HG10007131 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTTGGTTAGCAAATTCTTCTTCTCATTCTCCTATGAGGATTCTTGTCGATACAGATGTTGATACCGACGATATCTTCGCTCTATTCTACCTTCTCAAGCAACCTTCTTCTCTCTTTCATCTCCAGGTAAAACTTATGTTATTGATAAAATATATGTACAATCGTATTCGTGTGCTCGAATTCAAGAGATCAAAGAGATGTAAAAACTCTCAATGTCGAACTCGATAATTTCTTGTAAATTATTTTAATTAAAATGCATACATCTTGATCAGATCACGATAAATAAGAAAATTATAGTGGTTTTTTTTTTCATGTATATTGATAAATATTTTGAACGCATATTTAATTAAGATAGTTTTTATTTTCTAAAGGGATTCAAAATTTAGTGAATGGATGGTGAAAATTTTAGATGACCACTTGAAGATAGTTTTATGTAAGTTTATTAAGAATTAAAATCTAATATTTGAAAGGTTAGGTAGTAAAGGAATATTTAAAAATTTTAGTGCACAAAAATCTCCCAACAATAATAGAAGTTCAACTATGATAAAATACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATTGTATGTGGTTGAAGAAGAAGCTAGAAAGAGAAGTGATTGATTGAGGATGGAAAAAATAACAAAATTAGAGAATTTTTATATTGCTTTCCTTTTTGTTGAACACCAAGCAAACCTTATTTTTATTCCCAAAAAAAGAAAGAAAAAAAAACAATTCCTCATTTATTGGAGACACTATTCCATTTGAAATAAAATTTCCAAGATAATGATTCAAAAGGTTAAAATTCAATTAAAGTTTTACTAAACTAATCTTTTCAAATTACTGTAAACAGAAAAAATATCAAACTATTTATAAATATAGAAAATTTTTACTGTTTATCAGCGATAGATCGCGATCACTGATAGACAGTAAATTTTTTCTATATTTATAAATAGTTTGGCTCATTTTTCTATATTTGAAAACAACCCAAAAAATTAGGTCAAATTACTATTGGTTTTAATTATTTCGTGCCTTCATTATTTATTATTAAAAGTTTAATGATCTATTACAAATTAGTAACATGAGTATATAGTTCAACCGACATAAAACATACAATTTTGACTTGGAGGTAAGAGATTTAAATTCCTTCTCCCCATATCGTTGTACTAAAAAATTGATTTAGTAGACATTTTAAATGTCCGATTGTCTATTACAAAAAATTGAAAGTTCGAAGATATATTAGATACTTTCTAAAGTTTATCGATTTTTTTTTTTTTATGCAAACATGAAAATTTAAGAGTATACTTATAACTAGCCAACAATAGAATAAGAATTATTATTATTTTCTTAATAGGAAAAAATAGTCTATCTCCTTGCAATATACAATCTTTATTTTGCTAATCTTTTAATAGAAAAATAAGCAAGGTCTAATCTATTTAATAAATGTTCTCCAAAATATTATGTATTCATGGGAGGATTAAGGACTTGTATGGAAACTTGTATTCACATTGGAGTTGTTATATATATATATATAGTTCAACGAATAGAAAATTTAAACCTCTAACTTCTTTAATTGATGGTACATATTTTATGTCAATTGAGTTATGCTCGGGTTGACGATTGAAGATGCTATTAACCACTCCTAATTTTAAATTTAACATTTATAGTCATATTAAACACAAAGTTCAATTTTGTAATAGATCAGTTAAATATATCAAAGACTTATTAAGTGCAAAATTGAGAGTCTAGAAATTTATTGGATACCTTTAAAAACTCGAAGACTTTAAACACAAACATAAAAGTTTAAGCAAGGTATTAAATTTCATAAACATGTTGACATTTCTATTAATACTTTTTCACATTTTTGTGAGTTTGACATCAACATAAGGGGTGAACCAACTTTTCTATTATATCGTAAAAAAAATTCATGAAACGTAAAAATATAAGCAACAAAATGTCTCTGATGTAAGTATAATATAAACAATAAATAATGCTAATTTGTTTAAACAACGTGCAATATTTATTTATTAATATAAATGTTTTATTTGAATTTTATTTTTTATAATCTTTTAAAGAAAAAAAAAATATTTTTTGGTCCCTAAGTTTTGAGTTTAGTTTTTATTCGGACCATAGGTTTCAAAATATTGCATATTTAGTCCTTAAATTTTGAGTTTGTTTTCAATTTAGTGCCTTAATTTCAAAATGTTACAATTTCACCCTTGAAATTCAAGTTTTGTTTCAATTCAATTTCTAAGTTTCATGATTTACACTTTTAATCTTAATTTTTCACTAAATACTCATTTTAGTGTTAATGTCTACTAATTAATGCAAAAGAATCTAAAAAAAAAACTATAATTATTTAAGTTCCATTATTTTCTCATCATTATTAAAATTAATTTTAAAATTTCAACTTTATAGTTATTATCAATTGATTAATAGACATCAATGTTAAAGATTGAAACGAGTACTTAGTAAAAAAAATCAAGGTTATGACCTCAAACTTCAAGAGTAAAATTATAACATTTTGAAACTTAGGAACTAAATTGAAATCAATCATAAAACTGAATAATTAAAAGTGTAACATTTTAAAACTTACGAACAAAAAATGTAGTGTTTTTCCTTTTTAAAAATATCTATCCACATAAACATTCCGGTAAGATTGAGTAATAGAAAATCATAATTATCTATAGTATATTAAAAGGGGATACGAGAGAAATTTTTTTAACTCCCCTCTTTGCCCTTAACTTTTTCAATAATGACTATTTTGTCCTTACTCTCACACCCCTCTATGATCTTGCTCTTATATGTTACCTTTTATACTTTTTTTTTTTCATTTAATTTTACATTCCTCTTTTGCTATTAAATCTTTTAACAATTCTTATTTTGTCCTCCTATCCATTCACTTTTTTTTATCTCTATTTTTTTTTTTATTCGGATCCCTTTGATTTTTTTTATTTTTTAATTTTATTAATCAAAACCAAAAAATAATAATTGTCAAGTCTATAAGATTCCAAATGTTTTAGAAGGTATGACATGGTTTTTTTAAAAAAAAATCTCAAGTGTATATATTGTTATAAAGTTAATGATAATTTATTTTTACTATAACCTAAAATTATAAATATTTTTATTTACAAAAATTATATTCGTTCAAACATTTATATTTTACTTTAACTATGTTTTCAAACATTTTCAACTCGATGAATACATTTTATATCCATTATAAATTAATTAAATAAAAGCACATATATAGTTTTAATTACCATCTCTTTTTTTACTTTTTAAATTTGATGTTAGATATTTAGTATTTAAATTTAATTTAACTAAAAAAGTAAAATTATTTAAAAATTTATCTTATAAGTTATTATTATTAATGTGTGTATTGGGACGTAGGCAATAACAATTAACGGGAATGGATGGAGCGACGCGGGACATGCGGTGAACCATTTGTACGACATGTTGTTCATGATGGGCCGAGACGACATCCCAGTTGGTGTCGGCGGAGACGGCGGCATTTCCCATAACGCTACTATTTTCCCTCACGTCGGTGGCTACCTACCACTCATTGATCAGGTTATTTAACCCAACTCCCAAGTCTAGGGTTTTCAAAAAAAACCTGATGTCCAAAAAAATCGATTAATTCTCGATTTAGGTTGAGTTGAGTTCAAATATATGAAAATTTTATAGGTTGTGTTGGTTCATGGATTCATTTAAAATAACCGACCAATTCGAACTTATTATTAATTTTATGAGTTGCGTTGGTTCATGAACTTTCAAAAGTTTCAAAAAATATCCATAAACTTTCAAAATGAGTTAAAAAAAATACTCTTATAGTTAGTTTTAGATGAAAACTGTTAGTGTTTTGTGTCAAAAATACCTTTAAACTTTCAAAAGTTTCAAACATATTCATAAACTAAAAAAAAAAATACACTTACTATTATATGAACAAAAACCACTAATATCGTCTTGCTTCTCTATTTTCCCTATTTTTTTTCTCCTCTCTTCTTCGGTGGTCTCCTACTCTCCTTTTTGTTAAATGTTTGACATTTGTATATCTAAAAAATAAATATAAACAAATAAAATTTCACACACTTCAATTAATAGGAAAAACCAAAATAATAGAAGAACTAAGAGATTTTAGGACTTGAATGTTTTAACAGAGTTGTATGTTAATAGTTGAGTGTGTGTTTATTTGACTATTTATCGTTTTGGTACGTTTTAAATGGAGATTTTGATTTTGTAATTTTGTGAGTTTTTTTTATTTAACTTGTAAAAGTTTAAGGGTATTTTTATAATAAAACTATAACGGTTTCCATCTAAAACTAATAGCAATAGTATTTTTTTAAACTCTTTTTGAAAGTATAAGAGTATTTTTAAAACTTTTGAAACTTCAGAGGTATTTTTGACATACAATGCAAAGTTCAGAGGTATTTTTTTAAAATATAATTTACCCTTTATTTATTTAAATAAAAATTGCAAAATCATCCTAAAGTACAGTGGTAGTTGCAATTATACTCTCTAATTTGTAATTGTAAAAATTAGGCACTCAAACTTATATAAATATTTAAATTAGACCCTCTAACTTACCTAATTGTAGAAATTGTAACCGTTGTATAAAAATGTATAAATTTGAAGGTTAATTTTAAGTTTGACCTCTTTATATTTTTTAAACAAAATTCTACTTTGTAGTGGGTTGAAATGATATATATCTAACTTTCTAACAATGTTTGAGTTTGAATGTTCTTTAAATTTAGTCCATATTATTTAAATGAGTTTCAACTTCGTTTTTTGTATTTTAACCATGCTTTTTTCTTTATTAACATGTCATCACTTTAAATTTTATTTTATTTTTTATCATTGTATTTTCAACTATTCAAATTTAATCTCTGCATTTTTTTTTAAATCTCTTTAGATATAATATTTCAAATATAAATATGAAATTCAACTATTTGATTATAATTTTTTTAAACC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MVWLANSSSHSPMRILVDTDVDTDDIFALFYLLKQPSSLFHLQAITINGNGWSDAGHAVNHLYDMLFMMGRDDIPVGVGGDGGISHNATIFPHVGGYLPLIDQGVSTAGQCRYRQAIPVGEKGRLYANTNFGLRKPFLPQGKRRYIPMKQPTAQQVMKDAISAGPTTVFLMGAHTNLAIFLLSNPHLKKNIKHIYAMGGAIREICSESADKSHGKTCNNIGNLWPPNTNPYAEFNIFGDPFAAYTVLHSGIPVTLVPLDATSTIPVNKKVFLAFEQRQNTYEAKYCFQSLKMARDTWTGNGFFEIYSMWDSFMVGVALSQMYNLDRGGGNNAYSKMEYLNITIVTSNKPYGISDGSNPLVDGHLLPKFGVQKNGVHSGHVQTGMLDPFCVVPTEIGKCQDGYTKEADGPESVQVLVAVEAKSTIDANSSIDKAFYISFLDVLNSPRQTGRFDFRAQFPNYREVLYRPKFGKKLLGKPVIFDMDMSTGDFLTLLYLLKTPIEIINLKGIIISPNGWATAATIDVVYDVLHMMGRDDISVGLGDVFAIGEAHPSFPPIGDCKYSAESSVKYGAFRDTDHPELGQMSALDVWKDVVHSLDLEAKITVLTSGPLTNLAQIIHHKAVSSRIQEVYITGGHINYSVDKGNVFTIPSNEYSEFNFFLDPTAADLVLGSGLNITLIPLNVQRRVSSFHKILKKLELGNRTPEAWFSRRLLSRLYHLKQKHHQYHHVDMFLGEVLGVVSLAGKHLNLKQTFSFKPLKVVTNGGESKVGQTIIDDKKGKWVRVLESVEPLAFYEDLANALADEKQTAVIGSFEGQKRQWTPREELPPRSRQLSTSLTSVAGRPPSPPLGSVAVRRAQTNVAVAGAEFLVDLFLSLPRVQLVFLLCMPLNIKWVIVTHCNMVWCSNCVKNVAGSRDEAGFLYCDMCGKVLDFYNFSQDPTFTKDSGGQSQLSGNFVRSIQSNFSASRERTLNKAFEDMRYMRNGLNMGESDEIIRVAGAFYRIALERNFTRGRNTEFVQAACLYIACRYVLGAVFLQLCKVLRLEEHPIVQKPVDPSLFIDKFTQCLLGGTKEDGMKKEVSRTALKIITSMKRDWMQTGRKPSGLCGAALYISALSNGVKCSKSDIIKIVHICDATLTKRLIEFENTESGSLTMEEFIVMADKVKGSNSYTNNGLNATSDEVLCVHKNECKKPYALGLCKSCYDDFVELSGGLDGGSNPPAFQSAEKERMEKAMVEEGSNDSSAIGKFSQGLNPCNNTEKESDNVHADASKTVGSKEAEAKGAADEQRGLDEGANKIGADGLGATASDESDNWSDIDDIEVDGYLHNEEEKHYKKIIWEEMNREYLEEQAAKDAATAAAKNAYEANFQNCSEDLLAAKDLADAAAAAVAKSRKGVDGFWEIMIEIRDGEDNGSGG Homology
BLAST of HG10007131 vs. NCBI nr
Match: XP_038879905.1 (uncharacterized protein LOC120071620 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1581.2 bits (4093), Expect = 0.0e+00 Identity = 779/851 (91.54%), Postives = 800/851 (94.01%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. NCBI nr
Match: XP_011659920.1 (uncharacterized protein LOC101212769 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN66123.1 hypothetical protein Csa_007600 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1501.9 bits (3887), Expect = 0.0e+00 Identity = 743/845 (87.93%), Postives = 774/845 (91.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. NCBI nr
Match: XP_008450713.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492210 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1469.5 bits (3803), Expect = 0.0e+00 Identity = 734/847 (86.66%), Postives = 767/847 (90.55%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. NCBI nr
Match: XP_016900935.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492210 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1456.4 bits (3769), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/846 (85.82%), Postives = 760/846 (89.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. NCBI nr
Match: XP_016900936.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103492210 isoform X3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1456.4 bits (3769), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/846 (85.82%), Postives = 760/846 (89.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P46070 (Transcription factor IIIB 70 kDa subunit OS=Kluyveromyces lactis (strain ATCC 8585 / CBS 2359 / DSM 70799 / NBRC 1267 / NRRL Y-1140 / WM37) OX=284590 GN=TDS4 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 3.7e-37 Identity = 149/507 (29.39%), Postives = 233/507 (45.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92994 (Transcription factor IIIB 90 kDa subunit OS=Homo sapiens OX=9606 GN=BRF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 153.3 bits (386), Expect = 2.1e-35 Identity = 148/497 (29.78%), Postives = 218/497 (43.86%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8CFK2 (Transcription factor IIIB 90 kDa subunit OS=Mus musculus OX=10090 GN=Brf1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 149.8 bits (377), Expect = 2.3e-34 Identity = 144/495 (29.09%), Postives = 216/495 (43.