HG10013384 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10013384
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr02: 928833 .. 931651 (+)
RNA-Seq ExpressionHG10013384
SyntenyHG10013384
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGTCGTCCCTCGTGGAAGCTTGCCCGCCGATCGGATGCACGACCACTACATACCCAGGTAAATCAAGTAATTAGAGTTGGGAATGTTAAAAAAAAAAATATATATATATAGTAATTTTACAATTTCTTTATTATTATTATTAATATTATTAAAAAATATATATCTCAACCACCGCCTTAGTTTAAATGGTTTGTCAATCAAGTTTAAGTTTCATTATAGACAAACCTAATAAATAATAGATATGCTGTTCTTTGGCTGACTTTTAACTAACCATAATGTTATCTTCTCTTAATAACAAATGTTTTTTTAATGTATATATCATGATATTTTTATCGCCCAATATGGTGTGCTTAGTATCTTTTTCTTTTATTGTTTTGAGCAAGTTGGCATTTATGAATCTATTATTTTTCCTTTTTCAAATATTATATTTATCCATTTCCATGTCTACCAACCTAACCTAAGTACCTCTTCCGGCCCATTCCTTCAAAAAGTACAAATGTAGTATGTCAAATATAAACGTGGATCCAAAAATTGTGTTAAATAGGAAAATATTTATACCTATATCTATATATATTCATTTATTAGTTTATACTTTATAATATATAATTAAATTTTTAGTTTTATGTCTAGTAGTTGAGTAACGTATTAAAAAGTCTGAAAAATTATTGATCTTTGTTATATAAATTATTGAAAATTTATGTCTAATAAGACTCTAGATTTTTAACTTTATGTCTAGTAGATTTGTAATTGTTTAAAAAAAATATAGAGTCATGGCTTATTATTGAACATGAAGATCTATTGGATGCAAAATTGCAAATTTGAGAACTTATTAGACACTTCAAAATTCAAGGACCTATGTAGCGTAGCATTCAAAGCTCGATTACCTATTAAATATTTTTTAAAATTTAAAGACGAACTTATAATTTAATCATTTTTTTAGTTTAACAACTAGTGAGAACGAAAGATTTGAACCTTAGGGGTTAAAATGAAAATTTTAAAGTTTAAAGTTTGAATGAGATGAATTTTCTTATAGCTTATTAACTTTAGTTAATGTTTTTCACATTTTTATATGTATACTTTAAATGAAAAAAAAAAAAAGAAAAATACCATTTTCTAAGGGCTAAAATGAAAATTTTTATTGACGGAAAAAACAGCATATTTAATAGAATATTTAAGATTTTAAAAAAGGTTGAATATGTCAAAAGTACTAGCAAGGTTGATAAAGTCGAGTCGTGATTGTGAAGTGAGTTAAAAATAGAATTCAAGACCTACCTAACGTATTACCTAAGTAGTCAATTAAATAGGATTAAATTATAATGTACGCATCTATATACAAATACAATACTTTTTTTTGTTTATAGTATATAAATACAATCCATGATAGCCTCTTTAAGTCAAAAAGGTATAGTGTAATGTATTTCATAAATAATGATTGGATTTGATTCCATATTTGGATCATCATTATATTCATACTTTGCCTGTATAATGATTATATTCCATCACAAATATTTATCATATCATAAGATCATTATATATGTGTATAAAGTTAAACGGATGGGAAGAAAGAAATAGAAAAATGTTAATCCAACTATCAATTTATACCTCTAAATTTTATTAAAATTTTAAGTTAATGGTTATATTAATTTAAACTTCATATTTAAAATGCCCTTCATTAGAATTTCGTTTTGAAATCGTTATTGTATAACTTTCACGCGCTTAATTGTAAGATTTTTTTTTTTTTTTTTAATGTAAAGATGGATGTAAATGCGAGAGTCAAAATAAATAGTAATAGTTTTTGGTTAAATTCGAGTGATTTTACATCTATTGGTCTTCCACTACCTTTATGGGTCTTCTTTAGAAAAATAATTTTATTTAAGTGACTTTCAATAAAATTAAAGTTTAGATTTTAAATTGATACAACTATTAATTTGGAGCTTTGATTTATACCACTCTAAAAAATTATAGGTATAAATTGATATTTGTCGAATGTTAAATTAAGCTTCCTCTAAGGTTGAAACAATAATTTAAAAAGGTATCGACTCAACAACACAATGAAATAGTAGTTGTAACGTGTAAACAAGTTTTTTTTAAAAGAAGAAAAAATGGAGATGTCAATATTATGTCAAAATGAACATAATCTAACTGACATAAAATCTATACTATCAACTTTAAGGTTAGAAGTTCAATTTTCCTACCTCACGTACTGTAAAAAAAAAAATCAAAATTTTCAGTTTTTTTTCCTTTTAGTACCACAAGTTGGGACGTGGAGAGTTTAAATCTCTGAACTCAAAAAAAGTAGTACATGTCAATTAATGCTAGTTATGCTGATCACTTCGACATATCAATTTTCAAACTAAACTTTCAATAACACCCAATTAAATCATATACTTAAATGATTGCTATAATTTGTATCAATTTATTAAATTTAACAACAAAAAGACAAGAATGTAAATGCTTGGAAGAATTCACAAATTCAATAAATGTCAAGTTTGAGCACATAATTAATCATTAAATAAATTAGCAAATTCAATATATATGTTTCGTACAATACATAATTTGATAATTGTGTACCACATATGTATATTTAAACACGTGAATTTTTAAAATACTTGGAAGTTGCTAGATTTAAGAGTAAAAATGGACTGTGGTTTGTTTTTTTTTTTTCTTTTTAGTTGTAGCCAATCCAATTGAGTGTGAAGTTGATGGAGACAAAAGAAGGGGTGGGAATAGCTATGGTGTAGCCAAGGCCCAAGATGGTGATGAAGATGTATGCAACAACAAAAACCCCTCTTCAACGTTCAACCACATATATAATTAA

mRNA sequence

ATGTCGTCCCTCGTGGAAGCTTGCCCGCCGATCGGATGCACGACCACTACATACCCAGTTGTAGCCAATCCAATTGAGTGTGAAGTTGATGGAGACAAAAGAAGGGGTGGGAATAGCTATGGTGTAGCCAAGGCCCAAGATGGTGATGAAGATGTATGCAACAACAAAAACCCCTCTTCAACGTTCAACCACATATATAATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGTCGTCCCTCGTGGAAGCTTGCCCGCCGATCGGATGCACGACCACTACATACCCAGTTGTAGCCAATCCAATTGAGTGTGAAGTTGATGGAGACAAAAGAAGGGGTGGGAATAGCTATGGTGTAGCCAAGGCCCAAGATGGTGATGAAGATGTATGCAACAACAAAAACCCCTCTTCAACGTTCAACCACATATATAATTAA

Protein sequence

MSSLVEACPPIGCTTTTYPVVANPIECEVDGDKRRGGNSYGVAKAQDGDEDVCNNKNPSSTFNHIYN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 33..67
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 52..67

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10013384.1HG10013384.1mRNA