HG10013409 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTGTGATCTGCTGCTTTAATCTCACTGTGGTTGTTATTTCATCTGGAGTTATGTCGAAGTATGCAAAGATTGAATATGAAATTTCATTAACTTGCCAATCCATTTCAGAACTGTGAAAAGTCTTTTTCTTTGAAATACTTTTCTTTCTGAGTGAAAATTATCTGTTATATGTGGAATATGATGAACGAGAAAGTAAGGATCATAGACAGTGCACCTGTCTATATTATTTTAATTCAAAGCTGCAGTGAAAGAAAGAGTTTAGCCTGTTCTGAATTGTATGAGGGCATGGATTTGCTTATAGGTCATCTCGATCATTTTTCTTACGAAAATCAGACAGGAGGTAATGTCCAAGAAAAACGATTCTGTTTTGTCACACGGGAAGGTTTATTAGCAAATAATATGATGGCTTATTCATAATTGACTGATTTTTAATACATCCTTTCATGCGGGAATATTAATACAAAATATTATTTTTCTCCAAGTGTTAATTGATGAATACTGTTGCTTCAACTCTTCATTTTTTAATGAGAAATCCTCATCCTTCTTAAGGAAAGTTTTCTTATCTTCTTAAGGAAACACAGTTTTTGTTAGCCTTGTTGAAGGAGCTGTTTGGATGTATTACTTGACATGTGACACATGGCTTTCCTGTACCAATTCGTTTAAGAATTGTGTAGCTACGAAATTGCTGGCCTTTGTTGTTGGTAGTTGAGATTGTGGTTTTTGATTCTATTAGCTTGGTATCCTAGAGATTCTGTCATAGTTGTTGGAAACTTCACTCTTTGAGCTAAACTCACCAGTTCTTTCTACCTTGTATAACTTGTAGTCCTAGAATTCTGGAGTTGCTCTGATGCAATAGTTGGTTTTGAGCTTGATTTCTTGAGTGATTGACATAAAAATGCTTTGCTGACTGCGCAAAGATGTGCAGTATTTAATTGGACATTATGGTTTTTTGATCTCATAACTGTTTATACATTGCATACTTCAATTATAATTTGTTCTTCAAATCTTGGAACTCAATAACATATCTAATTCTAATTTCTTCTCTCGTTCTGTAATGGTCCTTCTGCTATTCTTCTCTTACGACATTATGTAATGGCCCTTCTGCTATTCTTCTTACATCTTTTCCCGTCCTATGGGTGTTATCCTTTCTGGAAATAATATTTGTGCAGTGCTCTTGCCTTTTCTCGTTGACATTATTTTGTAATTAGTTAAAAATTATAATGATTTTACTCTATGACACGTTTGACAAGATCAAATGTTGTCCATTTAAATCACTAAGTGAATGCCCCAAAGCTAAGACAGTCTATGGAAACATAGTCCATTTGGCTTTGCTAAAAAGGGAATGATAACAGTTGGGAGACAGTCTATTCAAATTAAGTTACAACAGGCAGATCCCAAATAACTCTCGCAAATCTATCAATCCACATAGACATGTCATATGTGAGGAGTGAGCAAGTGTTAATGATCTGTTGTTTCACTGTTTGTTCTGTGGCATATGGGTGGACCTCCTTTGTCATATGCATCACGAAATAAGCTTTACTCAGACGTTGTTGGGGTTCTTAAACTTCTGTGCTTGTAGTTATTCTCTATATTAGGAATTGTTTTGAGGAAGTGGTCAGTGTTTTTTTTTTTTTTTAAAAACTTTTATCTCGTTGCTGGTTGCATAACTTAACTGTGCACCAGAACTTTCTAGTATTTCTCATAGAATTATGTTGAGCTGTTTGATGTGTCAGATTATTTTAACTTGATTATAGTTGAATTTATGTGTCTGTTAGTTACTTTTTACTATTTCATTTTAGTTGGAATAGTTTTGTGTTTGTTCAACTATGTCTTTGATCTTATGATTTTTTCCGTCATCTATAATTACATACTAATTCTTGCAATTCACGTTGTTAACTGTTTTTCTTTCCTTTCTTGAATTGTTTGCTTAAACTTTCCCTTCATTGCTGCAACTTTTGATATATGCAATTTGCCTTTTTTAAATCAATTGCTCTTCTGCTTGACAGTTTAGCAGCTATAGCAAGGAAAAGACCAGTTCATTATGGTAACATTCTATCGGCACTGCTGGAATTTGTTCCAAGTTTTGAGACAATAAAAGGGCGTCATGCTGCCAGCATACAGTATTCTATAAGATCTGCCCTTTTGGGATTCCTAAGGTGTATGCATCCGGCTTTTGTAGAGGTGAGTTCACTTTGTGAGTTTATATTTTCATATTATCGTGCATCATGTGCACACATGTATATATAGTCCTCTAGTTTTCTGATTTTTACTTGGCTGTGGACTCGGGATTACAACGTGAGGTCACCATGTCATCATGATATAAGGATCTATTACACTTTGCTTTTAGCTTAGTTTGCGATGGAACTTCAGAATAGAATGCAGTTTCATAAATGTAAGACTTGAAGTGCAAAATCTTGAGTTCATTTTATATTTGTTATGTTAGTGAGGTATCCTAATGCAGCATGAAAGTTCTCTGTATTTCTTGATTGTGGAACCTTTATAATCAGTACAGTTTTCTAACTCCTTTTGTTTTTTTTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTGAGTTGAAAACCTCATAGAGAAATGATATTGACCTCTAACAGTTGTTGCTAGTTGGATTAGGGAAATTTCGAAGTTTTAATTTCATAATTTCTCAGTAAGAATTGGAATGGCTATAAATACTGAAATTCTTGGGAAATGATCGAATGCCCATAATCACTTTTCTCTGATAGTTTGGTTTTCAGTCAAGGGATAGATTGCTAAAGGCTTTAAGAGCTATAAATGCTGGAGATGCTGCAGATCAAGTAATCAGGCAAGTGGACAAAATGGTGAAAGCTGCAGATCGAGCTTCACGTGATGCTTGGCTGGGCAAGGTAATTATTGGCCGAGTGTTGATATGATCACTATTCTTTGTTGCTACATATGTCTCTTATTGCTTCCCTTTTCTTGTCTCATTCTTAATATATCTGATAATAAGGATGACCAATCATCAAATCAGCTCAATGCATCAGTGGATCTAACAAGAAAAAGACCTAGGCTTCTGGACGATGAAGAACTTCCCAATGGCCGAGAGGTTTCCAAGCAATTCCGCTTTGGTCCAGATGTTCACCCAATTCCCACATCTCAAAAAGATGGTTCTCTTCAGAATGCCACCTCTAATGGGACATCCCATGATGTTTCTACGTTAGATGTTGAATTGACTCCTGCAGAGCAGATGATTGCGATGATTGGTGCCTTACTTGCTGAAGGGGAGCGAGGTGCAGAGTCGCTTGAAATTCTGATTTCAAATATTCATCCTGACTTGCTGGCTGATATTGTCATAACTAACATGAAGAACTTGCCCAAAGCTTCCCCTCCTTTAACTTGGCATGGGGACTTGCCTGTAACTCGTCAAGGAAGTAGTCACGTGCAGGTTCTGGCGCCATCAGCCCCACCGAGTTCTGTGCAAACTTCAGTTGCTACTGCACAAGTTCCTTTTTCTTCGGCCACCTCAGCTGGTTCAACTTTTGCTGAGTCTACTGTCAGTAGTCTCCCCATTGATTCTAAACGTGATCCAAGAAGGGTAAATCTAGCCAGTTGTGGATGTTCATTAATTTGTCTCTGTCATGTTAGGTTTACCATTCTGCCTCTAAATAAATTGGTTTCTTTTACTCACTCATGCAGGATCCCCGCCGCCTTGATCCTCGTCGTGGAGGAGTATCTTCTGCTTCTAGTGTGGAAGAGGCAAGTTCAAATATATCTGATGTTGATGGCTCCATATCTTTGGGAAAATCTGCTTCGGTTCCAGTTTCTGTGACAATTGAGAATTCTTCGGTATCTCTTATATCAAAAACGAATGTTGAAGAAAAAATTATGGAGACTCAATTCGTGTTTGGAACAGATCAATCAACCCCCAAATCAAGATCTCCTGATAGAGCTGAGAAAGCCGACAGTATATTAGAGATTAATGCCCCTCTGGATCCCATGCCTACTGCTGTCGGGAAAGCTGATGATGGTTTAGTTGCAGTTAATTTGTTTGATGACTTGGCAACTAAGAGGGATGATACATCGTCTTCTATAGAATACAATCAGTATTCTCCATCAGTTACAAATGCAGCTGCATCTGAAGATACCTGTGAGGAGTTGCCTTTGCTTCCACCATACGTTGACTTGACTCCAGAACAGCAAACAACTGTAAGAAATTTGGCAGCTGAAAAGATATTTGATTCATGCAAGAATTTAAATGGGGCAGACTGTCAGCAGATACGCTTGGCAATAATTGCTCGATTGGTTGCTCAGGTGGGGGCAATGTCTGATTGTTTATTTTTTATTTTATGTCTTTTCTCTTTAACTAGACAAACTTTAATTACTGTCAAAATTTTACTGTACAAGGAAGTGTGCGGAATTGAAGTTCAGCCACATTGTACAGGCAAATAACAGCTTTTCAACTAGCTATTAGTGTGAATATAAGTAACTAGAAAAGAAGATGTATTCTTCAAGTTTTTGTCATGGAAGCCAAAGAGGCCCAAAGTGTAATATACTCTATTGTTTATTTATATTCATACGAATTCTATTAGAATCTTCCTTTTGCCTTCTGTACTTTTCAAAGTAACCCTGATCATACTCAAGCAACTTGGTTTTTGCTTTCAATATCTGCCTCTGTATGTTTGCACTTAACGCAATAAATGTCAACAATTTGAGGGAGGGATCCTTATAACCTAAGTTCAACTGGCATCCTTCATTTTAGGGTTCATGAAAAGGAAAATGTAAGAACAAGGGATCACTTTGCTGTGCTACATTTGTACATTGTGTTCCTTTATAATTTGTGTGCATGAGGGATCATGAAATCCAGTAATTTCATGAATGTTAACTTTTGTATCAGCTATCTTTACCACTTCAGGCCATAGTAGTTTTTGTCTAAGTGACTCTTAATCAACTTGGAGCCAAGCAATTTAATGGATTTGAACTTGGGTGATTAGAATTCAACAAACCTTTTGGAGTTAT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ATGCTTGTGATCTGCTGCTTTAATCTCACTGTGGTTGTTATTTCATCTGGAGTTATGTCGAATTTAGCAGCTATAGCAAGGAAAAGACCAGTTCATTATGGTAACATTCTATCGGCACTGCTGGAATTTGTTCCAAGTTTTGAGACAATAAAAGGGCGTCATGCTGCCAGCATACAGTATTCTATAAGATCTGCCCTTTTGGGATTCCTAAGGTGTATGCATCCGGCTTTTGTAGAGTCAAGGGATAGATTGCTAAAGGCTTTAAGAGCTATAAATGCTGGAGATGCTGCAGATCAAGTAATCAGGCAAGTGGACAAAATGGTGAAAGCTGCAGATCGAGCTTCACGTGATGCTTGGCTGGGCAAGGATGACCAATCATCAAATCAGCTCAATGCATCAGTGGATCTAACAAGAAAAAGACCTAGGCTTCTGGACGATGAAGAACTTCCCAATGGCCGAGAGGTTTCCAAGCAATTCCGCTTTGGTCCAGATGTTCACCCAATTCCCACATCTCAAAAAGATGGTTCTCTTCAGAATGCCACCTCTAATGGGACATCCCATGATGTTTCTACGTTAGATGTTGAATTGACTCCTGCAGAGCAGATGATTGCGATGATTGGTGCCTTACTTGCTGAAGGGGAGCGAGGTGCAGAGTCGCTTGAAATTCTGATTTCAAATATTCATCCTGACTTGCTGGCTGATATTGTCATAACTAACATGAAGAACTTGCCCAAAGCTTCCCCTCCTTTAACTTGGCATGGGGACTTGCCTGTAACTCGTCAAGGAAGTAGTCACGTGCAGGTTCTGGCGCCATCAGCCCCACCGAGTTCTGTGCAAACTTCAGTTGCTACTGCACAAGTTCCTTTTTCTTCGGCCACCTCAGCTGGTTCAACTTTTGCTGAGTCTACTGTCAGTAGTCTCCCCATTGATTCTAAACGTGATCCAAGAAGGGATCCCCGCCGCCTTGATCCTCGTCGTGGAGGAGTATCTTCTGCTTCTAGTGTGGAAGAGGCAAGTTCAAATATATCTGATGTTGATGGCTCCATATCTTTGGGAAAATCTGCTTCGGTTCCAGTTTCTGTGACAATTGAGAATTCTTCGGTATCTCTTATATCAAAAACGAATGTTGAAGAAAAAATTATGGAGACTCAATTCGTGTTTGGAACAGATCAATCAACCCCCAAATCAAGATCTCCTGATAGAGCTGAGAAAGCCGACAGTATATTAGAGATTAATGCCCCTCTGGATCCCATGCCTACTGCTGTCGGGAAAGCTGATGATGGTTTAGTTGCAGTTAATTTGTTTGATGACTTGGCAACTAAGAGGGATGATACATCGTCTTCTATAGAATACAATCAGTATTCTCCATCAGTTACAAATGCAGCTGCATCTGAAGATACCTGTGAGGAGTTGCCTTTGCTTCCACCATACGTTGACTTGACTCCAGAACAGCAAACAACTGTAAGAAATTTGGCAGCTGAAAAGATATTTGATTCATGCAAGAATTTAAATGGGGCAGACTGTCAGCAGATACGCTTGGCAATAATTGCTCGATTGGTTGCTCAGGTTGGTGCTGATGATGATATTGTTCGAATGTTGGAAAAGCAAGTTGCTGTCGATTACCAACAGCAAAAGGGGCATGAGCTTGCTTTGCATGTCTTATATCACCTGCATTCACTTGATATTCTGGATTCAGTGGAAAGTTCTTCTTTCGCTGTGTACGAGAAGTTTCTTCTAGTTGTGGCTAAATCGTTGCTAGATGCTTTTCCAGCTTCGGACAAATCTTTTAGTAGACTTCTCGGTGATGTTCCAGTTTTGCCGGACTCTACCTTGGAACTATTACATAACCTTTGCTATTGTGATATTACTGACAACCAGGGGAAGGGTTCTCCTGATATTGAACGTGTCACACAAGGCCTTGGCACTGTTTGGAATTTGATTGTGAAGCGTCCATATAGTCGGCAAGCTTGCTTAGATATTGCTCTGAAGTGTGCTATGCATTCAGAAGTTAAGGTTCGAGCAACAGCTATTAGACTGGTGGCAAACAAACTCTACCGGTTAAGTTACATTTCAGATAGGATTGAGCAACATGCAACAAACATGTTCCTGTCTGCAGTAAATGACGTAGATCAGACAGATGTAGAGCCTTCACCATATGGATCGGTTGAACAAAGAACGGGAGGAGAGGGTGAGAGTCAGGAAACATCCGTTGGTGGTTCTCAGGTGTCAGATCTCGGAACATCAGAAAACGATTCAATGAAGAGTTCACAACCTACCGTTCATGGCAGTTCAACCTTGTCACTTTCAGAAGCTGAAAGACACATTTCTCTTCTTTTTGCTCTATGCATGAAGAAACCTTGTCTGCTTCGGTTTGTATTTGATGCTTATGGACGGGCTCCTAGAGCAGTGAAAGAGGCCGTTCATGAACATATCCCTAATCTTATTACGGCCCTAGGGTCATCTGATTCTGACTTGCTTAGAATAATATCAGATCCACCTCCAGGAAGTGAACATCTTTTAGCGTTGGTACTACAGGTACTAACTCAAGAGACGATGCCTTCGTCTGATCTGATTGCAACTGTTAAACATTTATATGAAACTAAACTGAAGGATGTGACGATTCTCATTCCAATGTTGTCCTCACTTTCCAAAAATGAGGTTTTACCTGTTTTTCCTCGGCTGGTTGATCTTCCATTGGAGAAGTTTCAGAGAGCGTTGGCTTACATATTACAGGGTTCGGCACATACACGCCCAGCTTTAACACCTGTTGAAGTATTGATTGCCATCCACAACATAATTCCTGAAAAAGATGGCCTTCCATTAAAGAAGATAACGGATGCTTGTTCAGCTTGTTTTGAGCAACGTACAGTTTTCAGTCAGCAGGTTTTAGCAAAAGCCTTGAGCCAGATGGTTGAACAAACTCCACTCCCTCTTCTCTTCATGAGAACTGTGATTCAGGCAATTGATGCTTTTCCTACTCTGGTTGATTTTGTCATGGAGATACTTTCCAAACTTGTAAACAGACAGGTCTGGAGGATGCCAAAATTGTGGTTTGGTTTTTTGAAATGTGCATTTCAAACACAGCCTCATTCCTTTCGAGTACTATTACAGTTACCACCGCCACAGCTTGAAAATGCTTTGAATAAATATGTTAACCTTAAAGGTCCTCTTGCTGCTTATGCCAGCCAGCCCAGCGCAAAATCTACTCTCTCTAGGTAA MLVICCFNLTVVVISSGVMSNLAAIARKRPVHYGNILSALLEFVPSFETIKGRHAASIQYSIRSALLGFLRCMHPAFVESRDRLLKALRAINAGDAADQVIRQVDKMVKAADRASRDAWLGKDDQSSNQLNASVDLTRKRPRLLDDEELPNGREVSKQFRFGPDVHPIPTSQKDGSLQNATSNGTSHDVSTLDVELTPAEQMIAMIGALLAEGERGAESLEILISNIHPDLLADIVITNMKNLPKASPPLTWHGDLPVTRQGSSHVQVLAPSAPPSSVQTSVATAQVPFSSATSAGSTFAESTVSSLPIDSKRDPRRDPRRLDPRRGGVSSASSVEEASSNISDVDGSISLGKSASVPVSVTIENSSVSLISKTNVEEKIMETQFVFGTDQSTPKSRSPDRAEKADSILEINAPLDPMPTAVGKADDGLVAVNLFDDLATKRDDTSSSIEYNQYSPSVTNAAASEDTCEELPLLPPYVDLTPEQQTTVRNLAAEKIFDSCKNLNGADCQQIRLAIIARLVAQVGADDDIVRMLEKQVAVDYQQQKGHELALHVLYHLHSLDILDSVESSSFAVYEKFLLVVAKSLLDAFPASDKSFSRLLGDVPVLPDSTLELLHNLCYCDITDNQGKGSPDIERVTQGLGTVWNLIVKRPYSRQACLDIALKCAMHSEVKVRATAIRLVANKLYRLSYISDRIEQHATNMFLSAVNDVDQTDVEPSPYGSVEQRTGGEGESQETSVGGSQVSDLGTSENDSMKSSQPTVHGSSTLSLSEAERHISLLFALCMKKPCLLRFVFDAYGRAPRAVKEAVHEHIPNLITALGSSDSDLLRIISDPPPGSEHLLALVLQVLTQETMPSSDLIATVKHLYETKLKDVTILIPMLSSLSKNEVLPVFPRLVDLPLEKFQRALAYILQGSAHTRPALTPVEVLIAIHNIIPEKDGLPLKKITDACSACFEQRTVFSQQVLAKALSQMVEQTPLPLLFMRTVIQAIDAFPTLVDFVMEILSKLVNRQVWRMPKLWFGFLKCAFQTQPHSFRVLLQLPPPQLENALNKYVNLKGPLAAYASQPSAKSTLSR Homology
BLAST of HG10013409 vs. NCBI nr
Match: XP_038898452.1 (uncharacterized protein LOC120086087 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1880.5 bits (4870), Expect = 0.0e+00 Identity = 989/1056 (93.66%), Postives = 1017/1056 (96.31%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. NCBI nr
