
HG10006545 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATCCAACGCTGTACATGGCTGCCATGACAGGAAACTTGAGTTACCTTGAAACCATAGAAGTGATTTCAGATCTTCACAAAGAGTTAACCCCATGTGAGGAAACTATACTTCACGTGGCCACAGAATTCCATCAAACAGAGTTTGCAAAAAAGGCCTTGCATCTCTGCCCGCGGCTGCTGTTGCTAGCAAACTCCTCGGGCGACACGGCTCTGCACGTTGCGGCGGGAGAAGGTCACGAAGATTTTGTCGAGTTTTTCATCGACTATTTGCAAAGCTCCGACATCGAAACTGGAGAGTACAAGGATGTGACTAGAATGGTGAATTTAAAGAAAGACACGGCCTTGCATTGTGCTGCGAGGATAGGAAGTGAGGGTTGTGTGAAACTGCTGGCAGAAGCTGATCCTGAAGTTTGTAGCTTTGTGAATAATGACGATGAATCCCCACTTTATCTGTTTGTTGCATCAGGATCTTGGAATAAACGTGGGATTATCATAATCAATAACCTTCCTTCATCTTCATCAGCATCTCATCGAGGACCAAAGGCTCTAAACGCATTGCATGCATCAGTACTGTTAAAATTACATCTTGGTTACGGTAAGAAAATTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTTAACGAGATACTAACTACGTTAACAAATTCATAGTACTTTTATTATATATCCCAGACACAAATAGCACATATCGTATATGTTAAAAAAATTTGTTAGGTAAATATATACACATGTGATTTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTGTGCATGTTTGGAAGTGATGGTTTAAATAGTGATTTTAGAAAAAGAGATTTAGGTATTATTGATTTGTTCGGTTTGAAATTAACTATTTTCATATATATTTAAAAGTGATTTTGAATTTTCATGTTTGGATATTCCAAAAGTGATTTTACAATTATCAAATTAATAAAAGAGACAATTGCAAATATAGTAATCAAATTCAAAGTATTAGCATGTATAACAATATTTTTAAAAAATTGCAAATACTATCAGTGATAGACTTTTATGGTGTAGGTAGTATATCACACTATAAGAATCCTGATAAACTTTGCTATATTTGCAATTGTTTTCAAAATGTTGCTATATACTTAGGACATGTTTGAGAATGATTTTAAAAAGGCTAAAATCACTTTTTTTTTTTCATTTTCAAAATCTCCGTGAAATATGTTTTCAATTTTTCAAAACTAATTTTGATGATTGAAAATTGTATTTAAAAGTATAAAATTGAAAATTAAATTAAATTTGAGTGATTAAAGTGTGTTTTTGAGTGATTAAAAAGGACAAAAGTGATTTCGCTCCCAAATATGGCCTTCGCTATTCCTTAAAATTGCTAAGCATTACAATTACCCTTAATAAAAAGGGTATTTTCTTTTTGAGAAAATATTTATGATAAATATCAAAAGAAAATTCAAAATACAAACTTCGTTTCTTTGGAAAAAAAAAAAGATATTTATATGTAAAAAAAGAACTAGAGAGAAAGATCTTCAATTTAAAGCAACTGAACAAATATATCATAAAGTACAAAAAAGAGGTACTTAGAACACCAGTTGGCCACAAAAAGGGAGATATATCCTCCAAAAGAGATAAAGGGAGGGTTAAATTTGTGTTTTGAAAATGCGATTGTTTCACTCAAACCAAATATTATATTCTAAAAAATAAAAGCCCAAAAAGATTAGAAAATATATATCTCCTTTTTTTCTCTTAACAAGATACTAGAGTGAGAGAGATGGAATCAATAGGCGCACCGGAATATCTCAACTAGGTTGACACATTTATTACACCCTCATCACATCTCGAACCCAATAAAAAGAGCTTCATTGTTATAAAAAAATAACTAGATTAAAACATATATTAAAACATATATATCTCGTTTAATCTAGTTATTAAAGACACATTTTGCATGACAGGAAATGCTTGTCATCCTTTGGTCAATATGATTGGTTTCACATAAAATTTGAGTGATTTTGATAATTTATAGGGTTAATTAGTTTGGTTTTTGTGATTTTGGTTTGTGTTATTAGGAGTTGAGGCGATTGAGTTGCTGGTGAAATGGAGGAAAGAAATGATAAGAGAAGGTGACGATTTAGGAATGACTCCTTTCCACTATGTTGCTTATTATGGAGGATTTAAAGCAGTTGAGTTGTTTCTTAAATATGATAGCACTGCAATTTACTTGTTGAACAAGAATGGCGAGTCAGCTCTCCATTTAGCTGCTTATAATGGTCGTGTCAAAATATTACAACAGCTTCTAAAATTTCGTCATGATTGCTATAATATGGTGGATAAAAAGGGTAGAACAGTTCTTCATGCTGCAGTTTTGGGGAATGAGAAAGAAACAGTGGAATTTCTATTGATGAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATAATACACAAGGCCTAATTTCAAGGTTGATCAACAAGGTAGATAAAGATGGCAATACAGCTTTGCATCTTGCTGCCTCTTTCAAATTTATTGATATCATTCAAATTATCAGCAGCAATACAAAAGTGCGTTTTGATATTCTCAACAATGATCTTTTTACACCTTTTCAACTTTACAAACAGCACATCCCGGTAAGATACTTTATATATATATATATATATATATATATTTCTCTCTTTTCTTTTCTTTTACTTACAGCTTTTTCATTATACTAACTAATGTGTTTTCATCAGTTTTAGATTTTTTTGGTGAAATGAAGTGATTGATAATGACTAGAAGAACATAAATGATAATAAAAATTACTTAGCTGCTTGCTTGATTGCACCTATATCTTTGTGCAGCCCACCCAGTTCTTCCCTTTCTGACCCTCTTCCAGCCACTTTATTTAATAAATTGAGGCAGAGATATGATTAGGGTGCTAAGTATGTGACAACCTAGTTAGGATATTTTGTGTTGAAATATAAACTTGATTTTGGGGTTAGAAGTATTTAGGCGCCTAGTCTGAAACAAAAGCCCAATTTCTAGAAATATCAAGTATTAAAATATTCTAGAGATATTACTTGTAGGAGATGCTTAGAATAGATTGAAGAATTATCTAAAATATATGAGAAAAAATTGTAATTGTAAAGAATATTCTAGAGAGACACTTGTAACTATTAGATCATAATGTGTTGGAAAAATCCTAGCCATAGATTTAGGGGTACCAACTAGTATAAATAGGAGATATGTCTTAGATTTGTATCAAGCCACCAAAAAAAATAAAAAATAAAAATAATAATAGAATTGCTCAATAACACAAGTAGCCTCTTTCTCATATATATTTTTTCCAAATTACCTCCAACTTGATCCAAAAGTTTCTTTCCAACACCCTGGTGCACCTACTGACCCAATGTGTCTTGTATCTTTCTTTTAAAAAAAATAATAAAAAGGGTTGCATGAGATATAGCTGCAATGCACCTAATCATTGCCTAATGATAATAAGTTAATTGATATGTGTTTTCATGTGTCTTTCTACTATTATAAATATAGTTATTATACTTCATTTTCATGCATCCCCTTCAATCACAAGGGAAAAAAATATTTTTTGAAGAAAGAAAAATTTGTCTTGTGGCAACTTGTGATTGGACATTTGGGTGGGTTACACAAATATGAGTGCATCCAAATATTTTTTTTTGGAAAATTACTATAAACAGGAAAAAAAATCAAACTATTTACAAATATATTAAATTTTCACTATCTATCGGCAATAGATCATAATAAACTTCTATCGCGGTCTATCGCTGATAGACAGTGAAATTTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGACTCATTTTTCTATATTTGAAAACAACCCTATTTTTTTCTTATAAATATGGGTAGGGTTCTAGCTCTCTTTGTATTATCGAACTTTTTTTCCATTTGGATGAATGCATTTCTACTAGTCTGAGAGTTTGATGATGGTGCTAAGAATGTGTCAACCTAGTTGAGATGTCCTGGTGTACCTATTGATCCTACCTTCTTTAGTATCTTGTTAAAAAAAATTGTATGATCGGTAAGAGAACAATTTTCATTATGTTTTCAACATAACTACCAACAATACGTGGGTATACATTAAGTACTTATAAGTTATTTTATTTAATTATTTAATTTTTAAATAATTAAATAAAATAATTTATAATTATTTAATTTTAGTTTTTGGGTGAAAGATTATAAGTTATTTTATTTAATTATTTAATTTTTAAATAATTAAATAAAATAACTTATAATTATTTAATTTTAGTTTTTGGGTGAAAGATTATAAGTTATTTTATTTAATTATTTAATTTTTAAATAATTAAATAAAATAACTTATAATTATTTAATTTTAGTTTTTGGGTGAAAGATTATAGAAATTGTATGATGTGGATACTAAGGTTAGTTGAGATATCTCGGTGCACTTCTTGAGCCTACCTGACTCTAGTAATCTGTTAAATTTTTTTTATAGAAATTAACCCAATTTTAGTTGGAGCTTAATTATGTGTAAAATATTTTTCTTAAATTGTAGGAATCCATCCAAGAATATTATTTAAGATATTTCAAGCTTAAAGAAGTTAAGGGCGGTGTAAGGACAATGCATGAAAATGCCAACACACATCTGAAAAGAATAGGGACGAAAGAAGGTAAAAGAAATGCAATGAAGGAGACATCAACAAATAATAATGAAAACTTAGATAATGAAATGAGTAGTGAACTTACTGATGGCGGTGTTGGTGGCGACGGTGACATTCGCAGCAGGATTCACATTGCCTGGAGGGTTGGTTAGTGAAGGAGAAGACGAAGGGTTAGCCATTCTGACAAACAAACCAGCTTTCAAGGCGTTTATAATTTTCAACTCTATAGCATTTTATTGCTCCATTTTTGTAGTGGGATTTCACTTCGTCAACACAAAAGCCAACAATAATTTTATTCGACTTGTTTACAAAGAGGTTGTCAAACCC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MDPTLYMAAMTGNLSYLETIEVISDLHKELTPCEETILHVATEFHQTEFAKKALHLCPRLLLLANSSGDTALHVAAGEGHEDFVEFFIDYLQSSDIETGEYKDVTRMVNLKKDTALHCAARIGSEGCVKLLAEADPEVCSFVNNDDESPLYLFVASGSWNKRGIIIINNLPSSSSASHRGPKALNALHASVLLKLHLGYGVEAIELLVKWRKEMIREGDDLGMTPFHYVAYYGGFKAVELFLKYDSTAIYLLNKNGESALHLAAYNGRVKILQQLLKFRHDCYNMESIQEYYLRYFKLKEVKGGVRTMHENANTHLKRIGTKEGKRNAMKETSTNNNENLDNEMSSELTDGGVGGDGDIRSRIHIAWRVVSSIKTPTFTNSSMDPQLFNAATNGDLGHLQILTPLQKSRLQFQLSPNQNSSLHVATEFRQLGFAKAVVGDCQPLLWLQNGAGDTALHVAAREALVEFVEFFIEFGPTLLQMVNFDGDTALHCAARIGSLKCVEKIVEVQPELCGVVNNNSESPLYLAVAAGYWEVHLVIIRKAEFLASYKGANGLTALHPTLFYPNYDFEKIKSFVEWRKEMLKEQDDLGLTPLHYASLYGRTKAINIFLQYERSSIYIVDNNNGESALHIAAFKGHMDAVEEILKCCPDSCYLVDNKGRTALHAAVLGDQRKVVKLLLGKPLQGRVMNKADGDGNMALHLAAHYKLYDIIEILATNENVDLNVKNKDFLTALDIFNKHDQEGLRAAVIRNLLEGSTGAMTMQHLAEKDIKKMNEEITKIDDENSDEEVAETDGIISMKKLENCSYREKQKALEVNLLVATLVATVTFAAGFSMPGGYFENIGLSILSNKADHYQRVRYMGIAVIFTSIAIVAMVIAFASGTYVVLENSKAFSLTPFLICGGFAFLYFAIPFCDPGVEGYSFLPHTERRLFTSLLSAVSEWLLICMLFVDSIFSFFITKCARIWKLRPPCLLCSRLDHIFGSEKRGYLWKLICSKHKLELSSLVLCHAHNKLVNVHEMCESCLFSFATINKSNSETYRLLVGKLGEDPYPGIDRDPLLGDQKYDTLSQKCCSCCKELYVPRAFFQSLIQTQSSGLEAEDLDVPLSSSVVHCKEDFQECSSNPLPHVQYRELKITSDTESDGNGSILGVETTNSKDDLTIQGVNMEPNFISLASNLTSTKLVEPASAPEPLIIEPLLTPHVQYRELKITSDTESDGNRSTLRVETTNSKDDLTVQDVNTEPNVIDLASNLTSVKLAEPALAPEPLVLEPLVLLDDELPPVECGVSIGHGLDELTPKHVEVNEIFSSPIDLLPLDNMVPSSNTIATPVEAVEENYVTISEEFETESRGTEKAEILPKKATSEAGSEAQPVSSDSVQMAPNMLELGDAYKLAVGARGGRQLSGKLSEQWIEKESSKVSEDLKLLLSQLSFNRMNDQSRDMSPRLSVNGDELRNFDFSSTVGMQMLQKRISLERNESGLESLDGSIVSEIEGENVVDRLKRQVEYDKRIMSSLYKELEEERNASAIAANQAMAMITRLQEEKANLHMEALQCLRMMEEQSEYDDDALQKANDLITEKDKEIQDLEAELEFYRINFPNAYTTIDNLVETSVKERDIRVVHLESNQIRTIGYGNLVAGKPDIHEKVGSEGRTYNNLLLEFEDEKLNIGQCLKKLENMLHLFLNNGVKMDLNNGEYFGTKGSFSSGTNGLDLDNRKLEDGEDHACLPGEDAHADDDRLPSLINPSFDKESSELDCSDRNSLLATEMADVTFLRNEVSNLNKRMEALEADKSFLEHTINSLRKGEEGLQFVQEIASHLRELRKIETRS Homology
BLAST of HG10006545 vs. NCBI nr
Match: XP_038877642.1 (myosin-binding protein 1-like [Benincasa hispida] >XP_038877643.1 myosin-binding protein 1-like [Benincasa hispida] >XP_038877644.1 myosin-binding protein 1-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1518.8 bits (3931), Expect = 0.0e+00 Identity = 795/900 (88.33%), Postives = 835/900 (92.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. NCBI nr
Match: XP_004139387.1 (myosin-binding protein 1 [Cucumis sativus] >XP_011648739.1 myosin-binding protein 1 [Cucumis sativus] >KGN60783.1 hypothetical protein Csa_019501 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1510.4 bits (3909), Expect = 0.0e+00 Identity = 786/896 (87.72%), Postives = 824/896 (91.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. NCBI nr
