HG10009720 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATTTCCAACGACGTAATTTGTAGATCTCAAACGTTGTCGTTTTGCAGGAACCTTCCTCTTATCAACAATGCTAACTCGTCATTTCCTTTTAGACAATTTCTCGTCAAGCCTTTCAAAGCTCGTATGGTAATTGTCACGTTCTTCTTATTATTTAGTTTCTTATTTTATGTTGTTAGGAAAGAAAACAAAATGTAGTTGTATTGTTTTGGAAAGTAAACAAAAAAATTTGTTTTTTTTTAAATTTTTATTTCAATTAAAGTTGTACTTGAAAATTTTATTCTTAAGCAAATTATTCAAATGGTTATATCTGGGCTAATTTTTAAATACTTATAAGTAAAAAAACAACTATTTTGTTTTCTAAAAAATTATAGATAAAGAAGGATTGTTTTCAGATATAAAAAAATTTCACTGTTTATCGTCAGCCATAAAATTCTATTACTATCGCTCAAGTAATAAAATTCTATCGCGGTCTATCACTTATAGACAACGAAAATTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGATATTTTTCTGTTTATAGTAATTTTCCTAAAAAAACTCAATAATTTTTTCTTTTATTTATTTTTGGCTCTACTTATTGGATTAAACCATTTTTTTTTTAATTAATATTTAGCACTTGAAAATTGCATCATCTGAGTCAAAATGGGAAAAGGAGTGGAATCACAATCAAGAGAAACTTGATATAATCAAAGACAATATCAACAACATAGAGGTAACCTTCTAAATTATTTAAATTAATTTTAGTCCAATTTTTTTTTAAATATCCTAAACGTTGTCGTTTTACAGGAATTTCTTCCCCCTCATGAAGATGAACTTGTGGTTCCATCCCAAGAATTTTCTCACCAAGCTCATATTCCTACCACTCAAAAGGTCTCTCTCAATCACAATTCACAATTTTTTCACTCTTAAAACCTATTTAATAATGTTTTTTTTCCTTCTTTAACATTATTTCTTTTTCTTATTTTTATTATAAAAAAAAGGCATGCTTTTCTTTAAATTTTTATTTTTTTTAATTTTAATTTTTGAGTTACTACATAAACTCATTATATTCTATTTAACTTTTACTATATTAATTTTGTATTTTACGAGCATCAACATGAGCGTCATTGTTCAACTACCATACAATATCATCGACCAAAAATTTAGAAGTTCGAATCTCTAACTCAACATATCGTTGAATAAAAAAAAATACATTCTATAAGTAAGAAAATGATATGACCAACTTATATTATTTATTTTAAAAGATATATATATATATATATAATAAAGAGCTAGAAACTAATAAAAATGTAAAATTACCAAACATATGTGTATTTAAAAAGATTCTTTAAAAAAAAAGAAATAAAAATAGGATAATTATAAGAAATGGAAAAAATATCAAACTATTTACAAATATATAAAATTTTCATTGTCTATCAGCGATAGACCATGATAGACTTCTATCACTAAGCGATAGAAAATTTATTGCTGATAGACAGTAAGACTTTTCTATTTTTCTATATTTGAAAACAACCTATAAAAATATCACTAAACTATAAAAATAAAAAAAAATAAAAATAAAAAAAAAAATCACTAAATGAACCTTTGGTAGAACAAGAACATTTTTCTTTAATTTATAATTTACCTATTCTTGGCAGCTACTTATACATTAAATAATTATTTATTTATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGGGAATTAAGTACTTGGATATGTACAAAAGATCCATTGAAGAACCTTCAAAATTTTGGTCTGAAATTGCATCATCTGAGTTCTACTGGAAAAAGGAGTGGAATCACCATCAAGCTTTCACTGAGAATCTTGATATTACCAAAGGCAATATTAATATAGAGGTAACCCTCTTTAATTCGAAATCTTTTCATATACAGCAAAATGATCCATAGTAAAATAACAAAAAGTTTTCATTTTTTCATTTTACCATTTTGCTATATTTAAAAATATTTTCATCAATTTTCAATAATTTCTCAAATTTTAATGAATATATTATTTCATGTAATTAATTTTGTTTTCAAATTTTGATTATATTTTCTTATATTTGATATTTATTTATTTATTTTGGACAGTGGTTCAAGGGTGGCATCACAAATATTTGCTATAATTGCATTGATAGAAACATTGAAGCTGGTTTGGGAGATAAAATTGCAATGTATTGGGAGGGAAATGAACCTGGTTTTGAGGCTTTTTTATTTTTTATTTTTATTATTTTCTTTAATTTTCATATCTACTTAACTTTATTTCTTCTTTCGTATATTAAAAAAATGGTGTATTTATTTGTCAAATACCTTTTTTTATATATTTGGTCAAAAAGATATTTATATTATAAAAAAAATTTCTAATACATGTGCATTTATTAGAACAGCTTCAAATTTTTCTTTTAAAATCAATTGAGAATAATCAGTATATGAGTATCATTTTCAAACTAGCTAAATTAATATTTAATATTTTTCAACTTTGTTTAAAATATAACATTATTGGTGTGTTTGGAATAATTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAAATAAAATCATTTTTTTCTTATAATTTAAAGTTGATCTAATATAGAATTTTGAGTGATTTAGATTATTAAAAATAATATTTTTATTTAAAAAAACTATAATAATAAATAAAAATTATTTTAAAAATAGATTAATTTTAAAACTATTTTTAGTGGATTATACATTTGATAAGTATTTAATTTTTTAGTTTTCAATTCTTTTTAAAACTATGCTTACAAACAATATTTTTATACAAAAAAAAAAAATTTGAAAACTATATAGAGTTTAAATTTAAACTCATGAAAGATGAAAACCAATAAAGAAGTTATTAAAAAAAAAAAATATTTAGAATAAAAAAACTAAAAATCAAATTATTATCAGAAGAAAACTTTATAATTTGTTACTTGGTGTTAGGTTGTTTTATATACATTATTGTGTATTCTTGATGATGGCTAATGAAAAATAATTCAAATTTAGGTTGGTAATTATTTGAGAGATATTGGAGTTAAAAAAGGAGACACAGTTGTGATTTACTTGCCTATGATTATGGAACTTCCCATTGCAATGTTGGCTTGTGCTCGCATTGGTGCCATCCACTCTGTACGTATATCCCCTTTATATCTAATATATTTCAGCTTTAAAAACATTTTCCATCCCTAAACTTTTAAGAAATTAATAATTTAGTCTCTCTATTTTCATGAAAATCATCAAAATTACGTTCCTTTTTTTTAAAATTATGTAACGGCTTAATTAACAAACGAAGTGATGTTTCCAGCTTTTGCACATTAGTAGATAGAGGTCTTTAAATAACTCGACAACCCAAACAATATATCCAGACATACATGTAAAGGTTGAGTTGGGTTGACTTGAACTTTTTCTATTTTTCTCGAGTTGGGTTGGGCCACAAGTTGGCTAAAAAATAATTTTGGTTGACCCAACCCAACTCAAATTATATATATATATATATATATATATATGTCAGAGTTTGATTGCTTTGGATTGATGAATTTGTGAATTTTTAATATTTTTCTTTTAGAATTGTTATGATGTTTGTCTTTGTTTAACGTTTGTAATATCATAGATATTTGTTATTTAACATTTGGATTTTAAAAGATTTTAGTTATTAATCATGCGTTGTAGATAAATTTATATTTTAAATTAAAAAGAAAAAAAAAAGTTACAACCCAACAATCCAACCTAACCCAACCCGAATTTTAAAAGTTAGGTTGGGTTGGAAACTTTAATCCAACCAACCCGAAATTTCGAATTGGTCCAAAAAAACACACTCAATCCAATCGAATCATATACACCCCTATTAGTAGATTGCACAATAGTCTTGCTGATGAGATTGCTCTATGGGTAACTCTCAAAGTTCTTAATTACTTTCTCTTAGAGCAAGATATGGACATTTTTTTTATTCCTCTTAGCTTGTATTTCTCAAAGGAAAAATAACCAAAAAAAAAAAAAAAACACACACACACACATTCGGTCTCATAATCAATTTATCAAGTATGTAAGAAAATTTATTATTAAATTAGAATAGAAATACCTTTTAAGATAAGGATTAAATTATTGTATAATAAAGTTTTAGGGACTAAAAATGTTTTCAAACCTATTTTATTTTTATTCTCTAATGTTATATTTTCATATATAATGTATAGTTGGAAAATCATACTGAGTTTTTTCTTTTTTTGGGTGTATAATATAAGGTTGTATTTGCTGGATTTTCTTGTGAATCACTTGCTCAAAGAATAATTGATTGCAAACCAAAAGTTTTGATCACTTGCAATGCTGCAAAAAGAGGTTCAAAAACCATTCTTCTTAAAGACATTGTTGATGCTGCCCTCATCCAATCAACTAAACATGGCTTTTCTATTGGTAAGCTATTTAATTTATTCCAATTATAGAAATAATTATATTATAATATATTATTAGCTCATTTATTGATAATACTCAGGTGCAATCATCCTGTAGTTCAATCACATAGAAAAAAAAAGAGGAAAAATTACCTTTTTAGTCCCCAAGTTTTGAACAATATTTGCATTTAGTCCTAAGTTTATAAAAATAGGTCTATTTTGTCCCTATATTTTCAAAATATACTTTTTTAGTCTCTGAGTTTTTAAAAATATGTTTAAAAGGTTCTTCAAGTAATTTTATTATTATTATTTAAAATAATTTTATAATATTTTAAATTAGAGGAATAATTTTTAAAAATCATCTCCTCTCTAAAACTATATTTTTCTAATTTTAAATATCATATTATTATTTTTTTAAAAATCAAAGAAAATAATATTTGAAGGACCTTTTAAATCTATTTTTAATGGGGACTGAAAATGTATATTTTAAAAACTCAAGAATCAAATGGACCTATTCTTATAAACTTGGAAAAAAATGTACATTTTAAAAAATCAGAGATCAAATACACATATTGTTCAAAACTTGATGACTAAAAAGGTAATTTTTTTAAAAAT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ATGATTTCCAACGACGTAATTTGTAGATCTCAAACGTTGTCGTTTTGCAGGAACCTTCCTCTTATCAACAATGCTAACTCGTCATTTCCTTTTAGACAATTTCTCGTCAAGCCTTTCAAAGCTCGTATGCACTTGAAAATTGCATCATCTGAGTCAAAATGGGAAAAGGAGTGGAATCACAATCAAGAGAAACTTGATATAATCAAAGACAATATCAACAACATAGAGGAATTTCTTCCCCCTCATGAAGATGAACTTGTGGTTCCATCCCAAGAATTTTCTCACCAAGCTCATATTCCTACCACTCAAAAGGTTGGTAATTATTTGAGAGATATTGGAGTTAAAAAAGGAGACACAGTTGTGATTTACTTGCCTATGATTATGGAACTTCCCATTGCAATGTTGGCTTGTGCTCGCATTGGTGCCATCCACTCTGATGTGATTCCTAAATATTCAAATAGTTGTAGTGTGGAATGGGTTGATGCTGAGGATCCTCTTTTTTTGCTTTACACAAGTGGGAGTGCTGGAAAGCCTAAGGGTGTAGTTCATACAACAGGTGGATATATGTTATACGTTGGGACTACTTTCAAATATGTCTTCGACTATAAACCTTCTGATATTTATTGGTCCACGGCTGACTGTGGTTGGGGTGCGGGGCATGGCTACGTGACATATGGGCCACTGCTTAATGCAGCCACTATTGTTATTCATGAAGGGGTTGCAAATTATCCAAATTCAGGGAGGTGTTGGGAAATAGTGGATAAATACAAAGTCTCCGTTTTCTTCACTGCTCCCACTTTGATTCGTTCTCTCATGCGTGATGGGGATGAGGTGGTGGGTGACTCTCGGTGCCCTATTTCGGACACGTGGTGGCAAACGGAGACCGGTGCCGCCATGATTACTCCAATTCCAGGGGCATGGCCACTGAAGCCTGGTTCTGCTACTTTCCCATTTTTTGGAGTGCAGGCAGTGATAGTGAATGAAGAAGGGAAGGAAATAGAAGGAGAAGGCAATGGGTATTTGTGTATAAAAGGGTCGTGGCCAGGGGCATTGAGGACTCTTTATGGAGATCATGACAGATATGAGACCACATATTTCAAGCCATTTCCAGGATATTATTTCACTGGTGATGGTTGTACCAGGGATAAAGACGGATACTTCTGGATTACTGGACGAGTCGACGATGTTCTTAATGTTAGTGGACATCGAATTGGGACAGCAGAAGTGGAATCTGCATTAGTTTCACACCCTCATTGTGCAGAAGCTGCAGTGATTGGCATTGATCATGAGGTTAAAGGGCAGAGCATTCGTGCATTTGTTACGCTGGTCGAGGGAGTTCCTCAAAGTGAAGAGCTCCGACAAAGCCTAATACAAACAATTCGAACACAGATTGGAGCATTTGCAGCACCTGATAAAATACATTGGGCAAATGAGCTGCCAAAAACAAGGAGTGGAAAGATATTGAGAAGAGTTTTGAGAAAGATTGCATCCAAGCAGTTGGATGAGATTGGAGATACCTCAACACTTGCAGATCCTACTGTCTTGGATCAACTTATTGCACAAATTGATTCTTGA MISNDVICRSQTLSFCRNLPLINNANSSFPFRQFLVKPFKARMHLKIASSESKWEKEWNHNQEKLDIIKDNINNIEEFLPPHEDELVVPSQEFSHQAHIPTTQKVGNYLRDIGVKKGDTVVIYLPMIMELPIAMLACARIGAIHSDVIPKYSNSCSVEWVDAEDPLFLLYTSGSAGKPKGVVHTTGGYMLYVGTTFKYVFDYKPSDIYWSTADCGWGAGHGYVTYGPLLNAATIVIHEGVANYPNSGRCWEIVDKYKVSVFFTAPTLIRSLMRDGDEVVGDSRCPISDTWWQTETGAAMITPIPGAWPLKPGSATFPFFGVQAVIVNEEGKEIEGEGNGYLCIKGSWPGALRTLYGDHDRYETTYFKPFPGYYFTGDGCTRDKDGYFWITGRVDDVLNVSGHRIGTAEVESALVSHPHCAEAAVIGIDHEVKGQSIRAFVTLVEGVPQSEELRQSLIQTIRTQIGAFAAPDKIHWANELPKTRSGKILRRVLRKIASKQLDEIGDTSTLADPTVLDQLIAQIDS Homology
BLAST of HG10009720 vs. NCBI nr
Match: XP_008465301.2 (PREDICTED: acetyl-coenzyme A synthetase, chloroplastic/glyoxysomal-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 1.0e-250 Identity = 476/745 (63.89%), Postives = 497/745 (66.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. NCBI nr
Match: KAA0066121.1 (acetyl-coenzyme A synthetase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 870.2 bits (2247), Expect = 9.3e-249 Identity = 470/739 (63.60%), Postives = 494/739 (66.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. NCBI nr
