HG10007869 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGTCGTTATTCGTCTGAAGCTGCCGCTGCTGCTGAAGGTACCACCATCGAAGGTGTCACCACCAAAGGATTTGGTTGGATGGTCGCTGTCGAAGGTGCCGCCGCCAAAGAATCACTGCATGGAGGGCACCGTCGAAGGACTTGTCGGCGTGAGAGAGGGGGTGGGGTGAGGCTGCTCTTCTTTTCCTTCATTTTAGGGTTTTGTTTTATTAAGGGCAATATGGATATTTCAAATTTCATTTGTTCTCAAAAGTCTTATTTTTAAAAATTGATCCAAAAAATCTTTAACCTCCTAAATGTGTCATATTTTTTTGCAAATTTTCAATATTCTTGTAATAAGCTTGGAAACTTATATATATTTATAATAATTTTTAAAACTTACAATATTAAAAAAAACTCTCAACTTCATGTATACCTTCTAATTAAAAAGAAAAAAGTTTAAATAAAAGTTTACCATGTGATGATCGTGTATTTAGGTGATAGAAATTGACGAAGCTGGAGATGCAACCTAAGTATTTTTCAAATATTTGGAAAACTACGGATAGAGAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAAAGAAGAAAACCCTGAAAAACCCTGAATGGGGTGGCACCGTCCAGGGGCATCGTACTTCACTGTCCTAAAACCCTACTTTCTCTGTAACCCTTTAACCACTCCCAAACGCACCAATAGATCTTCTTCGATTATAGTCATGGCGACGAAATCCATAGCCGAATCAGATGTTGGTATACTCAGTTACATTTCTTCTCTCCCTGGCTTTCGCGGCATTCTTAAGCAAAGGTCTCAGCTTCTTTCTCACATGGCACGCCCTTCATTTCTCAGGGATGCTATGCTTCTCAAACGAATTTCGTACTATCTGCTTGATTGTATTGAAGATAAGGGGCAAGTTTTAGAATGTGAAATGAAATGTTGAGAGTAAATTTAAGTTATGGAAAATTGAAACTCTTCTTCTGAATTGATAACAGAATCAGAATGAATGAGAACAAATTGGTAAATTCAGCAACTAATTATTGTTATGAATTAGTCGAGATAACTGGCACCATGGAAATGTTCTTATGCTCTAGTTGGGTTGCAGAGATTTTTTGTGGCTGTTATCTGTTCGGATAAGTGTTTTTTTCTCCTCTCCCACTTTTGTAGTTTTATCATTTATCAATGAAATTTCTGATTCCTCAGAAAAAAAAGGTACAATAGAAATGTGTCCATTGTATAGCATCTGTTGTTTGTTCTCTTTCTATTCTTTGAGTGGGAAATAAAGCAATGAGCTTTTAGGTTGCTGTAGGAATGCTAATAGCAAATGGCATCATTCAACTTTCTTTATTTTTAATTTCTGAAAAAACTTTTACTCAACGATCCAGTTGTATGACAATTTTTAAAAAGCTTTTAGAACCCTACCATTTTAAACTTCTTTGGTTTTGATTCAGGTATTCTGACTTCATTGTGAATGAAGTTGACACTGATGGAAATGTTGTTCATTTGACGTCATTGGATGCTCCTCCAGAGGTGGTGAAGTTAAATTTCTCATTGTTTCTATTGCATGCCTTATATGTTGATTTTTCCCCTTTTGCGTGAACATGTATGGTAATTTTAATTCTTTCGAGGCATTCAGATTGTTTCGGAAAGCAGACCAACGATAGTCCACAGTACAAGCGAGAGTTATGCTTCTGAAATTGAATTGTTTAGATCTCTTGCTGGTGATTCTGATGCTGAGATTTTGGAAGCTTTTCTTAAGCAAATCAATTCTGGTGTGGATGACAGCATTTCCCCTATTGTATTCTCCCCAGATACAGACAAACCTCATCGAACGGTTAGCTCTAAGACCTTGTTTGTAATGTATTTGCACCTTTAATTTTGAGTTTATCTTGAAATTTTTTATTCCGAGTAACAACCAGTGCAGGCCATCTTCTTTTTTTCTTCTTTAGCTGATCTGTAGATTATTCCTTTAGTTTTTGGCAAAAACTGACCATTGTCGAATAGATGTCTATATATATTTTTAATGCTAAAGAATTTTTTTTTTTTTGCCTCAAAGTGTAACTTCTCTCATCATTCTGTCAAATTGAACGAATAAATAAAGACATATCGTTGTTTATTTTTCATCACCGTATAATTTACTCTTTAAATTTGAGGTTTTCAGGCTGTCCACAATTTCTTTAAGAAATTTAAGTTCCTTGTGACCGATACTATTGATGGACCAGATTCTTCATCAAAATGTGTCCGTGTGAGGGTGGATTCGGGGGCGCAGAATAACCGAGGTCGGTTCTCTAAGAAACGAAAAGAAAGGGGTGATAAACCCTTTGATAGTAGAGGTTCGGACAACTGGCCTGAACATGTTGGCAAGTTTCTCAGGTAAAGGATTTTCTACTTTTTAGTAGGTCTGCATGTTTTGTGGATGCCTAAAGCTTCTTGCCTTCTTATTCATCATTTTACCTTCCCTTTATATAAGAAATTAGTTATATTTCTGCTTGGATCTTAACTTCTAGATCTGAATTGAATAGAGGTACTAAATATGAACTGACTTCCAAAAATATTGTATCTTTCATGATGAAGATTTTGTTATCAGCAAAACAGCAACTTTGTGCCCATGCTTTTTCTTGATGCTTGATATAAATGCTTTATGTCTTTTTCTAACCAGAGGTCAAATGATCCTTTTGCTAACTGGAATTTCTTTTTGTAATCCTCTAGCTTTAATGGACATTTCTCTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTGGTTTTCGTTTTTGTATATTTTATCTGTTCATTGAATTATTTTTATATCATTTCCTATCCCCCTAAAAAAACTTGTACTGTCACGTTGCGCAATCCAAAAAGGAGTTTTTATCATTGAGTGTCATTGTTCCATGTAATTATACAGTCTAACAAATTTCCTAATTTATGGTTCTATCTATCTGGATGTTGGATTCTTAATCAACTTTAAGATGTCACTTAAAAATATTTTAGGTTTCATCTTTACAAGGAGAACAAGGACACGCAAGAGGCATTAGGACTTATAGGAAAGATGCTTGGCATCCAGGTTCGCATACTCTTAGTCTTGGCTTATTTCTCTGTCTAATAGTTGTTTGGCTGATTCTCTACAAGGGACTTTTGATCTTTTTCATTTTCCTATCGACATATTGGATAAAAAGTTTGTGAGCTCCTTGTTCATCACCTTTTAGAGTGGACACGTGTAATTTTGTTCATTTATACCAGCTCTTGACTAGCCCTTGTCTCTTGTTCAAACAGGGGTAGTTGGCAATTTGTTTTGACTCGCTGAAATCTTTTTAGTCTGGTCAAATGTAAAGTTGCAGCCGCATATTGAAAATGCTTTGCAGAAGTTGCAGCGGCAACTGGGCTTCTTAGAGCTATCTGCATAAAAACACAACTACATAAATATTTCCTAAACTTGGACTTTTTACTCCAATTTAAGTACATTAAGCTTAACAAGGTTAGAAATATGTCTCTTTCTCATTCTTTCATAATTTGGCCATCCGCCAGAGTATTGCCAAGGCTCTTGTTGCCTTCTACCAGAAGTACGAAAAAGGAGATTAAAGACATTTGGGTCAGGTATGTGTTAGGAACTAGTATGGGCTATCTTTGTCCCATATCGATTAGAATGGGATGACCAATGTGGTACCTAAGTGGCTTGACTCTCCCACCTCAATAGCTAACTTTTGGAGTGTGATTCTCCAAGGTGCTTAAATACCTAACAATGGTATCAGAGCCGGCTATTGACGTTTCGAAGTGGAATCGACGAAGGATTCTGACCGGGTGTGGCTGAGTGAAGTACCGTCAGCGTAGCCATCGGGACGTCAGCTTTCCGGGGATGGGGGATTGTTAGAAACCAAGGTAGTATGGCTACCTTTGTTCCACATTGGTTAGAATGAGATGACCAATGTGGTACTTAAGTGGCTTGGCTCTCCCACCTCAATAGCTAGCTTTTCGGGTATGGTTCTCCAAGGTGCTTAAGTACCTAACAGTATGATAGCTTTTGGGGTGTGGTTCTCTTCAATCATTGAAAATTATGGTCTTAAAATTGGGGTTGCTTCTCACCTCTTAAAATCGTGTTGATTTATTGTAACTTTATAAAATGAAAATTATTTCCTGGATACTAGGGGGTTGGCAGATAAACCAAAACAAGGTTTCCCTCAAAAGATTTCTACAAACTCACCATCCGAATGTGGTTTTAATTCAGGAGTTTAAAAAAGAAGTGGACCTGTCTTTAATCAAAGCAATTTGGAGTTCAAAAGACATTGGCTGGGCTTTTGTGGATTCTTGCAAAAATTCTGGTAGAATATTAACTATGTGGGATGAAAGCAAAGTACAGATGGTAGAAACATTAAAAGGAGGATTTTCTTTATCAGTGCAATTCATCACCCCGAGCAAAGTGAAGTGTCGGATTTCTAATATTATGGTCCATGCGACTGCAAAGAAAGGAAATTATTATGGTCTGAACATATGTCTATACGAAACCATCATGGGTTGGCCTAGTGGTAAAAAAGGAGACAAAGTCTCAATATATGGCTAAGAGGTCATGGGTTCAATCCATGGTGGCCACCTACCTAGGATAAATTTTCTACGAGTTTCCTTGACACCCAAATGTTGTAGGGTCAGACGGGTTGTCCTGTGAGATTAGTCGAGGTGCGCATAAGCTAGCCCGGACGCTCACGGATTTCAAAAAAAAAAAAAACTTATGTCTGTACAAAGTTACTGTGAAGGACCATGGTGCAATGGTGGAGACTTCAACATCACTAGATGGGCTCATGAATGTTTTCCAGTTGGTAGACCCACAAGTGTTACTGCAAGAAAGAATTCAGAGCTGTCTACCCCCTTCTGGGACATGGAATCCTGATAGCTATAAAGGCTCTTGGGAAGAATATAGCGCTCGATCTAGATGGATTTACAATAGAGTTTTTCCTTAAATTTTGGAAGATTTTGAAGGCTAACTTTCATAACTTATTTGCAGAATTCTACAAGAATGGAAAATTGAATG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BLAST of HG10007869 vs. NCBI nr
Match: KAE8653624.1 (hypothetical protein Csa_007328 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 713.0 bits (1839), Expect = 1.6e-201 Identity = 362/385 (94.03%), Postives = 370/385 (96.10%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. NCBI nr
Match: XP_038878533.1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 711.4 bits (1835), Expect = 4.7e-201 Identity = 360/388 (92.78%), Postives = 373/388 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. NCBI nr
Match: XP_038878530.1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 711.4 bits (1835), Expect = 4.7e-201 Identity = 360/388 (92.78%), Postives = 373/388 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. NCBI nr
Match: XP_038878531.1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 711.4 bits (1835), Expect = 4.7e-201 Identity = 360/388 (92.78%), Postives = 373/388 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. NCBI nr
