
HG10006787 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATGAGAATCTTCCAGTTCCAGCTTATTTCATAATGACCTTTTTCATTTTCATAAGCCGTTTAAAATCAAGCATAAACAAATCCAAGCCAAGGATAGCCTTACACCACCAACCAAACAACCTCCGAGACGATCCCGAAGCTTTAAACTTAGCTTCCTCGGATTATGGGAATATGGTTAAAGAAACCCCTGCTGCAGTTCTTGAACCATCTTCAATAAACGGCGTCGTTCAGCTAATCTCTTATGCTTACAACAATTCCATCCCTTTTCAAATTGCCGCTAGAGGACAAGGACATTCCGTACGAGGTCAAGCAATGGCCAAAAACGGCGTCGTTATTGACATGTCGGCGCTGCGTCGGAATCGGAAAACCCCGGGAATCGTTGTCTCCTGCCGCCGTTGGACGACGGGGGAATTTTACGTGGATGTGGGTGGGGAGCAGCTGTGGATTGACGTGTTGAATGCCACGTTGGCGTATGGGGTCACACCGGTTTCGTGGACGGATTATTTGTATATCACGGTCGGGGGTACGTTATCAAATGGCGGGATCAGCGGGCAGAGTTTCCGGTACGGTCCGCAGGTCAGCAATGTGGTGGAGATGGATGTCGTCACTGGTACGGAAATAATTTAGTTAATCTTATACTTTAGTATATAATTAATATATATTGTAAAATTTAAATGAAATCTATTTTCTTTTTGTTCACATTATATTATACGAAAACGCGACAAGTTTGATTGTTACAGAATGTGTATTGAGTACAGACATTTTTCTACATATCATTAAATGATGTGAGAAATTAAAGATGTTCGTTACGGTGGTCCCTATGTTTGAAGCCTAAATTAATTATGCCAACAAAAAAAAAAATGTGTATTTTTCAAACCAGGTGTTTCCAGTGGACTTTTTTTTTTTATTATTATTATAATAATTATTATTATTATGGGTTGCATTGCGTGCATGGAATTAATTTTTATGGGGTTTTAATTTAAAATTGATATATTTTTTTTGGAATTATTGTATTTTGTAGGGAAAGGGAATATGGTGACTTGCTCTCCCAAGCGGAATTCTGAGCTTTTCCATGCCGTTCTTGGAGGGTTGGGTCAATTTGGAATTATTGCTCGAGCAAGAATCGCTTTGGAACAGGCTCCAACTAGGGTAACTTTTTTCTTAAAATTTAATATTATTTCCAACCAAAAAAATTGTTGTTTATTTAATATCATTACAACACGATGTAAAAAAATGAAACATTATTTAATAAGATCGTCACAATTGGTTGTTTTATAATAATCTTTAGATGTAGATTAATAAATATACATGTCATCTAATAATCACCAAATTTGAGTTTGAGGTAAAAACTATTGGCTATAAATGCCCTTTCTACTTGTTATATACTTTCTAGCAATATTTTTAAAAACCAAGAAAAAAAAATAGTTTTAAAAAACTTGTTTTTGGAATTTGAATTTTGATTAAGAATTCAACCATTTTACTTCAAGAAGATGCAACTATGGTAAGAAACTGTGAGAAAATAGACTTTATTTTCAAAAACCAAAAATTAAAAATTAAGGCTCCGTTTGGTAACAATTTCATTTTTTGTTCTTAGTTTTTGAAAATTAAGTCTATTTCATCTCAATCTTACAATGATTTGCATCTTAAGTGCAAGAGTTGTATCCTTAGTCAAATTCCAAAAACAAAAACAAGTTAAAAATCATTTTTTTAGTTTTTAAAATTTGACTTCATTTTTTAAAATATTGGTAAAATGTAAATAACAAATCAAGAAATTTATAAGTGACAGGAGTATTATGGACTTAATTTTCAAAAATAAAAAATAAAAAATAAAATTGTTACCAAACGAGACCTAAATGATTAACCGACATAACTAAAAATTAATTTTGGAGGAAAAAAAAAGGTAATTCAAAGTTTGAAATATATAGGAATCGCATGTGTTGTTGGAACTACTATTGAAGTAAAGAATTTTAAGCCCATATGTTAATTTTGGTCTTTTCTCTTTTGTGGTTTGGAAGTTTTTGTTGTGTTTCTTATTTTGAATTTTACATTATATATATAAATATATATATATATTGTTTGACTTTGATTAGAAGTATGGAAGTATCTATAGATTGTCCAATGAAAGCTTCCAAACAACCCTACATATCCTTGTCTTTGTTTGTGAGTGTTTCTGTCAATTCCAACCACCAAAACGCTGTCGTATATGTAATACAGACAATTCCGGAATTAATTCTCAATTCCTATGTTTAACCTTTTCTTAACTGCATGCTTTGACCGCTAATTTATCATTATCATTATTATTATTATTTTATTTTTGTGGAATTTTAATTGCTTGTAGGTTAAATGGGTACGAATGTTGTACAGTAACTTTGCCGCATTCACCAAAGACCAAGAGCATTTGATCTCATTGAATGGAAGGAAACAAGCGAATGCACTGAATTATTTGGAGGGTTTGGTTCTGCTGCATCACGGCTCACCGGATAGTTGGCGCTCCTCCTTCTTTCCACCGTCTGATCATCCCAGAATAATCTCCTTGGCCAATCAAAACTCTGTCATTTATTGCCTTGAAGTTGTTAAATATTATGATGATAATACTCAGTCTACTGTACATAAGGTACTACTTCAATACTACGCATTTTCAAGTCTCGTGTTTAAAATCATTAAAAAATATATACTTTTAATCATTTCAAATTATAATTTTTTTATTATATTAAAATCACATCTTAATTAATTTTACCTAAATTGTAACAAATACTTATTTGTTTAAAAAGTACTCCTATACTTTCAAAATTTATAATATTATCCTTCTATTTTCATAAACGTTTTAAAACTACTCTTGAAGTATTTATAGGATTTTAAATAATATTGGTATATTTTAAACACCCTAGGGCTAAAATATTAAAACAGATGTCTAACTAGTTAATAATTAATCTTATGGATTGTGAGATTAATTAACAAAGATACATATTAAGATAATTAATCTACTTATTTATGACTATAAATAACGTTTCACTGATTAATAATCCTCATTTCTTTTGATTGGATGTATTATAGGAGCTTGAAATATTACTAGAAGGCTTGAATTATGAGAGTGGGTTCAAGTTTGAAAAAGATGTAACATATGTTGAATTTCTAAATAGAGTTAGAAGTGGAGAGTTGAAGCTTCAATCAAAAGGATTATGGGATGTTCCTCATCCATGGTTGAATTTGTTTGTACCAAGATCTCATATCTCGGATTTCGATTCTGGTGTCTTCAAAGACATAATTTTAAGACGAAACATAACTAAAGGACCTATTTTGATATATCCAATGAATCGATCCAAGTAAGCTTTTGATCTTTTATATTGTGCTATATTTCTGTTAATATTTTAGATTTGATTGCTATATTTTTAACTGTCGATTATAAATACAGATGGGATAATAGAAACTCGACAGTAATACCCGACGAAGAAGTGTTCTACACGATAGGGTTTTTGAATTCGAGTGGGTTTGATGAATGGAAAAAGTTTGAAGAACAAAACGAAGAGATATTAGAATATTGTGGGAAATCAGGCATTGAAATCAAACAATATCTTCCTCATTACAAAACACAAACACAATGGATTCAACATTTTGGTTCCAAATGGACAACTTTCAGAGATAACAAATTCAAGTTTGACCCTAAACATATTCTCTCTCCAGGACAAAAAATTTTCAATTCCTGAATTTTATTATTATTATTTTTGTTTTTCTTCGCAGTGTGAGAATATATATATATTAGGATAAAAAAAAATAGATTAATTAGATTTTTTGTTGGGGTTAAATTAATTATATACTATATTTTCAGCACTATTGTATCTATTCAGCCCTAAATTGTAAAATATAGTTTCAGCATTATTATATAACATCATTTCCATAAAGTTTAATTGAGATGTATTCTTTATATTTGAGTAGAGTGTACATAAAGATACCAAAAATCGATTCGATCCATTGAAACAGACCGAATCAATTATAATCGGTCAGGGAAGTCCCTTGGTCGATCGACAGTCGATTTTTCACAAAAAGCCGACCCCCGACCGACCGACCGTAATAGGGTTCCAAAAAAAATTATTTATTTATTTTCCTTTCTCCCTTCCTCTCATTCTTCTTCCATATTTGTAAGTCCATGAAAAAAGAAGTTTTTTATCCACAAACCCCTGAAAAATTAAATTCTAAAGAAATGAGATATTAAAAATAAATAATAAAAAAAAGGGAACCGACCGATCGTCAGCCGAATTTGAACCATTTTTTCTTGTCGGTTTTCGATGCTGGTTTTCGCCCAAAACTGACACCGATCGATCGATGTACATCCCTGATTTTGAGATTGAAAGTTTAATTTTGGGGCAATTAATTATTAATTTATACCCTAAACTTTTGGAGTTGTATCAATTTAAACCCTAAACTTTCATAAGGGTGTCAAATTAAACCCCAAACTAATAATTGTATTAATTTAAACCCTTCATTATGTTTTATGTTAATACACTTATGAAAGTTTAGGGTCTAAATTGATATACTTAAGAAAGTTTAAGGTTTAAATTGATATATTTATGAAAGTTCAAGATTTGAATTGATACAATTATTAGTTTGAGATTTAAATTGATACAACCCTCAAAGTTCAGGATTTAAATTGATACAATTATAAGTTTAATGTTTAAATTGATACAATTCTTAAAATTTAGAGGTATAAATTGATATTTGCACTTTAAATTTAAAAGGAATATAATTATAATTTTCCTTATGACTTGTAAGCATTGTATCAATTTAAACATTAAACTCATAATTATATTCCCTTTAAATAACTTGGTGATGATGGTGCTACGGTTGTGTCAACCTGGTTGAGATAGCCTGGTGCACCTACTGATCCCACTCAAATAGTACATTGTTAAAAAAAAAAGAGATATATTCAGATTTTGGAATTAGAACTAATGCAAATACAGTACTTCTATTAATTGAATTGTTCATAATTCATACAT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MNENLPVPAYFIMTFFIFISRLKSSINKSKPRIALHHQPNNLRDDPEALNLASSDYGNMVKETPAAVLEPSSINGVVQLISYAYNNSIPFQIAARGQGHSVRGQAMAKNGVVIDMSALRRNRKTPGIVVSCRRWTTGEFYVDVGGEQLWIDVLNATLAYGVTPVSWTDYLYITVGGTLSNGGISGQSFRYGPQVSNVVEMDVVTGKGNMVTCSPKRNSELFHAVLGGLGQFGIIARARIALEQAPTRVKWVRMLYSNFAAFTKDQEHLISLNGRKQANALNYLEGLVLLHHGSPDSWRSSFFPPSDHPRIISLANQNSVIYCLEVVKYYDDNTQSTVHKELEILLEGLNYESGFKFEKDVTYVEFLNRVRSGELKLQSKGLWDVPHPWLNLFVPRSHISDFDSGVFKDIILRRNITKGPILIYPMNRSNCLLNLDGLYREDDDDQKKQPSSSLGSFERRLFNEYTQLTFNLENNLVPGHAFKNNISFLEVHESVLQTLSSSQIQRQFYASVVFMGSSNGEIEVGFSEVNMVEKMKQTNPLFPSWEEVSSIDLKSPSIEESPESSSLSFYNDLSKILLPPTPTPSSSLLTGDSRGSAFEEYNVKIKKAAVTENHQKRESLTKKWIVFYRKLKLMRVGERIEARRPASAQLLHMIAERRRREKLNESFLALRSILPPRTKKDKASVLATTREYLTKLKAQVSELSHKNQMLLEAQALQNRKHDQSNTATSSLNERFTVKVSYAPPGSTEEIIDLEITVRGDGPLMADIAIRVLQFLKDIVNVRVVLSFQAHHQTVPSSLSRLGFRFSLQSGEWDESAFLEAVRRIVSDLPPS Homology
