HG10006145 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCTCTGTGTCCTCCAGATTCGACCAAAAATGTGTTGCAAATGTCCATCAATGGCGACGAACCGCCGCGAGCCTACGTTGTTGAAGGCTCTGCGATCGGCGGTGCCGGCGAGATTCCGATCATCGACGTCGGTGTGTTTCTGCCGTCTTCGTCGCCGGAACCTGAAGTTTTGGACTCCGAATTGGGAAAATTGAGATCTGCTCTCGCCAAGGAGGGATGCTTTCAGGTTTTCATTTCCTTTCCATTCCTCTAATAATTTTTTTCGAAACAAATTTAGACTTAAAATCACTTTTGTTTCATGAATTTTGTAGAATATCTATTTAGTCTATCAACTTTTGATTTGGAAAGATGTAGTGATTTCAAATTTGTAAAATTAAAAATATTTTTTTTTCAATTTCTTACAATAATTTTTTTATCTTTTTTAAGTAAAAAATTGAGTTCTTTAGCTAAATTAAAAAAACAGAAATAAATTTTTAAAAATTACTTTTTTTTTCTAGTTTTTAAAATTGACTTAATTTTTTTAAAATATTGGTACAAAAAATTGATAACAAAATAAGAAATTTAAGGCTCGATAACATTCTTGTTTCATGTTTTCTATTTTCCGTTCTTTGATTCTTGTTTTTTTGTTTCTTCTTTTTTTAGAACAAAAAATAGGGATATGTTTGATAACTATTCATGTTTCCTATTTTTTGAAAAAAAAAAAAAACAAAAACTTGTTTGATAACTATTTCTTGTTTCTTGTTTCTTTTTTGTTTCATACATTAAACGAGTTGTTTTCAAATATAGAAAAATGAGTCAAACTATTTTCTATCGCAGTCTATTGTCGATAGATAGTGGAACTTTTCTATATTTGTAAATAACTTGATCTTTTTTCTGTTTATAGTAAATTCTCGATCGAAAAAGATATTATAAAAAATTTATGTCATATAATGCAAGTAAGTCTCGTTGACAACTAAATATAATAACAAAGTTGTATACTATCATTCATACATGTTGCCCAAATTTGATCGGCATTGTCATCTCTAGCTCAAGTCATTTGTCTTAAATAATGTCGAGTCAAATCTAACTTAATTATATTATTTTATAAATGTCGTGGTTGTAAAATATTAAAGTTAAGCTAAATAAATGTCTTAGTCAGCAAAGTTTATATATTGTAAAATTCTACTCGATTTCAAATATATTAAAAATATTAGAACTAAAATAATATATAAACACACATATTGCAAAATCTAATACTCAAAAGTTGAAATATAAAAAAAAATTAAGGTTAAAAATCACTTCTAATCCTTAAACTTTTATGAAAGTAACAATTTGGTCCCTGAACTTTAGTTTGTAACGATTTAGTCCCTGAGCTTTCAATTTTGTAATAATTTAATCCCTAAACTTTACTATGTAACAATTTAGTCCTTGTACTTTAAAATTCGTAACAATTTAGTCTTTATTGTAGAAAATAGTGTTAAGATTTAATGAGATTTCTTGTATAAATGAACCGATAAACTAATTAGGGACTCAATATTTTTATAAATACAAGATCTACATCATAAAATAAAAAAAATTAACATCTAAATTTGATTATTGTTTTTAAGGAAAAATACACTTTTGGTCCCTGAAGTTCGGGGTTAGTGTCTATTTAGTCCCTAGGTTTCAAAAGCTACATTTTAGACCCTGAAGTTTGGAAAATAGTTCTAAATGGTCCCTAAAGTTAGTTTGACCGTTAGTTGACTAACGGAAATTTGATGTGGCATGTTGAAGTAGCAAATTCTAGATAAGGTGAGCAACTTTTCTAAATTTATATTATTTTTAGATTACAAAATCTCTTTTTAATTATTTTTTTAGTTTTTTATTATTTTCTTTCCCCTCTCTTTCTCCAATCTTTCTTATCTTCTCTAATGCATGTATCTCTCTTTCCCCCTTTTCTCTCTCTCTTTTTTAATCCTAAATTTCCTTCCAACAAAATTCTCCCAAACGCCCCAAATCTCCACCTTCGCTGCCATTAATGGCATTTCTTAAAACTCCTGCACTTCAAATTCTCAAATTGAGTTTATTGTGCTAAATTTTGTGAGCCCATTTTAGTTTTTTTTCCATGCCTAACCTCCATTACTAAAGCTTCAATCAAATTTGAAAGTCTCTCTCAAATTTGAAAGTCTCTCTCAAGTGCCCTTGTCAGCAATAATATATGTTAGTATTTGTGTGAAAAAACTATTTACTCAAAAGAAACTTGCATAACTATAAGAAGTTAATTAATGAGTTAAATTTATATGGTCTTGGAATGGTAGAATTTCTTTCTTATATATTTTTTCTGTAGTTTTATCTGTTGAATGGTCAAAATAAGTTCAAGGATATCATCAAGCAATTGCCTCTATTGAAAATGTTTAAATGTTATATATTGGAGTTTTGATTTCTATTGGAACAACTACAATCTAACCGTGGCGTTACTGCATGCATCGGACTGTGACTGTGAACAGCGGAGTGGGAAAAAAAGTGAAAAAAAAACTACAGAAGAAATGGGAAGAGATGTTGAAAAGAAGAGGAGGGATGAGAGAGAAGGAATGGAAAAATTAAAAAAATAATTTAAAAACCATGTAATCTAACAAATGACATAAATTTAGTAAAAAAATTACACTTCACTTAAAATTTGTCATCTCAACATGCCACATCAAATTTTCGTTAGTCAACTAACGGTCAAACTAACGTTAGGGGCCATTTAGAACTATTTTTCAAACATCGGGGTCTAAAATGTAGCTTTTGAAACCTCAGGGACCAAATAGACACTAACCCCAAACTTCAGGGACCAAAAGTATATTTTGCCCTTGTTTTTATCTTTTTAGGTCAATCGATGATTTAACAAATAACGGGTAAAGTTTTGAAATTTGGTTTAGGCAATTGGACATGGGATTTCGAGCTCATTTCTAGACAAGATACGTGAGATTGCAAAAGAGTTCTTTGAATTGGCAGAAGAAGAAAAGCAAAAGTATTGTCCATCGAATGATGAAGATGATAAATTCCAAGGGTATGGAAATGATGTGGTGGTTTCACAAAACCAAGTTCTTGATTGGAATTATCGTATCTTCCTTCAAGTTTTCCCACATGACTCAAGAAAACTCAACCTTTGGCCAAATGGTTTTAGGTAATTAAACATTTCCATTTCATTTCTTAGAAACTTGATCGTACGATATGATGACATGTTTATCATCTAACCCTATTTTTATATTTGACTCAAAGTCTTTATAATTCGTATTTTGATTTAGGTCGGTTACACTTGTTTCCAAGGTGTGGTTCGATTTTTACTCTGATCATGAAATTTTTATTAAGAGTCTCGTTTTGATAACTTTTATGTATGTAGGCTCTTTTTAATAACCGTTTTGGTTTTTAAAAACTTTGTGTGTTTGTTTTATCACAATTCTTTAGGATGGTTTTTATCATTCCAAACTAAACATTTGAATACCTAGCTAAATTCTAAAAATAAAAATAAGTTTTTTAAAATTGTAGCTCTGTATTTATAAACCAATTTGATTTTTATTTTGAAAATTGTATTTATTTTGTTACAATGGTTTTCAACTTTTTAAAATTAAAGAAACACATTTGGATTCATAGCCAAATTCTATAAATAAAATAAATTTTTTAAAAACTATCTTTTTTACTTTTTTTTTTTCGTTTACAAATTTTGGTTTATGGTATAGAAGAACCTAATAGCTATCAAACGTGACATTAGTTTTTAGTTTTTCATTTTTGGTACTTTCCTTCCAAGAGGCTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAATAGATTTTTGTACGAGTGTTTATAAATCTTTCCATAAAAATGTGTTTTCAAATCTAAGCCAAAGTCTTAAAACTTAAATATATTTTTTTTAAAAGGAAAAACTTTTTATTTTTTTAAAAAAATTGACTTGAAAAATTCAAATATATTAAAAAAAAACCTTGAGAAGAAACAATATAAATGACTTTAAAATACAAAAGGCTTACAAATGAAATCGTTATCAAACACGACCTAAGTGATCAATAAACGTCAATATATAAACAAACATTTGGAAACTTATGTGTTTACTTTGTTATACTTAATTCCGTGCTCCCATTTCTTTTACACATAATTATTTTTTAAAAAAATCATTTTATTTGAAAAAAATTATCACATGACAATTTTTTATAGGATAGTAGTGCAGTCCGTGCAACACCCTAAGTATTTCTAACTTTGTTATGTGATTTTCTTTCTATTTTTGTCATTATCTTTTATATCAACATTATGTTACTTTTTGTAGAGAAATCCTAGAAGAATACGTAGATAACATAAAGTTTGTAATGGAAGTTTTATACAAAGCCATAGCAAAATCATTGAACATCGATGAAGATAGCTTCGTAAAGCAGCTCGGGGATCGATCGCCGATGAATGCGAGGTTGAATTTCTATCCACCGTGTTCAAGACCAGATTTGGTTCTTGGAGTAAAGGCTCATACAGATGGATCAGCCCTCACAATTCTGTTACAAGACAAAGAAATGGAAGGTCTTCAAGTTTTTGTTGATGACAATTGGGTCAAAGTCCCTGTCTTACCTTATGCTCTCATTGTCAATCTTGGTGACCAAATGGAGGTAAAATTAACTTTCTCCCTACTCTCTCTCTCTCATTCTTTTTGTTTTTGATGTCTTTTTCAGTGAAAAAATTATATTTAATTACAAATTTGATCCCTATAGTTTAGAGATAGATAGAATTAGTTATCATGATTTGATAAAATCTCATAAATAGCCCGTATGGTTTGAAACAATCCTCATACGTAGTCTCTAATGTAGGAGCTATTTATGAGGGTTTTATCAAATCTTAGAGACTAAATTCTAAATCTAAACCATAGGAAATAAATTCTAACTTTCTTTAAATCGTAGAGGTCAAATTTGTAATTTAACCAAACAATATAGAGATATAGAACAACAATTTGAAAAGAAATATAAAAAATGAGGTGGTTTTATTAGTAAAATTGTAAGTTGAAGA