
HG10011983 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATTGATTTTGCAGGAGCTGAGTGGAAGATGAGTTTAATATCACAAAATGCTGCTGTAATTAGTAGTATTGAGAAGGTTACAGGGGAGAATATTGTTGGTTCGTCATCTCCGTTGAGAAATGTAGATGCTAGTGATGTAGAAAACTATGGTCTAGATACTACTAGGGCAAAGAAGAGAAAGAAAGAACACAAAAAAGAAGATGAAGAACTAGTAAAAGACCAACAGAAGGAAATGAAGAAGCTCGAAAACTTTCTTTTTGGATCGCTCAATTCTCCTGTTGAATTTGGGAAGGATGAAGAGCAAAATGGTTTTAGTTCTGAGGAGAAAGTTCCTGCTTTGTACATAATGGACCGCTCTGCAAATAATTCCCTTTCTGCATATGAAGATGATTTTGGGCTCCTAGATGAGAGTACGGATAAGGAGGAACCTCAGCAAAGGAAACCAGTATGGGTCGATGAGGAAGAGGACAAGGCCACAGTTAATATTACTAATGTTAGCAGACTGAGAAAGTTGAGGAAGGAAGAAGATAAGAATTCGATTTCTGGCTCAGAGTACGTGTCGAGACTGAGGGCTCAACATGCCAAGCTAAACCCAGGCACCGAGTGGGCTCAACTTGATGCACAATCCACGGGTGATAGTGATGATGATGATCGATCATCAGATGCTGAAAATGCAGTTGCATTGGCTGATGGTTATGATAATGTTGATTCTATTGATGATATCCTTCGAACAAGTGAGAATCTTGTTGTAAAGAGAGGTGCAAAATTGTTGCCTGGTCTTCTTGAATACTCAAGACTTGTAGATGCTAATGCAGAGGAGCCATCTAATGGTCCTATCAATTCGGTTCAGTTTCATCGCAACGCTCAGTTACTACTAGCCACTGGGTTGGATCGAAAGCTTAGATTTTTTCAGATTGATGGCAAACGGAATACCAAAATTCAAAGCATTTTCCTTGAGGATTGCCCCATACGAAAGGCATCCTTTTTGCCTGATGGATCTCAGGTTATCATAGCTGGAAGGAGAAAGTTCTTCTATAGCCTCGATTTAGTGAAAGCAAAAGTAGATAAAATTGGCCCTCTTGTAGGTAGAGAGGAGAAAAGCCTTGAAGTTTTTGAAGTTTCTCCTGATTCTAGCACGGTCGCATTTATTGGTAATGAAGGCTATATCCTGTTAGTGTCAACCAAAACAAAGGAGCTCATCGGGACGCTTAAGATGAATGGAAGCGTTCGTTCTTTGGCATTCGCAGACAATGGACGACAGCTACTGAGCTCCGGTGGTGACGGGCAGGTCTACCACTGGGATTTGCGAACAAGAACATGCATCCACAAGGGTGTCGACGAAGGTTGCATCAATGGTACTGCACTATGTACATCTCCAAATGGAGCATTGTTTGCAGCTGGTTCTGACAGTGGCATTGTTAACATCTACAATAGACAAGAATTCTTAGGGGGCAAGAAGAAGCCATTGAAAGCCATTGAGAATCTGACCACCAAAGTAGACTTTCTCAAATTCAATCATGATGCTCAAATATTGGCCATCTGTTCAAGAAGGAAGAAAAGTAGTTTGAAGTTGATACATGTTCCTTCTTTTACTGTATTTTCGAACTGGCCGCCGCCGAAGAAGAACCTTCAATACCCTTCATGTTTGGATTTCAGTCCTGAAGGAGGTTACATGGCTGTGGGAAATGCTGCTGGAAAGGTATTATTGTATAAACTACATCATTATCATCATGCTTAGATTTGATCTCCAGATGCTTAATCATTGGCTGGAACAGTTTTGATACTTAAATTAGTTATCACAATCAGCTGTTACTTTAGACAAGTTTACTCTAGCTGGTATTGTTGTTTACTAATTTTCTTCTTATTAAAAACTATTTTTTTGTTGTTAAGATTAACACTTGATATTAAGAGATTAAAACTCATGTTTCATAATTTGGTATTGAGAAGTACTTTCCTCTGGACAGTGGGATCTTGTTACTGAGAACTTACTGCTCTCATAATTGAGATTTGTTTTTATTTTGAAATTATTTTTTCTGTTGTTGATTATTTTACTCTTATCCTTTTTGAAAATGACATTTTCTGAAAAGTCAGCAAAGCTACAAATAATTGTATATATCTAATGGAGTGTTAATTTTAACCATTGATAGGCATTATTATATTCGATAAAACTCTTATACATAAAGTCTCTCGATCGAGAAGTTAGACGTTCGAATATATATATACTTGTTATACTAAAAAAATTATATATATATATTCCTATGAGAATTTTATCAAATTGTAAGTTCCATTTCTTTGTCATTTGTCAATTTAATCTACCTTAAGTTGAATAGATAATAATTTGGATTTTTTTTCTATTAATCACCGATTTTATTTATATTATCATTTCATCATTGATACTTTCTTTCATTTTCTAAGTAAATTATTTTACATGTAATTAATAATAAATTTTTTTAAAAAAAGTGCAAAAGAATCAAAGATATAAAAGAAAGTAAAGACAATAACTTTTCAAAAGTGTCAATTAGGTTATCACGTCATAGTCCATAGATACAAATATCATAAACTATCACATCAACTTTTTTTTCGCTACCACTAACGTCTTCAAGGAGAATACATTTTGATTACTGACATATGGATGTGTTAGCAACTAAGAGGTTTATTGTTTGAATCATCCTATGTTATTGTACTAAAAAAAACACGGGATTGATGATATATGTCTTTATCAACTGAGTTATCTTTGAATTGAAAAAGAAAATGAATGTGAATGGTCTTAATTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGTTCTTGAATTTTTAATTCTATATCTAAGAGATAATCAATTTATTTAATATTTTTTAAAATCAGACATGTTAGATACAAAACTAAAAATTTAAGGACACATTAAACATAAACTTCAATCTTATATTTATTAAATCAATTAACTTTAATTTTTTATTTAATATGTTAGAGATAAACTTATTGGAGACAAAATTGAAATTAAAGTTCAAAGATCTATTTGAATAAATTTTAATGTTCAAGGATCAAATAAATACAAACTCGAAAGTTGAAAAACTAAACTTATTAATTTACTATAGGAAAAATATCGTTCGGGATTCTTTTAATTTTTATTTGGTCCTTAGGTTTTGAAATCTTACACTTTTACTCCTGAGTTTTGAGTTTAATTTATATTTTAGTTCCTCAGTTTCAAGATTTTCACTTTTAAGCGAAGAACTATAATTAATTAGTCTTCACTAATTTTTCATTATCATTAAAATTAAAATTAATTTTTTATTTCACAATAATTTTAAATTAATTAATAAAAAGTTAACGTCATATACCAAGTGAGAATGGGCAAAAATTCAAGGATAAGAGTATAAAAATAATTAACACCTAGGACCAAATGAATATTAAACTAAAAACCAAGGATAAAATGTAACATTTTTTTTTTTCAAAGGGAAAATATAACATTTTGAAACCTAAGAACCAAATATAAATTACACTCAAAGTTTAGTAGTAAAAATGTGATATTTTGAAATTAAGAACCAAATAAAAACTAGATCAAAATCTTATTGATTAAAAATATATATTTTTTCCTTTCCTAAACCTTTCACTAAAATGCTTAATTATAGGCAAACTTTAAAATATTGATATTGATGAAAACGTTAAGATCTCAATTTCACAAAAATGTCTATTAAAACATTGATAAAATGGTTATTTCGATGGACATTTATGAAAATATCTTATAAACAAAAGAATTCAAAAAAATGTTTAAATTAGTAAATAAATATTCTATGCTTGTTTAAACTAGTTAAAATCTCTATTATTTATAAATTAAAATACTATTTTGTCGTCATACTTTCAATTGTCTAATTTTAGTCCTTGTAATTTCAATAAATCATAAATTTAGTCATTCAAAGTTAATTTTTATCCAAATTAATTAAATAATGATAATAAAAAATACACTATGTGAACATATTTTTACAATTTAAAAGAAAAATGCTCAAAAAGACTAAATCTTTTGAGAAAAATCAATAAAAAAAATAACTGTAGAGACTAAATTTAAAATATATTAAAAGTAGAGGAACCAATTTAAAGTCCATAAATAGAAATGAAACAAAATATAAAGAACAGGTACCAAAATGATATTTTAATTATATTTATATTTATTCATATTAATGATATTTTATTACTTATTTCCAATATTTCATAAACTTTATTGTATGAATTGAAATATATAATTGAAACGACATGTCGGAGGCTAAAGAGTAACGATAAGATAGCGTCCCGCCATCACCTCCCCATCTGTCTCGCAGAATGTCGATCACTGAAACAAAGAGCGTGAAGACACGCGCTTTTGACGCGCGTGGGAAAAAAGACTGCAATAGTAATTCCGGTTAAACATTTTGCCCCCACTCCAGTGAAAGCCCATGCAAGAAAAGAAAATCCCATTTCTCCTTTCTCAAATCTTTTCCCCAAACTTTTTTTTTCATAACTGAACCCACCAAAACCAAAATCTTCTGTTTCTTGATTTTGTTTTTTCTGCTCAAATTCCTCATTGAATTGAATCAATCACTTCCCAAGATTTCCAGTTTCTTCTTCCATTTGTTTTCTGTAGGCATTGGTAGAAGAAGAAGCAGAAGAAGAAGAGCAATAATGTTTGTGGGATCGAAATCTTAGCTTCAGAGATGGCTGGAGATGGATTTGTTATCCCTGTGGAATCTCAGGTGGGTTCGGTGAAGAAGAAGAAGAAGCAGACAACGACGACGAAGAAGAAGAATACTGCGATTTCCAGGAGCTGGGTTTCGTTGGACCATGAAGGAAGGAGTACGATTTTGGATGTGGATAAGTATGCGATTATGCAAAGGGTTCAGATTAATGCCAGAGATCTTCGGCTTCTTGATCCTCTGTTGTCGTATCCTTCCACTATCTTGGGCAGAGAAAGAGTGATTGTTCTCAATTTGGAGGTAAAGTAAAGTTAATGGAGATTGCTTCTTCT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BLAST of HG10011983 vs. NCBI nr
Match: KAG6606399.1 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 18-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1586.6 bits (4107), Expect = 0.0e+00 Identity = 911/1426 (63.88%), Postives = 975/1426 (68.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. NCBI nr
Match: RXH86497.1 (hypothetical protein DVH24_021770 [Malus domestica]) HSP 1 Score: 1026.2 bits (2652), Expect = 2.8e-295 Identity = 564/859 (65.66%), Postives = 672/859 (78.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. NCBI nr
Match: XP_038888553.1 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1015.8 bits (2625), Expect = 3.7e-292 Identity = 518/557 (93.00%), Postives = 538/557 (96.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. NCBI nr
Match: XP_038888554.1 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1015.8 bits (2625), Expect = 3.7e-292 Identity = 518/557 (93.00%), Postives = 538/557 (96.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. NCBI nr
Match: KAG6571483.1 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 18-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1012.3 bits (2616), Expect = 4.1e-291 Identity = 520/568 (91.55%), Postives = 543/568 (95.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FMU5 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g14050 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 654.4 bits (1687), Expect = 2.9e-186 Identity = 346/534 (64.79%), Postives = 415/534 (77.72%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8AJT9 (Magnesium transporter MRS2-I OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=MRS2-I PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 481.1 bits (1237), Expect = 4.3e-134 Identity = 262/370 (70.81%), Postives = 296/370 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q10D38 (Magnesium transporter MRS2-I OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MRS2-I PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 481.1 bits (1237), Expect = 4.3e-134 Identity = 262/370 (70.81%), Postives = 296/370 (80.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FLG2 (Magnesium transporter MRS2-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MRS2-2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 476.1 bits (1224), Expect = 1.4e-132 Identity = 270/403 (67.00%), Postives = 309/403 (76.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q304A0 (Magnesium transporter MRS2-7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MRS2-7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 451.1 bits (1159), Expect = 4.8e-125 Identity = 249/401 (62.09%), Postives = 293/401 (73.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498IW84 (RING-type domain-containing protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_021770 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1026.2 bits (2652), Expect = 1.3e-295 Identity = 564/859 (65.66%), Postives = 672/859 (78.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HKC7 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463814 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 998.4 bits (2580), Expect = 3.0e-287 Identity = 514/558 (92.11%), Postives = 536/558 (96.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BMG2 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 18-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold123G00820 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 998.0 bits (2579), Expect = 3.9e-287 Identity = 509/557 (91.38%), Postives = 532/557 (95.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C7I9 (U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497366 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 998.0 bits (2579), Expect = 3.9e-287 Identity = 509/557 (91.38%), Postives = 532/557 (95.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498JRE4 (Uncharacterized protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_010673 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 996.5 bits (2575), Expect = 1.1e-286 Identity = 560/890 (62.92%), Postives = 660/890 (74.16%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. TAIR 10
Match: AT5G14050.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 654.4 bits (1687), Expect = 2.0e-187 Identity = 346/534 (64.79%), Postives = 415/534 (77.72%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. TAIR 10
Match: AT5G64560.1 (magnesium transporter 9 ) HSP 1 Score: 476.1 bits (1224), Expect = 9.9e-134 Identity = 270/403 (67.00%), Postives = 309/403 (76.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. TAIR 10
Match: AT5G09690.2 (magnesium transporter 7 ) HSP 1 Score: 455.3 bits (1170), Expect = 1.8e-127 Identity = 252/409 (61.61%), Postives = 297/409 (72.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. TAIR 10
Match: AT5G64560.2 (magnesium transporter 9 ) HSP 1 Score: 451.4 bits (1160), Expect = 2.6e-126 Identity = 258/379 (68.07%), Postives = 292/379 (77.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011983 vs. TAIR 10
Match: AT5G09690.1 (magnesium transporter 7 ) HSP 1 Score: 451.1 bits (1159), Expect = 3.4e-126 Identity = 249/401 (62.09%), Postives = 293/401 (73.07%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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