HG10009866 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview


Name	HG10009866
Type	gene
Organism	Lagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
Description	Unknown protein
Location	Chr06: 12330409 .. 12335922 (-)
RNA-Seq Expression	HG10009866
Synteny	HG10009866

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS

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ATGTATTATGGAGTGTTACACACCATTCGAGTTAATTTTGAACAATTAGGAGCTAAAAAGAGCAATAAGACTTCAAGGAGTACAAATGAGCAAAATGCCCCCAAGGAGGGTGGCGCCGCAACGCTAATCCAGAAGCAGCCGTCGAGGGAGTGCTGGGGCATTGCCCTATGGTGTCGCAAAGCTCGACACACACGCGACACAAAAAATCGAAGAGCATTGTAGTGCTTAATTAACGACGCTACGACAAAGAGTAGAAATGCCGCAGGACTGTTCTATAGTGTCGCGACACTACCGCGATATTATAAATAGTTTCTTATGTTTTTAGGGTAAGAGGAGGAGAGTTTAGGTGATTTTCAGAGCATTAGGCTCAATTTTGGCCATTCTGGGTCAAACCCCATGAATTTCCTTTAGATTTTGAGTTATAACAAACATTATGGCGTTGGAATTCAAGATTTGATGATCGGCTAAAGGCCCAAACGTCGATTTTGAGGTTTTTTGGGCATTTTTCTATGGATTTATAAGATTTTGATGAATGTTTATGAGATTTTCTGATTTATTCTTGTTTTCTATTCTTTGCTTGAACTCATATGCAATGTATGTTCGATTAATGTAACAGATTAGTCTTCTTAAGCATGTGTTGTGTATGTTTGCTATGCATGTTGGAGTTATCTATAAATGCAACGAAAGCATGTTTAATTTGAGTAGCAAATAGGTTTCAGTTATAGTTATGGTTTAACCTCTAGCATCTCTAGGATCACCTAATAACGAAAGATAACTAAACCTAAGAATGGAAAACATTAGGTTAGATTTGGCCAATTTAATATGATGATCTTCAATCCAAGAGTTTAATGTGATTAACTAAGTGAAGCAGGCTTGTGTGACAACACTTAGTTAATTTAGGAATCGACTTGCATTGGTTTTCAATTGGGATTTTGTCTGGCTTTTTTAGGCAGTCGATTAGGCTAGATAATCAGATAACTCATTAACTTCAAGTGATAAATTAATGAATTAATACATAGGTAGCCCAACGGTCTCTTAATCGGTGAAGGTAATCTCGTGTATCGTTTACTATCTCTCTCAATCTATCTTACTTTTCTGCATTATAAATTCTTGCATTTAGTTTTCCTTCAACCCAAACCAAAACCCCCTTGTTTTTACTGCTTTCCAAAGGCTAATTTACCTTAGAGAGATTTTATCTTGGCTCCTTGATAGCTCCGTAAATGAGATATCTTATTATATATAATCTCACTTGCTTGTAATGTTTAATGTGTTTATATGTCTAAATTGTTAGGAACTTGAGCAATCCATGTGTTCCAAAATGTTATGAGTCGTTCGATATTAATTTGGAGCAATTAAGAGCTAAATAGAGTAACCAGACTTCAAGGAGTGAAGAAATGACAAAAATACTCTTGGAGGTTTGGCGCCACTATGCTACATGGCGCCAAAGGCAAAGAGCAACAAAAGGCATAGATAGTGTCGCAACGCTCCAAAAACGAACAGAACCACATGGAGGCATGGAGCACCGCAACGCTTGATGGCTTTAAGGCATAATGTTGAGCAACAGTGTTAGAGCGCTGCGATGCCGCATGATTTCTGTTTATATTTCTTAACTCTTTTAGGAGCCTTAAGCTCGATTTTTGGCCATTATTGGCCAAAACCCATGAGATTTCTTCCTATTTTGATTTGTATTTGAATATTATGACATTAGAATGAATGGTTGAAGGCTTAAACGTCGATTTTGAGGTTTGTTGGGCGTTTTTCTATGGATTTATGAGATTTTGATGTATGTTCTTAAGTTTTCTGATTTCCCCTTGTTTTCAATTCTTTGCTTGAACTTCTAAGATGAACATGCTAAGTAGATTAAATTGACAACTTAATTGCATATACTTGTATGTTTATTCGCCCACGTAATGCATGTTTTAATTATCTGTAATTGTAACGAAAGCATGCTTAATTTGAGTAGCGATTGGTTTTAGTTTTAGTTATAGTTCGCTTCTATCATTTCTAAGGCAATCAGTAACGAAAAGATAATGAAACCTAAAGAATAGAAATGCATTAGGTTAGATTAGACTGATTTAGGCTAACTTCTTAATCAATCCATGAGCTTAATGCGATTAACCAAGTGAAATGGGCTTGCGTGAAAACACTTAGTTAATTTAGGAATCAACATCCTCATTGGTTTTCAATCAAAGGAGTCTGATTAGTGTTTCTTGTCAGGAGATTAGGCTAGATAATCAGATAGCTCATGAACTCAATTCAAATAATGAATCAACAAATTAATCCATAGATAGCCCAACAGTCTCTTAATCAATGAAGGTAATATCGTGTACCACTTTCTCACTCGCAATCTATCTTACTTTCTTGCTATTTACTTTCCTGCATCTAATTTTTCTGTCAACCAAAACCAAAATCCTCTGTTTTTACTGCTTTCCAAAGGCCAATTTAGCTGAGAGAAATTCTATCTTAGACTCCCTGTGGTTCGACCCAATCTTTGCTACTAAGACTACTTGTTAGTTGAAGTTCATGATCAGGGATTATAAATATTATTTGATCCATCGAAGGATTCGACACCCTTCGGTGAGACCATCACTCCCTATGGTTTGACCGAGTCTTGCTACTTATACTACCTAGTAATTGAAGTTATAGATCAGAGATTATAAATTCTATTTGATTGAATGAGAGAGATTTCGACACCCCTTCAGTGTTTCGATCAAATTGGCATCGTTGCTGGGGAACCAATTAATTTCTCTTTGTTAAATTTGCCTTTCTAAACTTTAAAACCCCCAAAAAAAATTTCCTTTCCCTTTGTGTCTACTTATTTTATCATGGAAGATGACGTTGCAAGGCAAGCAGCTCAACGGGATGAGGAGGAGGTAAGAAAGCTTAATGAGCTTAGAAGAGATATTTCTGAACTAACCTCTCTTGTTCAGGATTTGGTTGTTAGGTGCGTCGATCCACACCTGTCGTGCCCAACATGTCGATACATGCTCCCCTTACACACTCAGGTTTGCCTTTAGATGAATTGGTTATGGAGATTGCTAACAACTCTTTTGAGTTTCGGCAGGAAACCCCTCCATAGGCAATATGAGTTCTCGAGCTTCTAGCAGTCTCTATTTCGGATCAGAGGCTAGAACTAACCTTTAGAGTTTGAGTGACCTAGTTACTCAGCTTGCTAAATTAGTTGGGAAGCGAGACGAATCTTTGTTGCAGCCATCCTCTGAGGCTATTGAGTCTCGCGACAATGAGGTAACCCACATCGACAGCCAAGTTGATCAATTGATTCCTCAAACTGCAGGCCAAGGTATGTCATTGGATGATATTATTTGTGAACTTGCTAACTATTCTTTTCAGTTTCAGTAGGTGAGCCAAGCGCAGCTGCAAGTATGGTTGACCATGTCGCCCGGATGATTGATTTCGTGCAGAGGCTGGAGAGTCTGTCATAGCTTCGATCCACATAGTCCATGCTACTGAGGTTGAGTTCCTTGAGGAGTTCTACCTGTTCAGTGATGACGAGGATGCGTACTCCCTGCTATGCCCATAACAAGTATGTGATGTTAAGTATCAGCCCAGGCTTCATCTCGAGGAGCCCAAGGTGATAAAGTTAGATACTGCAAAGCCTTGTTTTGTTCTTCCTTTTGACATCTCTTTAATTTTTGAGTTTTGCTCATCTTTTCCTTACAAGTCCATTGAGTCTTTTGTTTTAGTCAAGTCAGTCGAGTCTGGATTTTATTTTTCAAAAAACTGATATGGATCGGGACCTATGGGTTGCATTAGTAAATTTTAGTTGATTTTAATTAATTTCTAGGATTTTAATTTTAGAGTTATTTGTTGTCTTTAATTAATTTATGGCTTTTACGTGTTAAATTCAAATCTTGGTAATTATGGAGATGCATTAAAGAAAGTTGTTGAAAAGATGGTGGCTATCATTAATGGAGTTTACATTAAAGATGGTGGTTGGAAGATGATAGTTGGAAGATGGAGAACTCATTTAATGTTTTATTTTGACTTTTGAAATTTACATTAAATAGGTTAGAATCTCTACAAGGTTATATAATGTCTTCTATTCTTTCATTTGTAATCAGACTTTAGATGAATGAAATTTGATATCTCATATTGAAATTTTTTCTTTTAATTTGCAATTCTTGTGATAGAATGCACATGAGTCATTCAATCTAACATCGATCAAGTTTGATGGTGGAGTGACTCAATTCAGAACAAGATTTCTGAATCTTGTTTCTAGATCTTTAATCTAAGAGGTAATCTAATCCTAGCATTTGCTCTTAGTTGATCTAAATTCGTATAGAGAGGTGTTAATTTCATAGTTTCAAAGGTTTTTGCTTCAACAATAGCTTGGATCTTTGGGCTAAGGGTTAAAAAAAAATAGTTGTCTCTGGAACCCTTAAATGCTTTAAAAGCTTGCTTCCCTTAAGCAACTTTGTGGATTCAAGGAAGAAATGACTCGATAAATATGAAAATTTTTACATAACTTGACAGAAAAATACGGTCAAGCAATCAACCTTAAAAATTTGCTCTTCCTAGAGGCAGCCATGTGCAAAAAATTTACTTGCTTTGTTTTATTGCTTTGGTAGCTTAGCTTCTTGTTTTTCTTATGTAGGTCCCTCCTCGACCCTGGAAGAGAAAGACATCAATTAAAGTGGCAAACCCTATTACCACGCCTTAAAGACCCATGCACAAAAACACTATCAGATGAGGTTTTTTGTTCCTTTGTCTTTTATTTTCTTTATGATCTGATTAGAGATACATAAAGGGACAATGTATCGTTTAAAAGTTAGGGGTGGTTGGTATGCATGTTTGGCAAGTCCTTGAGCACTTGAGCTCAGACTATTGTATGCTTGAACTGTTGTTTGTCTTGCATGCTTGATTCATGATGATGAAAGTTTATGACTTGATGCTTTGCTTGTGATAATGTTTGCCTGTTAGGAAGTTTGCAATATATTGATGATTTTGAGCCATTTTTTTAAAAAAATCTCTTGTCTCTCATGCATGTTTATAGAAGATGCAATGACACCGCGGTTCTATGGCTTTTCCACCCACGAGTGTCATCTTGCTCAGCTTAACTCATGGAAAATTTCTAAAAGTTTCTGGCATCGCGGCGCTATCGTAATAGCACCTTAAATGTGTCAACTTACTCGGCTTAACTTGAGTTATTTGTGCAATTTGATGTGATTAATCTATTATTTTATAGGTATCAAGCACCTGAGAGGCATATTTGAGCATTAAGGCAAAAACTAAGCCTAAATGAATAAATTGAAGCCCTAAAGAGAGAATTAGATCAAAAGGAGGTGAAAATGACCGTGGATACCCTTTTGTCGCAGCGCCACGACGCTGGACAATACCATCCACGATGCTGAAGAAAATAACATACAAAGGGACTGGCATCACGACACTATCCTATGGCACCGCGACATCGTTGCAAAGATGGAAAGAAGACGTGCAGAAGAATGGCCATGGAACCACGATGTTGTCTTGTGGCACTACAACGCCCTGGCATAA