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ATGTCTCTGTGTCCTCCAGATTCGACCAAAAATGTGTTGCAAATGTCCATCAATGGCGACGAACCGCCGCGAGCCTACGTTGTTGAAGGCTCTGCGATCGGCGGTGCCGGCGAGATTCCGATCATCGACGTCGGTGTGTTTCTGCCGTCTTCGTCGCCGGAACCTGAAGTTTTGGACTCCGAATTGGGAAAATTGAGATCTGCTCTCGCCAAGGAGGGATGCTTTCAGGCAATTGGACATGGGATTTCGAGCTCATTTCTAGACAAGATACGTGAGATTGCAAAAGAGTTCTTTGAATTGGCAGAAGAAGAAAAGCAAAAGTATTGTCCATCGAATGATGAAGATGATAAATTCCAAGGGTATGGAAATGATGTGGTGGTTTCACAAAACCAAGTTCTTGATTGGAATTATCGTATCTTCCTTCAAGTTTTCCCACATGACTCAAGAAAACTCAACCTTTGGCCAAATGGTTTTAGAGAAATCCTAGAAGAATACGTAGATAACATAAAGTTTGTAATGGAAGTTTTATACAAAGCCATAGCAAAATCATTGAACATCGATGAAGATAGCTTCGTAAAGCAGCTCGGGGATCGATCGCCGATGAATGCGAGGTTGAATTTCTATCCACCGTGTTCAAGACCAGATTTGGTTCTTGGAGTAAAGGCTCATACAGATGGATCAGCCCTCACAATTCTGTTACAAGACAAAGAAATGGAAGGTCTTCAAGTTTTTGTTGATGACAATTGGGTCAAAGTCCCTGTCTTACCTTATGCTCTCATTGTCAATCTTGGTGACCAAATGGAGGGGGTGTTCTTGCTTTCTATTTCCTTCAAGAATTTGGGTGTTGGGTTTCTTTGGGCGACAGGAGTTTACGATCCTCCTAGGATCAAAGGAAAAAGGGTTGTACCTGATACACGTAAAGGACTTGTTCGTATTGGAAGGGGTGAGGAGGGATTGTTGCACATTCAATGGCTTGATCGGACACAAAATGTCATTGAAGATGTTAATCAAGCGTCAGGAAGAGTTTACTTATTGAAGTTTAAAACAGATGACAGGAAGTTCTTCTTTTGGATGCAGGAGCCCAAAGCTGAAGATGACCAGCAGTTGTGCATCTCCATTAATGACTACATTAATCGGCCACTGGAGTTCCTTGAGGAAGAAGAACAGGCTGTTGCTTCCACTCCTCTACAAGTTTCAGAAGGCACAGTCGAAGAAAATATCCCATCGAGCTCCTCACTACGGCCAGTGAAGTTGGAAGACCTGCAAAGAATTTTAAGTAACATTGAGCCGTCTGGTTTTGGATTAGGAGATTTATTGAAGCCTGATCTGATAATGCCATTGCTGGAAACGTTACCATTGGAACAGAGTTTAGTATCGTATTTACCTGAGGGTCCATGGTCTCCTGAGGATATATTGGAGCTGTTACAAAGCCCGCCTTTCCGTCAACAAGTAGATTCGTTTACTTACGTTCTTCGGACAGGACAGATAGATTTGTCTCAGTTTGGGATAGACCCGAGCAAATACAAATTTACAGTATTGTCTTTTCTCGAGGCCCTTGAGGATTCTGTCTCGAAAGCGTCAGGTTCCGAGCTGGGGCCGGATAATAAGGATGTAAGATCTCAATCCTTCAATCGTAGTGACTCGATGGATGAATCATAG MSLCPPDSTKNVLQMSINGDEPPRAYVVEGSAIGGAGEIPIIDVGVFLPSSSPEPEVLDSELGKLRSALAKEGCFQAIGHGISSSFLDKIREIAKEFFELAEEEKQKYCPSNDEDDKFQGYGNDVVVSQNQVLDWNYRIFLQVFPHDSRKLNLWPNGFREILEEYVDNIKFVMEVLYKAIAKSLNIDEDSFVKQLGDRSPMNARLNFYPPCSRPDLVLGVKAHTDGSALTILLQDKEMEGLQVFVDDNWVKVPVLPYALIVNLGDQMEGVFLLSISFKNLGVGFLWATGVYDPPRIKGKRVVPDTRKGLVRIGRGEEGLLHIQWLDRTQNVIEDVNQASGRVYLLKFKTDDRKFFFWMQEPKAEDDQQLCISINDYINRPLEFLEEEEQAVASTPLQVSEGTVEENIPSSSSLRPVKLEDLQRILSNIEPSGFGLGDLLKPDLIMPLLETLPLEQSLVSYLPEGPWSPEDILELLQSPPFRQQVDSFTYVLRTGQIDLSQFGIDPSKYKFTVLSFLEALEDSVSKASGSELGPDNKDVRSQSFNRSDSMDES Homology
BLAST of HG10006145 vs. NCBI nr
Match: XP_004152855.1 (codeine O-demethylase [Cucumis sativus] >KAE8651693.1 hypothetical protein Csa_006767 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 505.0 bits (1299), Expect = 8.3e-139 Identity = 248/268 (92.54%), Postives = 255/268 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. NCBI nr
