HG10010455 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGGATAAGAAGATCGCCGGCGAGAAGCATCAAGAAAAAATGCGACTGGGAAAGTATGAGCTCGGAAAAATTCTCGGCCATGGAAATTTTGGGAAGGTCAAATTTGCTATTAATTTTGAAACTCAGCAACCTTTTGCTGTCAAAGAAGTTGATAAGAGCAAGATTATCGATCTTAATTTCACCCATCAGGTCTTTAATTCTTTAAATTCATTCATTAATTTCCTCTTTTTATTTCTTCTTTTCATTCTGTTTTGCATTATTATTATTATTCGATTAATTGTCCTTCTCAATTTCTTTGATCCCTTTGCTGGATCTTCAAGCAAACTTTTTCATTGCCTACACTCATTTCATTTTTTTAGGTTTAAAACTTCAAAATACTCCGATTCGGTTTTTTAATTTTAGGGTAATTGTATTAATTGACAACATTGTTAGAAATATTGTCAAGCAAACTAAAATAAACACCTATAAACTATTATCATCTATCACTATTAGTGATCTATCAGTGTCTAATATTTTGTTATATTTAAAAATATTTGGACTCATTTTGCTATATTCGAAAACAACTCTTTTATAAAACGTAACTTTAAAGGTGACAAATTTGGTTATTTATCTATTAAATGAAAATGAAGGGACAAAATAGACATTTTTAAATTACATAGGTTAAAATGGACCAAAGTTAAAAGTAAGTATAGCAAAATGAACCTCTTGAGAGTACCAAATGAAACCAAGATAGTATTGAAGCTAAATTACATTTTGATTAAATATATATATATATAATTTTTTTTTTTTTGACAATTCAGTGGAATGGGAGGATCGAACCTTTTATCTCGCTCATGTTGGTGTTTAAAAAATGCCCTTTATTAATCTACTTTGAATATTCTAACTAATTTCCAGTAGAAAAGTGAAACTTTTATAAAAAGTTAAAACATAAAATTAATTAAACTTTTGAAAGATAGACATATTTGTAAAATAAATGAGAAAGTTCAAGATTTTCTTTTCCTATTTTTTTTTTTAATTTAGTCAATATTTTATATTATATAGTCATAATTATGTTTTTTTATACATCAATTAAAATGTCTGCAGTTTAAAAGGGAGATACACACCCTCAAACTTCTCAAGCATCCAAACATAGTCAGACTACATGAGGTACACTCCTTAAACTCTTCATTATTCTCTTTTAATCTAAAAATTAAATGAAAAATTAAATTTCTAATATTTTAAGATTTAGAGATTTTATAAATTAGTTTATTTTACTTTTACCAAAATTTTCGGCGCCAAATTGATTACCGACTGTACCCAAAATATTGACTTCAATTTTCATCTTATTTATTTATTTTATTATTGTTATTATTATTTTCACGACACGTTATCTTTTGAAAACCGAAATTAAAGAAAGCAAAAACGGATGAAAATAATTAATTTGACCAGTCTATAACTATAAAATTATTATTAATTTTATGTTACTCGTCCATTTCCAGCCAAATTTCTATTTTAATTTATTATTCTGTTTAATTGATCTGCATTTATTAGTGAATATACATAACATTATTTTAAATTAATATGGATTATCATAATGTTGGAAATGTGGCTGTTTCAATTCCACAAATTGAGGAGCCTACGTGTCAATATTAATTGCTTGTGGTTTTCATTTTATCCCGTGTATCACGTTTGGGTGATGACGTGTGTTGGGTGAAATGCGTGGGGTTAATAGTTTATTATTTTTGCTTTTGTCCACGAAAATCTAAATATTAAAAGTCAAAATTGCACACCTGCCCCTAAACTAATAGATTTAAGAATTTCGGACTTTAAGGCCGGCTATTTAATTTATATAATATTATAATACATTATAAAACGTTTATTTTAATTTTTATAATATGAAATACGATCTTTGTTAATAATTATTTAATTCATTTTAATATGATTTTAACATATGACAATTTTAAATTTTAAATTTTAAATTTAAATATATAAAATATAGTTTTTTAGAATTTCATTATGTCTATAGGGATGTTAATGGTCTTAACCACTGTGTTTAGATTGACTTCATAGAGAGGAAATGTGGAAAAATTATTTAATAAAGTTGGCTACCCCTTAATAAGAGTGGGTTGGATATATGGATTTCGGAAATCTACTTAGTTATAAATTTGAAATACTTCTATCGTTTTCTCTCACAAAATTATATGTCTGACTTTCTCAAAAAGACGAGAGAGGAAAAGACTTATTTTTTTATTTTATAAATGTGCATGTCAAGGCCTTGTTTGATAATCATTTGATTTTTTGTTTTTTGTTTTTGAATATTAAGCCTACAGATACTTCTTCCACTTTTAAATTTAAAGCTTTGTAAGCTATTTCTTACCAATATTTTGAAAATTAAAAAAAGTAGACCCCGTTTGGTAACCATTTGGTTTTTTGTTTTTTGATTTTGAAAATGAAGTCTATAGAGACTAGTTCCACCTCCAGATTTGTTCATTTGTTATCGACTTTTTACCAAAAGTTTAAAAAATCAAGTCAAAATTTGGAAAAAAAATAGCTTTTAAAAACTTGTTTTTGTTTTTAGAATTTGGCTAAAACTTCAACTATTATTGTACTTAATAAAGATGCAAATCATTCTAAGAAATAGAGATAAAATATGCTTAATTTCAAAAACCAAAAACCAAAAGCTAAATGGTTACCCAATAATTACATCTATTTGGTTCATCTTTTCATACTAAAAAAAGATTTGTCAATCCAAACATTACTCAATAGATAAGACAAACTATCGTTTGGTTTCAACGTCTCACCTCCGATTGTTGAACTATATATATAGGTCCCAATGCAATTGAACGAAGTCTAAATGAATCAATTGTCAAAGTAAATATAGATTAATCGTTATTGACATATACTCAATCAACGATTCAAATCTCCACGACACACTTATTTGTATTAAAAACAAAAGGGAAAAAAACCCTAAATGGATCCATTGTCACAACTAAAGAGAGAAGCCCAAAAACTTTTAGACCATATGGCCTAACCAAATAGAAAGAAGCCCAAATTGATCAATTGGACAACTAAAGAAAGATGTCCTAACCAAATTGATCTAATAACTTGCACTTTTTTTTTTTAATTTTAATAGTAAATTCTGTTATCAAATTATTTTATGAACGCAGGTTTTGGCTAGTAAAAGCAAAATTTACATGGTTCTCGAGTACGTGAACGGCGAAGAATTATTTGAAACAATCGTAAGTACATATGCCTTAATTAATTATGTGTGTTGTATAATTAAATTAGGATAGTTATTTTCATGAATAGAAAAATCAGCTAAACTATTTACAAATATAGAAAATTTTTACTGTGATAGAAGTATATCGCTCCAGCGATAGCATTCTATCGACTTCTATTACGGTTTATCGCGGATAAACAGTGAAATTTTTCTGTATTTATAAATAGTTTGATATTTTTTCTGTTTAAATTATTGTAATACTTTTTTTTAATTTAAGGAGTTAATGCTTGATTCTTATTATTTTATGTCGGACATTGTTTGATTTAGGCATCAAACGGGAAGCTATCAGAAGCTCGAGGCAGAAAAATCTTCCAACAATTACTTGATGGTGTGAGTTACTGCCATAGGAAAGGCGTTTACCATAGAGATCTTAAGGTAAAAATAATTTAATCTAAAGCTGAGATTAATAGAAGTAGCTTTGAGCACAAGTAGTTTAACTAGAGTAGGTTCCAATTACATTCTTAGACTTCAAAAAAATTTCATTTTTAACTTTTGAATTTTGAAATTTGTTTAGTTTCAATTTTTCATTTTTAACTTTTAAATTTTAAAATTTATTTCGAATTCAACATTCTCTTAAAGTTTTATACGAATATTGAAATAACAGTTATAGAAGGTATATATAACATCGATCATTTACAACATTAGTCTTGTAAATTGGTGTATTATTTTTTTTTCCTGACAATATCCGAGAAGGAGGGATAAAATCTCGTATCTCAAAGTTGATAGTACAAGTCCATGCTAGTAAATGCTTATGTTGGCATAAATTGATGAAATAAATAGTAACAACAATAATTTTAATCTTTTATATAATTGTAAATAATATTACAAACCTACTTTGTCCTGACTCCATGTAAATTTTTATCTTTTATTTTTGTTCAAAAGTAAAAATAAAACTTCTCAAAATCTATATAGTTTCATATTGATTTTTATTTTTATTATGAATCAATTTTACGGATTAAACGAGTATTTTCATGACTAAGAAAATCTCTCTTTTTTTTTTTTTTCCTTTCAAAGGAAATTCATATTTTTCTTGGAAACCTATATGCAGCTGGAGAACATACTTGTTGATTCGAAGGGAAATGTTAAGATAACTGACTTTGGCTTAAGTGCTTTACCCGAACATTTTAGGGTAAGTATTTAGTACATGTGTAAGAGTAATTTTAAAATGGTTAAAATTACTTTTATCGTATTTAAAATTATCCTAAAATATACTTGCATTATTATGCTATTAAAATTTATTTTAAAAATGACAAAAATGATTTAAACCATTTTAGGGTGTGTTTAAAATACCTTTTCAAGTGTTAATTTAAAAAAATAAATTATTTTAAAAGAAATAAAGTGTTTGGCAACCACTCAAAATGGATTTTGAAAGTCATAAGTTCTTATCAAAAGTGTTTAAATGAAAATGAGCTTTAGAAAAACATTTATATTTTAAGTTAATCTAAACGGGCTCTAAGTCAATCCGTCAAAAATATTTTGCAGCAATTTTTATTGGTTAAAATATCATTTTGGTCCCTACATTGTAGAGTTGGTTCAATTTTAGTTCTTATAATTTCAAATGTCTAATTTTAGTCCATGTACTTCAATTTAGTCCTTATTACTACTTAGTGTGGATTTTTCATCACTTTTTATTTCTTTTATTGGCATTTTCACTATAAATTTTGAAAAATATATTAATATATTGTGTTTCTTCACATGAAAATTATTGTGATTATTTAATCAATTTCAATAA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MKDKKIAGEKHQEKMRLGKYELGKILGHGNFGKVKFAINFETQQPFAVKEVDKSKIIDLNFTHQFKREIHTLKLLKHPNIVRLHEVLASKSKIYMVLEYVNGEELFETIASNGKLSEARGRKIFQQLLDGVSYCHRKGVYHRDLKILKGEIQLPKWLSQGAQNLIRRILDPNPISRITMASIKMDDWFRKDYHPTYLDEEEDIYMEATPFSMYQVQDYHGEKISESPTTINAFQLIGMSSCLDLSGFFEKEDISERKIRFTTNHSTKEDILKQMEDLVTNMGFLVQKKRGRIVATYTSGEMASGLQMSPQLEQIHGEIRDNFRALSNGFQRLDKIKDSNRQSKQLEELTGKMRECKRLIKDFDREIKEEESKNPPEVNKQLNDEKQSMIKELNSFVALRKTYMNSLGNKRVELFDEGGVSEPTADDNVRMASSMTNQELIDAGKKTMDETDQAIERTQKVVEQTIEVGTQTAVTLKGQTEQMGRIVNELDTINFSIKKASQLVKEIGRQVATDKCIMLFLFLIVCGVIAIIVVKIVNPNNKNIRDIPGLAPPAPARRLLYLRTPEHFE Homology
