
HG10013450 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCGTCCGCCATTCCTGAAAACCTAACCAGGGAACAGTATGTTTACCTGTCGAAGCTTTCCGAGCAAGCCGAGCGCTACGAGGAAATGGTCCAGTTCATGCAGAAGCTTGTACTGAGCTCCATTCCAGCCTCGGAGCTCACTGTCGAGGAGCGCAATCTCCTTTCCGTCGCATACAAAAACGTGATCGGTTCTCTCCGAGCAGCTTGGCGTATCGTATCCTCAATTGAACAGAAGGAAGAAGGAAGGAAGAACGAAGATCATGTCGTCCTCGTCAAGGATTACAGATCTAAGGTCGAATCCGAGCTCACTGAGGCATGCGCCAGTATTTTGAAGCTGTTGGACTCCAATCTGATACCCTCCTCATCCTCTGGTGAATCTAAGGTGTTCTACTTAAAGATGAAGGGAGATTACCATAGGTACTTGGCTGAGTTTAAGATCGGGGAGGAAAGGAAGTCCGCCGCCGAGGACACCATGATAGCTTACAAGGCTGCTCAGGTACTCGAATATTGTCATCTTGTTTTGATTTATGGCGCACTGTTCTTTTTAAATAATCGAGATTGCGAAACTGTAATTCTAGGGTTTTTTTTTTTTACTGATTAACAGCCGGAACATTATGCATTTATTTATGATCATTATGCACTATTTATGTATCGATATGACAAATATGTTTAATTAGCAATATAGCATTAGCCAGTGAACCTGCTAACAGTGTTTTGTTCAAATGTGGCTATTACGTGGCTTGATAGCTCAGGCTTCATCGATGAATCCTAGACAAGCATGAAATTACTTGTATGATATTTAAAATCTCCAGCTTATCATTAATTACATATAAACTGTTACTAGTCAGTCAGGTGCAATTTGGCATAGTGCATGGTTTTGAAGTCATTATGGTTCTACTTAACGCTTTTGAGTTGAATTTGTATAAAGAAGTTAAATACATTCATTGAGCGGAAAAATGTCGAGTCTATTTCTGTTGCAGACGTAATGTAATGAACCGAAAGGTTTACATAATCAATCAAATTACCCTTGAAATACATGGAAAGGGATGAAATACTTGAAATTAAAATGAAATGGTAAACGAGCTAAAGTGGGAAGGTCAATACATTTTTTGTCTACTATTAGAATTTTGGGTGTTCACGTTAGCACCCCTCTGATAAATTCTATGTTATGGAGAATATTGCAGTTGCCGATCTTGCACCAACGCATCCAATCAGGCTGGGCCTAGCACTAAATTTTTCTGTTTTTTACTTTGAGATCCTGAACCAGTCTGATAAAGCCTGTAGCATGGCCAAACAGGTAAAATTGCACTTCTCTTCCCTACTAGCTGCTTGTTATCGTCATTTTATTGCTTGTAAGTAACATTTCAACAATCGTCCAACCTCAACATATTTGATTTACTTTTTTTTTTTAATAAATATTTATTTATAAAGCATCATCCTCCATTTCACTGCATGAATTGTACGATCGGCTGTCTGCTGATGGCTGTCTGTATTGCTCTTAACTTACATTTTATTCATAGAATCGGTGTTCTCGTTCTTCTTTAAGTATGTGGTTACAGTGCTTGGTTGCTCAGAATGTGATCTTGAATTTTTGCAATTTGGCATGTCATGTATATGGCCTTTTTCTTTTCTAGGAACCCTCGGAAAGACACTTTGCTCTCTTGTTTCTCTCATTATGTTAATTGTTTGTTGAGGTGGATATCAACTTTTGAGAGGATAAGTGGTTGAGAGATAGACCCCCTTTGCTCTCAGGGTCTTCGTTTATACCATTTAGCCTCTATGAAAAATCATTTGGTTGCATCACGCATTCCTAATTCACAGAAATCACCATCATTCTCTTTTTCTTGGGATATGTCGCTTGTTTTCCAATAGGAAAATGTCAAATATCGCTACTCTCTTGTCCTTGATTCAAATGTTTCATTTAGTTTCAAACATTTTGGATCTTCATCATTGGGGTACTAATCCCTTTAAAGGATTCTCTTGTAGCCCCTTCTTTTGGTGTCTTGGTGGATTCTTCCTCCTCTGATCACACGGTCTTTACCTCGTTGTTGCAAGTGAAAATTGTAAATTTCTTTATGGAAGAGTTAATTCTACCCTAGATCGTGTTTCGAGAAAGGTGCTTGGTGTGATAGGTTTGCAAGGTTGTATGTTGTGTAGAAATGCGGTTGAGGATTTGGACCATCTGCTGTAAAGTTGTGATTTTTTTGGTTTGGTTTAGAGTTGTTTCTTTGAGAAGTTTGGATTTCATATAGCTGGTCTGAGGAGTTGCAGTTCCATGATCAAGAAGTTCCTTCACTCGCCCTCTCGTGAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTGGTGGCCAGGACTTGTGTGGTCTTATGGGGGTCTTTAAGGTGAGAGGAACAAGAAAAATAGAGGATTTAAGAGGTTTTTGAATGGTGTTTGACCCCTTTTAGATTTAATGCATCTCTTTTGAACTCGATGATCAAGTCTTTTTGTAATTATTTGTTGGGTCTTATTTTGCTTGACTAGAGTCCTTGGCTCTTTTTGTTTGGGACTTATTCTCGTATGCTGGTCATTCATTAAAAAAAAAAGTATACACTTCCATTGAGAGAAAAAAAAAACTGGGCTGGTGTTGTTTGGGTAGATTGTGTCATTGTATATTCTTCTCGACGTGTCTGATCGTATACAAGGGGAGTTATATAGTTATTACATTCCTTGAAGTACACTAGTGTTAGAGTTTTTGTAATATCTTCGGCTTTAGGCTTTGCCACACGATTTTATTCGTTTCACAAACCTTAACCGAGGATCTTTTCTACTCTAATCAACTGTTTTTCTTTGGTATGTGGGGAATCTTTTTTTTTTTTTTCCCCCTTTGTTGTTATTTGTATTGATCAGCTTTAAGAATTTGCCACACGATTTTATAAGCTAAGTGTTATCACCTAAATAAGTACCTGGCCTTCTTAGTATCTTCCCTATTCTACCAAATGCTGAATTTCTCCCGAAACTGAATTAGCCTCGAAGCTACCGTACAATTTCTGTCTTACTTATGCCAAACGTGGAATCAACAATATATGGTTTGTGTTTGTGTAGAATGACTAAGAACAATTCCTTGGGTAATGACTGCAAGTCTGCATGTATGTAGATCATTGATCAATCTATGTAGATCATTGATCAATCTAAATTTGTTCTGCTTGGATGTGTTACAACTTACAAGTACTCCATGGGACTTTATTATTTTATTTTTTTAAATTCCCTTTCTTCTCTCTACCGAAACGGATCGAACCTGTGACACGGATGGAAAGCATTGATGCCCCATTTAGTCAACAGGCTACAAAACGTTTTGGTAAGTACACCCTGGGACTTGGGGGGAAATATATTATTCTTTTACATCTCACATTGATGACAAAAGAACTGGCTGAGATACTTGGAGGAGATCCTTTCTCCTTTTTAGATGTTTTGTTTAGGTGCAGAGGAATGAATGTGTATGTATTCATACAGTTCCATCTTTTAGCCGTTAAAAATGGAATTTGAAATGTTCTAAATCTGTGAGCCCTTAACCATACCGTGGCATTATTTTTTTTATTTTATTTTTTTATTTTTTAATGTCAAATAACATCATTACGACCTTACTTGGGTAGGATTTGTTCTATGAGTGGTACGTAACTGGGTCCTTGTGTTCTAAAAAATAATATTTGCAATTTTTATTAATGGTAATTTGATCTTCTTTTATTTTCGATCGACTTAAGGCATTTGAAGAAGCCATTGCGGAATTGGACACGTTAGGTGAAGAATCATACAAGGATAGCACTCTAATCATGCAACTCTTAAGAGACAATCTCACCCTTTGGACTTCCGATACACAGGTATGTGCGATAACTTGGCCTCAAATTTTAGACTAATTTAGAATGATATTTTAAGTGCTTAAAAATTAGAAAGTCGATTCAAATGGACTTTTTTTGCAATGTTGGTTTGATGCAGGACCAGTTAGACGAGCCATAGAAGGCGTCGTGGAGTTGTAGGTCTGTTTTATTCTTCTTTTGGAGGAGGTGGGCTTCGAATGTCATTTTCCTTGCTTTGTTTAGTGTAAATTTGACCTTTGGGGAAACCTGAAAAATTGGCAGCATTTGATAAAACATTATCCGTCAGTTAAAAGTATGTTTCTTAATTCATGTAGATTGTCATTTGGCCGATACCACTTGTAAGTTGTAAGTAAGACATTTCTAATGTTTTTTAATTGACAAAAGTTCTTTAATTGACATCCTTTAATGGTTGGTTTTTATATATATATATTTGAGTACAAGTTGGGTTAATATTGACTCGAATGAAAAAAAAATTAGATTATAGCTAAAAATAACTATTAGAACATGCATGAATTAACATTTTGATTTTAATTTTCTATTTAAAAATGGCAATATTTATTCATATTTGTCGTTTTGTGATCTTATTTATTTTAGATCGTAAATGCTTGGCAAAAAAAGGAATTTTTTTTTCTTTTCATTTTCATTTGTTGTGATTTACTAGTTTTGGAAATTGTATTAAAAGAATTTGAACTTTTAACAATGAAACATGAATGAGTAGTTTTTTCCCCCACAAATGTTTTTAACTTGAAAACTTGCTGGTAAATTTCTTAACTAATACTGTCAAAATGGTTCGTAGAATTAAACACAATAGAAAACACTCACAAAATATGTGAAATTGCAAACTTGGTCCTTGTGGTATGGAAAGTTTTTAGAATTTAGTCTTTATGGTTTGTAATTAAGATTTAGTTCTTATGATTTGATAAACTATTTATGAGAATTTTTATCAAATTATAGGGACTATTTATGAAATTTTAGCCAACCATAACGACTATATTCGAACTTTTAAAACCATGGATATTAAACCTTAACCTTTTTCAAACTATGAGGATTAAATTAATAATTTAACTTAAAAATAACTAAATATTGATTTATGAATATATTGATGTTAGAGTTTATTTGAATGG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MASAIPENLTREQYVYLSKLSEQAERYEEMVQFMQKLVLSSIPASELTVEERNLLSVAYKNVIGSLRAAWRIVSSIEQKEEGRKNEDHVVLVKDYRSKVESELTEACASILKLLDSNLIPSSSSGESKVFYLKMKGDYHRYLAEFKIGEERKSAAEDTMIAYKAAQHPSDKFYVMENIAVADLAPTHPIRLGLALNFSVFYFEILNQSDKACSMAKQAFEEAIAELDTLGEESYKDSTLIMQLLRDNLTLWTSDTQIIGRSLIPARVSLSSLSSHGGLRLSRWQRLRFAREQAHQLSSRSHLWFADALVIHPKTLPGKGTGDDILGSLLISGSDDTRINIWSYSGRKLLHSLDTGHSTNIFCTKFVPETSDELVVSGAGDAEVEIGNPNVVWSASEDGTLRQHDFREGMSCPPDGASHQECHNVLLDLRCGAKRSLADPPRQTLALKSCDISSTRPHLLLVGGSDAFARLYDRRMLPPLSSSQKRMSPPPCVNYFCPMHLSDRVRSGLHLTHVTFSPNGEEILLSYSGEHVYLMNVNHAGRSTMQYTSGDVSKLMSFTPVLNGLELQHPVSSLSNGLPLICGVNAKLDKCRKLLQIAEKCLEGGNYFGGIEACNEILDGYSCNIGVIFKHDTLCTRAALLLKSGASVMMCYFPAVLSHRKWKNDVHMAIRDCYSARKMNHSSFSAHYYMCEALSQLGKHKEALDFAFAAQCLAPSNPEVAEKVESVKRDLAAAELEKSNKGNDGALRSAPLGGVLSLSDFLYRSDANSDVSQDGLRSEREDSDYDEEVELDFETLSGDEAHDVDSNVLHGSLNLRIHRRVDPARERIGPNGSCGSPSSSQNDSTLYQPEPVVDMKQRYIGHCNIGTDIKQASFLGQRGEYVASGSDDGRWFIWEKGTGRLIKILVGDGAVVNCVQSHPFDCAIATSGIDNTIKLWTPTAPVPSLVAGGAVGPQAADVLAAIENNQRRLCRNREAIL Homology
