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HG10006289 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTATATCCGAATCAAGCGCCATAAGACAACTTACTTTATCCAGTGTGATCCAATTGAGACAACTTTAAATATCAAGCAAAAATTAGAGTCCCTTATTGACCAACCAGTAGTTGACCAGCGCTTGATCCTGGTGGGGAGTGGGGAAGTATTGGAGGATTCAAAGACACTGGCTGATCAGAAGGTAGGTCTTAAAGACATATATTTATTACATTTGGTCATCAATTGTCGGATCTTTTGGAAATATTAAGGTTAAAAAAATACAACGGCTGCAACTCTGATAAACGTTTTCTATGTATTTCCAGGTTGAAAATGATGCAGTTGTGGCTCTAACGTTGCGAAAAGGTTTTTCCCTACCAACTCCCAAAAATTTTTGTGAACTTCTTGTTCTAGCACTTGTTTTTAAAAGCCTGTGTTCTGATCAGGGACTGAAAATTATTTGTGGGCTTGTGCTTGGATTTGGAGTCTTTATAGTTATGATCTTCATTGTCATTGGATCTGGATTCGAAATATGAAACTGATAGGAACGGTATTAGGGTGTTATTAGGATATTAAGGATATAATAGTAATTAGATAGGTGGTTGGTTATGATATTTGGTTATAAATAGAGAGGCAGAGGAATGGAGTAGTTAGGCAAAATCTTAGTAAGTGAATTAGGGCTTGAGAGAGGTCTCAAGAGAGGAGGGTTTATGTTCCTCAAATTACTTGACTATCGTGTAAGTTTTCGTACTTTACATTTCAATATAATGGATTGTGTTTTGGTTCCTATAAAAACGTTGTCTCATCATATGTTTTCTTGACTTTTTTCCCCTTCTTTGTGTAGATGATAATGACTTCGAGGAGATCGACATCGTCCAGCCAAATGATTTCTACCAATCTCGTGATGCCGATTCTGGCAATTGGTAAGGACTGAAAATTTGCTTCTACTGTGGGTAGTATATGATGTTCAGCCATCGATCTTGTGGGTGTACTGTTTAAATCACTTTTCTATCTGTTGGATGGAATTTGAATATGATGGAAAAGGAAGTATACTCCATCCTTTCTATTTGTTACCCCGTTAAGTGGTATCCTTCAGGGGTTGCATTAGTGATTTAACTCAACATGTATTGTTGCTACAAGTACTCTATATGAGTTGAGGATTTTGATTAGGACTTTTTAATTGGCCTCAAATGATATGAATGGGTCTAATAAAGTTGTAAATTGATTTTGTTAAATCATCGACTGATCCAAAAGCTTAAGGTAATGTGTGAAGATAAATTTACTTATCATATCTTCTAACACTCCTTCTCACTTGTTCGCTTGAAGTATTATGGAGACCCAACAAGTGGAAATGAATATTAATCGGGGAGGAAATAACATTACATAGGCTTGAACATAAGAGCTCATTGGACCACATGCTCTGATACTATGTTAAATCATCGAGTTTTTTTCTTATGTCAATTGGGTAAGACACTGATTACCATTTTAAAGGTTGATGATTCAATCTTCTACTCCGATAATGATTGAACTTAAAAGGAAGATAAAACTATATGAATTGTTTCAAGATATTCTTAAAATACGAGTTTCGTGGTTAAGATAATGTTTGTTTAAATAGAAATTTAATTTTTGAATTTGTTACGAAAAATGTAATTGGAAACATGAAATCTCGTTTCCAACTTTACATTTATAGATTGCCTACCAAACAAATCATAAATGAAGACAATTGTTTTTTTGAAACTCAATGATTTTTTTCAAAACTTTCTCACTAGTTGTAGGACATAAATAAATATTTTAAAGTTAAAATACTAATTTGGTTCCTATACTTTGTGTCTCATTCTATTTTAGTTTATGCACTTTTAAATTTTTTAAATTTAATTTATGTACTTTCAATAAATCTTGTAAATTAGTCATGTTTATTTGTATATAATTAACTTTATCGATCTTAGTAAAAAAATAGCAATAATTCTCATTTGTGTTCGTACACATTGTGAAAGAAAAAAAAGCTAACAATAACCTAGTAGTAAGACTAAATTTAACCTTTATCGGAAGTACAATTATTAACATTTAATATTCAACTTCTAAAATATTAAATTTGAGAAATTACTATAAATAGAAAAAATTTCAAATTATTTACAAATATGGAAAAATTTCACTATCTATCATAGATCGCATTAGAATTATTTTTTTATATTTGAAACCCGAAAGTTTTGTGGAATTTTTTTTTGGTTATCTAATTTTTAAGTATATTTTCAAAATTCAAGTTAAATTATAAAAACTAAAATAGTAAATTTTTAAACATTTATTTACTTGTTTATCTTGTCTAAGAAATCAAATATCTCCTTATATAATATGAAAATTAGTGCAAAATATGGTGGGAAACCCAGCAGAACTTTAAAAAGCAAACAACAAAAATGTTATCCAATGATTTTTTTTTTTATTAGTATAATAGGGATGAAGGAATTCAACCTACAAATCTTATAGTTCTTATAGTCACACATACTATATGTTAATTGAACTATATTCGTTTTCACAATAAAATAAAATTTAATTTTCAAACTTTCAAAAGTGTACGTCCTTAGACTTTCAATTATGTATCTAACAATTCCTTGCATTTTTAGTTTTATGTCTAACGGGTATTTTCATTTTCAATTTCGCGTCTGATAAATTATTTACACTCCAAATTTAAAAAATCAGCTAATCTATTATATATAAATTTGAATTTTATATCTATTTTTTTTACTTTAAACTTTAAATTTTATGTATAATAGATCAATAAATTTTAAAATTTTAAAAAACTCACTGAACAAATTTGTAACTTTCAAAGTTTAAATAAACACAAAGCTCAAAATTAAGAGTCTAAATTTATAATTTGACCAAAACAAAAAACTCAAAAATGATATTTAAACTATTAAAATAAGAACAATAGTTATGTGTGTCTCGTACTGCATCTATTTTTTTAGTCCATCCAATTATACAACAGAAAAATGTAAGAATATTTTATGAACAAGAAAAAGAAATATTTATCACACAAACTTTAGCTGCATAGAAATAGATGCAGGCAATGATGCAATTAAAATCATCTCGTTAAAATAACATTTTGGTTCTTCTCTTTTGAAGTTTGTTCAAATTTAGTCCATGTTCTTTCAATTGTCAAATATTAGCCATTGTAATTTTAATTGTCTAATTTTAGTCTCTCTATTTTCAATAAATCTTAAAATTAGTCTCTCAAAGTAAAAGTTAATGTTTAACGAAATTGGTTAAATAATAATAATAATTACCTTCAAGAAAAATACAATATATATTGTAAAAAAAAAAAACAAATATATGAATATATTTTCAAAATTAATAGTAAAAATGCCCATAACAATTATTTTATTTTATTTTTTGTTTAAAAAAATCAACAACAAACTAGTAAGCGATGTCTAAATTTAAAATTTATTAAGATAAGGAAAATTACTATAAACAGAAAAAATATCAAACTATTTACAAATATAGAAAAATTTTACAATGATACACCGCGATATAATTCTATCACTTTCTATCGCTCAAACAAATAAATTCTATAGTGATAGAAAGTGATAGAATTTTATCACGATCTATTAGACTATAAAATTTTTCTATATTTATAAATAGTTTCGCTCATTTTTTTTATATTTAAAAAAAACTCTAAAGATAAAATGTAGTAAAATTAAACAAATTTGAAAGTATGACTAAAATGTTAATTTAACTAATTTGTGGTCTTACAATAATAAAATATTTTATTAAAATAATACATAACAAACAAACAAATGCAAGGGATTGAGTTTTCACAGTATTCCGTTGGTCATCCGAATTCCAAATTCTGCAGTTGCAGTCTACTGCTTTCGTTCTCCGTGGGCTACTCCCACTCCATCCGCCATGGCTCTTCTTCCCACCAAGCTCGCTCTCGGATGCCCTAATTCTACACTCTTTTCTGCAGCTCCCAGGCTCTCTTCTCTTCGTCTTCCACCATTCCGAGTCTCATGCGCCAACAAACGGACCGGTAAGAGGAGGTATCCATCGGAAAAGAAGAAGCTCAAATTGAAACACAAAGAAGTCCTCACGACCGTCGAGAACAAGTTCGAAGGCATTTGGAGGTTGTTCAAGCTCGGAGTTCCCGTGGAGAAGGATCCTGGCAAGGATTTTCATGGCCTCTCGGATGCTTTGATGCAAGAGATTGCTAAAGTGCTCGAGTTCCCGGTACTTTTGGCAGCTTCATTGATTGTTATATTTTGAAAAACATTGTGAGTCGAATTTATTTTGTTTTCCAGGTCGCTTCGTTGCTACCGCGGGAAGCTTTCTCAGTTATTCGTAAATCTTTTGACGCTAGAAAGGTATGTTTAATGATATTCTTCTATTTTTTTTATTTAACATTTTTACGTTTTCTTAGCAATGTCTGTTGTTTAGAAGGAATAATTTATTATCAAGAAGTTGCTGGGTTATTATCTTGTGCTAATTCATCACCGATGCTTCCAGATGTTGAAGGAACCAAAGTTTGTTTATACTGTGGACATGGATGTACATAGGCTACTGATTCTTGAACCTCGTGCTCAGGATTTCATTTCGGACTTGGAGCCTAAAGTTGGATTGATGGAACATTTTGCAAAAGAAAAGGTATCCAATGATGTAATCAGTATCGTTCATGATCTCAAAAGTAATCAGGAAGTGGTGGGAGCAAATGGACTTAACGGTCATTCTGGCCCGTACTTGCGCTTGTCAAATGGTAAACCAAAAGTTGCTGTTGTTGGCAGTGGGCCATCTGGCCTTTTTGCCTCACTTGTCCTTGCAGAGTTTGGGGCCGATGTTACCTTGATTGAAAGAGGTCAACCAGTGGAACAAAGAGGGCGTGATATTGGTGCATTGGTAGCTCGTCGGATTCTGGAGCTGGATAGCAATTTTTGCTTTGGGGAGGTTATTTTTCTTACTTCTTTTCTTACTTCTTCCATAGACTTATTTGGTTTTAAGTTATATATGCATTGCATTATTGCTTGATTTGAA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MYIRIKRHKTTYFIQCDPIETTLNIKQKLESLIDQPVVDQRLILVGSGEVLEDSKTLADQKVENDAVVALTLRKDDNDFEEIDIVQPNDFYQSRDADSGNCIPLVIRIPNSAVAVYCFRSPWATPTPSAMALLPTKLALGCPNSTLFSAAPRLSSLRLPPFRVSCANKRTGKRRYPSEKKKLKLKHKEVLTTVENKFEGIWRLFKLGVPVEKDPGKDFHGLSDALMQEIAKVLEFPVASLLPREAFSVIRKSFDARKMLKEPKFVYTVDMDVHRLLILEPRAQDFISDLEPKVGLMEHFAKEKVSNDVISIVHDLKSNQEVVGANGLNGHSGPYLRLSNGKPKVAVVGSGPSGLFASLVLAEFGADVTLIERGQPVEQRGRDIGALVARRILELDSNFCFGEGGAGTWSDGKLVTRIGRNSGSVQAVMKSLVYFGAPKKILLNGKPHLGTDRLIPLLRNIRQHLEMLGVSIYPILSLDVNIKFGTRVDDLIEESGHIVGVKVSDSRDKSKLSNQKLEFDAIVLAVGHSARDVYQMLVSHNIPVVPKEFAVGLRIEHPQELINSIQYSGLANEVEKGRGKVPVADYKVSKYVNVDTENPSSNSLAASRSCYSFCMCPGGQVVLTSTNPGELCINGMSFSRRSSKWANAALVVTVSTKDFNDHGFHGPLAGVEFQRELEQRAAVMGGGNFVLPVQTATDFMDRRLRVTSVPPSSYRLGVKASNLHELFPGHITEALQQSVLAFDQETRTSSPVQIPRNPETYESTCLRGLYPVGEGAGYAGGIVSAAVDGMYAGFAVAKSFNLYHGDLETVLGKAQSSGQQGQSWARLGFSMAHRLLRDLEADGWERSDFPIICESCLGDNPYVRMTRADYDKECKICTRPFTVFRWRPGRDARYKKTEICQTCSKLKNVCQVCLLDLEYGLPVQVRDTALSINSNDAIPKSDVNREYFAEEHDRKARAGIDYESSYGKARPNDTILKLQRTTPYYKRNRAHVCSFYIRGECTRGSECPYRHEMPETGELSQQNIKDRYYGVNDPVALKLLNKAGEMPSLEPPEDESIRTLYVGGLDARVTEQDLRDNFYAHGEIESIRMVLQRACAFVTYTTREGAEKAAEELSNKLVIKGLRLKLMWGRPQAPKAESEGSDEAKQAAVAHSGMLPRAVISQQHNQLHPPGTHDQPQAMHYFNIPPPPPQQERAFYPSMDPQRMGALVSTHDVGVPPNGPTGSTETRPGSEKQHQQGHQFPYHSMHPPPPAQYQQQFYPPYGYMQHYPPYPPYHSNMPPPPPSQSQSQPHPPSGLQQYQQQHSTPPGSAPQSHGGASSVSAPLGSTPSVSAPSSTSSEPASS Homology