BLAST of HG10010455 vs. NCBI nr
Match: CAE5959621.1 (unnamed protein product [Arabidopsis arenosa]) HSP 1 Score: 662.9 bits (1709), Expect = 2.4e-186 Identity = 382/727 (52.54%), Postives = 461/727 (63.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. NCBI nr
Match: XP_038875562.1 (novel plant SNARE 13 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 499.2 bits (1284), Expect = 4.7e-137 Identity = 262/268 (97.76%), Postives = 267/268 (99.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. NCBI nr
Match: XP_022138859.1 (novel plant SNARE 13 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 1.4e-136 Identity = 263/269 (97.77%), Postives = 268/269 (99.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. NCBI nr
Match: XP_008458287.1 (PREDICTED: novel plant SNARE 13 isoform X1 [Cucumis melo] >TYK02986.1 putative plant SNARE 13 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 3.7e-134 Identity = 257/268 (95.90%), Postives = 263/268 (98.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. NCBI nr
Match: XP_023513592.1 (novel plant SNARE 13-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 489.2 bits (1258), Expect = 4.8e-134 Identity = 257/268 (95.90%), Postives = 265/268 (98.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LRP1 (Novel plant SNARE 13 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPSN13 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 417.5 bits (1072), Expect = 2.3e-115 Identity = 219/268 (81.72%), Postives = 250/268 (93.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LNH6 (Novel plant SNARE 12 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPSN12 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 405.2 bits (1040), Expect = 1.2e-111 Identity = 212/264 (80.30%), Postives = 245/264 (92.80%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q944A9 (Novel plant SNARE 11 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NPSN11 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 8.7e-86 Identity = 175/258 (67.83%), Postives = 212/258 (82.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RWC9 (CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CIPK1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 302.4 bits (773), Expect = 1.1e-80 Identity = 175/374 (46.79%), Postives = 224/374 (59.89%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94C40 (CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 17 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CIPK17 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 302.0 bits (772), Expect = 1.4e-80 Identity = 178/430 (41.40%), Postives = 241/430 (56.