HG10011341 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGCTATTTCAGATACAGATTTGAAGTATTTATTGGACAATTTGGATGGAAGGATAAATGAGAATGAGAAATGGGAACGTGTTGTAGAAAAAACTAATGATCATCTTTCATATAGTGCTAAATGCTGCAAGCCTAAGGTTCTCATCCTCTCTTTCCTTTTTCACATGTGGGATGATATTTTGGTCAAGTTATGAATTACTATTCTATTTGTTTATTGAGAGTTCTTTGTTTATTTGGTTTGTGAAGTGAATGATTCTGAGTTCAAATGGTCAAATACTGATCTTGTTGCAGGATGGTCCCCTGAAATACTCGAGTGTGACAGTATTTGAAAATTGCTGTCCAAAATTGTTGAGAGACTTCTACATGGACAATGACTATAGAAAACAGTGGGACAGTACCATGCTTATGCATGAGCAGCTACAAATGGATGGAACTAGCGGAATTGAAGTCGGTCGCACCTTAAAAAAATTTCCATTATTGACGCCCAGGGAGTATATACTATCATGGAGATTATGGGAAGGGAAAGATAAATCCTTTTACTGTTTTACCAAGGTATTGATTTTAATGCTTTGCCCACCGTGGCGTGCACTCATGCACATGAACACAAAAAGTATGTATTTATTCTGTTTATATTATTTTGATAATTCCCAAACAAGGAAAAGCTCACTATATTGTGGTTCTCTGCCTGGAGGATTGTATTGTATTATAAATTTCTCTTTTATATTGCTTCTAGTAGGAAGATTTATATGTATATAAGAAACAGAACGTTTCTTAAATCTAAGATTGAGAATCTATCAAGCCAATGCAATTACAAGTCCATCATTGTGAGAAGGAGATGGATTTCTCTTTACTCACTCTTCCTCTCCCCATCCATCATTGTCCTCCTCTTCTTCTGTTGGTTCTTCTTTCTCAACAGCCCTACAAGTATTGAGATGCTAAAAACGGTCAATGCCTTCCCAAATGGACAACAAGCAAGCCTTTCAATCTTTGACAATATAAATAAAGAAAACATTAGCCTATACAGTGCCCAACTCAATACCCCCTCCTGCCATGACACCCTTTCTTTCCCTCCCACCCCCTCTGCCACGAAGATGAACTCACCTACCTGCATCCCAACAATGGAAAAGGCACCATCGACATACTTTGCCACCATAGAGAAAAGAATTACAGTATAGAGACCAATAGCATAGCAAACTTTAAGGAACTGGAGTTAAAGATCTCAGTGAGGACAAGGGATTGAGCCTTCTTTATTAGCACCCACTAGTCGTCTCTATGTTGGCCAGAAGAATCTTTCTCGTTTCCTCCTCATACTCCCCTAAACTAGATATTCTTCAAGGAAGCTCACATAGAAGGCCAAACTATCTAGGTAGAAAAGGCCTTAAATAGAAAGGGAACCATAACTGAAATTACCCTTCTATCCAACTATGGAGGGATAAACAGAATTATCTTCCCAGTGGGAGATGAAAGAAAAGGACAACATGGGCTTTATAATCTCATCTCCAACTACCCCTCTGCTTCGCCTGTAGGGAGCATTAACCATCCCAAACCCCCTTCCCAGGGTTCAAGCTCAGCACTAAATCCCCCGCTTTAAATGTCTACTTTATTCTACAAGGAAATAGTTTCTCCAAGCAGGAAGGAGGATTTGTAATTTACCTCGAATCAACCTCACACATACCCCTACTCCTTCACAAGATACCTCCACAGTGTCTACAAGGAAATGCTTCCATGACGAATGATACAAAATTATAAGGCCCTTTATTCCCTTATTAGTGATTTCTGCCTTTTAAATCCTTTTTGGTTAAATAAGGCTCTTTTACTTGTGAAAATGGGGACCTAGCCAAAACCCATTGCTTCTAAGTTTATTTCCTTGAAAATGACTTTTGGCAGGAGTGTGAACATCCTTTGGCACCACAACAGAAGAAGTACGTGCGAGTGAAATTTTTCAGATCTGGTTGGCGAATCAGGAGAGGCAAGTGGCTGTCCTCTCTCTTGTTGCTTTTTTTAATGGTCATTAGTTTTTTAATTCACCTAGGAACATTGCATATTTTATCAAAGAAACTCCAAATCCAATTGCATATTGTTAATTGCTCAGGTCATAGAAACGCGGTATAATTAATGTCTGTAAAAAGTTCCCTTCCTTTTTTGTTATGCTGTCTTGGAGTTCATAGATGGTTAACTGACGTTTTTCTTTCTTTATAGGGCATTTTTTAAAATATTAGGGGAAATTATCTTTTAGTCCTCTTTTGCTTACTTCTAAAGAAAGTTTCTATTTGCTCCCCACGTTTCTTGCTGCAGTCAACAAAAGGTGATTGAATAATTTTAAAAAAATTAGATTTGTAACGTTAGTTGTGTTGACACAAACATTTGCAACAATTACTTGGTTTTATATTTTTCTTGTATCTCACTTCGCAATTTTATAAATCAAGTCAAATTGTCAAATTACCAAAGACTAAGAAAAAATTTAACAACAATTTTTAAATTAAAAAATGAACCCAATTTTGTAAAAATTCAAGCCGGAAAGGTGTTTGGAATGATAATAAATTAGTTGGGGATTTTATCTATTGGGGAACTAGAAATGGTTGTGTTCTGTCCCTTGATCCTTTAGGCTGTTCCGGTTGAGTTTTTTTATTTATTTTTTAAACCAAACACAAAAAATATACATGTACATAAGAGGAAAAATGTATATGTTTGTGCCTTTGTTTATTGTTATTATTATTATTTCCTTTCCGTTAGAAAAGGAAAACTGGAGCTTGCTTGAAGTCAAAGTTCTTGTTAATTGTTATGGATATTGCCAAGTCTAAGCCCACGGTTTCTTTGTTCTGATATTATATAATTAATACAATTAAAAAGAAGCCAGTTTTTCACTATCCTGGCTTACCATAAAGAACTATAAGAGTGTTTGGACCCCCAACTTTAAGTAGGTGGAGTAGGCCAATTATGATAGTTGGTTTTTCCAACTGTTATAACTTACAATTAACTACAATATTACTATTTTAAATCCCTCTTTGTCATAGATTTTACTATTTTTTACTCGTCCTCTCTTTCCTTCTTTGTTATAGTGTTTACTATTTTCTACTCAGACTAAACTAGTCTACACCCCAAACACAGACTGTTATAACCCACAAACTATTATAACCACTAACTATAATAACCAACCCAGTACCCCAAACACTCTCTATTTTACTATCTTTTAGAATTCAAGGATTTTATTTAATTTTTATTATTTTTTTAATGAGAATTTTAGGATTCAAGGATTAAAATGTCACTTTTAAAATTATGGGATCAGATGGAAACTTTCTTGAGAACTCATGAATATTAGGGATTTTGCAAAATGGAACTTTTTTTTTTAAAACCATCTAAGTAAATAAGCTAGCTATAAGTGTAGAAGATTAGGCGTACATTTTTTCTAGACTTCAAATCTGAACCACTTATCCTAATGGTTTCAGATTATTATAATTGCAGTATCCGGCAGAAATGCATGTGAGATCAGTATGTTGCACCAAGAAGATGCTGGTTTGAATGTGGAGATGGCAAAACTTGCGTTTGCAAAGGGCATATGGAACTTTGTCTGTAAAATGGATAAAGCATTACGCAAATACGCTCTAATCCACTGCCCTCAATCAAGTTCACTTGTCACTGCAATTACTCTGATTAAGAAGGTTAAAATGTTTACTCTTTACTTTATTGATACTAATTATACAATTTGGTCAAGATTAATGTTCGTCATTTTATTCATTATCCAAGTGTACGTAGTATGTACTTAATTGTTTTATGGAGTGTTCTTATACTCACGCCCCTTACTGTTGTGGCAGAGAACACACTTCGTTAGTTTGCTTCGGGCAGTGTTAGTGGTCTGTTTATAGGTTGAGCTTCGATTTGTAGAAATTTGTCGTAAAGGGAATTCCATGACAAACATGTTATAGATTTAGGTCACTTTGAACAGAAAAAAATTATGGCAGAGTTTTTAAAGTATAAGTGACAATAGTACATACATGTTCCTCTTATTGGTGTTCTCTTCCCAAGGTGTCCTCTCCGACATTTAGTTCGAAAAGAATCAACGAATTTTTCAGAATTCTGCTTAAACTTCTTTTGCTTGCTTCGACTCGGCTTGTCTAAAGGCTTCTAATTAATGGAGTTCTCTTTTCAACACTTTGGATGGGTTTTCAATTCAGGATATCTATAGTGGATGAAATGCTTTCATTAATCCCTTTTAAGCTTTTTAAGACTTTGTTTTTTAAGGTTATGCTCTTGTATGTGTTATTAGTCTCTTTTCATGTTATCCTCATTTTGCGTTGAGTTATATCCTTTGGAATACATGTTCCTCTTATAGCTTTCTTATGATGGATATGACTGAAACCCATTTTCGTACATAAAGGTTCCAGATGGATTTGAGGACATGGATGGCATTATCTCTAAAGCAAACATTGTAGAAACCGAGTCTTGTGGAGAAGTTTCTTCAGAAGAGAGAAAGCTCTCGAGGGCATCAAAAAAACTTGTGGCCAATGGTTTGCTTCTAATTGGTGGTGTGATCTGCCTGTCGCGAGGTCACTCTAGTCTTGGTGCCAAAGTTGTTATGGCATATATTCTTACAAAGCTAAGCAAGCGAGTTGATGCACCAGGAGGCCAAATGGCAACTAAAGAACCGTAATTATATGACATAGTGAAGGAAGGGAGGAGATATAACCATGTTTTCTTTCGAGCACTAGGCTCTTTATACTACACAAATGAAAAGTTTCGTTTTTTTTTCCCCTTTAAATAAAAAATCTTGTTCAAATATCTGTATCATACAGTATAGTAAGTTGCAAAGTGTTTGTTTTTGTCATTAATATTTGTTATAGATCATATGCTTCATTTGTTTCTATAGAGGTTATAGTGTCAAAAAGAGTTTGTTTGGATTATGGGCCATTTGGATTGATTTTCTAAGTATTTATATTTAAACACTTTGAAAGTCAATCCAAGCGGGTCCTTTCTAGGTGCTTAAAAGTACTTT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MEAISDTDLKYLLDNLDGRINENEKWERVVEKTNDHLSYSAKCCKPKDGPLKYSSVTVFENCCPKLLRDFYMDNDYRKQWDSTMLMHEQLQMDGTSGIEVGRTLKKFPLLTPREYILSWRLWEGKDKSFYCFTKECEHPLAPQQKKYVRVKFFRSVSGRNACEISMLHQEDAGLNVEMAKLAFAKGIWNFVCKMDKALRKYALIHCPQSSSLVTAITLIKKVPDGFEDMDGIISKANIVETESCGEVSSEERKLSRASKKLVANGLLLIGGVICLSRGHSSLGAKVVMAYILTKLSKRVDAPGGQMATKEPSSAARRPPLSVFPHFLKSTKLVQGYFSPCIGTRMKPALVHSPLLAGDGHGHGGNNNGGWNNSNPFGGFGWWQDDGDSSPWSDNAFFAFFFTSILGCFCLFQLAAALARNEMNYESVWEVKGGKRIRLILDTFRDEFHVATGMPSSSLSFSFVNVWLRCSDVFRRLMLPEGFPDSVTSDYLEYSLWRGVQGIASQVSGVLATQALLYAVGLGKGAIPTAAAVNWVLKDGFGYLSKILFSKYGRHFDVHPKGWRLFADLLENAAYGMEMLTPAFPLHFFVIGAAAGAGRSAAALIQAATRSCFYAGFAAQRNFAEVIAKGEAQGMVSKSIGMMLGITLANRIRSSTSLALGCFSIVTLIHMFCNLKSYKSIELRTLNPYRASLVFSEYLLSGEVPSIKDVNNEEPLFPAVPFLNTRLACDEPKLGLLSAEAKESAANIEKRLQLGSKLSDVATCEEDVLELLSLFNKENYILSEHRGKYCVILKESASPVDMLKAVFHVNYLHWLERNAGITARSASNDCRPGGRLQMSLEYVEREFNHIKYDGELAEFYSHSKIRSTTSPLFLVSYTGRSTNSNATVPVGHWRTLPLSASHITHTAAPHLIKNALTASIEGNRSRPRIENKPSSNSRPALVEVYKDASLKSNSQREMIGLHRNDFVDWFNLAVKVVIVCGLGQSLGRNLLEFIMQPWTQLLLGILKTKINYIGVKEMELRMKVTQAVHVLNHDTQSCNRVAANQWLVQFQQTGAAWEVATAILTSDHVQHPLSSFVPDLEVEFFAAQILKRKRIKKVLEEEACILSIDGNFGPKEVAPSLPVDNSSPQELLEDVMQSSSSAYTSPMSSSLIPDNLLLWLRLGAFSFRQFLLVLKELQFKGVCLIQNEGYHLQLGVKDALLNALLVAAKKFSSGPPQLLTQICLALSALILRTVEHGKPIDRLFYSLQNLQSVDNGNLAVLEMLTVLPEEVVDSQNVDCKISSSCRSQYARELLLHTPMVLEFLLQQSEKGFDCGTQPQERNRKILRCLLSWVRVGCFSEIPQGSLPTHPLLNFVLKSLQDAASFDLAIEVLVELVSRHEGLPQVLLCRVHFLKEMLLLPSLSSGDEKVISGLACLFSEVGQAAPSLIVDASAEALALADALLSCVAFPSEDWEIADSTLQFWSSLASYILGLDENNSANRKHVEDVFLSVFSALLDGLLLRAQVSFPVLLVLDTPNTKLVLVACLSERLLIYFMLSFV Homology
BLAST of HG10011341 vs. NCBI nr
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BLAST of HG10011341 vs. NCBI nr
Match: XP_011651345.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8650562.1 hypothetical protein Csa_009558 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1025.4 bits (2650), Expect = 5.1e-295 Identity = 511/545 (93.76%), Postives = 521/545 (95.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. NCBI nr
Match: XP_008449956.1 (PREDICTED: protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1008.1 bits (2605), Expect = 8.4e-290 Identity = 501/545 (91.93%), Postives = 517/545 (94.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. NCBI nr
Match: XP_031738101.1 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 977.6 bits (2526), Expect = 1.2e-280 Identity = 492/545 (90.28%), Postives = 502/545 (92.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. NCBI nr
Match: KAG6581156.1 (Protein root UVB sensitive 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 964.5 bits (2492), Expect = 1.1e-276 Identity = 517/703 (73.54%), Postives = 563/703 (80.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7X6P3 (Protein root UVB sensitive 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 595.5 bits (1534), Expect = 1.7e-168 Identity = 328/554 (59.21%), Postives = 404/554 (72.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84JB8 (Protein root UVB sensitive 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RUS3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 176.8 bits (447), Expect = 1.9e-42 Identity = 127/374 (33.96%), Postives = 196/374 (52.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q499P8 (RUS family member 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Rusf1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 167.5 bits (423), Expect = 1.1e-39 Identity = 90/245 (36.73%), Postives = 142/245 (57.