
HG10006581 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGAAGCAATTTTATTGACGAAACTACCAGCTGTGGTGAGGCTGATGGGTCTGAAACCACTATTGAGATTAAGTTAAAAACTTTAGATTCACAAATTTATACTCTCAGAGTGGATAAACAGGTATTAATCTTCACTTTAGGGTCATAAAGGTTGTGGGACAGTTAATTTTCTGATCAATTAACTCAAGATGATGTTTTAAAATGTATTTATAATTTAAATAATTTTAGTGCTTCTTTCCTTATATATTTCAAGTTACATGTTAGGTTGCAAGAAATCTGATAAGTTAAATGGGTACTTGAATTTTATTCAAGTTTTGTTAGCTTCAATGAAAATCTATTACTTCAAAATAGAGAACACTATAACATTAATTTTTGTGAACTTGTATAGATGCCAGTCCCTGCTTTGAAAGAACAAATTGCTTCTGTAACTGGTGTGTTATCAGAACAACAACGTCTTATATGTCGAGGAAAAGTTCTCAAGGATGATCAGCTCTTGTCCGCCTACCGTATCCTCTATATGATTTTACTATATTTCTTTATTTTCCACAGAACATCAATTGAATTGATGTTCTTGTGATTTAAAGTGCTCCTTTGTTTAGGATTTTTACTGAGTCATAAGATAATATGTGATTCATCCTTTTATACATATAGACAATACAGATCCACGTGTGAATGTGCAATGAAAAGTGAAAACACATGGAAATTTTTTTTTAACTGAATACTCAACCTATTTTACTTGGTACTTTTGTATGTTGACTTACATGGAAATAAGAATAGATCAATAAGTTTATTGAAAATAAAAAAACAGTTTTTGGGGAAGTATGACTATGGGATATCACAACCAAGATTGTGCTCGAGTCTTGGTTACTCATCCAGAAAAGAGCCAATTGAAGGATTGATTATTGCTTTCAGTGATAAGTTTAAAGATTTGCCAAAGATCTGGGTGAGATCCAAGGTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTGGTTATTGTGGTTATTTTTTTATAGTTCCAGTTGGAGCACTCTTCTGTAAGCTCTTAGTTGGTCGGGGGATCTTTCATCCCTATATTCTTGTACTTTATAGTACTAAGCTCACAAATAGCTTGAATTTCTGATCAACTAAGGAATTAAGTTTATCCTTTTTTGGGTTACTAATAGCTGCTCGGATTGTGCTTGTGTTGTATATGTGGTTTTGGATTAAACTTCTTGGAGAGGAACAATACAATTTTTTGACCTCTCTAGAGATCTCCAAGTGAGGTTTGGTTCTTTGTTAGATTCAGTGTATTTATGGGCTTTTAATATGCCTTGTATTCTTTCATTTGTTCTCAATGATAGCAAATTATTCATTAAAAAAAAAGAAGAACACTCTTGTGTAGGGTGGATTTTCATGCTGTACTGCAAGTCATTTAGTCTTACGTATCTAGTGATTACGTGATCTTTCAGTTAAAAATATATGCTAAGGTATTCTTTAATGGGAGGTAGACGTTGAAGATGGTCACACCTTGCATTTGGTTGTCAGGCAACCTCTTCCGCCATCAGAGACTTTGCCCAATCGGCCAGGTTCGGTCTGCTTTCATGCACCAGTACTCTGAAATAAATATTACTTCATCGAGAATACTGAATTGAATATTTTTTGTAAGCCTTGTTACATATCTCTTGAAAGGAAAACTTGTTACCCTCGTTTGTTATAAAAGACTGAAGGCAATCTTGAGGCATATATCTAGGCATAACCGCATAATTTTTAAGTTGTGAGGCATGAACTACTGGTATAGTGATTATGTCAAGTCTAAAATTTCAGCATTATCACTAATGCTAGAAAGAAGATCAGGCAGTTCATATCAGGAAGCATTGTGGAAGGGAACAAAGAAGAAGGGAGAGTATGTAACCTTTTAATACATAGGTGCTAGGGAAGAAGAGAGATTAAATACAAATCATCACTATGACGAAGCATCATGGACGAAAAAACTGGCAGGAATTGGCGTACTATGGAAAAGAAGCATCCTATGGTGGCTGTGTCCCCAAACCAGCATGTGCCCAACAAAGAGAATCAGAACCACATTTTTATTCCATATTGTTCCCCTTGTATGACATAATTTAAAGGCCAAGGCAACGATCTTATAAACCAATGTAGTCTAAAGCTATTCTTTGAAATATTTTATTCGGAAGGAATTAAAGAATTTTGAATGATGAATGTAGAAATTATGGGGGATGTTTAGCCGAAGTTTTTGGCTTCTACTTTGTATACCTTTTTGTATGCTCTTTGGGTTGTATTCCTGCATCTCCACTTTTCTTCGCTCGATACAAAATTTCTTCTCGTTTTATGGATAAGACCTGCAAACTTTCAATCAGAAATAGAGGGTAAAAGGGATCCCAACTTCCTAATTTTGTAGTGTTGCTCTACCATAATCCCTTTGCACAACTTTATCATATTTAGCTTATCATATTACAGTCAGATAAAATCACATGAAACTTCTTATTTTGCTTCACCTCTTAGATCACGTCAAACTATGTGTTAAACTGACATGTCTACCACTGCTGTTTCTACTCAATTTTTATTGCTGAAAGTTGTTTGCAGAGACTGATCCAAATTCGAGTACGAGTCGTGTTCATAGCAATCGGGTGGCTCCGGGTGTGGTGATTGAAACTTTTAGTATGCCTGTTCAAGGGGATGGTGTGCCCCCAGAAATCAACAGGGTCAGGCTATGACTTTGGAGGATGAAGAAGTTCTTTCAGGTTCTGGGTATAGTCTGTTTTAGGTGTAACTAAACACTATCCTTTTTCTGCACAGATCGTGTCTGCCGTTCTAAGTTCAATTGGACTTTCAAATTCTGTAACTGGCAGTGAAGGGATGGATGTTGTCAGGGTAAGCTTTCATTTTAAACTAATTTCCTTAACTGTCTGTTCATCTTGTGTCTTCATATGTACACCTCTTCTTCCTCGTATGAATTGTGACTGAAGGAAATTGACCAACAAAGATCTGGAGAACGGGTCATTGCAGCTGGGATGATAGATTTGAACCAGCATCAATCTGGGGACAATGGCTCAAGGTCACTATCTGATAGGTTTCATGGCACTTCTGGACATCCATCAATTCCTTCTTTAGGGTCGTTTCCTCCTCCTGTAAGTTAAAATTTGGGGATTCTTTAGGTACTCTGAGTCTTTTTCAGCTTAAGATTTACATTATGTATAGTATTTTAAAAAAAGTCAATTTATTCAGGATTCACTGACTACTGCTCGTGCTTTATTTGATTCTATTAACAAAAATCAAGGTTTACCCTTAGTCTCAAGTAGAAGTATAGATGAACAGTGATACTATATATATATATATATTGAATTCCTATAAGAATTTTGACATTTAAAAAACAGAAGCAACCTTTGAAAACAAGCAAGTACAGACTACTGATTATTTTTGGGCTCTTATTGTGCTTTATTTCTTCCCTCCATGAATTGTTTTTTCTGAAATTCATCTGGTTGAAACGAATGGTAGTGTCATCTTATGGAAATTCTCCTAATGTGTGTATTTAATATTTGTTTATCATGAAATGGTTGGCAGGCAGAGCTGGAGGAAATAATGCTCAAGAAGCTAATATTCATGGAGATGAGGAAAGTAGCTCTAATTCTTCATCTCGTCCAAGTACCACCCAAGAAAGTTTTCCTACTCCTGCATCGTTGGCTGAAGTCATGCTTTCTACTAGACAAATGCTTACAGGGGAAGTCTCAGAGTGCCTACTTGTGCTTTCTAAACCATCTTATACTCACTATTAGTGTAAATTTTTGGTCTTTCTTCTGTCAAGGGTTTGATGATTAGTCCTTAATTTATCATACGTTTCCTTTCAACGTGCCAACTTATTGGTGAATGCAAAAGCTGTTTTTTCTGTCGATTAAGAGAACACAATTTAATTTTTATGATTTATTTGCTGGTAGCAACTCGCAAGGCAACTGGAGAATCACAGAAATATTACTGATCCTACATTAAGGATGAATACTCAGTCTTCTGCATGGAGAAGTGGAGTTCTGTTTAATAACCTAGGTGCATATCTCCTAGAACTTGGTCGCACTATGATGACATTGCGAATGGGTCAAAATCCTGTATGTTTTTTCTGCCTTTACTTTCACCATGGCTTCCTTTTAATTTGGATGGTTTCATCATCTCTCTCTTTGTTTCATTTTTTGGATGGTACTTAAACCTTCGGTGCATGTATTTCAAATTGATGTATGATGTGCAGTCAGAAGCTGTTGTTAATGCAGGACCTGCAGTTTTCATTTCCCAAACTGGTCCTAATCCTATAATGGTTCAGGTAATATTTTCACGCCTTGCTGGATTTTGACTATTTTCAGGGTTGAGTTTGTATCTTCTTCTGCTAATAATTTCTATAAGCAGCCTCTTCCCTTTCAACAAAATTCAAGCATAGGTCCAGTTTCCATGGCAACTATGCAGCCTGGCTCTGCACTAATTCATGGCCTTGGTTCTGGATTTCTCCCAAGGCGTATTGACATACAAATTCGAAGAGGTAACTTGCAAACGTAGCTTCTTCATGGTGCTCTCTCTCCAAACTCTTTGTAGATTACTCTATTCAGGAGATTAGTTAAATTGGAATGCTTTTTTATCTTCGTCTTCTAGTTAGTTTTTTCTGGTTTTAGTCTCATACTCGAGTCGTGGTTATAAGTTTCCTTTTTGTTAGTCTTTTTGTTTTGTTTCCTATCTTGTAATTCGAGCATTAGACTCATTCCATTACTTAAATGAAAAATATCGTTTCGGTTTAAAAAAAAAAAACTATTCTTCTTTTGTTGGATGTCTAGAATAATCATATTTGCTTCCACTAATTTCAAGGTTCACCAACTACGGCATCAAATGGCAATCCAGAGGAACGCAGTGGAGCTCAACAGCCATCAGGGCAACAAGAAGCAGCCAGAGGTGTGGGTGAAAATCCCACCAATCAAGCAACCACTAGGATTGTAGAGGGCCCAAGTGTGGGTGGAGAATCTGGAGTGCGAGTA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MGSNFIDETTSCGEADGSETTIEIKLKTLDSQIYTLRVDKQMPVPALKEQIASVTGVLSEQQRLICRGKVLKDDQLLSAYHVEDGHTLHLVVRQPLPPSETLPNRPETDPNSSTSRVHSNRVAPGVVIETFSMPVQGDGVPPEINRIVSAVLSSIGLSNSVTGSEGMDVVREIDQQRSGERVIAAGMIDLNQHQSGDNGSRSLSDRFHGTSGHPSIPSLGSFPPPDSLTTARALFDSINKNQGRAGGNNAQEANIHGDEESSSNSSSRPSTTQESFPTPASLAEVMLSTRQMLTGEVSECLLQLARQLENHRNITDPTLRMNTQSSAWRSGVLFNNLGAYLLELGRTMMTLRMGQNPSEAVVNAGPAVFISQTGPNPIMVQPLPFQQNSSIGPVSMATMQPGSALIHGLGSGFLPRRIDIQIRRGSPTTASNGNPEERSGAQQPSGQQEAARGVGENPTNQATTRIVEGPSVGGESGVRVVPIRTMVAALPGPFSRLPSNSSGNSFGLYYPVLGRFPHPASGNARAERGSQASSERQSTGLQSEQHTILESVVEQQNVEDAARDDGAQGTLESERQVPSNGVQFLRTLFPGGEINIEDASFQEISGSIPAHHSMASSSVANVQESESRTSDEGMFLSNIFHQIMPFTSQRGNEPDMPSVEANASERQNVPDSSAQASSGDAETSRRRADAEAGAPSSKRQKNQMGNPDKEPALTGTSDRTRSGNSFPLESISEDAAVIDRKENPSTFVPALRSGEWSDIGKRPYMEDTHVFDGHGGKGAAQSLLVANAGDCRAVLSRQGCAVEMSKDHRPCCTKERKRIEALGGFVDDDYLNGLLGVTRAIGDWHLEGMKEVGEGGGPLSAEPELRLMTLTKEDEFLIIGSDGIWDVFTSQNAIDFARRRLQEHNDVKICCKEIVEEAIKRGATDNLTVVLVSFHLEPPPPVVFQRPRFRRSISAEGLQNLKFLLEG Homology
