HG10011088 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAATATCATCCCGCCACCGCAAACCCGCCATTTTTTCTCCCTTTTCATTTTTCACTTTTTGAGGCTCACATCCACCGTCGGCAAACACCCACTTCGATTTCGTCTCTGTTTCACCGTTTGGGGCTCACATCCACCGCACGATCCACCTCCGTCACCGTCTTCTTCGCCGCCCTCCTCATTTCGTCACTCCCCACAGTCCTCGCTTCCGAGTCTGATCACAAGGTACAGCTTCCGTTCTTCTTGATCTCCCCATCTCTCCCCCCTCCAACTAGCAAGAACGTCAAAATGGCGATGTTAGTATGTATACGCGGCAATGTTTTTGGTCATTAAAATCTTTAATCAGCATTCACTATATTTCCTTCTTACTTTCGGTTGCATATGAAAAATTTAAAATCGAAGTGTTGTTGTGTTTTAGGGCATTGATCCCTAGGCATCTGCGTGGACTCAAGTATTGAGGAAGAAATCATGCGAGAAGAGTAGCGGCCTTGGCTCTTACTTATTACATGTCCTTTACGTATTATCTTTAGTGTTTAACTCCATTTGGTATTTATGCTGCAGTCAAGGCAATTCAGGCGACGATCTCAAATTTGGTGGTAAATGTCCTAAAATGAATTGGTTGGAACACTCAAAAGCACATAAAGATTTCACATGCCAAAAGAAGTTTCTGTGCTCAAATTTTCTCTTCTCTCTACCAGAACAAAAGGCTTCTTCTACAGGAGCAATTGACACTGGGTATCTATCCCATTAATTGGCTTAACTTTCATATATCCTTATCAAAGTGCTCATACACTTTGCCTTATTTTCATTAAATAATGATAATTCATTGTCCGTTTTCTTTTCCCTTCTGCACCTAGTTTCCCAGTTAATTTGATACTTATTGGTCCTTGAGATTGCGTATATTTTCTCCTGTTTGAATGCATGACACGACAAGGCATTCCACTTTTCTAATTTCTTACCGAACTTTAATTATTTTCTCAACCAATGTCTCAGACCTATATTATATTTTTAACTATATATTATCCATTGAATGTTATAATTAAAGCCATTATATTGAATAAACGTTGGCTTGAAAGCCAGCAGGGTTGTTACCTATAATGTAAGAGTGACAGGAAAAAAAAAAAAGGCTCTATTCCTCATGATCGCCTCTCTCTCCAGTCTCCCTCCCCTTTTTTGTTTGGTAGCTTCCTTGGTCGCCATCAAGCCTTTGCTCCTTTCCTGAGCTTTATGCAGTCTTTGTTGATCTTTAATTTTGTATCTTTTGGATTCGGATAGTAGACCTTTCTTGGTAACTGTAGAAAGGATCTATCGAAGTGTATAGTAAATTAGAGGAAACCCAACCAAAAGTGGGAAAGAGATAGTTTCTCATGAAAGCTCTGTCTTGCAATCGTAGTTGATTCATCAACCTCCTTTCCTTTCCCTGAAGCCTAAAATTCTTACTTGAATTTCAAAGTGTAGACTATGTATTGGGTTTAAAAAAACGTTGGCTAAAATCATCATGGGTTGGCTTAGTGGTAGTGGGAACATCCAAAAAAGGTCAAAGGGTTAAGGAGTCATGAGTTCAATTCATGGTGGCCACCTACCTAGGATTTAATATCCTACAGGTTTCCTCGACATTCAAATATTGTAGAGTTAGGCGGGTTGTCCTATGAGATTAGTCGAGGTTCGTGTAAGATGGCCCGGACACTCATGGATATAAAAAAAAAATGTTGGCTAATTTAATTTTCTAGTTTATGAAATTTCACCTTTCTGTTTGTTTGGTCCATAGATTTTCAAAGACTATGATTTAACCCTTAGTTTTGCCAAATAGTTTCATTCAGTTATTGTTATTATTTCTGTTAGTTGCATAAAACCCTAATTTTGGAAAAAAACAAAAATAAAAATTGGGAGACTTTGAATTGGATAGAGAATATATTAAGCTTGGAAGGCTCTTCCACCTGAAGCTATGTTGTCCCTGAGAGATCCTTTGCTAAAATAGCTTTCCTTTAATACCCCAGTGAACCTTCTAAATGCTATTAAAAGGATCCACGAAATAAACCTTAGAGTTTGCTTACATCCTTTGAAATTTTCTTTTTGTTGTCCATGGAAGATTTTTCCACACTAATTGGTTCAAAATGCTACCAACCTTCTGAGAAATTAAAAACGTTCTCTATTCTAGTAACCTTTTCCACGTGATGAAGTTATACTTTGACTTGAAGATCCTGGCTATTCTAGACTTTTGCTTTCAATGCGAATAGTGAATTGTGCAAGATTTTGTTTTGAAATCTGAGACAGTAGATTTTTTGAGACAATTGAGAGGTTCTGTCACTCCCTCTCATAAAAATTGGATATAGGTTAATAATATGCCTCTAAAGTGGTTGAATTTGAAAATTTTCACTACTACAGGAAAAGATAGTGGTGGCTTTCTAGGCTGTGTTGTCAAAGCTGTAAGATTGGATATCATCATGGCCCTTTAAAAAGATTAAACAGAGCTTCGTTCATTTCATCCCCTCTAATGCTAGTTTTACCCCATCTTTTGGGCATCTTGCTATAATTCTTGTGGTTTCCTTTGACAAATGACAACTCAAAGTTCTTAATTGAAAATTTGAATGAAGTCCATACCTTCATGGTTCCTTTTATTTTGAGAAGCAACCATTCTGAAAGTATTGAGACCAATAATCTTTGTCCATTTGATAAACTTGGTTTAGAGCTTTCCTTTGGTCTTTATTGTTGGAAAGGAATAGAACATTTTTGGGAGGGAAAAAAACCCTTTTGAGATCTTTTGGGAGAACTTGTCTTTGTGGCTTCTTCTTTGTGCAAACTTATTCCTGTAATTCCATCTATATCTTCCATTTGCATCAATTGATGGCCTTTTCTTTAACTTACTGTCACTGAACGTGGCTCATCTTTATGTTTCATTTTAAGTTTTTAACAATAAAATAATTTATTATCACACACACAAAAATAATTATAAATTTAAGGAAGGTTTTCATCGAAGAAAGAATAAAAAGCTTGTAATTTGAAGTTGATGGAAAATTGAGATTCTACACTCTCGGCATTGGTTTGATTATCTCCATAATTTATTAGTTTTTTCTTTTCCTGTGCTTAGGAATTTGGCTTGTCAGATGCAGAATGCTCAAAGAATACGAAGGTCACAGATTGAAAAGGTAAAATCACAACTTCATAAACGAAGGAAGATAAATCACAAGAAAGATTGTAACTAAGAATAATTTGTGGCAAGCTGGGTGTGTGACATTGTCAGGTCAAAATTAGTTGGTTTGGAGGCTGTTTTTGTAGGTTGCCTCCCTTTTTGTGGGCTTTATTTCTTTGAATGTCCTTGTATTCTTTTGTTCTTTTTCAATGAAAGTTCAATTATTGATTAAAAGAAAAGAAAGAAGAATAGTTTGATGTCAATCTTATCTATTTTTACTTTTTTTTCCTGAAATAGAAATGAACTTTTCATTGATGTAATGAAAAGAGACTAATGCTCAAAATACAAAACTTCAAAATACAACGATACATAGGAATAATCGTAATAACTATAGTACCATGGATCAGAAGGTGCACTAGGACATCTCAACTAAGTTGACACCCCCATAGCACCCTCATCATATCCATTTACAAGAAGAAACTATCAATACAAAAGACAAAAGACTACTTGCTTGATTACAAAGAAGATATAAAAGCATTCCAGTTGAGACAAACATCCTGAATAGAATAATCAACGAAAAACTTTGACTGAGAGCATCAAGAAGAGGCTAACAAATGAGCTGATCCAAACCAGTCTGACCAATCAATAGCCTTGTTGTGGAAGACTTGCTGGTTTCGCTCAAATCAAATTTTTGAGATCAATGCTTTAACTGCATTTGACCAAAAGAATTTGTGACTTGGAGACAAAATAGGGCTGGTTAAAATGTGGGAGATATTGCTGTTAATATTTTGTCCAAAAACCCAATGTAGACTGAAATATGAGAATAGTTTCCTCCAACATTTGCTTGAATAAGGACAATCAAAGAACACATGTTGAAGGTCTTCACTGCTTGCTAAACATAAGTGGCAGATGGTGGGAGATAGGTAGGGAAAATGAAGTTTATGTTGCAATACTCCAGAGCAATTAATCGTTTTGAACATCTTTGCACTTTGTAAGCTTACTTTGACCCAAAATGTTATCTCTCTTCTCTCCACGATCTCTCCTCTTCTCTGTTCATCTTCAACCACCCATCCTGTCGATTCGAGCACCCATGAAACATCTGAAACCACCATTACAACCCACCATGGCTACTACTTACTCTTTGTAAATCACCCATTGACCCAAAAGCTTAAGCTGATGGGTGAAAGTAAATTTAATATTATATCATCTAACCCTCTTCCTCACTTGTGGGCTTAAAATATTTAGAAGACCAACAAGTGGACATCAATATTAATTAGGGAGGAAATAACATTGTAGGGGTTTGAATACAGGACCTCGTAGACCACATGCTTTGATATCGAGTTGAAATTGGGAAGAAAATATTGTTATATTATTCTATATGATGAATCAAATACAAGATCTTTTATATAGACGAAAGACCAACTACCAATAAGGAAAAAATCCAACAGACATAAATGATGGATATACACATGATAATCATCTAATATTACAAGAGATAAAGGAAATCCAGTATGGGATGAGAGAAACAACAGAGTTTTTCAAGAAAAAGAAAGATCCTCAGAAGCTGTTCTTGAATTAGTTGTTTTCCATGCTCTATTTTGGTGTAAAAATTTACAGCCTATACAAGTACACATTTCAAATTTCCTTGTTGCAAGTTGAAGAAAATTTCTGTATCCACTGTAAATGAGCTCCTTTTTGATCTATTTGGATATTTCATCCAATCGATGAATTGTTTCTTATTCAAAAAAAGAAAAGAAATAACTGTTTTCATTGAGAATGAATGGAAGAATGTACAGACATACAAAAGAAAACCAACCCACAATAGACCCCTTTAAAGAAAGGAGCTCCAACTAAGAATAATGTT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MEYHPATANPPFFLPFHFSLFEAHIHRRQTPTSISSLFHRLGLTSTARSTSVTVFFAALLISSLPTVLASESDHKVQLPFFLISPSLPPPTSKNVKMAIQGNSGDDLKFGGKCPKMNWLEHSKAHKDFTCQKKFLCSNFLFSLPEQKASSTGAIDTGNLACQMQNAQRIRRSQIEKAWNALSNIQISGRHYAKPGKTRQVKDVFADCPPDTGRITSNSLSDANAGSQYKKSILHLTGDIFFLILEDEDDDIIENIDVDQIVEQYQSQSACTPQPSVSKLPPITPIIEKDNVARQEESNFPDELCTNCSHGFKIELCPEASGHLQELKDRLISISNDLLDNVNNLSPVQIDKLRQERLHLNKQIQLLERHISLDAVNEERRRSHLLATTVTPKTFHFETPQGFEFRTDSKLNTSHVHLHCEPRRIEPWNSMGSSYSDERFGMSSGPVEREPYIPKVIDVNYIEGSNDKKWSSLNFSWTKELEANNKKVFGNHSFRPNQREVINATMSGYDVFVLMPTGGGKSLTYQLPALICPGVTLVISPLVSLIQDQIMHLSQANISAAYLSANMEWSEQQEIFRDLSSDCSKYKLLYVTPEKVAKSDVLLRHLESLNARYLLARIVIDEAHCVSQWGHDFRPDYQGLGILKQKFPKIPVLALTATATASVKEDVVQALGLINCIIFRQSFNRPNLWYSVIQKTKKCVDDIDKFIKENHFDECGIVYCLSRMDCEKVAERLQECGHKAAFYHGSMDPAQRSFIQKQWSKDEINIICATVAFGMGINKPDVRFVIHHSLPKSIEGYHQECGRAGRDGLRSSCVLYYSYSDYIRVKHMISQGAVEQSTLVSGYNRTNLGSSGRILETNTENLLRMVSYCENVVDCRRLLQLVHFGEKFDPGNCKKTCDNCLKSMNLIEKDVTDIAKQLVDLVRSMGQQFSSAHILEVYRGSLSQFVKKHRHEKLSLHGAGKHLLKSEASRMLHHLVIEDILVEEVRKSDIYGSVSSLLKVNESKVRSLLNGGQRITLRFPSTTNTNKLSKSEMTPAKGSLVSGKMYPNIDTPAQPQSEIDVQLSAKLYSSLRMLRTNLVKEAADGVMAYHIFGNATLQQISRRVPRSKEELLDINGIGNNDSAKRRRSGNKDADEYLEENGATKSFDRSKKRATEIQNKVPKVHNSSRPEHPDQFFDSELDFDDSYYEIHDLESNLSRARASPPHRAQIADDSILLHLDSSRRGPTYSSPPVPLQLMEPQTENHRDENGDVKRDGDDYEDRDVEEFRILGHSMCLKRRRDGESSSLLGSTKRVSCEFDMETRRNAVRSWGNQNLRAADPKLFGIMEKEKQRQIMGIELIASENYVCRAVMEALGSHLTNKYSEGMPGARYYGGNQYIDEIETLCRERALAAFDLNSHTWGVNVQPYSCTSANFAVYTGLLLPGDRIMALDSPSGGNPSHGYCTRNGKKVSGPSIFFESFPYKVNPQTGYIDYDKLEERALDFRPKLLICGGSAYPRELDYASFRQIADKCGAVLMCDMAQISGLVAAKECCSPFEYCDVVTSTTHKSLRGPRGGIIFYKKGYKPRGRAIVLYQGNDTKQYDFEERINFAVFPSLQGGPHNNHIAALAVALKQVATPEYKAYMQQVKKNAQALASALLRRNYKLVTGGTDNHMVLWDLRSLGLSAIEISLAGIHPIVLNLGTLTSLGGPKFANRYNLWRSTLGKNLEQLCEMCHITLNKIIIFGDNGIITTGGVRIGTPAMTSRGCLESDFEVIVEFLHTAAQIAICIQREYGKLPNAFLTGLQSNNEVVELGYRVESFSAKFAMPGVET Homology
BLAST of HG10011088 vs. NCBI nr
Match: XP_011651280.1 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1995.3 bits (5168), Expect = 0.0e+00 Identity = 1021/1188 (85.94%), Postives = 1045/1188 (87.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. NCBI nr
Match: XP_038877356.1 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038877363.1 ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1987.6 bits (5148), Expect = 0.0e+00 Identity = 1014/1197 (84.71%), Postives = 1042/1197 (87.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. NCBI nr
Match: XP_008456057.1 (PREDICTED: ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1986.5 bits (5145), Expect = 0.0e+00 Identity = 1018/1189 (85.62%), Postives = 1046/1189 (87.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. NCBI nr
Match: XP_038877368.1 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1954.1 bits (5061), Expect = 0.0e+00 Identity = 999/1181 (84.59%), Postives = 1027/1181 (86.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. NCBI nr
Match: XP_038877365.1 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1952.2 bits (5056), Expect = 0.0e+00 Identity = 1000/1197 (83.54%), Postives = 1028/1197 (85.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L840 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RECQL4A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1237.2 bits (3200), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/1139 (59.26%), Postives = 807/1139 (70.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FT70 (ATP-dependent DNA helicase Q-like 4B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RECQL4B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1138.3 bits (2943), Expect = 0.0e+00 Identity = 636/1122 (56.68%), Postives = 768/1122 (68.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LM59 (Serine hydroxymethyltransferase 6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SHM6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 754.2 bits (1946), Expect = 3.4e-216 Identity = 385/629 (61.21%), Postives = 462/629 (73.