HG10006046 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10006046
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr07: 12218336 .. 12227819 (-)
RNA-Seq ExpressionHG10006046
SyntenyHG10006046
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGGCAGGGATTTGGCTTCGGAAGATCTGGATCCGTTTCTTGGTGGATGGAGTGGACACCAACCCAGAAATTGAGTTGAGAAGGTCCAATGAATCCGCCATGGGTAGAAACGAATATCTTCCGATTGGGAATTCGAGGCCTCAAATACGTAAGTTGAAAATGGTGAGACGAAGAGTCTGACGCTGCTGCATATAAGAAGAACTTTGCAGAGGTTTCAACCTTAGTTTTAGGGTTTTAGGAACTACAAGAAGGATGGATGGACACTCATTCTTTAAATACAAATTATTTATTCTTTTAACTTTGAATTTATATGTTTTGCCTAATAAAATGAAACACTACATAAGTGAATGTGTCTTCTTATTTTTCTTTTCCTATGCCTCAATACTTCTCCAATTTTTTTACATGTGTTTGGCAAATGGTAGATAAAGATAAATACTTAGTATTTAAAAAAGCAATTAATTAGTATTTTATAAAATGCTACATAAATGCGAATACAGAAATATACTAGTATTCTCACATTCAATTTCGTGTTGTAATTGGTAGTATCTTTTCTTTCTTTATTACCATTGTGATTGAGTTCACTTCTGTTAGGAGATCGAGGTTCTCTATCCTTTGTGCAAGAAGTTTTGAATCGGTTGTAATTGTTGTCTAATCTTATTACTATTGATAATAAAGGTTTGATATTTTGTGTTAGCATACCTCTTGATGAGGTAGAGAGACTTTTGGCGTTCATAAAGTTTCGTTTGGCTTCTCTTCCTGTTTGTTATCTTGGCTTGTCTCTTATTTCGAGCAGGCACCGTATACTAATTGTTTGCTTTATTGAAAAGGGTTCTACTCCAATGAGGAGTATGTCAACTATGACTTTGTCTTATGTAGGTTGATTACAACTTATTTGGTCCGTTCTACAAAGCTTTCATGTATATTGGGTCGACGTGTTTGTTTTGCTAGAAAAATTTATTCAAGACTTTTATTGTTTACTTCGCTCCTAGCTTTGGAGAGGGAAGCTGGACAGAGTTAATAAGGACAAGTTTGTTTGGTGGATGTCTATCCTCTATGTTGTGATGATAGCTTACTATTTATCATCCTTTTTTTTTTTTTTTGAAATGTTGTTATTATCATGAAGTTGTTGTTTCCTGTCTTGATTCCTTATGTATCCTTGTGGGTTGCCTAGACGGAAACTTATAGTTTGCATGGTTGGAGTATCTAGGCAATTCGTTCCTCTAGTTCTTTGTTTAGATGTTCGAAGACCATCTTTTGTGTTTGGGATAGTTTGCAGCTCTTGGTTCATTTTTTTCATTGGAGATAGGCATTGTTGTTTGGTTTATTTTGACTCTTGGTTAGAAGGGGCCATATTCTTCAATAGTTTAGTGTGATGGTTATTTCAGAGCCCTTCATGCTAAGGTTTTTATTTTCTCTATCCATATAGGATTTGGGTCTAGCCTTATAATTCTAAAGAGCTGGTGGAACACTTGTAGCAAGTATAGTCAGTAGTGATTGAGGCTGGGATGGAGTCAAACCACTTGTAGCAAGTACAATCAATAGTTGTTGAACCACTTGTTTGGAAGTTGTTCTTCAATCTTTACAAGATCCTAGAAGTTGTTCTTGAACCATTTTTCAGTATTTGGTAGGTTAGGTCATCTTTGCACCACTTTTGAACACACAGATGACCTTAAGATGCCTTTTAAATTTCTTTTTGTTCATAAAAAAATATTTTTAGGTTTATGGAAATTCAAATTAACTATTTTGTCAAAATTCCTACATGATTGAACTCTGTTCATTCTCTTCAAGTATGAATAAGGATTGGATTAAGCTTAGTGATAGATTCTCATGATATTATATTGAAAGAGTTGTACACTTTCTTGAAATGGCAAAATGTCATTCAATAAGGCAAAAAAATTGAATTGTACATATAAGAATTGTCAAAATTCAATGTTGTAGTCATTGGACGGAGTTGAACTACGTTTGTTTACATATGACATTTCTCCTTCCTAGAGTCAATGAGTTTATTACGAAGAGTTAGTGAACTTAGCTTGATTTAAAAAAAAAAAAAAAAAGATGAGACTTTTTCAGCCAATGATGGATTAAGTAGAGAGTCTAATGATCATAATAATGACAATGATGAGATGTTTGTTTTTTAACTGATGACAGTATGAAAAATATTGAATTTGTCTTTAATGAGAAATGTTCTCAAAAACCTATTGTCAAAATACTAATTGTTCGTGAAACACTTTATTGATGAATCAAATATTATAAAAGTTCAAGAAAATGTGAACAAAAGTAAATTTGATTTATTACATTTTTTTTGGGGAAAATTTAACAATACTACCTGGATAGTTAATTTAATATCCACTGTTAAGATTTATTTTTCATTACAATTAAATTGTAATTCTTGGAAAACACTTAACGACGTAGAATAATTTGTGCATGTTAGCCCAAGGAAGCTAATCTCAGTTCATGTAGTGGAAGGCATTAAGGGCATGTTTGGTAACGTTTGAGTTTCTTGTTATTGTTTTTCCATTTTTTAAGAAACAGACTTGTTTAGGTTTCGTTTGGTAACCATTTGGTTTTTTATTTTTAATTTTGAAAGTTAAGCCTATACACCTATACCACCATTATATTTCTTTCTTTGTTGTCTACTTTTTACCATGTTTTCAAAAACCAAACCAAAATTTGAGAACTAAGAAATTGTTTTTAAAAAGAATTGTTTTCCTTTTTGGAATTTAGATAGGAGTTTAACTCTTGTACTTAAGAAATATGCCAACTATAGTAAGAAAGTGTGAGAAAATAGGCTTAATTTTCAAAAACAAAAAACGAAGGCCCCATTTGGTAACCATTTTTTTTTTTTTTTGGTTTTTGAAAATTAAGCATATTTCCTCACATTTTCTTACAATAGTTTGCATCTTTATTCAATACAAGAGTTGAATTATTAGCCAAATTTTAAAAATAAAAACAAGTTTTTTTAAAAATACATTTTTTAGTTTTCAAATTTTGGCTTGATTTTTGAAAATATTGGTAAAAAATAGATAAGAAAGCAAGACATTTAGGGGCTGTTTGGGGTCGTAATTGAATGGATTTGGACTATAATGTAATTCAAAACCCATTTTTGGATTGAGCGTTTTGGATCTGATTTGTGATATTAAACTCATTATGTTCTGACAGTCTTTAACCAAACCTTCTTTCCCACCATTTTTATGTTTTACGATCCCATTTTCGTTCTATCCTCGATACCTCACGCATTCTAATACTTCTATTATTCCTAATTATTTTGATTACATTCCAGTCTTCTAAACAATCCCTTAGGAGTGGGAGGGGTATTTGTAGACTTACTTTTCAAAAACTAAAAACAAAAAATCAAATGATTACTAAATGGGGCCTTAATAATTCATAGAATCATTCATAAAATTGGGACTATACTTCAAAAAATACTCAAAGTAGTTTCAATTTGTGTCGTTGGTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTTTCCTGTTTTGGTTTTAACGTATACAAATTCCGTTTATAAATCAGAATTTCCATTACTATACTGGTCTCAGTGATATTCATGATTTTTTTGGATACCGAAGTCTTGGTTCGAATACCACGGAGAATAGTTGGTTTTTTATTTGATTTTTTCTTAAATTTGCAATATATATTATTTTAAGATAAATTTTAACAAAAAGAAAAAATGTCAAACTATTTACAAAAAATAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAACAGGGATAGACTTCTATTAGCATCTATCAGTGATAGATTTCTATCTTTTCTATCACTGATAGACCCTGATAGACTTCTATCTGTATCTATCACAACAATCTAAGAATTTTGCTATTTTGTGTAAATAGTTTTCCTTATTTTTATATTATTTTAATTTTGAATTTTTATTTTAATACATTTAGAACCAATTAAAATTTTGTAATATATAAATTTTATATATTAAAACACATATTTAACTGTGTTTAAGATACAAGGTTGGTTAAGAGCGAGGTATATGGTGTAGTTTTTTGTAACCTAAAAAACTTTGATTTTCTAGTGGCTAGTTTTGTTTGTGTAACCATTTAATTACATACATATTTTTCTGAGTTTTAAATACTCAATTGACGACCAACTAAAGAACTTCACATATATATTTACAATTTTGTGCACGTAACTTTTGTAATTGATATATAAAAGATACACACGTTTCATAATAACAATAAAATTACATTGTTAGAAACTTTTGATATCTACCTTAAATTAAGGTTTCATATGTTAGAATTAAAAATCATTCTCATTTAAAAAATATAATTTTTTTCTTACCTTTTTGATATAGAGAAACAAACTACCTTAAATACCTTCATGGCGTAGAATCTTATTGGTTTTCCTCTCTTGAGCTCAACCTTTTTTCACACTAAGGCCTTAATTCAATTTTTTTTTCATAATTAATTGACTAAACATGATGTTATGGTCCTTTATCGACAATCTCTAATATTTTCCTATCACTCTTGTGCATAATCAAATATTAGTCTAACAATAAATTAAGCAAATACTAGTAACTAGTGGCCAATTTTTAAAAAATATTAAACACAGAAAAGCCAAAATGTAATTGAAATTGAATGCGATCAAACGAGAACAATTAACGATTCAACAATCTATAACCTAGTAAATACCCTAGAATTATAGAATTCAACCAATTATTGCTTTGAAAAATTGAAATATATACATAAATTCAACCATCCAGGAATTGGAGATAGGAAAAAAAGGGAGAAACGATTAGCCGATTCGACTTCGTCTCCATCGTGAGATTGCTTGCTAAACTCTTGATCTGCACCTTCAAGCTCTCGATCTTCCTTTAGTAACTCTAAAGCTCTCAAAGCTTTTTGAAATGCACTACCCTAATCAGTCTTGGACTAAATTTCTATGCCCTCTCTAAACAATCGAGCAGTAGATAAATAGAACACAGGATGTGTTGGATTTTATGTCCTACAACTCGTAGTTCGTAAAC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mRNA sequence

ATGGCAGGGATTTGGCTTCGGAAGATCTGGATCCGTTTCTTGGTGGATGGAGTGGACACCAACCCAGAAATTGAGTTGAGAAGGTCCAATGAATCCGCCATGGGTAGAAACGAATATCTTCCGATTGGGAATTCGAGGCCTCAAATACTCTATGGATCTTTTGTTTTCAGATTTGCTCGTGGGTCTTTTGTTCCCAAATATGTTCATGAGTCCTTGCTCGTGAGTCTTAGAACCACCGCGTTGTTCCATTCCATTCGCGCTGCTTTGTTCTGCTCCATCCGTGCCATTCATTTCTGTTCGCTCCACTACCCAGATTCAATCGTGCATAACAACCACAACCATTACAAGTCCAAGCCGCGCCACCTGCCTAGATCTGTACAGCTTGTCGACCATATATCCGTTGCAGCCCTGTCAATCACAGATTTGTTCTTCAGATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCAGGGATTTGGCTTCGGAAGATCTGGATCCGTTTCTTGGTGGATGGAGTGGACACCAACCCAGAAATTGAGTTGAGAAGGTCCAATGAATCCGCCATGGGTAGAAACGAATATCTTCCGATTGGGAATTCGAGGCCTCAAATACTCTATGGATCTTTTGTTTTCAGATTTGCTCGTGGGTCTTTTGTTCCCAAATATGTTCATGAGTCCTTGCTCGTGAGTCTTAGAACCACCGCGTTGTTCCATTCCATTCGCGCTGCTTTGTTCTGCTCCATCCGTGCCATTCATTTCTGTTCGCTCCACTACCCAGATTCAATCGTGCATAACAACCACAACCATTACAAGTCCAAGCCGCGCCACCTGCCTAGATCTGTACAGCTTGTCGACCATATATCCGTTGCAGCCCTGTCAATCACAGATTTGTTCTTCAGATAG

Protein sequence

MAGIWLRKIWIRFLVDGVDTNPEIELRRSNESAMGRNEYLPIGNSRPQILYGSFVFRFARGSFVPKYVHESLLVSLRTTALFHSIRAALFCSIRAIHFCSLHYPDSIVHNNHNHYKSKPRHLPRSVQLVDHISVAALSITDLFFR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10006046.1HG10006046.1mRNA