Match: XP_008456276.1 (PREDICTED: myosin-binding protein 1-like [Cucumis melo] >XP_008456282.1 PREDICTED: myosin-binding protein 1-like [Cucumis melo] >XP_016902090.1 PREDICTED: myosin-binding protein 1-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1479.5 bits (3829), Expect = 0.0e+00 Identity = 774/897 (86.29%), Postives = 816/897 (90.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. NCBI nr
Match: KAA0063582.1 (myosin-binding protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ97909.1 myosin-binding protein 1-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1475.3 bits (3818), Expect = 0.0e+00 Identity = 773/897 (86.18%), Postives = 814/897 (90.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. NCBI nr
Match: XP_022946503.1 (myosin-binding protein 1-like [Cucurbita moschata] >XP_022946504.1 myosin-binding protein 1-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1145.6 bits (2962), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/893 (72.23%), Postives = 707/893 (79.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HXQ7 (Myosin-binding protein 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MYOB1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 318.2 bits (814), Expect = 6.2e-85 Identity = 356/1238 (28.76%), Postives = 508/1238 (41.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4INW9 (Probable myosin-binding protein 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MYOB4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 205.3 bits (521), Expect = 5.9e-51 Identity = 221/750 (29.47%), Postives = 345/750 (46.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CAC4 (Myosin-binding protein 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MYOB2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 139.0 bits (349), Expect = 5.2e-31 Identity = 124/388 (31.96%), Postives = 195/388 (50.26%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 55.1 bits (131), Expect = 9.8e-06 Identity = 31/75 (41.33%), Postives = 43/75 (57.33%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WNW4 (Myosin-binding protein 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MYOB3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 137.1 bits (344), Expect = 2.0e-30 Identity = 135/448 (30.13%), Postives = 221/448 (49.33%), Query Frame = 0
HSP 2 Score: 75.5 bits (184), Expect = 7.0e-12 Identity = 47/139 (33.81%), Postives = 65/139 (46.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LMC8 (Probable myosin-binding protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MYOB5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 2.7e-27 Identity = 158/660 (23.94%), Postives = 242/660 (36.