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84WV0 (Serine hydroxymethyltransferase 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SHM7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 751.1 bits (1938), Expect = 2.9e-215 Identity = 380/608 (62.50%), Postives = 449/608 (73.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23254 (Serine hydroxymethyltransferase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SHM4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 583.9 bits (1504), Expect = 6.0e-165 Identity = 294/501 (58.68%), Postives = 353/501 (70.46%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3L3 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496104 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1986.5 bits (5145), Expect = 0.0e+00 Identity = 1018/1189 (85.62%), Postives = 1046/1189 (87.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L762 (DNA helicase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G221760 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1964.5 bits (5088), Expect = 0.0e+00 Identity = 1007/1173 (85.85%), Postives = 1031/1173 (87.89%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E469 (DNA helicase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111430623 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1931.8 bits (5003), Expect = 0.0e+00 Identity = 994/1188 (83.67%), Postives = 1027/1188 (86.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1X6 (DNA helicase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496104 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1923.7 bits (4982), Expect = 0.0e+00 Identity = 995/1189 (83.68%), Postives = 1023/1189 (86.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JBZ8 (DNA helicase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483078 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1919.8 bits (4972), Expect = 0.0e+00 Identity = 990/1188 (83.33%), Postives = 1022/1188 (86.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. TAIR 10
Match: AT1G10930.1 (DNA helicase (RECQl4A) ) HSP 1 Score: 1237.2 bits (3200), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/1139 (59.26%), Postives = 807/1139 (70.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. TAIR 10
Match: AT1G60930.1 (RECQ helicase L4B ) HSP 1 Score: 1138.3 bits (2943), Expect = 0.0e+00 Identity = 636/1122 (56.68%), Postives = 768/1122 (68.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. TAIR 10
Match: AT1G22020.1 (serine hydroxymethyltransferase 6 ) HSP 1 Score: 754.2 bits (1946), Expect = 2.4e-217 Identity = 385/629 (61.21%), Postives = 462/629 (73.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. TAIR 10
Match: AT1G36370.1 (serine hydroxymethyltransferase 7 ) HSP 1 Score: 751.1 bits (1938), Expect = 2.0e-216 Identity = 380/608 (62.50%), Postives = 449/608 (73.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10011088 vs. TAIR 10
Match: AT4G13930.1 (serine hydroxymethyltransferase 4 ) HSP 1 Score: 583.9 bits (1504), Expect = 4.3e-166 Identity = 294/501 (58.68%), Postives = 353/501 (70.46%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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