HG10007006 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACGGTCCCTTTAAGAAACATGTTGATTACTATTTGCATTCTGTTGCTTAGCATGAACATGAACACAAAGATGATTGAGATTGTAAATGCATCAAGATATGATGATTATAGCCAGCCAATTGATGATGTGAGTTCTGAATGTAGTGCCAAACGTCAATACAACTGCAAACCACATCGTCAAGTTATTAACAAAGGCAATGGAAACAAAGGCATTTCATAAGTTTCATCCACAAGAAACTATTCTGGAAATCCTTGGGATCATCATATTTATGTAATAATCCTTCTTAAATTACATATTTCATGGGATTTATTATTATTTATTGTTTATTTATTTGAATAATGTGACGTGACTCGATTATTTATCTATGCGTTTTCCGATTCACATTCCAATGTAACTTTCTTATTAAGAATTCAAAGAACGTTTGAATTAGTTATTATTATAGTATGTGAGTTATAATAGTATCTATTTGTGATAATTACTATTTTAATACGAGTAGGAAATAGTAAATAGTGTAAAAAAAACAAGTTATAAACGGTTGTAAACACGACTATTCTATTTGGAGCTCAAGCTATATACAATAACTACCATACTAACTTCAAGTTAGGGCCTAAATAGTCCCTCAAAATTTTGACATTTCAAAACTAAGTCAACGTCAAAGTTTGAATGTAACTTTGGTCGGGTACTACTTTTTATAAACCAATTTTGGTTTTATAAGAATAACTGCTTGATTTGTTTTCCCCTTCAAACATTGGTTTAGAATCTTCTTTGAATATTGTGGCTTTTTTTTTTACAATGTTGTGGAATAGGAAAATTGAACCTCTAACTTTGAGATCGATAAATTTTGTGTCAGTTGAATTATGTTCATTTTGTATATATTACGTTTATTTATGCGGTAAATATGATAATCATGTTTTTTTTTTATGTTGACAAAAGTAAATATGATAATCTTGGTATAACATATGGAATGGTAAAAAAAAAAACATATGATAGCTAGGATAATGTATATTCTTATATTATATGGTCAAAAAATTTGAATAATATTTAATATTAGTGATTGAATTTGAAGCTTATAAAAGTTGAATGACTAGTCTCGCTTGATAGCCATTTGGTTATTGAAAAATTAAGCTTATTATCACTACTTTTTATATATTATTTTGAGGTATAATCAGTTTGCTAGTGTATTAAGTTCTTATATATTATTTTTCCCCAACAATTCCTCCCCACTTCTTCCCTATTTTACGTGTAATCGAATTTTCATGAGTAAGATGGACATCTCTAATTTGGTACGTAGATTTCAAGCATGAAGTTTTCAAAGATTTGGAAGAATTACAAAAGCAAGAAAAGAAAGAATTGTTAAGATATGATATTAAATTTGTCCTTCACCTATCCTATCAGCTTAAGCTTTTAGGTCAATCGATGATTTAACATGGTATCAGAGCGGGTGGTCCAGGATGTCCTGTGTTCAAGTCCCTGGATTTAACAAGAACAAACCATATTAAAAAAAAGAAACAAATACATTATGAGATTAATAAAAGAATTCAAATGAACAAAATATTGGGTTGTTTTCAAATATAGAAAAATGAGCCAAACTATTTACAAATATAGAAATTTTTTTCTATCTTTTAGTGATAGACCGCAATAGAATTCTATCGCTTTCTATCGCTATAATATCTTTTAGTGATAGACCGCAATAGAATTCTATCGCTATAGTATCTTTTAGTGATAGACCGCAATAGAATTCTATCGCTTTCTATCGCTATAGAATTTATTTGCTTGAGCGATAGAATTCTATTGCGGTGGTCTATCATTGATAGACAATAAAAATTTTCTATATTTGTAAATAGTTTAATATTTTTCCTGTTTATAGTAATTTCCCTAAAATATTTGGAAGGTGGGAGTATTTGAAAAGGCACAAAATTGCAAACATGAAGGTTTTATAATAATTATAAAAAAAAAATACTTTATATATTCGAACTTAAGACAATCAACTATATTTAAAAGGTGCATAATAAGAGAGGGAGATTGTAAGAGAAATGGAGAGAGGAGAGCAATGAAAGAAAAGAGAGCAAGAATAAGAAAGTGAAGAGTGAGAGTAAGAGAGCTAGAGTCGAGAAAAAGTCCATTACGCATGCGCGAAATTCACTTTTTTTAGTAATTTTACTCGAATTTGACGTCAGCAAAAGGTTAAAAAATCTCATCTTCAGAAAGTGGGACAAAACTTATTTTTCCTCCGAAATTTTGATCATTCATCCAACGGATCCGAAGATAATGGATAAGAGGTAAAGACGAGAGAGTCCACAACATTAAAAAATATTATTAAATTAAATTTTTTTGCCAAATCAACTAACCAACCCATCTTTTTAACATACACATCATTTTATTGTTAGTCAACTGATGGTCCAAGTAGTTTCAGGGAACATTTAGAACTATTTCTCAAACCTCGGGACTAAAGTGTTCATTTTAAAACTTTATGGATCAAATAGACAACAACTTCAAATTTCAGATACCAAAAGTGCATTTTGCCATATTTTTAACTATCTATTCTAATTTCCAATTTCCCATTTCCAAATTGGTCCATTAATCCAAAAGAAAAACCTGGGTCATTTTTTAGAATTACCCAATTTCCCCCCTTGTCTTAGGAAAGCTTTTCATAAATGGCGTCATTTCTGGCCTTGGGTGGCTCATTGGCCTCCCGCCATTCGGGATTTCGAACGCTCCTTCTCTGCATTTGGGCATCTGCTCTCTCAGTTCCTCTACTTTCTCCAATCTTGATGCCATGAGTTCCAAACTAGGTACCGGAAACTAGACAACATTCTGACACTCATCTTCCTTCCATTATATAATTTGTACCGTAGTTTCTGATTGTGTTAGATGGGTCAAATTGTAGGTGAAAAGGCCACTGATTTGTGGTCCGAGTTAATAGCTAGCGAGGGAAGCGAGTGCCAAGAAGAAACGCGAGTAGAAGAGGTTTATAGACGAAGAAAGCCAACTCAGAAGACCGTTCATGCCCTTCCCTCGTAAATTTTCTTCAATCACTCGTTTAATTCCTCTCTATGTTTTATTTTGTTTGATGAAATCCATTGTTTCATGTTTCCGTTTCAATTTTCTTGCAGGAAGCAAAACTTAGGTTCGAATGGTTGCAATGTGAACAGGGTGAGTTTAGCTGCTGTTGACAGTAAGAGAATTAGTTGGAACCGCGCCCTTTCCGTCAGGTTTACTTCGATTTTCTTTTAATGTTCTTCTCAACTTTATACTGCCAATTCCAATAAGGGTGTCGATGTGGTTTGATATCTACTTTCTTAATTGTTTGTTGCTAACACGGATAATTTTGTTGTAGCTTATCTCTTTTAAGTTGACTATGTAATGACTATAATGAAACACAAGGAGGGAAATATCCAAACGACAACGAAATAAGTCTAGATAACAGATTAATATGCTCTGCGGCAGTCGATTGTTGAATTACCATGAAGTATAACTGCTAATCGGATGCCATGAAGTGATCTTAAAAATAGACGAATTGTAAGAAAGAACGGGTTACAGAGTGTAGGGATCAATACTGTGTGACCTTGGCCTTCGTACATTCTTCTTTTCTTGTAAAAAAGAGTATTATTCACAGACCCTGTCTAATTTGACATAATGCACGTTGATTCACATGCAGAGTAGGATCACATCTACGGTATGGCTAATGAAACTCTTTAGCAAGGCCTAGGTTCTTTTAGCTAGATTTTCTGATGCACTCAAGTTAAGATATTTTATTGAAATGACAAATTCAAACTAAAAGTTTACAAAGAGGTTATATTTGTTATTTGTACAAGAGGGAAGGCTTGCCTAACCGGCCAACAGCCTACTAATTAACTAAACAGCCGAGAAATAGCTATAACAAACTTAAAACAATCAGCCTAAAGAATTACAAGAAAGAGAGTAAAATAACCACAACCATACTTGGTTAAGAAAACTCACAAAATGAAAGGCCCTACATCAACCCTTCCCACCAAAAAGAAGACTTGCCCAAGAGTTTTAGGTGCTACGTTGAATTCAGAAGGCGCAAAGTAGGGGAAGACGTTCGATGCATTTAAGGTGTTGCTAATGGGCATGGAAGGAGGGCGATCAATACAATAAGCCTTATGGCCAATCCTCTCTAAAATTGGAAATGGGCCAACCTTTTTGTTGGTGAGCTTAGAATGAGTCCTAGCGGAAGTCTAGAGTTCTTCATGCACCCTTACAAGATCACCAACTTTCCTTAGCATGCCAATGGGCACCAACATGAGCCTTGTAGGAATTGTTAGCTTATTCAGGATGATGTTGAACCCTAGTGGAGCTCCAGAACCCGCACAACCATCAACTTGGCCTTCGTTCTAAGATCAATTGAAGAAGGCAAGTTAGTGAGAACAATAGTCAAACCAGACGATCATGTATAGACAATTTCAAAAGGTGCCTTCGCCATGGAGCGATTAATAAGGTGGTTGACAGCTAATTTCGCTCGAGCGAGAGAAAGATCCCATTATCGAGGCTTATCACCACTCAAACAACGGATAAGGTTTTTTAGTGTATGGCTAGTCACTTCCATTTGACCACCCGTTTGGGGGTGACTCATTGTGCTATAGAGGAGTCTTGCTCCAAATCATTTCCACAAGGATTTCCTAAAATAGCCGATAAATTTAACGTCCCTATTAGAAACAGTTGTCTTTAAGGTTCCATGAAGCTTAACAATCTCACAAAAGAAAGTTAGTGATAGTCAAAGCATCACTAGTTTTCTTACAAGCAATAAAGTGGGACATTTTTCTAAAGCAATCAACTACAACCAAAACTGAAACAAAGACACGTTGAGTTCGAGGGAGGCCAAGAACAACATCCATTGATAAGTCTTCCCAAATAGAAGTAGGGATTGGTAATGGAGAGTAAATGGATAGACTTTGGCTTGAGCCTTTTGAAAATTGGTAAATAAAACATTTTTTTGACAAAGTCGACATTTTCTTAAGTTGAGGAAATAG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MTVPLRNMLITICILLLSMNMNTKMIEIVNASRYDDYSQPIDDVSSECSAKRQYNCKPHRQGKYVQPTNFDKERAYFQEVDAFELLEESPSPKSFSTWTSSQFDSATVPSLCSRIEKWLISKKSNYSLAPSSTLSKILETPLGSIEPIGGNHLEKFNLRTPEKTAREIDAHLCSIQRRFISSINDLNDLEIESNGDNRSNRAEDVSTEDREGIEVDVKKLSLTSTSTTFHNYNLDPLSALLAVCGQSAPSTLKDAFSNLCDPETIVKVGEGTYGEAFKAGNTVCKIVPIDGDLQVNGEIQKFLSALCWAIKHFDVMQFLGQLKGRKLVSSTFHTLGFVRITFVCNNGTVSYGLLTSICTIFLSNSLRVCQGSYDAVLIKAWEDWDEKHGSENDHPKEFPEKQCYVVFVLQHGGKDLESFVLLNYDEAQSLLVQVTAALAVAEAAYEFEHRDLHWLGSSSIYNYFGRFFSFITDLDRVFIVRGNVLLSRNDSEALQFTLEGKNMTVQTFGLQISIIDFTLSRINTEMSKKDVHGVVCGGFAACFPRTNVLWLLYLVDILLLKKSFERSSKHERELRAFKKRLDKYNSAKEAIYDPFFSELIVWSSSVE Homology
BLAST of HG10007006 vs. NCBI nr
Match: XP_038879239.1 (serine/threonine-protein kinase haspin homolog isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 818.5 bits (2113), Expect = 3.7e-233 Identity = 435/574 (75.78%), Postives = 465/574 (81.01%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. NCBI nr
Match: XP_011659430.1 (serine/threonine-protein kinase haspin homolog isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 785.4 bits (2027), Expect = 3.5e-223 Identity = 423/597 (70.85%), Postives = 460/597 (77.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. NCBI nr
Match: XP_031741056.1 (serine/threonine-protein kinase haspin homolog isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 778.9 bits (2010), Expect = 3.3e-221 Identity = 423/603 (70.15%), Postives = 460/603 (76.29%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. NCBI nr
Match: XP_038879240.1 (serine/threonine-protein kinase haspin homolog isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 771.5 bits (1991), Expect = 5.2e-219 Identity = 415/572 (72.55%), Postives = 444/572 (77.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. NCBI nr
Match: XP_023516003.1 (serine/threonine-protein kinase haspin homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023516006.1 serine/threonine-protein kinase haspin homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 759.2 bits (1959), Expect = 2.7e-215 Identity = 407/572 (71.15%), Postives = 440/572 (76.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80528 (Serine/threonine-protein kinase haspin homolog OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HASPIN PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 462.6 bits (1189), Expect = 6.8e-129 Identity = 276/611 (45.17%), Postives = 363/611 (59.