Match: XP_004150200.2 (acetyl-coenzyme A synthetase, chloroplastic/glyoxysomal-like isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN51167.2 hypothetical protein Csa_023241 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 869.4 bits (2245), Expect = 1.6e-248 Identity = 473/742 (63.75%), Postives = 490/742 (66.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. NCBI nr
Match: XP_031742111.1 (acetyl-coenzyme A synthetase, chloroplastic/glyoxysomal-like isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 869.0 bits (2244), Expect = 2.1e-248 Identity = 473/743 (63.66%), Postives = 490/743 (65.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. NCBI nr
Match: XP_023550650.1 (acetyl-coenzyme A synthetase, chloroplastic/glyoxysomal-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 835.1 bits (2156), Expect = 3.3e-238 Identity = 455/742 (61.32%), Postives = 480/742 (64.69%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9DGD6 (Acetyl-coenzyme A synthetase, chloroplastic/glyoxysomal OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ACS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 649.0 bits (1673), Expect = 4.4e-185 Identity = 299/408 (73.28%), Postives = 339/408 (83.09%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 78.2 bits (191), Expect = 3.1e-13 Identity = 43/79 (54.43%), Postives = 55/79 (69.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6MNF1 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Bdellovibrio bacteriovorus (strain ATCC 15356 / DSM 50701 / NCIMB 9529 / HD100) OX=264462 GN=acsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 531.6 bits (1368), Expect = 1.0e-149 Identity = 266/542 (49.08%), Postives = 332/542 (61.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4UP35 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Xanthomonas campestris pv. campestris (strain 8004) OX=314565 GN=acsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 531.2 bits (1367), Expect = 1.3e-149 Identity = 268/539 (49.72%), Postives = 330/539 (61.22%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8P3L1 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Xanthomonas campestris pv. campestris (strain ATCC 33913 / DSM 3586 / NCPPB 528 / LMG 568 / P 25) OX=190485 GN=acsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 531.2 bits (1367), Expect = 1.3e-149 Identity = 268/539 (49.72%), Postives = 330/539 (61.22%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q21LV0 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Saccharophagus degradans (strain 2-40 / ATCC 43961 / DSM 17024) OX=203122 GN=acsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 529.3 bits (1362), Expect = 5.1e-149 Identity = 285/604 (47.19%), Postives = 349/604 (57.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CNY9 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502952 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 876.7 bits (2264), Expect = 4.8e-251 Identity = 476/745 (63.89%), Postives = 497/745 (66.