HG10006742 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAACGTCGAATCGACGTGTTTAATGGCCTCGAGAGACGTGATTGATTTAAAGCTCGAGCAGTTCATATCTATAAGTTTGGATAATTACTTCCTTTTTCTTTTTAGTAACTGTAATAAATTTTAGTTTTTATTCTGATTTTAAGCTTCAGAATTTTCATGTTTTAATTAGAAGTAACTTTTTTATTTCTTTTAGTATACAATATTTCAGCGATGGCTCGAAATTTGAGTCTTCAATTTACTGAAAATTTTACAAAGTGTAGCTGGAGTGAATTTTGAATTTGAGACTCGAATCATTTACTCTTTGAACGAGATCGTATGTTTTATTACATGATCAGTTGGGTTTTACTAGTTGACAAAGATAATAAAAATCACTCATAATTTTTTTAAAATCAAAATTGCATGTTTTATTCTATGTTCGGAATTGCACTATGTCTATGTTGATAATAGTTGTAGAAACCACCTCTATGTTTATTTCATGCTCGGTTGAGTCAAGTTCGTGCTGACAAATAGAGTGGAAATTATTCATGGATAATTTTTGTGTCGTTGCACGTGAGTGGCTGGCTCATAAGTCACAAGCACTTAAAGTAGAAATCTTGAGTAGCATAGTGAAAATTGCACGGATAGAGTCAATAAAGGATTGTAATTGTTTGGGTAGCAATTTTTTTCAATCAAAATCATCCAAATGTGTTGATATGCTTAGATTCAAGTTATATAATTTGTTTATTAAAAAAAGAAAAAAAAACTATCCAAATTTCTGGATAATGAATTTTGAAATCTATTTAATTGGAGTACTATTAAATGATTAATTCACCTTACAAACAAAATGAACAACATATGAATAATAGATCTGGGCAATATTCCACCTTTTTTTTTCTTTGAAAAAATGTGCCTAATTAATGTGTAGAAATTAAAAGTTCAACAAGCCACATTCTACCATTGTTAGTATTATAAAATTTTAAATTATAAATAGGAAAAGTTTTAAAAATAGAAAAATAAGAAAAACTATTTACACAAAATAGCAAAATTTTTAGATAATTGTGATAGACGCTGATAGAAGTCTATCATGATCTATCAATGATAAAAGTGATAGAAATCTATCACTAATAGATGCTGATAGAAATTTATCAATGTCTATCAGTATTTTTGCTTTGCTATTTTTTATAAATAGTTTGACATTTTTTTTATATGCGAAAATTTTCCTTATAAATAAGACATTTCAAATTTAAAAAAAAAAATAGAATGAAATAATAATGAAAAGCGACAAAAATCTTGATAAATGCTTTCAATATTTTCAAATGATTCCTTTTGTTTCATCCACTAGTTTTGGATCAACTAGAAATGATTGAAGTGATGTTATGTGAATCATGTCTTTACATTTAATTTGAATATATATAGCAAATTTTCTGTACAAATAATTTATTAAATAAAATAAAATATAGTAATTCTCAATTACTCGTGAAAACATAAAAAAGAAAAATATACCTATTGTCAAAATTTGTATATACTCAAATTTTGTGTGGGTGAGAGATGGAATCTCAAACCTTGAAATTAATTATATAAGTTCATACCAATTAAGTTGTAGACATGTGTGCTATACACTTAATTAGTTTATGTCAATTAATATTTATCAAAATTATGCTTTAGAATATCATTTGATATGAGATTAGAAGGATATCCTAATATTCTAAATAAGTGATAATCATAATTTGTTTGAGAATTCTAGTCTTACAAATGTATCTAAATAATTCGCAGTACTAAAAAAAGACGTACCTAAATTTATGACTTATCTCTTTGACACGAGATCGATACTCGTATATCATTATCATACTTTTAAGAACTTTCACATATACACTTAAAAGCTTTCTCTTTCACTCTCTTTCTTCAATGGTACCCATATGTTAATATTTTCTCTCTCCTATATTGCTTTATTCATGGTTGTTGAAAGGTTGCCTTTGGGATTTATTATAGGTCTCTTTAGTTTCTCTTTTGTATAGCGACGTGTTCAATTTAGTATACTTTTCGTGGTTCTAGTTCCATTCCTTTACGTGGTTACAAGGTTATATATGTTAAAAATCGTTGACACGATTGACATATAATTTATCAGCCATTTTTTCTTTTTTTATCGCCTTAAAACTTTAGAGAGGGACATTCTGAACTAACGAGAAGTAATATTGAATTGATTTGATTTTATCCGTTGGGTTGTTGATGTTGTATAGTATTGCAATAGCTTGTCTTGTTCGCCCACTTGGCATACTTATTTGTAGTTACCATCTTAAAGATACATAGTGTTCTAGTTGAAATGGTATTACTAAATTGAACAGAAAAATTCTATTAAGGTATGCATCTAGTTAGATCACGACAATAAAAAATAGTTCGATTTGAACACGAGGACACGTGTATATCCTTCATAGTAGCCATGTCGTCATTTGACATTATATGGCACGACTATTAGTCTCACTTTTAGCTACACACCATTCAACGTATGACTAATTAACTTTTAAATATTTCTTTTCATGAGTCACATGTGTTATCATTAACTCTTCTATAAAGGTTTTTTTTTTTTTTTTTCTATAATCATTATTGTTCCTAATTAACCATATCAACTTTTCATTCAACATATAAATAATGAATTGTTAAATATTTGAATTTATGAAAAGTAAATTATATAGAGGGCACACCCTTACTGTTTTAGCTTTTGCATGTAAATATTATTCTTACATTTTTCTAATTTAAATACTAAAAGTTTAAGATTTTGCACTTTCTTTCTACCTAATGATTATTTCACAAAAGTAAGATTAGACATAATAATTACGAGTAAACAATAAGCAACAATGTAAAGCTAATTACTGATGTTTGACTTCTTACTCAACATGAGTGCAATTTAAGTTTTGTCTAAATTTTGGCAAAATACATGTAATATTTTTTTCCACTCCTTAAGTCCTTAAATTTAGTAGATGTGGATATAACTTTAAAAAAATACCCTTCCAAAAAGAAACTAAACAAAAATATTTTCAAATATAGAAAAATGAGTCAAGTTATTTATAAATATAGACAAAATTTACTGTCTATCAGCTATAGGCCGTGATAAAATTCTATCATTTAAGCGATAGACGGTGATAGAATTCTATCGCTTTTTATCGCGATCTATAGCTGATAATGAGTGAAATTTTCTATATTTATAAATAGTTTGATATTTTTTTTTATTTATAATAATTTTCCTAAAAAAAAACTAATTTGTAGGAAGTTAATATAAAAAATTTCACACACACCACGAACAAAAACCTAGCTCAATGGTGTTAGATACTAAGAGACATGGACATTTTAGTCACCATACCTGAATCATGTGTAAGGATTAAAAAAAAAAATCCATCGATTCGTAGATATAACCGTAAAATATCATAGAGTTCGACATTGATATTAGGGATTAATCAATATTTTTTATATCTTTTAAAAGTGCCCATAATACTTTAAAAAAAATATCATCTATTAATTTTAATATGAAATATAACTATTAAAGAGGTATACAACTTAATTTGGAAGTTAAAAACAAGTAAATTGTTTTATCCAAGCAAAAGATATTTGAATAGAAAGATATTGTCAAATTCCTTTGCCAGATTTGAATTATTGTAATCTAGCTTTGTTTGCGATTTTATTTATTTTGGTAAAATAGTGTGAGAGTGAATTTTCGAGGACTGGTCTGGTAGTTGGGCCCATTTACTCCAATAAGCTAAACAGGTTACTGGGCCGAATATAGGTGGGCTTGGTAGTCTAGCCCATTGATAAGCTAAGTTCAAAATTTTATTTATCTTAATATTTATTGTACTATTTAATTTTAAACCCATGGGGATGTAGCTCGGATGGTAGAGCGCTACGGGGATTGATACCCCACATCTTCATCTATTTTATTTTTTCAAAAATATTTATAAATATTTTTCTCTTTCTTTCTTACTTTTTATATAAGTTTGTATATATTTTTAAAACATTAGATTATTTTATTATCAATTGGGGATGTAGTTCAGATGGTAGAGTGCGAGAGGTATGGGAATTGATACCCCACATCTCCATCTATTATATTTTTAAAAAAATATTTAGAAATCTCTCTCTTTTCTTTGTAAATATATTTTAAAAATTAGATTTTTTTTTATCAATTGGGGATGTAGCTCAGATGGTAGAGGATCGATACCCTGCATCTCCACCTATTACATATTTATAAATATTTTTCTCTTTCTTTTTTACTTTTTATATACTGAGTGAGTTTCTATATTTTGAACACAATTGGATTAGTTTTACTATCAATGGGGGATGTAGCTCAGATGGTAGAGCGCTCGCTTAGCATGCGAGAGGTACGGGGATCGATACCCCGCATCTCCATCTATTTTATTTTTTCAAAAATATTTATAAATCCTTTTCTCTTTCTTTCTTACTTTTTATATACTGAGTAAGTTTGTAAATAATTTGAACAAAATTATATTATTTTTGCTAACAATAGGGGATGTAGCTCAGATGGTAGAGTGCTCGCTTAGCATGCGAGAGGTACAGGGATCGATACCCTACATCTCCATGATTTACAGTTTCCTCATGAAAAATCATTTATCACACTTTTTTAAAAGTGTGCTACTTATGAAAAGTGAAAATTTAGAAGGGTTATTTTTAATAATTTCTCTAATTTAATCTTTAAATCTAATTTATCCCAACCAACTCAATCCAAACAATCTTGATAAACTAAATTTATTTTATGCAATTTTCTTAAAATCCAAAAAGAAAAACATTTGATTGTGACGTGGAACCTATTCACTGGTCGAACACAATCGGCGCCAAACTCGTCACAGCACTCGATCATTGCTGCCGCGTTTCCTTCAATTTCACTCGTCGATCAGAATAAACCCCTTAACTAACGTCTGCCTTCCTCGGAAATTCTCATTTCCTCGTAATCGTCCGTCGCACATGGTGGCCGATTCTCCGAATCTCCAATTAATTGATTGAGCTGAAAA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BLAST of HG10006742 vs. NCBI nr
Match: XP_038877411.1 (golgin candidate 1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 961.1 bits (2483), Expect = 5.0e-276 Identity = 575/674 (85.31%), Postives = 596/674 (88.43%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. NCBI nr
Match: XP_038877412.1 (golgin candidate 1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 954.5 bits (2466), Expect = 4.7e-274 Identity = 574/674 (85.16%), Postives = 595/674 (88.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. NCBI nr
Match: TYK10741.1 (golgin candidate 1 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 916.8 bits (2368), Expect = 1.1e-262 Identity = 547/673 (81.28%), Postives = 583/673 (86.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. NCBI nr