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9P6R0 (Transcription factor IIIB 60 kDa subunit OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=brf1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 143.3 bits (360), Expect = 2.1e-32 Identity = 130/492 (26.42%), Postives = 211/492 (42.89%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P29056 (Transcription factor IIIB 70 kDa subunit OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=BRF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 8.9e-31 Identity = 136/534 (25.47%), Postives = 240/534 (44.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LWJ1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G572440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1501.9 bits (3887), Expect = 0.0e+00 Identity = 743/845 (87.93%), Postives = 774/845 (91.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BP73 (uncharacterized protein LOC103492210 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1469.5 bits (3803), Expect = 0.0e+00 Identity = 734/847 (86.66%), Postives = 767/847 (90.55%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DY76 (uncharacterized protein LOC103492210 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1456.4 bits (3769), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/846 (85.82%), Postives = 760/846 (89.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DYY6 (uncharacterized protein LOC103492210 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1456.4 bits (3769), Expect = 0.0e+00 Identity = 726/846 (85.82%), Postives = 760/846 (89.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DM35 (uncharacterized protein LOC111021821 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021821 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1451.0 bits (3755), Expect = 0.0e+00 Identity = 715/861 (83.04%), Postives = 770/861 (89.43%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. TAIR 10
Match: AT5G18860.1 (inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein ) HSP 1 Score: 939.5 bits (2427), Expect = 3.1e-273 Identity = 482/861 (55.98%), Postives = 605/861 (70.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. TAIR 10
Match: AT5G18890.1 (Inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase family protein ) HSP 1 Score: 531.6 bits (1368), Expect = 2.0e-150 Identity = 283/541 (52.31%), Postives = 358/541 (66.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. TAIR 10
Match: AT3G09360.1 (Cyclin/Brf1-like TBP-binding protein ) HSP 1 Score: 425.6 bits (1093), Expect = 1.5e-118 Identity = 245/514 (47.67%), Postives = 336/514 (65.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. TAIR 10
Match: AT2G01280.1 (Cyclin/Brf1-like TBP-binding protein ) HSP 1 Score: 355.9 bits (912), Expect = 1.5e-97 Identity = 220/500 (44.00%), Postives = 306/500 (61.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007131 vs. TAIR 10
Match: AT2G45100.1 (Cyclin/Brf1-like TBP-binding protein ) HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 1.0e-93 Identity = 214/520 (41.15%), Postives = 294/520 (56.54%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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