HG10011667 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10011667
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr01: 9042017 .. 9050651 (+)
RNA-Seq ExpressionHG10011667
SyntenyHG10011667
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGCTAAAAATTATGGCAGGACAATACAGTGCTGTGAAGGCTGAGGCTTGGCCTGAAGGTCAGCCCAACAATAGAACCCCTTATCTGAAACAGACAGTAAATGCCCTCGCAAAATCCAAGCTTTACAAATAGCCACCAGTAGCCACCACCTTCAAGTCTTCTTCCCAAAACACAAGCGAATGGCTTTCACCCCAAAACCCAACTTTAAGAACAATTGTCAGGAATCCAAAATAAGGGAATAATCTTACCCTGAATCGAACAGTGAACCTATTGTAGCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAACAGAAACGACGAGAAACGATGCAGCGGGGTGGCTGATCGGCGGCGTGAAACGGCGCTACGACGCGACGGATCGCGGATCGAGCAGCGGCTACGAACGCCGACGGCCGTTGCGGCTGGGTGTAAACGACGACAGGCACGAACGGCGGCGGCGGCTGGAACTCAACGAGCGGTTGTGAGACGCGATCAGTTGCAGACGAACGCACGGTGGAGAGAAACTGAGCGGCGCGAGGAAGAAGAAGAGTTTCTCTCTCTTTTTTTAGTTGCACGTAAATCGAGACCCCCATAAATTAATATTATATATTATAATATATAAATTAGAATAATATATTTAAATTAATATTATATACCTTTTTCTTCTCCCAAAATTCACCATATTCTCCAAAATAAACATCCAATTCAAATTTGAATTCCATAATTAAGTATTAGATCCAAAATATTAAACCAAATTCAAATAAATCCCAACAATTAATGTTCAAACACTTGAAAAAAAAATTTGGGATGTTACAGCATCGATCTCTAGCTCCTCTTCCTCTAAAGGATTCATTTGAGTTTTGAGAAACGTCGGTGTTGGCTTCACTTCGACCACCACAACCTCTTCCACGTCTACGACTATTCTCCTCATTGAGTTTGAGTTGGAGAAGTTGTTCAATGGTCTCCGTTTGCTCCATTCTTTTCTTTTACTCCTCATAGGCTTGTAATGAGCCTATAAATTGTTCAATCGTCATAGTCTTAAGATCTTTTGTCTCCTCGATTGTCATGGGGATGATCTCAACTTAGATTTTAGGCTCCATAGAATCTTTTCCATGACACGAACATCGGCGATTTCTTCACTGGTCCATCTTAATTGGTTGACAACAGTCATAATTTTGGTGTGATATTCCCCATCACTTCCTCTCCTTCATCTATAATGATTCAACCCACCACGTAAAGTTTGTAATCGTACCTTTTTAACACAATCAGCTCCTCTATGAGTCGATTGGTGCTTGTCCCATGCTACCTTTGACGTCTCGGCATTGCAGATATTTTGAAATGTGTCTTCGTCAGCTGATTGGTACAAGATATAGAGGGCCTTCTTGTCCTTCTTTCTTCTCTCCTTTAGCCCATCACTTTGCGCTTGATTAGCTCTAGTTTCCGCCTCTTGAAAACCATTTTGGACAATCTCCCACATGTCTTGTGCTCCTAGTAATACTTTTATCTTGATACTCCAACTGTCATAGTTGAGCTTGGTAAGCATTGGTATTTGAAGTGAACTCATCCTGTTACGTCCCAAATTTTCGTGTGTTAATAAAGTAATTGTTTGGTTTTATTTGGGTTTGAATTGGATTTATGTTGGGAGAATTGAGGTATTTTGGAAGAAAGAGAGTTAAAGAAATTATAAAAACATATGTTTATATATTATGATTTATTATTATATATATATTATTATAATATATTTATATTTGGGTTGCCTTGTACTGCGTGCAAGGTAAAAAAATCCTTTTCTTTTCTTCTTCTTCATCGAGCGCTGCAGCCCCCGTTCTTCGTCTACTTCTCGTGAGCGCCGCCGACAACCTCCCTCGCGATTTACTCGCCGCCGCTCAGACCTCACCTTGCGCCGCCGTTCGATCGCCGTCCGCGCGTCGTCCAGAAGCCAAGCCGAGAAGCCGCTGCGTTCACCGTCGCTCATTCTCGCCGCTGCTCGTTTTGGTTCACCGTCACCAGATTCGCGCTCGTCGCCGTCTGTCAGCTGCTCGCCATCAGTCGTCCGCCAGTCGCCGCTCGTCGCTGCCGCTCCCGCCGCATGCTGCCGTCGATCGGATCTGGCTGTTCACTCTGCTGCCAGTGCCGGAGTCGCTTGGACAGTCGCGTCGTTGGATTTGGGGTAAGGTTGTGGTTTCTTTTGGATTCCTAAAGTTTTAAATTGTACCCATCAAGTCTTGGCTTCAACACATTATTATTAATTTCGTTGGATATTAAGCGGTAACCATTTGTGGGTTTGATTGGAGCTCGGAACGGGTTTGGATCATAACGCTTGTTGGATAAATATGTGATTACTTGAACTTAATTGTCGTTTTGGCATTTCGCTTTCATTATTAATTGAAAAGGTTGGGTTATGTTTTAGGGTTGGAGTTTTGGTGCACAAGGTTTTTGGCCGCGATTGTTTCCTGTTTAGTTCGAGGTAAGTGGTTCTATTGCTGGGCTGACCTTCAGGTCAGGCCTTAGCCTGTCACAGTACTGTATTACCTTGTCGTAACTTAACATGCATGTTTAGGACCTCTCTGGCTACTGAAAATTTACTAATTATGTATGTGTGTATGTGTGACCGAATCTCGTGACTAGTAATTATGTATGTATGTATGATTGAATCCGATGCCAGATGCCCGTTTCGTCCCATGCTATATAATGTGAATCGTCAGGTTCACCTTCAGTTTTGACGGTGTGCCATCAGGCCACTAGACAAGCGTGGACCGACGGGTTCACCCCCATGTTCGATAGTATGGGTCGTCAGGCTCACCCTTCAGTATTGACGGCGTGCCCTCAGGCCGCTAGGCATGGTGACGGGACAGCCTGCCTATGTACACAAAGATCCCAGCAATGGGATTACTTACTGAGTTTTATACTCACTCCTTTCATTTTATGAATTTCAATTAAAGGCAGAAACAGACTGGCGGGCGACATGAAGAATCCGTGACCGGGCCAAGTAGGGATACGTTGAGGCTTCCACGTTTCGTTTGTTCATGTTTTTCTTAGATGGGTTGTTCAGTTTTGAACCGGTGGTTTTATTCTTTTTATTTATTTTTCGTTAATTATCTTGATTTAATTTGTTGGTTAGGGGTACCCCGATCAAGATTTAATTTTATTATTTTTTTATATAAAGGATTTTGAATTATTTATTTATTTAATTATTGATCTAATTTCTTAGTTAAATACTTTTTTTAACAAGAGGTTGAGCCTTTGTTTTGTGTCATCAATCTAAGTCTTTGAGATGTGGTAATGTGCTAGTAGAAGTGTCAGGAGTTGGGGCGTTACAGTTGGTATCAGAGCCTAAGTCTTAGGTTTTGTAGACTGACTTACAATGTAAGTCCAGGTTGTCTCATTTGGCCATAACGGGTTCTTCGTCGCCGCCAGGTATGTTTAAATAAAATTCATAATCAAAGTATAAATGTATAAGTATGTTTGGGTGTGTGCATGCGAGACTATACTTGTTTGATTGTTGTGTAGGCTGGCCTCCTTTTCTTTATGATGCAGTGTTTGCTAAGAAGTCTTACAGGTGGTTGTTAGGTGATGGCGCCAAAAGACAAGGGGAAGAAAAAGGTCAGAGTCATACAGCAAGACCCCGTGGGCCCGGACCCCCCAGCGCCGAAGGACCCTTGCCGCCTAGAGACCCTTCTAGGTCAGGGTGGCAGCAGACCCGAACCAGGGGCCGAACGGAGGGTACGAATGTGCCTACAGGCACCCCGGTCGAATTTTCAGCTATGGCGGCAGCGATAGGGGAAGTGTTGCTAGGGAAGATGAAAGAGATGATGGATGAGCAACTGGCCCAGTTCGCCCAGTCCCAGCAGGTACCCGTCCAACCAGCTCAAGCACCACAGGGTCAGGCCCAACAATAGAATGTGCAGGACCTATCTGTTGAAGCTAAACATCTAAGAGATTTCAGGAAGTATAACCCTCGCACCTTCGATGGGTCATTGAAGGATCCTACAAAGGCGAAAATGTGGTTGTCAACGATTGAGAAAATTTTTCGTGATATGAAGTGTCGAGAGGATCAGAAACTTCAATGCGCCGTGTTCATGTTCACAGAAAATGCAGAAATTTGGTGGCGCTCAGCAGAGAAGACGATAGACACGAATGAAGGGCTTGCATCCTGGGAGCAATTCAAGGAGTGTTTCTACGAAAAGTACTTTTCGACCCACACCCGGCACAGTAAACAAGCAGAGTTCTTGAGTTTGAGGCAAGGAACCATGATGGTAGAGGAGTACGAGCAGGAATTCGACAAGTTGTCCCATTTTGCCCCAAAACTTGTGGCCACCGAAAAGGACAGGACAAAAATGTTTATTCAAGGCTTGAGGAGCGGAATACGAGGGTTGGTGCACGCGATAGAGCCTCAAACTTTCGCCCTAGCGCTTCGTGCCACCGTAAAGATCGACGCGGATGCCAGGGACGAAAGTGAGTATAAAAAGTTGGAAGCTGGGATTTCCGTGGGGTAGAAGAGGAAAGCGCCTGAGCTAATACAGAGGGATCAGTCTTCAGACAGACCCTTACGACACTATTGGCAGCAAGCTTCAGAGGCAGGCTGGGTAGAGAGGAGTCGACCGGTGTGTGGCACTTGTGGAAGGCGACATTGGGGACGATGCCTGGCTGGCTTTGGAGTTTGTTTTCACTGCAGAGAGGAGGGACATTCACTTGACAGATGCTCTAACAGAAACAGGTCGAGTAGTAGAAGCCAATCTACCGGTTTTAGTCAGAGGGGTTCGAGCGCCCCACAGCAGCAGCAGCAAGGCCGAGTGTTCACTACAACTCGGCGAGAGGCATACAAATCTAATTCAGTGGTGACAGGTACACTCCCTATCTTGGGGTATTATGCTTTAGCTCTATTTGATTCAGACTCGTCGCATTCTTTCATTTCATCTTTGTTTGTGAGGCGGGCCATGTTAGAACTAGAACCTCTGCATTATGTGTTATCAGTTTCGACTCCGTCAGGAGAACTTGTGTTAGCTAGTGAG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mRNA sequence