BLAST of HG10006289 vs. NCBI nr
Match: XP_038890425.1 (uncharacterized protein Cbei_0202 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038890426.1 uncharacterized protein Cbei_0202 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1271.1 bits (3288), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/703 (92.18%), Postives = 667/703 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. NCBI nr
Match: XP_004144792.2 (uncharacterized protein LOC101214567 [Cucumis sativus] >KAE8651641.1 hypothetical protein Csa_021224 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1241.5 bits (3211), Expect = 0.0e+00 Identity = 635/703 (90.33%), Postives = 656/703 (93.31%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. NCBI nr
Match: XP_008452584.1 (PREDICTED: uncharacterized protein Cbei_0202 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1240.7 bits (3209), Expect = 0.0e+00 Identity = 635/703 (90.33%), Postives = 655/703 (93.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. NCBI nr
Match: KAA0056117.1 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYJ96400.1 FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1235.7 bits (3196), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/703 (90.04%), Postives = 654/703 (93.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. NCBI nr
Match: KAG7020822.1 (hypothetical protein SDJN02_17510 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1227.6 bits (3175), Expect = 0.0e+00 Identity = 624/703 (88.76%), Postives = 661/703 (94.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5SNN4 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 40 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os06g0170500 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 679.1 bits (1751), Expect = 1.0e-193 Identity = 359/488 (73.57%), Postives = 390/488 (79.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6Z358 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 49 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os07g0281000 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 670.6 bits (1729), Expect = 3.6e-191 Identity = 359/496 (72.38%), Postives = 390/496 (78.63%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZW36 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 25 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g29580 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 642.5 bits (1656), Expect = 1.1e-182 Identity = 342/507 (67.46%), Postives = 389/507 (76.