mRNA sequence

ATGTATTATGGAGTGTTACACACCATTCGAGTTAATTTTGAACAATTAGGAGCTAAAAAGAGCAATAAGACTTCAAGGAGTACAAATGAGCAAAATGCCCCCAAGGAGGGTGGCGCCGCAACGCTAATCCAGAAGCAGCCGTCGAGGGAGTGCTGGGGCATTGCCCTATGCGCCACGACGCTGGACAATACCATCCACGATGCTGAAGAAAATAACATACAAAGGGACTGGCATCACGACACTATCCTATGGCACCGCGACATCGTTGCAAAGATGGAAAGAAGACGTGCAGAAGAATGGCCATGGAACCACGATGTTGTCTTGTGGCACTACAACGCCCTGGCATAA

Coding sequence (CDS)

ATGTATTATGGAGTGTTACACACCATTCGAGTTAATTTTGAACAATTAGGAGCTAAAAAGAGCAATAAGACTTCAAGGAGTACAAATGAGCAAAATGCCCCCAAGGAGGGTGGCGCCGCAACGCTAATCCAGAAGCAGCCGTCGAGGGAGTGCTGGGGCATTGCCCTATGCGCCACGACGCTGGACAATACCATCCACGATGCTGAAGAAAATAACATACAAAGGGACTGGCATCACGACACTATCCTATGGCACCGCGACATCGTTGCAAAGATGGAAAGAAGACGTGCAGAAGAATGGCCATGGAACCACGATGTTGTCTTGTGGCACTACAACGCCCTGGCATAA

Protein sequence

MYYGVLHTIRVNFEQLGAKKSNKTSRSTNEQNAPKEGGAATLIQKQPSRECWGIALCATTLDNTIHDAEENNIQRDWHHDTILWHRDIVAKMERRRAEEWPWNHDVVLWHYNALA

Homology

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of HG10009866 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10009866 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10009866 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of HG10009866 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 18..39
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 18..35

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
HG10009866.1	HG10009866.1	mRNA