HG10006897 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCACTTACTGTCTCTTATCATAGAAATCTTACACACAGGAGCTTCAAACTTCCCAAATGGCTCGAGTATTTCCTAGCTTATTGTGCAGCTCATGCATTTCAGGTATGATATCTTAATCACTCGTTAAAATAAAAGGCAAAAGTTTGGTAAGTCGAAAATTTTTGGGACTCGTATATTTTAGAAAATTGAGAATCATGAAAAACACATAAAAAGAATGATGTCACGTAGATATAAAACATAATTTTTTACTAGAGAAGACAAACACACCAAAGTATTTTGTGCAAAACTCTATAGCCTTCCAAAAATGTTTTATCAATATTTTATACTTAAAAATCTATGTGTTTTAAAAATAACACTGATTGCTTTCTAATTTTTAGGGTGATCCAATCAGCTGGGTGAGCATACATAGATGTCATCATCGATATGTTGATACTGAAAGAGACCCACACAGTCCTATTCAAGGATTTTGGTTTAGTCATATAGTATGGCTTTTTGACTTACCTACCTTGAATAAGAAGGTTTGTCCAAAGTATTTTAGTGATACCCAAAAACAAGAAAGAAAGATGTACATGTTGTTCTTCAAGCAAGGAAATCCAGATAATGTCTTCGATTTGGAGAAGCAAACCTTCTACCGATTTATTCAAAAATCCTATGTTTTTCATCATATGGCTCTTGGAGTTTTTTTCTATGCAATCGGAGGATTACCATTATTTCTATGGGGAATGGTAACATCAAATCACTTCTCCCTTTTTATTTTTCCTTTTAATTATTATTAAGAGGTCACTACCATATTTTACTACAATATTGTGTACATATGTGTTTATTTTATCTTAGAAAGCATAACAAATATTTTGTGTAATGTACATAATACAACATTTTTATTTTCTTAACATAACATGAATACGCTATTTTCCAACGAAAGCTAGTAAATTATGCGTGTTCTTAGTCATAACTAATTTTTAATTGATTTAAATGTTAGTTGTTATAACTATAAAAGCTAGGAAAATTTTCACTGATAGAAAAAATATCAAACTATATTTATCAAAAATAGCAAAAAAATTATTGAATAGACATTGATAGACTACTATCAGCATCTATCAATGATAGACTTCTATCATTTTTATCACTGTTAGACTTTGATAGACTTCTATTACCATCTATCACAACTATTTAAAATTTTTGTTAATTAGTGTAATTAGTTTCCCTTATTTTTCTATTTTTAAAAATTTTCCTATAAGCTAAATACACTAGGTGGAAATTTGAAACAATATATTTTTAAAAATAGGATATGACGAGAAAATATTGAGTGACATGATAAGTTGTACCTGAATGTTATAATCAACAGTAATTATGCATAACAAAAAAATAAGCATAATCTCAATTAGCATAAAACATGTTCTATCAATTTTAAAATAAGAAGTTTGAATATATTGTTAAATAAAAGAAGAAATAATAATGATACGTACCACACGTTGACTTGTCTATGATATATATATATATATATATATATATATATTAACAATGATAATTTTAACAAAAGTAAACATGGCTAACGGGCAATGATAATTTTAACAAAAGTGAACATGACTAAGGAGTAATTAACATCTACCTACCTCCCTTAAGGTTAAGGCTTATATCCCCTATCCCGTAGGTTGTAATAGAAGAAAAAAAATTCCAATAATTTTAATATTCAGGCATTGACAAAAAAAAAAAAGTGTTATTCTTTTTCTTTATATTTATTATTTGGGTAATTATTTTAAATGACAAAACTGCTGGAAATATTTTTACATATAGCAAACTGTACATTGATAGACTACTATCATCTATCACTGATAAATAACAATGATATTTTGCTATATTTTTAAATACATTAACTTATTTTGCTATATTATATTTGTTAATTTATTCTATTCAACGATATATGTACTGTCCATAAAAGTAATAATAGTAATTTATGTACTAAAGTCATTTATTTTCTAAAACTATTTGTAGTGCGTTCGGATGGTAGTGAATCTTCATGCAACATTGATGGTGAATTCAATATGTCACATATGGGGATACCAACAATGGAATACTGGTGATTTGTCAAAGAATAATTGGTAATATGCCTTTTTTTTCTTTTCATTTCTCGAGTTTTAAATAGGGTTTAAATTTTATGTTGGTCTCTCAACGTTTATTTTTTTTTCTAAGAATATTTCAATGTAAAATAACCAATTTTCACATTAAAGGTTAGTTGCTATGATTACATTCGGGGAAGGATGGCATAATAACCACCATGCATTCGAGTATTCAGCAAGACATGGTCATGCATGGTGGCAGATCGACTTTGGTTGGTACTTCATAATGTTTCTCCAAACAATAGGATTGGCGACTGATGTCAAATTACCCTCAGCTTCAAAAGTAGCGGCAAAACTTGCATAACTGGACAAACTAAATCTCCATCTTCAATTCAAAAGTCTATAACTAATTATAATATGCTAATATATGAAAAAAAATAAAGGTCGTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAGTACAAGTGTACCCTATTGTTATGGTGTACCCTATTGTTACAGTATGTTGTTCATTTTATGCTCTAAAGTGAGAACATATGAATAGTATATTTTAATTACACCATAACTATGTCCAGTTTGGTGAATCTATTCGCATTTGAAAATTATGTAACAAATGGAATAATCATAATCTAAATTAAATAGAATAATATTTGCATTAAAAAAAAATGAAACATTTAAATTCTGAATTGAAGTTAAATGTTAAGTGTGAGACAGAGAAAATCTTGAATGTATACTTCTAGGTTTATGGAGTTGATAATAAATCGATTAGATAGGTTGATTAATTGAAATAATCAATCCAAACAAATGAATTCATACTGGCCTGAAATTGTTACTCCATAAAGAACCAAAATCCGATTTTAAAAACATCTTTTTTTTTTTTTTTTCGTTTTCAAAATTTCTTAATAATCTTTAAAATGTTTTTAAATTTGAAAAAACAGAAAATCAAAACAAATTCATTTTTCAAAAATTAAAAATCAAAACAAAATGATTATTAAATAGCTTCTTAATTTTCCATTTATATGCTAGTTTTCTAAATTTAGGTTGAATGTTATAAAAAATTACAATGTGCTAGTTCTAAAATTTTTGGACGAGGATATAACCTACGAGCCACCATTGAACTTTACTAACGAAATCATTTATAATGGTACTTAAAAAAAAAAAAACTAAATCATTTATAATAAAATTAGCTTTAAGCTATTTGAGACTTAGAAACATTTATAGAAAGATAATTTTAAATAATATCATTCTTTCGTCATAATTACTGAAAAATTTTCACACATAAAAAAAATGTCAAACTATTTATAGAAAATAGCAAATAAAATACTGATAAATATTGATAGACTTCTATTAGCATCTATCCATGGTAAACTTATATCACTTCTATCGCTGATAGACTCTGATAGACTTCCATCAACGTCTATCACAATTATCTAAAAATTTTACTATTTGTGTAAATAGTTTCCCTTATTTTCTACTTTTAAAAATTTTCCATAATTATTAGGTTAAAACATTGTTTTGGTAGATGCATTTGAGGTTTTGTGCAATTTTAGTCCATATATTTTTATATGTAAAATTTTAATCATTATATTTTAAATAAATCTCAAATTTAGTCACTTAAAATTAATTTTTATCGAAATTGACTAAAAATAATAATAATTTTCTTACCAAGAAATATAAGTTGTGGATGTATTTTTAAAATTTAGAATAAAAATACTAATAAATAACAAAAAGTTTGTTAAAAATCAACCACATGAATAAGTAGTGAACTAAATTCAAGATTTCTTTAAAGTACGTGAATTAAATTTAGACATTTAAAAATACAAAAACTAAAATTCAACAAAGTCTATATTATAATACCGAGATTAAAATCATATTTTAACTTAATTATTATTAAAATTATACACAAAATGACTGGAGAAATTAAATTCGTTAGGTGAGGAGTCGGCGTCGGTGGGGGAAATGGACGGTGAGAGAGTACGTCTGCGTACCAAAAGGGAGGGCTGCTGCTTCATAAATAATAATAATAATAATAATAATTGTTAATTTACCCATTTAATCTTAATTCTGCACCACATAATTTTAAATTTAGAAAAAAATTCTTTTTTCAAAAAATTTAGAAAAAATCTCAAACTTAGACCATAAAATTAGTTCCTCATAAATATTTATAAAGATAGTTGTGTAGTTGACAAAATTCGTCATCGTAAACATAAATAAATAATTGTTAATTTGCCAATTTTTGAAACTTAGACCATAAAATTAGTTTCTCATAATTATACTATTTTTAAAGTCTATCACTGTGTACCAATTTTAAATGATTGATCCCTCCATTTTTATTTTTATTTCATTTTTAAGGTATTAAAATGGTCACTTTTTGAAAGTTTAAAAATCAAAATGAATCAAAGTTAAAAGTTCAAGAAACAAAATGAATATTTTAAAAGTACAGGGACCAAAATGAACCAAAGTTGAAAGTATAAGGACTAAAATGAACATTTTAAAATTGCAGGGACCAAAATGAACTAAAGCCAAAGCACAAGGACCAAAATAGTATTTAAACCTAAATTTTATATCAATCACCTATAAATAACTATCCAAAATTAGAGATAATTTTTATTATTAATAGACTATTTTTATGTCTAACAATAATCATTTTTACGTGTTTGATATATCATTTTTATATCTATCATTGATACAACATTTTCACCTTTATCATTGGATAGACAATTTCCTCATTAATAAATCAATGGTAGATCGTAGATGTCTCAATTTTTGTTAATAAATATCAATGCCATATGTCTGTTAATGATACCCATTTATTGCTGCCGATACATTGCTATTAATCATTTATGTTAATTGTTGTATATCAAATTTTTAGGCAATTATAACAAA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MALTVSYHRNLTHRSFKLPKWLEYFLAYCAAHAFQGDPISWVSIHRCHHRYVDTERDPHSPIQGFWFSHIVWLFDLPTLNKKVCPKYFSDTQKQERKMYMLFFKQGNPDNVFDLEKQTFYRFIQKSYVFHHMALGVFFYAIGGLPLFLWGMGDPISWVSIHRFHHRYVDTERDPHSSIQGFWFSHIAWLFDLRTLNKKVCPKYFSDTQKQERKIYMLFFKQGNPDNVSDLEKQTFYRFIQKSYVFHHMALGVFFYAIGGVPLFLWGMSSSRTGVDSRSEQINMEVQGSSKKMIATQAEMVEARVPIPYRDQCAHLLIPLNKCRQSEFYLPWKCEDERHSYEKCEYELVMERMLQMQKIREEEAKLKKGIPLIPKTANL Homology
BLAST of HG10006897 vs. NCBI nr
Match: KAG6575951.1 (Palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 364.4 bits (934), Expect = 1.2e-96 Identity = 181/376 (48.14%), Postives = 209/376 (55.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. NCBI nr
Match: KAG6575957.1 (Palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 353.2 bits (905), Expect = 2.8e-93 Identity = 175/327 (53.52%), Postives = 203/327 (62.08%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. NCBI nr
Match: KGN52908.2 (hypothetical protein Csa_014723 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 290.8 bits (743), Expect = 1.7e-74 Identity = 158/476 (33.19%), Postives = 201/476 (42.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. NCBI nr
Match: XP_038893002.1 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 287.7 bits (735), Expect = 1.4e-73 Identity = 128/151 (84.77%), Postives = 137/151 (90.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. NCBI nr
Match: XP_022155827.1 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 248.8 bits (634), Expect = 7.3e-62 Identity = 112/161 (69.57%), Postives = 127/161 (78.