BLAST of HG10013450 vs. NCBI nr
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BLAST of HG10013450 vs. NCBI nr
Match: XP_022133751.1 (WD and tetratricopeptide repeats protein 1 isoform X3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1213.4 bits (3138), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/652 (91.26%), Postives = 619/652 (94.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. NCBI nr
Match: XP_022133732.1 (WD and tetratricopeptide repeats protein 1 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1196.0 bits (3093), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/686 (86.73%), Postives = 619/686 (90.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. NCBI nr
Match: XP_038899405.1 (WD and tetratricopeptide repeats protein 1 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1192.9 bits (3085), Expect = 0.0e+00 Identity = 597/675 (88.44%), Postives = 610/675 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. NCBI nr
Match: XP_023524081.1 (WD and tetratricopeptide repeats protein 1-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1191.8 bits (3082), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/687 (86.61%), Postives = 616/687 (89.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94BQ3 (Protein ALTERED SEED GERMINATION 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ASG2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 836.3 bits (2159), Expect = 3.6e-241 Identity = 442/690 (64.06%), Postives = 511/690 (74.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96451 (14-3-3-like protein B (Fragment) OS=Glycine max OX=3847 GN=GF14B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 396.7 bits (1018), Expect = 7.4e-109 Identity = 206/250 (82.40%), Postives = 226/250 (90.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P93207 (14-3-3 protein 10 OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=TFT10 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 395.6 bits (1015), Expect = 1.6e-108 Identity = 208/256 (81.25%), Postives = 228/256 (89.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P93206 (14-3-3 protein 1 OS=Solanum lycopersicum OX=4081 GN=TFT1 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 393.7 bits (1010), Expect = 6.2e-108 Identity = 208/253 (82.21%), Postives = 230/253 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O49996 (14-3-3-like protein D OS=Nicotiana tabacum OX=4097 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 389.8 bits (1000), Expect = 9.0e-107 Identity = 206/253 (81.42%), Postives = 229/253 (90.