Match: XP_038898451.1 (uncharacterized protein LOC120086087 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1874.8 bits (4855), Expect = 0.0e+00 Identity = 989/1060 (93.30%), Postives = 1017/1060 (95.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. NCBI nr
Match: XP_011652606.1 (uncharacterized protein LOC101202828 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN60445.2 hypothetical protein Csa_002340 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1856.3 bits (4807), Expect = 0.0e+00 Identity = 979/1055 (92.80%), Postives = 1012/1055 (95.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. NCBI nr
Match: XP_008466106.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103503628 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1851.3 bits (4794), Expect = 0.0e+00 Identity = 974/1055 (92.32%), Postives = 1007/1055 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. NCBI nr
Match: XP_011652605.1 (uncharacterized protein LOC101202828 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1850.5 bits (4792), Expect = 0.0e+00 Identity = 979/1059 (92.45%), Postives = 1012/1059 (95.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZYV9 (Symplekin OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=sympk PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 223.0 bits (567), Expect = 1.6e-56 Identity = 171/585 (29.23%), Postives = 283/585 (48.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92797 (Symplekin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SYMPK PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 219.9 bits (559), Expect = 1.4e-55 Identity = 175/587 (29.81%), Postives = 282/587 (48.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q80X82 (Symplekin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Sympk PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 217.6 bits (553), Expect = 6.7e-55 Identity = 172/587 (29.30%), Postives = 282/587 (48.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8MSU4 (Symplekin OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Sym PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 1.0e-42 Identity = 106/291 (36.43%), Postives = 165/291 (56.70%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQF9 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1851.3 bits (4794), Expect = 0.0e+00 Identity = 974/1055 (92.32%), Postives = 1007/1055 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQH3 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1845.5 bits (4779), Expect = 0.0e+00 Identity = 974/1059 (91.97%), Postives = 1007/1059 (95.