BLAST of HG10006581 vs. NCBI nr
Match: XP_038889778.1 (ubiquitin-like domain-containing protein CIP73 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1250.0 bits (3233), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/707 (94.20%), Postives = 676/707 (95.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. NCBI nr
Match: XP_004139265.1 (ubiquitin-like domain-containing protein CIP73 [Cucumis sativus] >XP_011648724.1 ubiquitin-like domain-containing protein CIP73 [Cucumis sativus] >KGN60751.1 hypothetical protein Csa_019246 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1249.6 bits (3232), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/707 (93.78%), Postives = 677/707 (95.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. NCBI nr
Match: XP_008456646.1 (PREDICTED: large proline-rich protein bag6-B [Cucumis melo] >XP_008456655.1 PREDICTED: large proline-rich protein bag6-B [Cucumis melo] >XP_008456664.1 PREDICTED: large proline-rich protein bag6-B [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1235.7 bits (3196), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/707 (93.35%), Postives = 672/707 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. NCBI nr
Match: XP_038889776.1 (ubiquitin-like domain-containing protein CIP73 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038889777.1 ubiquitin-like domain-containing protein CIP73 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1211.1 bits (3132), Expect = 0.0e+00 Identity = 642/681 (94.27%), Postives = 650/681 (95.45%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. NCBI nr
Match: XP_022946658.1 (large proline-rich protein BAG6 isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1178.3 bits (3047), Expect = 0.0e+00 Identity = 634/709 (89.42%), Postives = 651/709 (91.82%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D5LXJ0 (Ubiquitin-like domain-containing protein CIP73 OS=Lotus japonicus OX=34305 GN=CIP73 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 553.9 bits (1426), Expect = 3.6e-156 Identity = 376/738 (50.95%), Postives = 454/738 (61.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5SMK6 (Probable protein phosphatase 2C 54 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os06g0179700 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 328.6 bits (841), Expect = 2.4e-88 Identity = 185/353 (52.41%), Postives = 216/353 (61.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69QZ0 (Probable protein phosphatase 2C 27 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os02g0799000 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 327.8 bits (839), Expect = 4.2e-88 Identity = 175/338 (51.78%), Postives = 210/338 (62.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SLA1 (Probable protein phosphatase 2C 22 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g25620 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 263.8 bits (673), Expect = 7.4e-69 Identity = 156/348 (44.83%), Postives = 196/348 (56.32%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q69VD9 (Probable protein phosphatase 2C 57 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os06g0597200 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 255.0 bits (650), Expect = 3.4e-66 Identity = 122/186 (65.59%), Postives = 149/186 (80.