BLAST of HG10006787 vs. NCBI nr
Match: KAG6586478.1 (Cytokinin dehydrogenase 3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 929.5 bits (2401), Expect = 2.0e-266 Identity = 544/917 (59.32%), Postives = 601/917 (65.54%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. NCBI nr
Match: XP_038890602.1 (cytokinin dehydrogenase 3-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 802.0 bits (2070), Expect = 4.9e-228 Identity = 395/428 (92.29%), Postives = 409/428 (95.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. NCBI nr
Match: XP_011648605.1 (cytokinin dehydrogenase 3 [Cucumis sativus] >KAE8651493.1 hypothetical protein Csa_019205 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 783.9 bits (2023), Expect = 1.4e-222 Identity = 386/431 (89.56%), Postives = 404/431 (93.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. NCBI nr
Match: XP_008459369.1 (PREDICTED: cytokinin dehydrogenase 3-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 778.5 bits (2009), Expect = 5.8e-221 Identity = 381/429 (88.81%), Postives = 402/429 (93.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. NCBI nr
Match: XP_023521300.1 (cytokinin dehydrogenase 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023545411.1 cytokinin dehydrogenase 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 752.7 bits (1942), Expect = 3.4e-213 Identity = 379/466 (81.33%), Postives = 403/466 (86.48%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTS3 (Cytokinin dehydrogenase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CKX3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 473.4 bits (1217), Expect = 5.3e-132 Identity = 231/404 (57.18%), Postives = 301/404 (74.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q67YU0 (Cytokinin dehydrogenase 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CKX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 414.1 bits (1063), Expect = 3.8e-114 Identity = 208/384 (54.17%), Postives = 274/384 (71.35%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FUJ2 (Cytokinin dehydrogenase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CKX4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 3.3e-110 Identity = 203/394 (51.52%), Postives = 266/394 (67.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FUJ3 (Cytokinin dehydrogenase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CKX2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 399.8 bits (1026), Expect = 7.4e-110 Identity = 206/405 (50.86%), Postives = 264/405 (65.