTATTATGTGTCAGTGTAATGAGAAATTGCCAGCTCACCTTTTTGTGCATTGTCCCTTTGCTTCTCGTTTTTGGAACACTGTTTTGGAGGCTTTCGACTGGTCTCTGACATGCTCAACCATATTTTTTATATTTCGGCATCTTTTATGGTGGGAATTCCTTTTGGTGGTACCAAAAGAATGATTTGGTTGGCTCTCGCCCGTACTTTCTTTCGGGCTCTTTGGTGCGAGCGCAATGACCGTCTTTTCAAGGATTCTTTCTCCTCTTTTAATAGATTTATGGATATGGTTTTGTCTACTTTATTGGTGCAAGGATAAGCACCCTTTTAATCATTTCGGTTGATTTTATGTAGTCTCCAATTGGAAATACTTTTTGTAATTACCTTTTGACTTTTGGATTTTCCCCTATTTCATTAATCAATGAAATGTTTCTTAAAAAAAATCTTCAAGGAAACAATTTTTTGTAATTATTTTTGCAAACTATTTGAGTGTTTACCGGTATAATTTACAAAATTTGCAACTGGTTGTTATTAATTATTATCCTTATTGAGAAGTGCCAAGTCGTCAAGTCTAGAAAATCAAAGTTTTTTTTTTTCCCTCTCTCCTTTTGTTGTCTCAAATTACAAATATTTCAACTCCTTGTCGCTATAGGTTTGCCTCTTTTCCATGGGGCTGAGGCGGCCATGACTCACCGTTTGACTTCATCTGCCCGTTGTTGCAGGATAAATAGTGTTTAAGCATTATATTATATCTATTTCCTCCATAGTCAAGTTTTATATTACACTAATTTTTTTTCCTGGTAAAGTTCAACTAGGGTTGGGCGTTGGCGAGTTCAAACTTCTAACTTTTAAAATAGTAAGTGATATCTTGATTAGTTGAGCTATATTTATGTGGATTACTTTACTGTCTATCTAACTAGCAAAATCTATTAGAACTCTATGAACTTCTTTCTGCATTTTATTTCTGTATAGCATATGGCTTTAAAATAAATCTAGGCTTCCGTTTGTCTGATATGCATTTTTAGATCATGCTGCTTTCCATTGGCAGAGGGTGGAAAGTTTCAAAATGGAATGGGGAAAGTTTTGTTTTTATACTTACTCAATTTAAACCTTATTCTTGTAACTCCGTCACAGTGAACCAGGCTTAACTTAAATGGCTACTTAATTAATATTCTGTTTTTATTTATACTTTTAAGATTAGTGGCCATGAATTTTAGTATGACTAAGATGAGATATATTATAATTATTATGTGTATTAGTTATTGTGATCGTTGGTTACTTTTTAATTGGATTTTGACATTTTTATTGATAAGACTAGTTTTTTAAGGTTCCGTCTGGTAATCATTTCGTTTTTTGTTTTTGAAAATTAAGTCTATTTCTTCACATTTTCTTACCATATCTGCAATTTGCATCTTTCTTGAGTACAAGAGTTGAATTCTTAGCCAAATTTTAAAAATAAAAACAAGTTTGTAAAAATTTTTTTTTTTTCAAATTTTGGCTTGGTTTTTTAAAATATGGGTAAAAAGTAGATAAAAAAGCATGACATTTAGGGGTGAGAGGGGTGTTTGTAGGCTTAATTTTCAAAGACTAAAAACTAAAAACTAAATTGTTACCAAACTGGGTCTAAATATTTTGTTTTTATTGTTTTTATTTTATTCTAATTTAATTTTGCTCTTGTGTCAATGTTATTTGACTTCCATCACTTTTATAACTTGATTTTTGAGTGTTTGCTAGTGAAAGTTAGTGCAATTTATTAGTCTGTCGGTTCTTTTAGCAGTTTTCTAATTTACTCCCAATTTAATGTTGTTATTTAATTTCGATAGAACTGAAAGATAGATTAAAGATGTCTCACCTAAGCCAAATTGAGTATAGTTTAGCGATAATTGACATATACTCTTGTCTTTCGAAGTCAGATGTTGAAATTCCCAAATCACTTGTTATACTAAGAAAAATTGCTCCACTTAATTATCTAAGTTACCTTTTTTGCAAAAAGGGAATACAATGGCTTCTATTTAATATTTTTTTAGTATAATGAGTTTTCTGCTCTGCTCTCTAATCCTGTTTCTTTGTCATTATTTTCTCGCCATCATAATGTGCTCTATGCTCATGTCCCATGTCAATCCCATCTATTTGTTATCTTCCTTGACCCCCGTTCTCTGGTATGTTTGCTGCATCCATGTAGCATGTTTATTGATTTCATTAGGATGTTAACAAGTTTTTTTAGTGTAATTTTACGATATGTTTGGATTGACTTTTCAAACAGAAAAGAAAGTGTTTTTAAAACACTTAAAAAGTCAAGTCAAACATGTAAGTATTAAAAAATAAACATCCTTTCTTTATAGTCAGGCATGAATATTTATATATTAATTTCTAATGTTTGATGGAATACTTTGAATACTGATTTACATGTTTGGTTGGCAGTTATATATAAATGTGTGTGGTTGACGACAATAGATGTAACGTATGCAATGGAATTGGAAGCTTTCATTGGGTAAGGAGGTATGTTGGCCACTAGCTGCATTCTCTATAGTATATTCTTAAGCTAAATGTCTTCAGTGAGTGTGGCATCAAAAGTTGTTTGTATTCACACACAAATTAAAATATTACTTAAAAAAAAGTATTACTAAACTTCTAAGCTATATATTGGATCTGAAAAAGTACTATATATTCTCCCATAGGCTATCACTTTTGTCTATGAGAGCATGCGGCTCACAAGTTTTAGATTCTGGGAGTGGAGAGGAGATTTTAGTTAGTTTAATTTCATTGCATTTCTTCTTAATCTTTAGTATGAACTAAATCTTTAGGCTGGAATTTATGGGACTTAACTCTATTTTTATGGTCTTTTTTGTTATGTAAATCTTATAGTGGTATAGTTTGCTTTTGGATGTTCATTGTTATCAACTTTGGATAGGATGCTACCTTGTTTTATTTCTGAGAAGGTTCAAATTAGTGGAAGTGGCATGAGCATTATAAGTAGGTAGGGACATGTTTTGAAGAATTGGGTAAATCTAAAGGTCTTATGGCCAATTTGGATTAACTTAAGAAAAAAATGTTTTTCAAAAAACTCATTTTTATTTAAATTCTTTTGATAAAAATTGTTTAAAATACATTTTAAAATCTATTTTGGATCTTTGTCCAACACTCTAATTTTTTTAAAATGACTTATTTTTTAAATTAAACACTTGAAAATGTAAAAGGAATTGGAGGATTATTTTATTATAACAATATGCATAAAGGGTAACATCCTAGCTCTTGGCACATACTTTATGCTGGGTAATCTATGTGTATGTTGGCGAGGAAGTTTATTTATTATTTATTTTGAAATATTTTTAGTCGTTTTAATATTTTATGTCAAATATATGTAATTTTTTTAGGGAAATTATTTTAAACAGAAAAAATATCAAACTATTTACAAATATAGAAAAAAATTACTATCTATTAGCGATTATCGTGGTCTATCGTTGTCTATCACAGTTAGTAAATTTTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGGTTCATTTTTCTATATTTAAAAATAATCCAATTTTTTATGGTATTATTTTGGTCTTATACCTTCATAAATGTAACTGTGTGGTCCTTTGACATAAATTATTCATTAAAATTGTAAGATAGAAATCAGATTAAAAAAAAAAGTATATACTTGTTTTTAAAAAATGTGTGGTGTATGTGGACCTTTTTCTTTTCACCTTTCATTTAAAAATTTTATTATCAATTATGATAATAAAAATAAAGTAAAGCCATTTACTAAGATGGGTTTTGTCCCAGAAATCAAATATAGGATTGTTGAAAATAATTGAATAATATCATTTGTTTTACATTATAACAATGTTATACATTGATGCAATAAATACTTACTATAAGATTTGTCCTCAGATTTTTTTTTTTTAATAATTAAACAAAAATAATTAAAGTATATTTAAAAAAGAAAACATAATAAGTGGATTTAGTTAACTAAATCTCATTTGGATGAGTTAACACTAGTTACCTTATAGTCAACATTAAAAGGTTTTTAAAAAGTTACAATATTAGTTACTAGATTAGATCGAACGAACAGTCCTCCCACTTCACTATCATCGTTGGGCAAAGCAAAAGATTCCAAGTCATAAAAATCAAAGAATATATAGTTAGTTGCCCAATTTGGTTGGTTTTAGCTTCGAGGATCAAAGATTTGCCTCTTGCATAATGCATTAGTGGGAAGGTAAATATCAAGACAAGGATTCCTCCTCATTCCTCTTCACTTCCTTGAAATAGCATTAAAATCTCGAAAATAATATATAATATATGTGTTTATAAATATCTATATAGTGGCAGCTTGTTCATTATGCCACTTGATTTATAGAATATTGAATATCTAATTTCTTTGTCTACTATAAAATAAATTAATAAATAACAACACGAAGAAAAATATTGAAGTTCTTTTTTCCTCTTTTAGTCATAGAATGAGTAAGTTTTAAAATTTTAGACTTAGTTTTGTTTTTTTTCTATTTGTGAAAAGACCCCTCCATAGTATGTATTATTTTCTATAATTTGGAGGTTCAATTCATATCTCTACAACTATTTTACTAAAACAGATAAAATAGGATGATTTACATATTCAATTTTTATTTTAATTTTCACTCGCAAAGTAAAATTTTGAAAAAATTTCAAATGTATATTTACAAATTTTATGAACTTTCGAAAAGATTAAAAAAAAAACCGTAAATTAACTCTCGAGTTTTGACCGGTCAAAACCTCAAACTCCAAAGCTAATCCGCCGCTGTACTCGGACCATTTCCAGTCGGCCTCAGACGCGCAAACGACCGTTCGCCGAAGTCCTCATTCACAGGAGACCGTCCGGTTCCGGCAGCTCTTCCGACGACAGACGCCGGCACCGAAAACGTCCGCTGTAGGAAATTCCTCCACCCGCCATTTTCTCCGATTCCACCCCGATATCCCCGTCGCAAACTCTGCACTCTCGGCAACTCCGCCCAGCTTCTGGTCCGGCTCAGCGTCGAGTTCATCAATTGGCTCCGAACAGCCTCCGGCAATCGCAAAGTGAACCGCTCATGCCCGGTCGAGTTAGACCTCTGGAATATTCCGCTCAACCGCCATCCCAACGACCTCGACCGCGTCGGAGTACTCCGGTTCGCCACCGGACTTGGATTCGTCACATTTGACTCCCCTGCCGCTCCTTCTCCGGCACGTCGGTCATCGACCACCGGAATGGACACGTGGTTCGGCGACGGCGAAGGCGATGGCGTCGGCGACCGTTCGATTCCGATTCTTTCTGAGCCGGTGGACGGATCGAAATTAACGATCGACAATGTTACTTCACCAGGTTTAGGACAAAGATTGGCTCTGCAAACAGGGCAAGTCGAGTGTGAAACTAACCAAGCATCAACGCAAGCAGAGTGA

mRNA sequence