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LNV5 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g07360 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 638.3 bits (1645), Expect = 2.0e-181 Identity = 337/510 (66.08%), Postives = 388/510 (76.08%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FL40 (Zinc finger CCCH domain-containing protein 53 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g07060 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 454.1 bits (1167), Expect = 5.3e-126 Identity = 233/414 (56.28%), Postives = 284/414 (68.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LM76 (FAD_binding_3 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G036590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1249.6 bits (3232), Expect = 0.0e+00 Identity = 644/722 (89.20%), Postives = 665/722 (92.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BV00 (uncharacterized protein Cbei_0202 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493563 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1240.7 bits (3209), Expect = 0.0e+00 Identity = 635/703 (90.33%), Postives = 655/703 (93.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3B957 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold546G00270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1235.7 bits (3196), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/703 (90.04%), Postives = 654/703 (93.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HYE6 (uncharacterized protein LOC111468611 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468611 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1215.7 bits (3144), Expect = 0.0e+00 Identity = 619/703 (88.05%), Postives = 653/703 (92.89%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FBU8 (uncharacterized protein LOC111444197 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444197 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1215.7 bits (3144), Expect = 0.0e+00 Identity = 618/703 (87.91%), Postives = 655/703 (93.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. TAIR 10
Match: AT4G30720.1 (FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 891.3 bits (2302), Expect = 9.3e-259 Identity = 461/687 (67.10%), Postives = 547/687 (79.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. TAIR 10
Match: AT2G29580.1 (CCCH-type zinc fingerfamily protein with RNA-binding domain ) HSP 1 Score: 642.5 bits (1656), Expect = 7.5e-184 Identity = 342/507 (67.46%), Postives = 389/507 (76.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. TAIR 10
Match: AT1G07360.1 (CCCH-type zinc fingerfamily protein with RNA-binding domain ) HSP 1 Score: 638.3 bits (1645), Expect = 1.4e-182 Identity = 337/510 (66.08%), Postives = 388/510 (76.08%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. TAIR 10
Match: AT5G07060.1 (CCCH-type zinc fingerfamily protein with RNA-binding domain ) HSP 1 Score: 454.1 bits (1167), Expect = 3.8e-127 Identity = 233/414 (56.28%), Postives = 284/414 (68.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006289 vs. TAIR 10
Match: AT5G07060.2 (CCCH-type zinc fingerfamily protein with RNA-binding domain ) HSP 1 Score: 454.1 bits (1167), Expect = 3.8e-127 Identity = 227/376 (60.37%), Postives = 273/376 (72.61%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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