HG10007987 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10007987
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr10: 18318500 .. 18324316 (-)
RNA-Seq ExpressionHG10007987
SyntenyHG10007987
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGCTCCCCCTTCGATCGTGGTCGAATCTTAGATTGTACGGGGTGAAAGACTCCCTGGATGAAATCATCCGTTCTACTGCTGGGTTAGGGATGACTAGTCTTGAGACTTCTGGAATTCTGATTTCCTTAGATGGTTGATGAATGTAGTTCTTGCTGGCTATTTTTATTCAGGTCTGCTGAGTTTATGAATTCTTTATTTTTAAAAAATCTATTTAAGGTTGTATTTTAAGAAGTCTAAGAAATTTTTATGGATTTTCGAGAATATATGTATCAACTAATTAAAATTACCTCTGTGTGTGTGAGAGAGAAGGGAGATAAATAGATTTCAAATTTTAATGTTAAATAAAAATAAATTTTAACAACGGACCTATCTTTCTGTTTACCAATGAATTTTTTTTTCTTTAATTATTATTTTTAAGTGAATAAATTGAACACTTACTGGCTAAAGTAGAGAATTTTTTATTACAAAATAGCATAACGTGGCATGCAGAAATTTTTTTGTCAGATTGCCATTATTTTATGCAGATTGTGGCAATGACTATAAATTGAGAGCCAGTTCATAAGATTGACATATAGCACAATTAAAGTTTTACATGGATTTATTGTACATTTGTTTGGGGCAAAATTTGCCTATAATGCGACTAATGTCATCCATTTTTATTGTTGCCATGCCAGGAAAATTTGTACAAGCTAGCGTTTCTCCAGTCTTCTATTCGGGTTTGGACACGTGGCTGGAGTTCACCTACAAGAGTTCTCATATTGATGTGGTTCTGAACTGAGTACACTCTAATACCTTAGTTAGTCTATAAAGTATTTTGTTCGACTAAACACAGAGAATTACGTATCCCTTGGAGGCCGTTTGGTTTAAGGTTTTATAGATGTTCACGAATTAAGAATGTCTGAGAATAAGATTGATGGGAATCAATGATGACTGTGTTTGGTTGTGCATGAAAATGTTATCGGGATTTAATTACCAATATTTGCAAAATGAGTAATTTAAGTCTGTTGGTGTGAGGTTATTTGTAAGGCTAATCCTCAAAGTTGAACATTGATGGTGTCAAAATACGTGTGACCCTCAAAGTTGTAGGGTGTCACTAACGAGCTTAGCTCAGTCGTTGCCCTTTTGGTAAAACTCCACGAACTCAGCTAGTCACCTTGAAACCCGAGGGCTAGACTTTCCTTTTTGGAACGTGTAGGCCCTATAGTACTAACTTTTTCACCCCTTTGGGCTTGGACCGCTCGTGGACTTGGGTCTTGCATTGGGCAATCCTCAATAATTTTTTCTTTTTTAGCTCAATAAAATGTGAGGCAAGGAATTCAAGTCTCCAATCTTTTTTATCGATAATATATATTTTATGACAGTTGATTTATATTCATGTTGGCAATATGATCGATTATTTTTTTCACATTAATTTCAGAGGTTTCATGTCCTATTGTTTGGGTTAAATTAGATAAATATATATCAACAAAATATATATTGCATTCAAACATCAAATTAAGGGTGCATTTATCTATACATTGGTGATTTAGGGTGCAGTCGTAATTGGATTGTGTTGTAAAGGGAGTGGGCTGTAATGGTATTCAAATTACCTTTCATGGTATTTATTAACGTGTAATAGGAATGGGTTGAATCATAACCAGAAACTCAATGGTGGTGTTTACTTTTGTTTAATAGGAATGAATTTTGAAATGATTACCAGAATACCCTTTTATATTTCTAATTAACTTTATGATGCTCGATTCCATTTTTCTTTATATTTCTTCATTTTTATCTTATTTAGGAATTAAAATTTTATATTTAACAAAGTTTAATACCTAGACCAAAAAAATATAGGATTTAAAAAAAAAAAGAAATAGTAATTATTTTTAATTTCGTTAATCTAATTCACATTTTAATTTGATTGTAGATTTATTTTTTTCCAAATAATTCTTTTTTAACTGATAGAATTTTTTAAGTTTCTAATATATATTTTTTAGATGATTATATATATATTTTTAAATAAAATATTTAATTAGATAAAATCTATATAATGAACAATATATTCTTTTTTATTTTTAAAAATAGCAATAATCTCGATCTGTAATCTTAAACGAGAGCAAGAAGTACCTAGAGTGTTTGGTTTCCATAGAGCAAGAGTTGGAGCGAAAGCGAGATCGGTATGGAGAGCGAGAGAAGAATTGATCAATGAAATCAAAGTTCTAGAACTTGAATTTGAGATTAGAATCCCAGAAAAATAACAATAATCTCGCCTTGCAATCTTAAACCAAAGCTATAAGTACCTAGCGTGTCTGGTTTTGATCACATAGCAAGAGTTGGAGTAAGAGTGAGATCAAACTTGAGCGAGAGTGAGATCAAGCATAAGCAAAAGCTAAAAGATGTAGAGAAAAAATGAGGGATTCAAGGAAAGTGTTGCGTATAAAGCTTGATAAGTCAGTATTTTTTTGGTCTTTAGAGGAAAGTAGTGTATTCCTAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAGAAAGGATAGAAAGAGAGAGTACATACATCTGGATAAAGTGGATACTTTTGATTACAAAGTAAAGTGTGAACTTTAAATAGCAAAGTTGATACCAAACTGTTGATGACCAAGTGGTGAGTATGAAGACGAAGGAGCTTAAATCGAGGTGTAGAGGCCCGAGAGAAGGATAAAGTACGTAAAAATTTCGTGTGGATCTCATATAATTCAGCAAAGGTCATTAAATTACCACATTAGGTGGGAGCAATCCAATTGCTGGATTGGGGTAATGTAATTACACAGGTCCCATAACTTATTTTCGTTTATAGCGTTATGTAAACAACCACAAAAGTAATTAGGTGGCGCGGCTTGCCTAAATTGTGTTACATTGATTGCTCTTGTATTATCGTGTCTAATTCCTTTTAGAATTTTTCATGTTTTATTTAAATATCGGTGTAATTAGATCAGCTCTACACTTACATAATTGATCTACAAATTATAATAATAATATTTCAATTTCATTACCTTTTTGTTTTTAACTTTTATTTTTACCTCAACCTCCTTTTATCTATTTTTTTTTTAATCATAAGTTTCGTTTATGAACTTTAGTTGTGTGTCAATTTTATTTCACAGCTTTAAATATTTAATAAGTCTACGAATAATTTTTATTTTTTTTTGTCTAATATATGCCCCTAAAATTTATGTATATCAAGTCTTTAAACTTCAATTTCATGTTCACCGAATAGGTTCATAAATTTTTCAAACTTGTATATGACAGATCCTTGACTTATTCAACTTTTTTTTTAATTCAATTTGATATTTATTAGATCAATTAGCTTTTAAAGATTTTAAATATGTCAATAACTTATTTAACATAAAATTGAGAGTTTATAGACCTAATATAACACTCTTTAAAATTCAGGGACCTAATATACACAAGCTTAAAAGTTTATAAACTAAACTAATAATTTAACCTATTTTTTTTAATAGAATGTTTATCTCAAAGTGTGATTCATTTTCAGTTGATCTATATTCACTTTTGTTTTCATTCACCAAATTTTGTTTTTATTTTGTCATTATACAATTATTTTTTTTATAAGGAGAAAAAAGAAATAAAGAAATGAACATACACTTATAACCTAACATATACATGTGAAGAACTACGTACCTCTTTGTTAGCTCTCAAAAAGAGCTAATTTTTATGTATATAATCTAGCTTTCTTGATATGTTTAATGTTCTTAATTATCTATTTTTGTAGGAACTTGAGAAATTCATGCATTTTGGAGCTTTGCGGCCCATTTGGGGTTAATTTGGAGCTATTGAGAGTCACATCGAACACCCAAGGCTTCAAAGCAACAAAAAATGATTAAAATACCCCCAAAGGCAGTCGCAGCAGCGCTCTCGCAGCGTTAAGTTGGCGCAAAATCTCAAGAGGCCACATTTGGCTCGCGTTGCCCTGTGGCGCCGCAACGGTACATTTTCTAGGGTTTAGGATATTAGAAGGCCCAGTGCCACCCTAACTTCTTCATTTTCTAGGGTTTAGGATATTAGAATTTATGGAGGCTGAGGAGAGCTTCAAACTTCTTCTTCTTCCTCTATTTTTCCAGCACTTTTAGGTCAGATTTTAGTTTTCTTTTGGGATGTAGTCATGGATTGGATGCTCTCCCTCTACATTTTGTCTATGGGTTGTTGAGGTAAGAGTTTTTCTAGTTTTTGGGAGCGAGGACCTATGTAGTTTTCTTGAGATTTCTTTTGGTTGGATTCTATGCATTTCAATTTATGTTTCTTTGAATCTTGATTACCTTCTAAATATATGTTCTTGAATGGATTGACTCTCCTCCCCTTGAATGTATGTCTTAGTTATGATTTAAAGCTTGTGCCTTCTTTCTTGTTCGTCTAGCTCGAATCCCAAATAGTAAATGGTTGAATCATGTATAATAGGTATATAGGCTTCCCATAAACTAGAATGCATGTTTTAACTAGTTTCAAGGATAAATTGATTAATTAATTGGACTACCTCATTGATTAAACACACAATGGAACCCTAGAGTCTAATGCTTTAAAAATTCTATATGGACGCTTTCGAACATAATAGGATTGAGGCATTTAGTTTAATTAGGGCTTAGGCTTTAATTAATAATTAGGGTGCTTTCTTAGTTTAATCTGATGATTCGACTGCCTGTAGTGCCAATGAGTTTGGTTAGGTTGAGTAAGTCATTGTGCACGCATGAATCAAATGTATGTTCAATGAAGAGAAGTCGATGATCGAAAATTACATAGGAATCTCCCTTGCTTCCAGAACTAGAATTTCCAACCCTAGATTACATTTACCCGCTTCCTTTTATTTTCATGCTTTTAATTTCATGCACACTATCTCCAATCCACACACAACCCCCTGTTTACCACTATAACTAGTTAATTGACTAGACGAAACATATCTTGCACTTCCCTGCAGATCGACACGAACTTGTCATTATTGCTACGCCTTTATAGTAGTAGTAGTACAGTTCAGTAATATAAATTATTTTTTATTGGTCATTTGCAATCGACGACAAAAGGTTCTATCAAAATGGCGTCGTTGCCGGGGAAGCCATTTTGTTTCATTTAGTTAAGTTTCAAGTTAGAGCATTCTTTTGCTATTGATTTTTTTTTCTTGTGTGAGTGTTCTAAGCATAACATGATATCATCAACAAGGATGGGGACAATCTAGTGGAGCAGCTCAACCTAGTAACGAGGTTAGTGACCTTAGAGGTCAGCTTTCTGAGTTAGTTTTTTTGGTTAGTCGAATGGTTGTAGGAAAATCGCAGTGAGTGCAAGCATGTAGGATTTGCTCGTTCGTGGCCATCCTGAGCAAGCATGCCCAAAGTTGCAGTGGAGTATGATGCCACGTGTCTACTCCATGGGAGTGTTTCCTAGTCATTTGGATGACAATTTCTATCGGTCCAAATGGAAGGAGTCCTTTGGCTATGGAAACCAAGGATGGGACTGCAACCACTACGATTCAGGTCCTTCGCATCCGACGTGTCAATGCAAGCTTATACTACCAGCTCAGGTAGGTCACTAGAGGACGTGATGCGATAGATTGCTAATAACAATCTTCTTTTTTAGCAAGAGATTCTCCACCTCCAATAGAAAAGTCTTCGTCCCTAGACGGAGGCTGGAATTGACCTTCCGAGCTTGAGAGACCTAGTTAATCAATTTGCTAAATCAGATGAGAGAGGACATGAATCTCTGCTACTCACATCCCATGACATTACCGAGGCTTGCAGAGATAGGGTAGTCTATATCAGCACCGAGGATGAGTGGGAAGATATCATGTCATGCTTGAAACTAGTTGGTTAG

mRNA sequence