ATGATCCTTTGGCTCTCCTATCAAATTAATGGACCTTCGAGAGTGTTGGCTCCTGAATTTACTATCGGTTATTTGCAACTATGTTTCCTAAGCAATGGTCCACGAACTGCTAAGTATTCAAGAGAACAAAGTGGACTTGAGGAGGATTGCGAAGTTTCTAAAGGACTACCAGTCGGCCTCAGACGCGCAAACGACCGTTCGCCGAAGTCCTCATTCACAGGAGACCGTCCGGTTCCGGCAGCTCTTCCGACGACAGACGCCGGCACCGAAAACGTCCGCTGTAGGAAATTCCTCCACCCGCCATTTTCTCCGATTCCACCCCGATATCCCCGTCGCAAACTCTGCACTCTCGGCAACTCCGCCCAGCTTCTGGTCCGGCTCAGCGTCGAGTTCATCAATTGGCTCCGAACAGCCTCCGGCAATCGCAAAGTGAACCGCTCATGCCCGGTCGAGTTAGACCTCTGGAATATTCCGCTCAACCGCCATCCCAACGACCTCGACCGCGTCGGAGTACTCCGGTTCGCCACCGGACTTGGATTCGTCACATTTGACTCCCCTGCCGCTCCTTCTCCGGCACGTCGGTCATCGACCACCGGAATGGACACGTGGTTCGGCGACGGCGAAGGCGATGGCGTCGGCGACCGTTCGATTCCGATTCTTTCTGAGCCGGTGGACGGATCGAAATTAACGATCGACAATGTTACTTCACCAGGTTTAGGACAAAGATTGGCTCTGCAAACAGGGCAAGTCGAGTGTGAAACTAACCAAGCATCAACGCAAGCAGAGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGATCCTTTGGCTCTCCTATCAAATTAATGGACCTTCGAGAGTGTTGGCTCCTGAATTTACTATCGGTTATTTGCAACTATGTTTCCTAAGCAATGGTCCACGAACTGCTAAGTATTCAAGAGAACAAAGTGGACTTGAGGAGGATTGCGAAGTTTCTAAAGGACTACCAGTCGGCCTCAGACGCGCAAACGACCGTTCGCCGAAGTCCTCATTCACAGGAGACCGTCCGGTTCCGGCAGCTCTTCCGACGACAGACGCCGGCACCGAAAACGTCCGCTGTAGGAAATTCCTCCACCCGCCATTTTCTCCGATTCCACCCCGATATCCCCGTCGCAAACTCTGCACTCTCGGCAACTCCGCCCAGCTTCTGGTCCGGCTCAGCGTCGAGTTCATCAATTGGCTCCGAACAGCCTCCGGCAATCGCAAAGTGAACCGCTCATGCCCGGTCGAGTTAGACCTCTGGAATATTCCGCTCAACCGCCATCCCAACGACCTCGACCGCGTCGGAGTACTCCGGTTCGCCACCGGACTTGGATTCGTCACATTTGACTCCCCTGCCGCTCCTTCTCCGGCACGTCGGTCATCGACCACCGGAATGGACACGTGGTTCGGCGACGGCGAAGGCGATGGCGTCGGCGACCGTTCGATTCCGATTCTTTCTGAGCCGGTGGACGGATCGAAATTAACGATCGACAATGTTACTTCACCAGGTTTAGGACAAAGATTGGCTCTGCAAACAGGGCAAGTCGAGTGTGAAACTAACCAAGCATCAACGCAAGCAGAGTGA

Protein sequence

MILWLSYQINGPSRVLAPEFTIGYLQLCFLSNGPRTAKYSREQSGLEEDCEVSKGLPVGLRRANDRSPKSSFTGDRPVPAALPTTDAGTENVRCRKFLHPPFSPIPPRYPRRKLCTLGNSAQLLVRLSVEFINWLRTASGNRKVNRSCPVELDLWNIPLNRHPNDLDRVGVLRFATGLGFVTFDSPAAPSPARRSSTTGMDTWFGDGEGDGVGDRSIPILSEPVDGSKLTIDNVTSPGLGQRLALQTGQVECETNQASTQAE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 60..85

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10013457.1HG10013457.1mRNA