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQG3 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1845.5 bits (4779), Expect = 0.0e+00 Identity = 974/1059 (91.97%), Postives = 1007/1059 (95.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CQS1 (uncharacterized protein LOC103503628 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503628 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1845.5 bits (4779), Expect = 0.0e+00 Identity = 974/1059 (91.97%), Postives = 1007/1059 (95.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LGZ1 (Symplekin_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G893440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1803.9 bits (4671), Expect = 0.0e+00 Identity = 952/1023 (93.06%), Postives = 982/1023 (95.99%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. TAIR 10
Match: AT1G27595.1 (CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Symplekin tight junction protein C-terminal (InterPro:IPR022075); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HEAT repeat-containing protein (TAIR:AT5G01400.1); Has 593 Blast hits to 297 proteins in 111 species: Archae - 0; Bacteria - 3; Metazoa - 139; Fungi - 49; Plants - 57; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 345 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 810.1 bits (2091), Expect = 2.2e-234 Identity = 497/949 (52.37%), Postives = 635/949 (66.91%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. TAIR 10
Match: AT5G01400.1 (HEAT repeat-containing protein ) HSP 1 Score: 542.0 bits (1395), Expect = 1.1e-153 Identity = 398/1104 (36.05%), Postives = 598/1104 (54.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. TAIR 10
Match: AT1G27570.1 (phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein ) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 7.5e-09 Identity = 36/109 (33.03%), Postives = 55/109 (50.46%), Query Frame = 0
BLAST of HG10013409 vs. TAIR 10
Match: AT1G27570.2 (phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein ) HSP 1 Score: 60.8 bits (146), Expect = 7.5e-09 Identity = 36/109 (33.03%), Postives = 55/109 (50.46%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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