Match: XP_008458730.1 (PREDICTED: golgin candidate 1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 915.2 bits (2364), Expect = 3.2e-262 Identity = 546/673 (81.13%), Postives = 582/673 (86.48%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. NCBI nr
Match: XP_004150848.1 (golgin candidate 1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN60588.1 hypothetical protein Csa_019241 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 911.4 bits (2354), Expect = 4.6e-261 Identity = 547/673 (81.28%), Postives = 583/673 (86.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8S8N9 (Golgin candidate 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GC1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 510.0 bits (1312), Expect = 4.0e-143 Identity = 365/686 (53.21%), Postives = 456/686 (66.47%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5JLY8 (Golgin-84 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os01g0744400 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 452.6 bits (1163), Expect = 7.6e-126 Identity = 331/686 (48.25%), Postives = 431/686 (62.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CG21 (Golgin candidate 1 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold332G00520 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 916.8 bits (2368), Expect = 5.3e-263 Identity = 547/673 (81.28%), Postives = 583/673 (86.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C940 (golgin candidate 1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 915.2 bits (2364), Expect = 1.5e-262 Identity = 546/673 (81.13%), Postives = 582/673 (86.48%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LFU5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G000950 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 911.4 bits (2354), Expect = 2.2e-261 Identity = 547/673 (81.28%), Postives = 583/673 (86.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C8N8 (golgin candidate 1 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 911.0 bits (2353), Expect = 2.9e-261 Identity = 546/673 (81.13%), Postives = 581/673 (86.33%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V032 (Golgin candidate 1 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold41G00930 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 885.9 bits (2288), Expect = 1.0e-253 Identity = 522/615 (84.88%), Postives = 553/615 (89.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. TAIR 10
Match: AT2G19950.1 (golgin candidate 1 ) HSP 1 Score: 510.0 bits (1312), Expect = 2.9e-144 Identity = 365/686 (53.21%), Postives = 456/686 (66.47%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006742 vs. TAIR 10
Match: AT2G19950.2 (golgin candidate 1 ) HSP 1 Score: 509.6 bits (1311), Expect = 3.7e-144 Identity = 365/688 (53.05%), Postives = 457/688 (66.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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