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LG67 (GTD-binding domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G010190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1510.4 bits (3909), Expect = 0.0e+00 Identity = 786/896 (87.72%), Postives = 824/896 (91.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E288 (myosin-binding protein 1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496267 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1479.5 bits (3829), Expect = 0.0e+00 Identity = 774/897 (86.29%), Postives = 816/897 (90.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BFT5 (Myosin-binding protein 1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold285G001250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1475.3 bits (3818), Expect = 0.0e+00 Identity = 773/897 (86.18%), Postives = 814/897 (90.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G417 (myosin-binding protein 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450545 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1145.6 bits (2962), Expect = 0.0e+00 Identity = 645/893 (72.23%), Postives = 707/893 (79.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KBZ4 (myosin-binding protein 1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493560 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1143.3 bits (2956), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/909 (70.85%), Postives = 713/909 (78.44%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. TAIR 10
Match: AT1G08800.1 (Protein of unknown function, DUF593 ) HSP 1 Score: 318.2 bits (814), Expect = 4.4e-86 Identity = 356/1238 (28.76%), Postives = 508/1238 (41.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. TAIR 10
Match: AT1G08800.2 (Protein of unknown function, DUF593 ) HSP 1 Score: 318.2 bits (814), Expect = 4.4e-86 Identity = 356/1238 (28.76%), Postives = 508/1238 (41.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. TAIR 10
Match: AT2G30690.1 (Protein of unknown function, DUF593 ) HSP 1 Score: 205.3 bits (521), Expect = 4.2e-52 Identity = 221/750 (29.47%), Postives = 345/750 (46.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. TAIR 10
Match: AT1G03670.1 (ankyrin repeat family protein ) HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 1.8e-39 Identity = 155/587 (26.41%), Postives = 271/587 (46.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006545 vs. TAIR 10
Match: AT4G03500.1 (Ankyrin repeat family protein ) HSP 1 Score: 159.5 bits (402), Expect = 2.6e-38 Identity = 154/609 (25.29%), Postives = 262/609 (43.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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