Match: XP_038889716.1 (codeine O-demethylase-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 1.8e-138 Identity = 250/268 (93.28%), Postives = 255/268 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. NCBI nr
Match: XP_038889718.1 (codeine O-demethylase-like isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 1.8e-138 Identity = 250/268 (93.28%), Postives = 255/268 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. NCBI nr
Match: XP_038889717.1 (codeine O-demethylase-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 503.8 bits (1296), Expect = 1.8e-138 Identity = 250/268 (93.28%), Postives = 255/268 (95.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. NCBI nr
Match: XP_008450549.1 (PREDICTED: codeine O-demethylase-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 494.6 bits (1272), Expect = 1.1e-135 Identity = 241/262 (91.98%), Postives = 250/262 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O48726 (26S proteasome regulatory subunit RPN13 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPN13 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 1.1e-77 Identity = 160/272 (58.82%), Postives = 187/272 (68.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q39224 (Protein SRG1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SRG1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 169.5 bits (428), Expect = 1.1e-40 Identity = 96/235 (40.85%), Postives = 139/235 (59.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D4N502 (Codeine O-demethylase OS=Papaver somniferum OX=3469 GN=CODM PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 169.1 bits (427), Expect = 1.4e-40 Identity = 94/242 (38.84%), Postives = 139/242 (57.44%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80449 (Jasmonate-induced oxygenase 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=JOX4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 1.5e-37 Identity = 98/282 (34.75%), Postives = 157/282 (55.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZWQ9 (Flavonol synthase/flavanone 3-hydroxylase OS=Citrus unshiu OX=55188 GN=FLS PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 150.6 bits (379), Expect = 5.2e-35 Identity = 89/240 (37.08%), Postives = 130/240 (54.