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CB99 (novel plant SNARE 13 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111009926 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 497.7 bits (1280), Expect = 6.6e-137 Identity = 263/269 (97.77%), Postives = 268/269 (99.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BXM9 (Putative plant SNARE 13 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold46G00740 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 1.8e-134 Identity = 257/268 (95.90%), Postives = 263/268 (98.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C842 (novel plant SNARE 13 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497752 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 489.6 bits (1259), Expect = 1.8e-134 Identity = 257/268 (95.90%), Postives = 263/268 (98.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EWD1 (novel plant SNARE 13-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436737 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 489.2 bits (1258), Expect = 2.3e-134 Identity = 257/268 (95.90%), Postives = 265/268 (98.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9V5 (t-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G000720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 486.5 bits (1251), Expect = 1.5e-133 Identity = 255/268 (95.15%), Postives = 263/268 (98.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. TAIR 10
Match: AT3G17440.1 (novel plant snare 13 ) HSP 1 Score: 417.5 bits (1072), Expect = 1.7e-116 Identity = 219/268 (81.72%), Postives = 250/268 (93.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. TAIR 10
Match: AT1G48240.1 (novel plant snare 12 ) HSP 1 Score: 405.2 bits (1040), Expect = 8.6e-113 Identity = 212/264 (80.30%), Postives = 245/264 (92.80%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. TAIR 10
Match: AT3G17440.2 (novel plant snare 13 ) HSP 1 Score: 328.9 bits (842), Expect = 7.8e-90 Identity = 174/212 (82.08%), Postives = 198/212 (93.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. TAIR 10
Match: AT2G35190.1 (novel plant snare 11 ) HSP 1 Score: 319.3 bits (817), Expect = 6.2e-87 Identity = 175/258 (67.83%), Postives = 212/258 (82.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10010455 vs. TAIR 10
Match: AT3G17510.1 (CBL-interacting protein kinase 1 ) HSP 1 Score: 302.4 bits (773), Expect = 7.8e-82 Identity = 175/374 (46.79%), Postives = 224/374 (59.89%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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