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q949X0 (Palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ADS3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 183.0 bits (463), Expect = 6.5e-45 Identity = 79/158 (50.00%), Postives = 105/158 (66.46%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SID2 (Delta-9 acyl-lipid desaturase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ADS2 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 2.0e-41 Identity = 78/152 (51.32%), Postives = 98/152 (64.47%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVZ3 (Probable lipid desaturase ADS3.2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ADS3.2 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 8.2e-40 Identity = 77/161 (47.83%), Postives = 101/161 (62.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65797 (Delta-9 acyl-lipid desaturase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ADS1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 1.1e-39 Identity = 74/152 (48.68%), Postives = 95/152 (62.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0DOW3 (Acyl-CoA 5-desaturase AL21 OS=Anemone leveillei OX=212809 GN=AL21 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 164.9 bits (416), Expect = 1.8e-39 Identity = 83/176 (47.16%), Postives = 103/176 (58.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DQF3 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022855 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 248.8 bits (634), Expect = 3.6e-62 Identity = 112/161 (69.57%), Postives = 127/161 (78.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GMY0 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455910 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 240.7 bits (613), Expect = 9.7e-60 Identity = 105/151 (69.54%), Postives = 121/151 (80.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CR34 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013452 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 240.0 bits (611), Expect = 1.6e-59 Identity = 101/151 (66.89%), Postives = 122/151 (80.79%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J0F3 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480111 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 2.2e-59 Identity = 103/150 (68.67%), Postives = 122/150 (81.33%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DHZ7 (palmitoyl-monogalactosyldiacylglycerol delta-7 desaturase, chloroplastic-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021091 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 239.2 bits (609), Expect = 2.8e-59 Identity = 102/150 (68.00%), Postives = 118/150 (78.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. TAIR 10
Match: AT3G15850.1 (fatty acid desaturase 5 ) HSP 1 Score: 183.0 bits (463), Expect = 4.6e-46 Identity = 79/158 (50.00%), Postives = 105/158 (66.46%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. TAIR 10
Match: AT2G31360.1 (16:0delta9 desaturase 2 ) HSP 1 Score: 171.4 bits (433), Expect = 1.4e-42 Identity = 78/152 (51.32%), Postives = 98/152 (64.47%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. TAIR 10
Match: AT3G15870.1 (Fatty acid desaturase family protein ) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 5.8e-41 Identity = 77/161 (47.83%), Postives = 101/161 (62.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. TAIR 10
Match: AT1G06080.1 (delta 9 desaturase 1 ) HSP 1 Score: 165.6 bits (418), Expect = 7.6e-41 Identity = 74/152 (48.68%), Postives = 95/152 (62.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006897 vs. TAIR 10
Match: AT1G06100.1 (Fatty acid desaturase family protein ) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 1.7e-40 Identity = 75/152 (49.34%), Postives = 96/152 (63.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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