ATGCTCCCCCTTCGATCGTGGTCGAATCTTAGATTGTACGGGGTGAAAGACTCCCTGGATGAAATCATCCGTTCTACTGCTGGGTTAGGGATGACTAGTCTTGAGACTTCTGGAATTCTGATTTCCTTAGATGGATGGGGACAATCTAGTGGAGCAGCTCAACCTAGTAACGAGGATTTGCTCGTTCGTGGCCATCCTGAGCAAGCATGCCCAAAGTTGCAGTGGAGTATGATGCCACGTGTCTACTCCATGGGAGTGTTTCCTAGTCATTTGGATGACAATTTCTATCGGTCCAAATGGAAGGAGTCCTTTGGCTATGGAAACCAAGGATGGGACTGCAACCACTACGATTCAGGTCCTTCGCATCCGACGTGTCAATGCAAGCTTATACTACCAGCTCAGACGGAGGCTGGAATTGACCTTCCGAGCTTGAGAGACCTAGTTAATCAATTTGCTAAATCAGATGAGAGAGGACATGAATCTCTGCTACTCACATCCCATGACATTACCGAGGCTTGCAGAGATAGGGTAGTCTATATCAGCACCGAGGATGAGTGGGAAGATATCATGTCATGCTTGAAACTAGTTGGTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCTCCCCCTTCGATCGTGGTCGAATCTTAGATTGTACGGGGTGAAAGACTCCCTGGATGAAATCATCCGTTCTACTGCTGGGTTAGGGATGACTAGTCTTGAGACTTCTGGAATTCTGATTTCCTTAGATGGATGGGGACAATCTAGTGGAGCAGCTCAACCTAGTAACGAGGATTTGCTCGTTCGTGGCCATCCTGAGCAAGCATGCCCAAAGTTGCAGTGGAGTATGATGCCACGTGTCTACTCCATGGGAGTGTTTCCTAGTCATTTGGATGACAATTTCTATCGGTCCAAATGGAAGGAGTCCTTTGGCTATGGAAACCAAGGATGGGACTGCAACCACTACGATTCAGGTCCTTCGCATCCGACGTGTCAATGCAAGCTTATACTACCAGCTCAGACGGAGGCTGGAATTGACCTTCCGAGCTTGAGAGACCTAGTTAATCAATTTGCTAAATCAGATGAGAGAGGACATGAATCTCTGCTACTCACATCCCATGACATTACCGAGGCTTGCAGAGATAGGGTAGTCTATATCAGCACCGAGGATGAGTGGGAAGATATCATGTCATGCTTGAAACTAGTTGGTTAG

Protein sequence

MLPLRSWSNLRLYGVKDSLDEIIRSTAGLGMTSLETSGILISLDGWGQSSGAAQPSNEDLLVRGHPEQACPKLQWSMMPRVYSMGVFPSHLDDNFYRSKWKESFGYGNQGWDCNHYDSGPSHPTCQCKLILPAQTEAGIDLPSLRDLVNQFAKSDERGHESLLLTSHDITEACRDRVVYISTEDEWEDIMSCLKLVG
Homology
[Close]
BLAST of HG10007987 vs. NCBI nr
Match: XP_038905523.1 (uncharacterized protein LOC120091514 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 9.2e-08
Identity = 39/85 (45.88%), Postives = 45/85 (52.94%), Query Frame = 0 

Query: 45  GWGQSSGAAQPSNEDLLVRG------------------------------HPEQACPKLQ 100
           G  Q SGAAQPSNE   +RG                              HPEQACP+LQ
Sbjct: 27  GQEQFSGAAQPSNEVSDLRGQLSKLTSLVSQMVTRRSQRVQACRISSFMSHPEQACPRLQ 86

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of HG10007987 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038905523.19.2e-0845.88uncharacterized protein LOC120091514 [Benincasa hispida][more]
BLAST of HG10007987 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10007987 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10007987 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10007987.1HG10007987.1mRNA