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8TF76 (Serine/threonine-protein kinase haspin OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HASPIN PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 140.2 bits (352), Expect = 7.7e-32 Identity = 109/364 (29.95%), Postives = 165/364 (45.33%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2KIP2 (Serine/threonine-protein kinase haspin OS=Bos taurus OX=9913 GN=HASPIN PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 137.9 bits (346), Expect = 3.8e-31 Identity = 116/377 (30.77%), Postives = 159/377 (42.18%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Z0R0 (Serine/threonine-protein kinase haspin OS=Mus musculus OX=10090 GN=Haspin PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 137.5 bits (345), Expect = 5.0e-31 Identity = 112/385 (29.09%), Postives = 171/385 (44.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P83103 (Serine/threonine-protein kinase haspin homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Haspin PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 131.7 bits (330), Expect = 2.8e-29 Identity = 101/382 (26.44%), Postives = 161/382 (42.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HU83 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111467856 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 756.5 bits (1952), Expect = 8.4e-215 Identity = 406/572 (70.98%), Postives = 439/572 (76.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DYE2 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492097 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 755.4 bits (1949), Expect = 1.9e-214 Identity = 411/572 (71.85%), Postives = 441/572 (77.10%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HE26 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462027 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 755.0 bits (1948), Expect = 2.4e-214 Identity = 405/572 (70.80%), Postives = 439/572 (76.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LVR4 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G560690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 740.7 bits (1911), Expect = 4.8e-210 Identity = 406/597 (68.01%), Postives = 442/597 (74.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQE2 (Non-specific serine/threonine protein kinase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022845 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 694.5 bits (1791), Expect = 3.9e-196 Identity = 382/572 (66.78%), Postives = 422/572 (73.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10007006 vs. TAIR 10
Match: AT1G09450.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 462.6 bits (1189), Expect = 4.8e-130 Identity = 276/611 (45.17%), Postives = 363/611 (59.41%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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