ATGCTAAAAATTATGGCAGGACAATACAGTGCTGTGAAGGCTGAGGCTTGGCCTGAAGGTCAGCCCAACAATAGAACCCCTTATCTGAAACAGACAGGTAAGTCTGTGGACCGGAGTAGTGCTCATGATCGGATCGAGCGGACAAGTCCAGTTGGTGATGATCATCGGGTTGGTGATGATTGCCATAACGTCGACCCCATGACAGTTGTAGCTGACGAAGCCTCGAGTGTTCACGAGCAGATGGACGAGGTATGA

Coding sequence (CDS)

ATGCTAAAAATTATGGCAGGACAATACAGTGCTGTGAAGGCTGAGGCTTGGCCTGAAGGTCAGCCCAACAATAGAACCCCTTATCTGAAACAGACAGGTAAGTCTGTGGACCGGAGTAGTGCTCATGATCGGATCGAGCGGACAAGTCCAGTTGGTGATGATCATCGGGTTGGTGATGATTGCCATAACGTCGACCCCATGACAGTTGTAGCTGACGAAGCCTCGAGTGTTCACGAGCAGATGGACGAGGTATGA

Protein sequence

MLKIMAGQYSAVKAEAWPEGQPNNRTPYLKQTGKSVDRSSAHDRIERTSPVGDDHRVGDDCHNVDPMTVVADEASSVHEQMDEV
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 36..62
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 17..63

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10011667.1HG10011667.1mRNA