HG10007422 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACACGAGTCGAGGAGTTGTGGGAGCGCTTAGTTCGAGCAGCCTTAAGAAGGGATAGAATTGGTATTGATGCTTATGGACGCCCTGAGAGTGGCATTGCCGGGAATGTACCATCTTCACTTGCAAACAATAGGGACATTGATGAAATCTTGAGAGCTGCAGATGAAATTCAAGATGAAGATCCCAATATCGCGAGAATATGTATGCTATCCTTTAGTTTCAAAATTTTATTTATACTACTTTTTAAACATTTGTTTCTTAATTTTTTTTCATTAATATTGGGAAAAATAGATTCTACGAGTCATAAGACCTTGAAAGAAAGTCCGTCCAGTTTAATCATTAAAAAGGAGAAATTAGAGTTATAATTTTCAAAGTATCATTCGAAGATATAAATTCTTTAAACATATTAGATAATATGAAGTTCCATCTCAAAACCAATTGAAACCAATTGGCAACAAGAGGAGTAGCTCATCTATCTTATAAAGATAATGAGGTCCCTTGATTTGTCCAATGTGGGATCCTCACCATGGCCTATCAAGATGACGCCTCTTTAGGTTCACCATTCATGGATCATGTCTTTTTTTTTTTTTTGGGACTAAATACCCGTTTGGACTTTATGGGCTCTGGTATCATATTAGATAACATGCGGTTTCTTCTCAAAGCCATTTGGCAGTGAGAGGAGTAACCCATTTATTTTATAAAGATTGTGAGTTCCCTAGATTTTTCCAATGTGGGATCCTCACCAAAACATCACAAATGAAGAGAAGGATTTGTTGGGAAGTTTTTGAATGTCACATCACCATTACATTGTTCTAATTATCAGGGCTATAACTTTTAAATATCAATCAATTTTTGGTTTTATTTTTGTTTTTTGATGAGAAACATTTCATTGATTATTGGAATAGGAGAAACCCCAAAAGTCAATTACAAGAAACATTTCTAGTTGGAGACTAAATAAGATAAACTGAAATGATTAAAAGGGTGCTTATTTTTGCACCAATAAAAAGCGGTAGACAAAACAATATCCAAAAATCTATCAAAGGATGAGAACGAATCCTTGAACATACGACCATTGTGCTCACACCAAAGAGTCTAGAAAAAAGCACACGTAATGGCCAACCATCAATCGTTTAGTACCGCCAAAAGGCTGATCCACCATAAGGGATGCCAAATTATCAAAGATAAGATTAGATTCTGTTAGACCAACCAAAAGCTTCCAAAACAATGTGCCAAAAACGAGATGCAAAAGAGGAATGAACAAAAAGATGAGCGGGAGATTCCCTGTAGCACTGACACATAATACACCAAGAAGGCGAAAGAGACATATATGACCACTTGGTGCTTGCTGTCCAATGATTTTTGTAATCCACTGGTTGTGTGGGAATAGCTCATCCCCTCCATTATTTCTAGACTTTTTTCAATGAATTTCATTTGTATCTTATTATGGAAAAGGTGACAAAGACTTTTATGCGTGAGGGCCTTTAACCTTGAACCTAATTCCCCAAATTGGAGAATGGGGTGGGGAGGAGGATTAAAAAACCAGTGGCGATGGTGATGGAAATGCATCCCACCCCTTTTTAGCCATGTTGCAATTCTTAGTCTATGCTTGAAAATTGAGAAACTCTAACACCAAAGAACACTAAAGATGGGAGCCAACATCCTTTTTAGGTTGAATGTGTGGATTGAAGTTGATTCTCTGGAAGTGATATTTCCAAGGCTTTTCAAATTGGCTGGGTTAAAGAATTATGGTTAAGAAGGCTAGGAGAGCTTCCTTACGTTGTTGGTGCATCAATTTCAAAATGGTTCCTGGTTCATCACTTTATGGAAAGGTTTTCAAACCGCTTAACTAGTAAAAATAGGGCTGAATGAAAAGTTAATGACACATTCTCTCACTCTCCATTTCTCCTTTCTCTCTTCGACACCCATTCTCTTGCCACCACGACATCTCCCTTGAACTACCCTAATCTCTCTAGATCCCTTCACCTCATGGGTTGCCGACCACTTGACATCCCTCTTCAAAATGGATGATACACATGGTCTAGCTATCAAGAAACACCCTCCTTAATGCTCATTAACATGTTTTTTGGTCTTTAAAAGTGTTGTTTCTAAGTTCTCCAATGTGATTGCTTGTTGTATTGAAAGAATTACATTAGACCATAATCGTATCCACTTAATCTTGGGCAAAGAGATCTAGGGGCCAACACCTTTCAAATTTTTAATTTGTGGCTTGGCTTCAACACCATACTTAGTGTTTTCCATCTCACAACCCCCTTCGAAAGCCAGTCCAAGGACTGGGGGCCGTAGTACTGTAACAACCAAACTTTTTCCAAACCTTGGGCATTACTATGCATGAAAAATTTGTGTCACAAAAAATGACCCCTAACAAGGCCCACCATGCATATTTGTGTCACATAGATGTGTCATATAGACGCTCAAATGTATACGGTCCTCACATAAGAAGCAAAACGTAAGCTTAGTTGTTGAAACACTTGCGTCACACAGACCGTATTTAACACTTTAGCAACAAACATCCCATGAGTTATAACACTTGGTCACACAGACATATCACACAGATAAGGTGTACATATCTCATAGCTCACATAGGGCTCGTGTCATTCACATTCGCGTCACAAAAACCATCAATGCACACGACACACTCATAACAATTATCAACATGCATCAGTAATGCAATAAATCATCCAATCGACACTACCTCAGATTCGCTTTTGCTCTTTGTATCCTTATTTTTTACTTTGAGCATTAGTCTCATTTCATTAATTCAATGAAGAGATTGGTTTCCTTTTCAAAAAAAAAAAAAATATCCAATTGACACTAAGTCGAAAATCAATTGTGTATCATGCATAACAGATAGATCTAAATCCATCGGCAGGAAACCACTTGTCTTGAATTGAAACCATTACCAACTGAGTAACCTCCTTTATCTTATGGAACCCACGCTTTAATTCTCTAACTAAACATAGAAATCAAAATCCAAATTCGAACATCAACAAACCACTTAAATTCCATGGTAACAATTTAGTTCCAACGAACCACTTAAATTCTATGGTAACAATTTAGTCTCAACTAGAAAATCATCCTTGGAATGCCTAACACACTAACCCAAAAGTTCCTTGTTCCAATGCTCTTAAGTTCCACCAATTAAACTTAAATTGAACATCGTCGAACACCGTCAAACTTGCTGGACAACGACACATTTTTTTGCCAAACTTTGAATAAGACCTTAATCAACACAGATGTACATTATTTGAAACCAATCCATTTCACAGAAAATCAAAACTTCAACAAAAACCCACAAAAAAGCCTCGATACTCACCTAAAACGCTGGTGGCCTATTCTTCCAGCGACCACACGGCAGCAGTAGCGACGATGACCAGTGAACATCGGCGATGGAGCATGTAGTCGGCATCTCCTTTCATGGTGAGGCTGCACGGAAGAAAGATTTGAGGAGAGAGAGAATTATATGATGTTTAATTCCTTTTTTTCAAGTCAAAACCCTAGTTTGACTTCAACATTGACTTGGTCAAGGTTCACCCTTTGACCTCCTTAGCCCAAAATGGGCCTAATAACCAGCCCGACGAGGTCCAACGAGCCTAAAAACTGCTCTATCCTTCAAATCACACCAAAAAGAAAATTTTAAACCAAGAATCAAATGAAAAATCCAATAACTTGAAAAAATTTTGTGAATTAACTTACCCAAATTTCTGGGGCATTACATTTACTCACAATTATTTTATGCCATAGTGTATTAATTTTCCTAGGCAACTGCCACAACTATTTGCCCAACAAAACCTCATTATGCGCCCTAAAATTCCCTACAGCTAGCTTCCCTAACTCCACCAATTTAGTCACCAACTCCTAATTAGTCAAGTGTATTCCCTTTCCCTCCTCCACCCCTTCCGATTAAAAATCATGCACGAGTCTCTCTAGAGAATTGCACACCCTTACACGGATCTGAAAAAGAGACACAAAATACACGGGTGTGCCACTAAGGACAGACTAGTTGGGAGTCAGTCTTCCCCCCTTAGAGGAAAATCTTTTTCTCCCACGAGAATAAGCATTTTTTAATATTTTCCACCACTAGATCCCAAAAAGTTATGCTTCTAGGGTTATTATCGAGAGAGAGGCTGATGTATGATGATGGGAGAGACCTTACGTCACAGCCTGCCAGGAAGTCCATATTTCCAACTTCAAGGGGTTATGGTTAAGACGGATAACTGAACATTTGCTTCTATTAATCTTCAACCCCAAAAGTTGAGTCAAAGAATTGCAAAATTTGGTTATTATTAAGAAAAAGACTTCTCCTTCCTTGAACAGAAGAAAATCGTGTCATCAGTGAACTGGAGGTGTGATAATGACATATCACCTTCCTCACCTAAAAAGCCATGGCAAGACTCTTTTCTACTCCTCTTGAAACGAGGCTACTCAATTGTAGGGACAATGCTGTCTTGTTTTATTGGAACTATTTCTTGGTTCTATATGTATCAATTGGACATCTCATTTGTATGGTTATGTATTTTTTCAGTTGAAAAGTTATTTACCTCACAAGAAACAGATGTCTGAAGTAATATTATCATGATAAATGATGAATGTCAACACTTTTCCATCGAGTGACATGTACAACTAAACTTAAATTCTCCCATTTCTAAACGCCAATTTATATGCCAATTTTATCATTTTCTAACAATTTTTTTTAATGAATTGAGACTATTGCTCAAAGTACAAAAATAGATACAAAGATCACTAGAACTATAGGATCGGTGAGTGCATCCGGACATCTCAACTATGTTAACACCCATTTAGCACTCTCATCATCTCCAAGTGGCGAAATAATAATAGTAGCTAACCGAAAATACAGATCCAAGCAAGCCCAAAAGCTCCCCTAATTCAATGGGAGAAACTGGAACATGGAACAAAACATATAGAACAACATTACAAAATAAAATCCAAAACATAAAGCAGGACAAAAAACTTC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MTRVEELWERLVRAALRRDRIGIDAYGRPESGIAGNVPSSLANNRDIDEILRAADEIQDEDPNIARILCEHAYSLAQNLDPNSEGRGVLQFKTGLMSVIKQKLAKREGVSIDRSQDITRLLEFYKLYREKNNVDKLREDEMKLRESGAFSGNLGELERKTLKRKKVFATLKVLAMVLEQLSDAIPEELPVVVRKNLVRQFHLVLLQMKRLMESDAAMTEDLIAYNIIPLDAPSMTNAIGSLAEVQAAVSALKYFSGLPKLPAEFSVPETRSPDIVDFLHFVFGFQKDNVSNQREHVVHLLANEQSRLRIPEETEPGQVDFSFCKWKLKIGSLLTKDVGGLGEWGGCVTMGFREMLIGLGGLVRRGGFGLEGRPIDGLGSVKEEEGEEQCLSAVSKEKKLLFISLYFLIWGEASNVRFLPECLCYIFHHMVREMDEVLRHQIAQPAKSCESKDGVSFLDQVICPLYEVLAANMLGRSRHQGKTSFVEHRTFLHLYHSFHRLWIFLFMMFQALTIVAFNNGSFNMKTLLEVLSLGPTFVVMKFIESVLDILMMYGAYSTSRRLAVSRIFLRFLWFSIASASITFLYVKALQEGSKPNAERVMFRLYVIVIGIYGGVQLCLSILMRIPACHLLTNRCDRWPLVRFIKWMRQERYYVGRGMYERTTDFIKYMLLWIIILGGKFAFAYFLQIKPLVEPTRLIVNMRDIRYSWHDFVSKSRSLLNNDIQAILPSSNGGQSLQPCSKFSIQEPNSTSWLFEPYSFYYTRKFTRSSLLGKSDINADILEEACTRLISSSPKIPQPSLPTPVDRFTYIEFIPSGSNVVFTKGVLSSSTTKASTSTHSIDDGDSDFASDVSMSSEEVEEQNATT Homology