Match: XP_038878534.1 (multisubstrate pseudouridine synthase 7 isoform X4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 711.4 bits (1835), Expect = 4.7e-201 Identity = 360/388 (92.78%), Postives = 373/388 (96.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q96PZ0 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PUS7 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 204.9 bits (520), Expect = 1.9e-51 Identity = 128/356 (35.96%), Postives = 184/356 (51.69%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O74343 (Multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=pus7 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 203.0 bits (515), Expect = 7.1e-51 Identity = 133/377 (35.28%), Postives = 197/377 (52.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q08DI8 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=PUS7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 202.6 bits (514), Expect = 9.2e-51 Identity = 127/356 (35.67%), Postives = 184/356 (51.69%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q91VU7 (Pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pus7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 201.4 bits (511), Expect = 2.1e-50 Identity = 126/356 (35.39%), Postives = 180/356 (50.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q08647 (Multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=PUS7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 186.8 bits (473), Expect = 5.2e-46 Identity = 121/353 (34.28%), Postives = 197/353 (55.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHJ1 (pseudouridylate synthase 7 homolog isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501017 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 704.9 bits (1818), Expect = 2.1e-199 Identity = 356/390 (91.28%), Postives = 367/390 (94.10%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F560 (multisubstrate pseudouridine synthase 7 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440943 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 686.0 bits (1769), Expect = 1.0e-193 Identity = 348/384 (90.62%), Postives = 358/384 (93.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DY30 (pseudouridylate synthase 7 homolog OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025594 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 682.6 bits (1760), Expect = 1.1e-192 Identity = 343/392 (87.50%), Postives = 367/392 (93.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KMR0 (multisubstrate pseudouridine synthase 7 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111496015 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 681.0 bits (1756), Expect = 3.3e-192 Identity = 347/384 (90.36%), Postives = 356/384 (92.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V3D9 (Pseudouridylate synthase 7-like protein isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold79G00610 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 662.5 bits (1708), Expect = 1.2e-186 Identity = 334/357 (93.56%), Postives = 342/357 (95.80%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007869 vs. TAIR 10
Match: AT3G04820.1 (Pseudouridine synthase family protein ) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 7.6e-141 Identity = 245/357 (68.63%), Postives = 298/357 (83.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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