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VK77 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold21G001170 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 870.2 bits (2247), Expect = 4.5e-249 Identity = 470/739 (63.60%), Postives = 494/739 (66.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSH3 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489370 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 830.1 bits (2143), Expect = 5.2e-237 Identity = 451/747 (60.37%), Postives = 478/747 (63.99%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FM97 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445248 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 787.3 bits (2032), Expect = 3.8e-224 Identity = 415/621 (66.83%), Postives = 436/621 (70.21%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FGP9 (Acetyl-coenzyme A synthetase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445248 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 777.3 bits (2006), Expect = 4.0e-221 Identity = 394/549 (71.77%), Postives = 411/549 (74.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. TAIR 10
Match: AT5G36880.1 (acetyl-CoA synthetase ) HSP 1 Score: 649.0 bits (1673), Expect = 3.1e-186 Identity = 299/408 (73.28%), Postives = 339/408 (83.09%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 78.2 bits (191), Expect = 2.2e-14 Identity = 43/79 (54.43%), Postives = 55/79 (69.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. TAIR 10
Match: AT5G36880.2 (acetyl-CoA synthetase ) HSP 1 Score: 649.0 bits (1673), Expect = 3.1e-186 Identity = 299/408 (73.28%), Postives = 339/408 (83.09%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 78.2 bits (191), Expect = 2.2e-14 Identity = 43/79 (54.43%), Postives = 55/79 (69.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. TAIR 10
Match: AT3G48990.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 101.3 bits (251), Expect = 2.4e-21 Identity = 65/209 (31.10%), Postives = 105/209 (50.24%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. TAIR 10
Match: AT3G16170.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 100.1 bits (248), Expect = 5.4e-21 Identity = 93/387 (24.03%), Postives = 160/387 (41.34%), Query Frame = 0
BLAST of HG10009720 vs. TAIR 10
Match: AT1G21540.1 (AMP-dependent synthetase and ligase family protein ) HSP 1 Score: 95.5 bits (236), Expect = 1.3e-19 Identity = 103/384 (26.82%), Postives = 170/384 (44.27%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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