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BNU3 (codeine O-demethylase-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492112 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 494.6 bits (1272), Expect = 5.4e-136 Identity = 241/262 (91.98%), Postives = 250/262 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C8P5 (26S proteasome regulatory subunit RPN13 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold648G00230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 458.0 bits (1177), Expect = 5.6e-125 Identity = 240/277 (86.64%), Postives = 246/277 (88.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BQP8 (26S proteasome regulatory subunit RPN13 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492157 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 458.0 bits (1177), Expect = 5.6e-125 Identity = 240/277 (86.64%), Postives = 246/277 (88.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BP07 (26S proteasome regulatory subunit RPN13 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492157 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 457.6 bits (1176), Expect = 7.4e-125 Identity = 240/278 (86.33%), Postives = 246/278 (88.49%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TXA8 (26S proteasome regulatory subunit RPN13 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold115G00620 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 457.2 bits (1175), Expect = 9.6e-125 Identity = 240/279 (86.02%), Postives = 246/279 (88.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. TAIR 10
Match: AT2G26590.1 (regulatory particle non-ATPase 13 ) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 7.9e-79 Identity = 160/272 (58.82%), Postives = 187/272 (68.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. TAIR 10
Match: AT2G26590.2 (regulatory particle non-ATPase 13 ) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 7.9e-79 Identity = 160/272 (58.82%), Postives = 187/272 (68.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. TAIR 10
Match: AT2G26590.3 (regulatory particle non-ATPase 13 ) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 7.9e-79 Identity = 160/272 (58.82%), Postives = 187/272 (68.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. TAIR 10
Match: AT5G20400.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 223.0 bits (567), Expect = 5.9e-58 Identity = 110/234 (47.01%), Postives = 152/234 (64.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006145 vs. TAIR 10
Match: AT1G49390.1 (2-oxoglutarate (2OG) and Fe(II)-dependent oxygenase superfamily protein ) HSP 1 Score: 222.6 bits (566), Expect = 7.7e-58 Identity = 108/234 (46.15%), Postives = 152/234 (64.96%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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