BLAST of HG10007422 vs. NCBI nr
Match: XP_038878486.1 (callose synthase 9-like [Benincasa hispida] >XP_038878487.1 callose synthase 9-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1133.6 bits (2931), Expect = 0.0e+00 Identity = 627/856 (73.25%), Postives = 660/856 (77.10%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. NCBI nr
Match: XP_008451107.1 (PREDICTED: callose synthase 9 [Cucumis melo] >XP_016900973.1 PREDICTED: callose synthase 9 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1111.3 bits (2873), Expect = 0.0e+00 Identity = 614/856 (71.73%), Postives = 652/856 (76.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. NCBI nr
Match: XP_011660099.1 (callose synthase 9 [Cucumis sativus] >KAE8653490.1 hypothetical protein Csa_007250 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1105.9 bits (2859), Expect = 0.0e+00 Identity = 609/856 (71.14%), Postives = 651/856 (76.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. NCBI nr
Match: XP_023531967.1 (callose synthase 9-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1105.5 bits (2858), Expect = 0.0e+00 Identity = 593/766 (77.42%), Postives = 621/766 (81.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. NCBI nr
Match: XP_022966547.1 (LOW QUALITY PROTEIN: callose synthase 9-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1103.6 bits (2853), Expect = 0.0e+00 Identity = 592/766 (77.28%), Postives = 620/766 (80.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SFU6 (Callose synthase 9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CALS9 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 843.2 bits (2177), Expect = 2.6e-243 Identity = 461/774 (59.56%), Postives = 542/774 (70.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SJM0 (Callose synthase 10 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CALS10 PE=2 SV=5) HSP 1 Score: 633.3 bits (1632), Expect = 4.1e-180 Identity = 347/765 (45.36%), Postives = 478/765 (62.48%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SL03 (Callose synthase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CALS2 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 256.5 bits (654), Expect = 1.1e-66 Identity = 215/763 (28.18%), Postives = 344/763 (45.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9AUE0 (Callose synthase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CALS1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 249.6 bits (636), Expect = 1.3e-64 Identity = 213/770 (27.66%), Postives = 344/770 (44.68%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LXT9 (Callose synthase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CALS3 PE=3 SV=3) HSP 1 Score: 248.8 bits (634), Expect = 2.2e-64 Identity = 206/762 (27.03%), Postives = 341/762 (44.