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LL64 (Ubiquitin-like domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G009390 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1249.6 bits (3232), Expect = 0.0e+00 Identity = 663/707 (93.78%), Postives = 677/707 (95.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C513 (large proline-rich protein bag6-B OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496538 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1235.7 bits (3196), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/707 (93.35%), Postives = 672/707 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4G5 (large proline-rich protein BAG6 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450659 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1178.3 bits (3047), Expect = 0.0e+00 Identity = 634/709 (89.42%), Postives = 651/709 (91.82%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4G3 (large proline-rich protein bag6-B isoform X3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450659 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1176.8 bits (3043), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/710 (89.15%), Postives = 651/710 (91.69%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G4A8 (large proline-rich protein BAG6 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450659 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1176.8 bits (3043), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/710 (89.15%), Postives = 651/710 (91.69%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. TAIR 10
Match: AT5G25270.1 (Ubiquitin-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 326.2 bits (835), Expect = 8.6e-89 Identity = 281/729 (38.55%), Postives = 365/729 (50.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. TAIR 10
Match: AT2G25620.1 (DNA-binding protein phosphatase 1 ) HSP 1 Score: 263.8 bits (673), Expect = 5.3e-70 Identity = 156/348 (44.83%), Postives = 196/348 (56.32%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. TAIR 10
Match: AT3G51470.1 (Protein phosphatase 2C family protein ) HSP 1 Score: 213.0 bits (541), Expect = 1.1e-54 Identity = 123/297 (41.41%), Postives = 156/297 (52.53%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. TAIR 10
Match: AT2G33700.1 (Protein phosphatase 2C family protein ) HSP 1 Score: 209.1 bits (531), Expect = 1.5e-53 Identity = 104/186 (55.91%), Postives = 134/186 (72.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006581 vs. TAIR 10
Match: AT5G42220.1 (Ubiquitin-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 3.4e-53 Identity = 175/510 (34.31%), Postives = 252/510 (49.41%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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