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91W34 (RUS family member 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Rusf1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 1.3e-38 Identity = 89/245 (36.33%), Postives = 140/245 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5R8F6 (RUS family member 1 OS=Pongo abelii OX=9601 GN=Rusf1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 164.1 bits (414), Expect = 1.3e-38 Identity = 100/297 (33.67%), Postives = 156/297 (52.53%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BP56 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103491686 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1008.1 bits (2605), Expect = 4.1e-290 Identity = 501/545 (91.93%), Postives = 517/545 (94.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F2S0 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 951.8 bits (2459), Expect = 3.5e-273 Identity = 481/560 (85.89%), Postives = 509/560 (90.89%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F1U0 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441619 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 947.2 bits (2447), Expect = 8.5e-272 Identity = 481/561 (85.74%), Postives = 509/561 (90.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7M2 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482094 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 945.7 bits (2443), Expect = 2.5e-271 Identity = 476/560 (85.00%), Postives = 510/560 (91.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J7Y8 (protein root UVB sensitive 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111482094 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 941.0 bits (2431), Expect = 6.1e-270 Identity = 476/561 (84.85%), Postives = 510/561 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. TAIR 10
Match: AT3G45890.1 (Protein of unknown function, DUF647 ) HSP 1 Score: 595.5 bits (1534), Expect = 1.2e-169 Identity = 328/554 (59.21%), Postives = 404/554 (72.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. TAIR 10
Match: AT1G12930.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 438.7 bits (1127), Expect = 1.9e-122 Identity = 252/488 (51.64%), Postives = 311/488 (63.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. TAIR 10
Match: AT3G13062.2 (Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein ) HSP 1 Score: 371.3 bits (952), Expect = 3.7e-102 Identity = 184/309 (59.55%), Postives = 235/309 (76.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. TAIR 10
Match: AT3G13062.1 (Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein ) HSP 1 Score: 371.3 bits (952), Expect = 3.7e-102 Identity = 184/309 (59.55%), Postives = 235/309 (76.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011341 vs. TAIR 10
Match: AT3G13062.3 (Polyketide cyclase/dehydrase and lipid transport superfamily protein ) HSP 1 Score: 364.0 bits (933), Expect = 5.9e-100 Identity = 184/317 (58.04%), Postives = 235/317 (74.13%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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