HG10006059 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGGAGAAGCACGAGGACGTGGATGATGTAGGGAGTGCGTCCGGCGATTATTTTATCGATGACTCAGAAGACGATAGGCCATCAACATCTGGGAAGGACGATCAGTTGCATCTCGAGGCAAGCGACATTAGCTTTTCCATTTGTATTTGCGAAGTCTTGGTTTCACTTGTTGCTTCATGTCTTGCTAGTCAGTAGATACTTAGGTATTAATATCTGTTTCAATTCTACTGTATTCTTTAATCTCAAGTATGGTACGTTTGTTGTTTGTTTTCGTTTTATTCATTGAGCAGGAACCGTTGACTGAGCAAGAAATTGAGGATTTGGTGGCCGAGTTCTTGGAAGTTGAGAGTAAGGTGTCATACTGTTCTCTTAGCTTCAAGGACTCATGTTCCTATGTTTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTTTCCTTTGATAAGATACAAGATGTATATTATGCACTTGGGCAAAAATGCAGCCTAAGAGCAGGGGAAGAGAAAACCCCCTCCCTCACCAAAAAGGCTAAAAGAGAGCTTTCTAATTTGATTGTATCGTGAACAAGCTGTAATTATAAAAGAAGTTTTTTGTGCTTCATGCACCACAAAGAAGCTACGAATTAGGTGTTACTACAAAAAGAACCAAAGCAACGTTCTGACAGCCATACCCCACAAGATTTTTCCTCCGTTTTTCAGGTTCCAAACCACCAAAACATTATGTTCCCAATAATTTGTGATTGTAGTTGGGTTCTTTTCAAATATAGAAAAATGAGTCAAACTATTTACAAATATAGAAAATTTTTACCGTCCATCACTGATAGATCGCGATAGACTATAAATTTTTTCTATATTTGTAAATAGTTTGATATTTTTTCTGTTTATAGTAATTTCCCATTGTAGTATTGATAAATAGATTCTATTCTAATATCATTATTGGTATGAGGCATTTTGGATGGTTAAAAAAAAAACCATGAGGACTTATGCTTAAAGTGGACAATATTGTATCATTATGGAGATATGTGGAGGGTCTGTTGTCCTTATCAGTGGTGTCATGCCTCAATCAATGGAAAAGGGTGAAAATTCGTCTCCTAGATGATGATATCGACATTATTGTCATAAAGAGACAGAACAAAGCTCTCCTAGCCAATTGGATATGGAGGTTTTCTCATAGAGCCGCTCTATGGAGGAAAGCTATCAAAGCAGAATTTGAGTTTTTCCACTTTGATTGAACCAAACCTCGAGCAAAAAGCATCAGCAAGAAGCCCATGGTCCTTCAATGTAAAGCACATTGACCTTATATATAAAAAAACCTTAGCTAAAAGATTAAAGGATAGCTCTCTCCAAGAATCAAATTAAAGTCTTTATTATAAATCAAAAGTTATGAATACAAGAAAATAATTCTCTATTTATGGAGAATTGGAAAACAAACTAACCATAATCCTAACTAATCAAGGAAACTAATCCTAATTAACCAATAAAACTAATCCTAATCCTAATCCTAATCAATTAAGGATTTGACCAATATGCCTTAATTTACCCTCATCCTACTACATCAAGCTAATTCAAAGGGGCTACTATTGTTCCATAGTTCAACAAAGACCTCCTGTAATACCTTATCATTTCTAGAAACCCCCACAACTCGTGGTAGTTATTGGTAGAGGCCAATTTACCATAGCCTGGATTTTATCTCCAACAGCTTCACCTCTTTTTCAAATGCCACACCCAACGTCCCAAATGTTTGATCCTCGATTGATTGAAAACACACTTCTTTTGTTGGCAAATAATTGGTTATCTCTTGGCACATTGAACACCATAGGCAAGCGTTTTTCATTAGTATCCATGTTCAAGTTGTATACTAATATGTCATCGAAGAATACTAAGATAAACCTCCACCACAAGGGTCTAAAAATCTGGTTCATTAGTGGTTGGAAGGTAGCTAGGGCATTAGTTAGCCCAAAAAGTATAACCATAAACTCGTAATGCCTTCGTGGGTTCTAAAGGCTATTGGGCACAACCCTCTAGTGCATTCTTATTAGATGATTTGAATGCACTTTCAATTAAGGCTCTTGGGCTTCTGTCTTTTTCAAGTTCTTTCGGCTACATTAATTAATTGGAGATTTGTTTGTTTTCAAGATAGCATAGGTTATCTCATTGGAATCAAGGCAACATTAATTATGGATTTTCTTTGTTTCCAAGGCAATTTTTGTTGAGATTTTCTCATTGGAAGCAAGACAACATTGTTCTTCCTCTTGGCTCATGTTAGTATTAATTTGGTCCTTGGAACTAGAAGTCCTCTTGATTTTTTCATTGGGATTGGAAATTAATTCGTTATGGTTGCTTGATTCACCTTCCTATCATCCACACAAAACTTCCAACCGTCGTTTCTTTCTGACCAACAAAACTGGACTTGAAAAAGGGTTACGACTCGACCCCCAGGTGGATTACTCTAGTTGTGAGCATCTCACTAAGTACTATACTTTTGATGGTTTTTGGCCTTCTTCTATTACTAGAGGTTCTTTGAAAGCTCCTTGGCAGTTTATTTGTCAGATTTTTGATTTGGTTGCTGTTCATATTCGTCATGGTTTGGGAGATGGTTCTTCTATTTCTTTTTGGAATGATTCTTGGCTTAGCTGTGGTGTCATTTTTACAGTTTTCTGAGGCTTTTCCGTCTTACTCTTCATTTTGAGGCTACAGTTGCCAATTTTTGGAATTCGTCAACGAATGCTTGGGATTTGCATCTTCGTCCCAACCTTAATCAGTGTTTTAAAAAGTCCTCTTAGGCACGCGCCTAGGCTCAAGGCGCAGGTCTGGCGCCTTGCCTTTCACAAAAGGCGTGCGTCTTTTATGAAGCCTGAAGGCTCAAAGCCTGGGCCTTGGGGATTTTCCATTATTTTTTAAAAATAATAATAATTAGGATTTTTCCTTCTTTATTAACTTAATAAAGCTGATTTACTAAGCCTAAATGCAAAATTTCTTGTGTTTAGAAGTTTTTTTTTTTTCATATTTCCATTTCAACTATGCTTTCTCTTCTTAATGTAGTATTTTTATACATAGTGTGCCTCACAAAAAAAACCGCGCTTTTTTTTCACCTTGCACTTAAGCTCTACAAGACTATTGTGCTTTATTGCGCCTTGAGCTTTAAAAAACACTGACCTTAATGATTTGGAGATTATTGACTGAACATCCTTATCTCATCACTTGTTTGCTGCTAGATTTCATTCTGCTCCTGATCCCTGGTTATGGCCCCTTGGTTCCTCTTTGATGTTTACTGTTAAATCTCTTATGGCTGATTTGGTGGGTGCGACTGGTTCGCTCTTTTTTGATCTTTACTTTGTTATTTGGAAGGACTCTTGTCCAAAGAAGATCAAAATTTTTCTTTGGGAGCTTAGTTTGGGTGCCATTAACACTGTCGACTGTCTTCAACGACAGATGCTTTATATGTCTCGTTCGCCTTCCTTGTGTCTCATGTGTCGTATCATTTTGAATCTCCAACCCACCTATTTATGCACTGCCCCCTTGCATCTAGATTTTGGACCATTATTATGGAGGCTTTTGGATATTCTATGCTGTGCCCTAATTCTATTTTTGATGTTTTTGCTATTTTGTTGGTGGGTCATCCTTTTGGTGGTACTAAAAAGATGATTTGGTTGGCTCTATTGCGTGCCTTCTTTTGGCTTCTTTGGGGCGAGAGAAACAGTCGCCTTTTTTGTGACTCTTTTTCCACTTGTGATAGATTTTTGGAATTAGTTCTTTTTACTGCTTTCTTTTGGTGCAAAATTAATACACCCTTTTAATCATTATAGTTTATCTTTTTCAGTTACCAATTGACAATCTCTCTTGTAATCACCTATAGGTGTTTTGGGGTTTTCCCTTATTTCATTTATCAATGAAATGTTTCTTTATAAAAAAAAAAAAACAGCCAACCTTTGGAATTGTGGGTGGCTCCATAACTGATTAACGTGATTACTTTTTCCCCCTACCACCCCTTTTAACTTCATATACATGGTGCAAAAACACCTAGAAAAATCGTAGATCTAGTTACACGTTAGCCACTTCTAGTGCTTTAGCTTCCACTAGTTCTTCCTCGCACTTGTCCCTTGTTTCTTTGATTTCATACCCATCGTTTACTATTATCTTTTTTGAAATGGAAACTAGCCTCTTCATTGAATTATTGTTGCTATTAACAACATCAATTCTCAATTCTCTCACGGTTTACAATGATGCCCTACTGAATACTTGTCATCGGAAGCAAAACCCTTTTCCCTCTTCTCTTTGTATTCAATGTTTTAGAGCTTTTTGAGAGGTGGTTCCTTGCAAACAATCTACCTTTTTCTCGTACTTTATCTATCAATCTCTCTAAACTCTTACACATGTTAACCAACAACTCATTCCCAATATTTCTTTCTCATTTCCATCATTCACTCTTCTAACTGTTTCTATGCCATACTCCTTATTGTTCCCATAATTTAGCTCAATTCAACTTTTCTAATCTCTCTGTCACCTCTAAAAATGGTGTAGATGAAAGAGAGAATTTTACTATGAATGAAAAGTTGTAGAATACGTGAGAGGGGTTCTATATTTATAGAGAATTGAAAGCAAAATAGAATCCTAAAATGAAACTAAAAGGAACTAAACCAAGATTAATAGGAATTTACGTAATTTATCTTAATCCTATTACAATTCTATCCCTCCCAAAAAAAAAATCTCATCCTCGAGTTGAAAAAGAAAATGAAGATAAAAGTAAACAAGTAAGCCATTCAAATGGAAATGTTTTTGAACCTACAACCTGCTGAACATGTCATTAGCTAAGCCACAAACACAAACAGCAGCTACAAGCTGTTTTAAACAAGAAACTTAAAACAATTATAGGAAAATACAAAAGTACACTTAGGATTGGCCTAGTGGTAAATAGGGGGGCATGAACTTGATAAACGACTAAGAGGTCATGGGTTCATTCCATGGTGGCCAACTACCTAGTATTTAATATCTTACAAGTTTT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ATGGAGGAGAAGCACGAGGACGTGGATGATGTAGGGAGTGCGTCCGGCGATTATTTTATCGATGACTCAGAAGACGATAGGCCATCAACATCTGGGAAGGACGATCAGTTGCATCTCGAGGCAAGCGACATTAGCTTTTCCATTTGTATTTGCGAAGAACCGTTGACTGAGCAAGAAATTGAGGATTTGGTGGCCGAGTTCTTGGAAGTTGAGAGTAAGGCTGCAGAGGCTCAAGAAGCACTTGAAAAGGAGTCTCTTGCAAAAGTGGAGAATGACGTTCGAGAAGAATTGGCATTGACTCTTAATGGTGATGATTTGGAAATGGCCATTGCCAATGAAATGGCTACTTTCATAGAAGAGTGGGAAGTTGTGCTCGATGAGCTTGAGATTGAGAGTGCTCATTTGTTGGAGCAACTTGATGGTGCTGGGATCGAGCTACCAAGTCTCTACAAGCTAATTGAAAGTCAGGCTTCTAATGGTTGCTTTACTGAAGCTTGGAAAAAAAGGATACACTGGGTAGGGTCTCAGGTAACTGGTGATCTTCTTGCATCTGTCTCTGATGCAGAGAAGACCCTCCAAATCGAAAGGCCCGTAAGGAGACGACATGGTAAACTGTTGGAGGAGGGAGCAAGTGGATATCTGCAGAAGAAATTTTCCACTCACAAGATCGAGGGAATTGGTACGGAAAATTTGGAAGTTGATTGGTGCTCTCTTAATAAGGTTTTTTCAGAAGGCCCAAAGGACAACGACACATTGTTCGGCAGCAAGAACTGGGCTTCTGTTTACTTGGCTAGCACTCCGCAACAAGCTGCAGAAATGGGACTCAAATTTCCTGGAGTTGATGAGGTAGAGGAGATAGATGACGTTGATGGAAATTCTTGTGATCCGTTTGTTGCAGCTGCCATTGAAAATGAAAAAGAGTTGGATCTTTCTGAAGAACAAAAGAAAAATTTCAGAAAGGTCAAAGAAGAAGATGATGCCATTTTTGATAGAAAACTTCAAATGCATTTGAAACAAAAGCGATATCAGAAGAGATGCAAACAGGAGGTCTTCCAAAAAGATGTTTCCCCAAGAGATGAAGAGCAGCCTGTATCCCTGGATGACTGTTTGAACCTTGTTTCAGATGATAACACTGATGGACGTCGAATGGGGTTCTCTGATGATGAAAATGGAGATGCTTGCCACAAAATCAAGGTTGACATACCCAATGGTTCTGATGCTTCAAGTGATGTTGACATGGAAAGGTCTATGGAGCATACGGCTTCTGTGCTTCCTTCGGCTTTATCTGATTTTGTGGAACCTCTAGGTTCCAAGCGTTTAAATGATATGGAAGAATTGACCACTCAAACTAAAAAGAGTCGAACTAATGGTGTACATAACGATGAAAGTTCCTTGATAAAGGAGGATTCTGCTTTCAATCTGACGACATTGGACACCATATGCAACACGGAACAAGATGACCATGGTGCTGATTCTCTTCCATCAGAGTGTCCGAATAAGAAGATCCATTGTACTGCTTGTGATCAAGTGGTTATTAAGGCGTATGCACATCCTTTCCTTCAAGTAATCGTTTGTGCAGATTGCAAATCCTTGATGGATGACAAGAAGAATGTAAAGGAACCTGATTGCTCTGAATGCTATTGCGGATGGTGTGGCCGCAATGCTGACTTAGTAAGTTGTAAATCATGTAAAACACTATTTTGTATTGGTTGCATAAGGAGGAACCTTGGTGTCGAGTGCTTGCTCAAGGCCCAGGCTTCTGGCTGGCATTGTTGTTGTTGTTGCCCAAGTCTCTTGCAACCCTTAACCATGCAGTTGGAGGAAGCCTTAGGATCTGGAGAGTTGACAGGTTCGAGCTCGGATAGCGATTCAGACAACCCAAATGCAGATATAAATATAACCATGAGCTCAAAGAGAAAGCGTAAGAAAAAGATACGGCGGATACTTGATGACGCTGAATTGGGAGAAGATACTAAAAAAAAAATTGCCATAGAAAAGGAACGCCAAGAACGTCTAAAATCATTACAAGTTCAGTTCTCCTCCAATTCTAAAATGATGAGCTCTGCTGGCTTTTGTGGAAATCTATCTGAAGGTGCCAGTGTCGAAGTTCTTGGTGATGCCTCAACGGGATATATAGTGAATGTCGTGAGGGAGAAAGGAGAAGAAGCCGTCAGAATTCCACCAAGCATTTCATCGAAGTTGAAAACCCATCAGGTTTGA 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BLAST of HG10006059 vs. NCBI nr
Match: XP_038889289.1 (protein CHROMATIN REMODELING 20 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1312.7 bits (3396), Expect = 0.0e+00 Identity = 682/741 (92.04%), Postives = 698/741 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. NCBI nr
Match: XP_011649017.1 (protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031736980.1 protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN61312.2 hypothetical protein Csa_005917 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1266.1 bits (3275), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/739 (90.12%), Postives = 687/739 (92.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. NCBI nr
Match: XP_008441784.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1261.1 bits (3262), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/739 (89.58%), Postives = 686/739 (92.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. NCBI nr
Match: XP_011649018.1 (protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1252.7 bits (3240), Expect = 0.0e+00 Identity = 661/739 (89.45%), Postives = 683/739 (92.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. NCBI nr