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZAY9 (Cytokinin dehydrogenase 5 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CKX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 398.7 bits (1023), Expect = 1.7e-109 Identity = 208/390 (53.33%), Postives = 261/390 (66.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C9Z6 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498521 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 778.5 bits (2009), Expect = 2.8e-221 Identity = 381/429 (88.81%), Postives = 402/429 (93.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4H4 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450699 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 748.0 bits (1930), Expect = 4.1e-212 Identity = 378/466 (81.12%), Postives = 401/466 (86.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DPL8 (Cytokinin dehydrogenase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021923 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 739.2 bits (1907), Expect = 1.9e-209 Identity = 365/430 (84.88%), Postives = 392/430 (91.16%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V6X9 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold41G00510 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 728.8 bits (1880), Expect = 2.6e-206 Identity = 363/429 (84.62%), Postives = 383/429 (89.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FD08 (Cytokinin dehydrogenase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444271 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 728.4 bits (1879), Expect = 3.4e-206 Identity = 358/428 (83.64%), Postives = 390/428 (91.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. TAIR 10
Match: AT5G56970.1 (cytokinin oxidase 3 ) HSP 1 Score: 473.4 bits (1217), Expect = 3.7e-133 Identity = 231/404 (57.18%), Postives = 301/404 (74.50%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. TAIR 10
Match: AT1G75450.1 (cytokinin oxidase 5 ) HSP 1 Score: 414.1 bits (1063), Expect = 2.7e-115 Identity = 208/384 (54.17%), Postives = 274/384 (71.35%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. TAIR 10
Match: AT1G75450.2 (cytokinin oxidase 5 ) HSP 1 Score: 409.5 bits (1051), Expect = 6.6e-114 Identity = 208/385 (54.03%), Postives = 274/385 (71.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. TAIR 10
Match: AT4G29740.2 (cytokinin oxidase 4 ) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 2.4e-111 Identity = 203/394 (51.52%), Postives = 266/394 (67.51%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006787 vs. TAIR 10
Match: AT4G29740.1 (cytokinin oxidase 4 ) HSP 1 Score: 401.0 bits (1029), Expect = 2.4e-111 Identity = 203/394 (51.52%), Postives = 266/394 (67.51%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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