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BW21 (WD and tetratricopeptide repeats protein 1 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006244 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1213.4 bits (3138), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/652 (91.26%), Postives = 619/652 (94.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BXJ8 (WD and tetratricopeptide repeats protein 1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111006244 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1196.0 bits (3093), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/686 (86.73%), Postives = 619/686 (90.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J4N6 (WD and tetratricopeptide repeats protein 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481283 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1191.0 bits (3080), Expect = 0.0e+00 Identity = 595/687 (86.61%), Postives = 616/687 (89.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FJT8 (WD and tetratricopeptide repeats protein 1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446086 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1190.3 bits (3078), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/687 (86.32%), Postives = 617/687 (89.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LHL7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G890030 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1189.5 bits (3076), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/687 (86.32%), Postives = 614/687 (89.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. TAIR 10
Match: AT5G10940.2 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 837.4 bits (2162), Expect = 1.2e-242 Identity = 441/688 (64.10%), Postives = 510/688 (74.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. TAIR 10
Match: AT5G10940.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 836.3 bits (2159), Expect = 2.6e-242 Identity = 442/690 (64.06%), Postives = 511/690 (74.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. TAIR 10
Match: AT5G65430.3 (general regulatory factor 8 ) HSP 1 Score: 388.7 bits (997), Expect = 1.4e-107 Identity = 202/249 (81.12%), Postives = 226/249 (90.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. TAIR 10
Match: AT5G65430.2 (general regulatory factor 8 ) HSP 1 Score: 387.9 bits (995), Expect = 2.4e-107 Identity = 202/249 (81.12%), Postives = 226/249 (90.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013450 vs. TAIR 10
Match: AT5G65430.1 (general regulatory factor 8 ) HSP 1 Score: 387.5 bits (994), Expect = 3.2e-107 Identity = 202/248 (81.45%), Postives = 225/248 (90.73%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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