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DYC5 (1,3-beta-glucan synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492488 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1111.3 bits (2873), Expect = 0.0e+00 Identity = 614/856 (71.73%), Postives = 652/856 (76.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HN98 (1,3-beta-glucan synthase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466194 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1103.6 bits (2853), Expect = 0.0e+00 Identity = 592/766 (77.28%), Postives = 620/766 (80.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EP57 (1,3-beta-glucan synthase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436119 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1100.9 bits (2846), Expect = 0.0e+00 Identity = 591/766 (77.15%), Postives = 618/766 (80.68%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DST9 (1,3-beta-glucan synthase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024075 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1078.9 bits (2789), Expect = 0.0e+00 Identity = 597/856 (69.74%), Postives = 644/856 (75.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A251NIJ6 (1,3-beta-glucan synthase OS=Prunus persica OX=3760 GN=PRUPE_6G014200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 964.5 bits (2492), Expect = 2.9e-277 Identity = 513/768 (66.80%), Postives = 581/768 (75.65%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. TAIR 10
Match: AT3G07160.1 (glucan synthase-like 10 ) HSP 1 Score: 843.2 bits (2177), Expect = 1.9e-244 Identity = 461/774 (59.56%), Postives = 542/774 (70.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. TAIR 10
Match: AT2G36850.1 (glucan synthase-like 8 ) HSP 1 Score: 633.3 bits (1632), Expect = 2.9e-181 Identity = 347/765 (45.36%), Postives = 478/765 (62.48%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. TAIR 10
Match: AT2G31960.1 (glucan synthase-like 3 ) HSP 1 Score: 256.5 bits (654), Expect = 7.5e-68 Identity = 215/763 (28.18%), Postives = 344/763 (45.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. TAIR 10
Match: AT2G31960.2 (glucan synthase-like 3 ) HSP 1 Score: 256.5 bits (654), Expect = 7.5e-68 Identity = 215/763 (28.18%), Postives = 344/763 (45.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007422 vs. TAIR 10
Match: AT1G05570.1 (callose synthase 1 ) HSP 1 Score: 249.6 bits (636), Expect = 9.2e-66 Identity = 213/770 (27.66%), Postives = 344/770 (44.68%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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