Match: XP_008441780.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008441783.1 PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 20 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1251.9 bits (3238), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/745 (88.59%), Postives = 685/745 (91.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4HW51 (Protein CHROMATIN REMODELING 20 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATRX PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 6.7e-171 Identity = 365/748 (48.80%), Postives = 486/748 (64.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B484 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1261.1 bits (3262), Expect = 0.0e+00 Identity = 662/739 (89.58%), Postives = 686/739 (92.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Z9 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1251.9 bits (3238), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/745 (88.59%), Postives = 685/745 (91.95%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4W2 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485842 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1247.6 bits (3227), Expect = 0.0e+00 Identity = 657/739 (88.90%), Postives = 682/739 (92.29%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CSD7 (protein CHROMATIN REMODELING 20-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014150 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1218.0 bits (3150), Expect = 0.0e+00 Identity = 640/745 (85.91%), Postives = 674/745 (90.47%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HNN1 (ATP-dependent helicase ATRX OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465339 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1180.2 bits (3052), Expect = 0.0e+00 Identity = 621/745 (83.36%), Postives = 660/745 (88.59%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. TAIR 10
Match: AT1G08600.1 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 4.8e-172 Identity = 365/748 (48.80%), Postives = 486/748 (64.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. TAIR 10
Match: AT1G08600.3 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 4.8e-172 Identity = 365/748 (48.80%), Postives = 486/748 (64.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. TAIR 10
Match: AT1G08600.4 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 4.8e-172 Identity = 365/748 (48.80%), Postives = 486/748 (64.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10006059 vs. TAIR 10
Match: AT1G08600.2 (P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 4.8e-172 Identity = 365/748 (48.80%), Postives = 486/748 (64.97%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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