HG10005996 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGATACTGAGATTGCGAGTAGTGGATGCTGATAGCAATGGAGATTTCGCCTCTCTCGAGCCGGAATCCGTCGCCAGTCGCAGCGCCTTAGGATGTTCTACAGCCGTTGTTGTGAAGAAGGTAAGTAGGTGTGCAGAGGCGCTCCACAGAAAAGTGAGATTTCCCGATTACTCTAATTGTCGTCGTCTGTTTTGCTTTTATAGGCGCTATTATGGCGCTTTCCATCTTTGGTGCAGGTGAGACCACAACGCGTTCTGCTTTGACTTTTCTGATCGCGCTTTCTGCCTCTGTCTAACGGTTTCTAGTGTAAAGGATCTCTCCAGCTGTCATGATTGGCTGCCCATGCGTTGATAATGTTCTCGCCGCATGGTTGCGCTGAGCTGCCCTGCACATAAAACAGTCAAGTGTCAATTCTTATCAATAATATCACATATTGTCTTTTTCATGCACTTACGCGTAGTATGAGAATATATTAAGGAATCATGCGTTGAAATGCCTTTCTTTTCACTAATCATTCATTTATTCTAATACAAATAAGTAAAATAACTTGTATTTCTACAAGTTATCAAGCGGCCCACGTCCTTTCCTAGGGGTCTCTTTTGAGGGAAAATGTTTGGAGTTGCCACTAACCATTTTGGGGTGTGATTGGTCACCCATTGTAAAAAGAAAACAAAAAAACGGTCTACTCTCAAGATAGATTCAGGGGGTCGTTGAGTGTAGGGAAGGTATTAGCACCCTAGACCCGTTTGAAAACGTTTTATTCTATTATCCAAAATTAAAATGAAACCCCATAAAAAATTGACTTAGTAATTCCCAGTAGAGGTGTTCCCTTACCGTCGACCTAACTATCTAAGCTTAAATAAAGTTATTATCTTAGCCAATTATATTTTAGAAATATTTGATAAAATTTAAATAAAAGGTAATATCTCACTAAAGTGTAAAAAGTAAGTTGAATTTCGTGAGGGACAATGTATGTGGATTTATGTTTGGATTCTCTTCTGAAATATTCTCCTAAAGCAATATTAACTTCGTCATGGAATTTATGAAACATCTAAAAGCGTTTGAAATTCATTTGAAAATTTAAAAATTTAAATTGAACTAAAGTTTTATTTTGGAAACCAAGTGATAACTAATTTGAAACTCATTTAGAAATTCCAACATAAAGCAGTTTTGAAATTCATTTGCAATTCAAATTTAAATCCAAATTAGGAAATGCCTACTAAATTCTATGCTTAAAGTTTATTTTGTGCATCTAAATTATAATATAATAAAATTTGTGTTTAAAGTTTGAAATCCAAGAAATTGGAAAAGAAATTTCAACCTGAAAAATAACATATTTGAGAGTAGTAAAGTTTTGATTAAAGACTTAAATTTTAATTTCAATCTATTAAGGCTAAAAAATCATGAAAATATGTTAAAAAAAAGCAACAATTTAAAATCTAATGTGTGGAGATTGAGAATCTAATGTTTATTAAAAACCAACTATAAAACAACCAAATAAAACATTTGAAAATATTTTTTAAAAAATGTAAGTCTTTTGTAAATATTAAGATTAGATAAAATAGAGAGAATAAATAAAATATAATAAGAAAGAGAATATAATAATAAATATAAAAAAATAACAATAGGTAAATAAATATGGTAGAAACAAAAAGAGAAGAAAAAAAAGTAAATAAATATAAAAGTACGTGGGTCTCACTATTTTTAAAATAAATAAATAAATAATATAATAAAAATTAATACGTGGGCCCACTATTATTTAATATAAACATACTATTACTACAAATTCCTCGTCGGTCGGGAGATTGTGTCGGAGGTTCGTCGCTAATCATCAGAGTACCACTCAAAGCTCGCCGGAGGGTGGCCATTTGGGTTTTCTCCCTATTTTTTTACATCCCGCTCTTTCTTTCCTTCTCAAATGTATACTTCCTCTTCTTTCTCTAATTTCTCAACTTTTCTCTACTTTCCTCAAATTTTCCAACTTTCCTCAAATTTTCCAACTTTTCTCTATTCCTTTTCATCCTTTATTTCACCTCTTTTTTTCATTCCTTCCTCAACCCTCATTCTTCATTGCATTTATAGGTCGAGAGATAGTAAAAGAAGATGATGATGAATAAGGAGGATTTTGGTTTTTTTTCTTTTAATTTACTTTTAAATTAATTTAAAAAACTAACTATTCTTTAAAATTTATTTTTTTAAAAAAATCAATTAGATTTATTAACCAACATTTTTTTAAATATTTGTTATTATTCCTTTTATTTTTTTTAAAAAATATTAAACTCTCAATTTTCATTAAATTTTCCAAATTCATTGATAAAAATTAAAAAAATTGTTTTAAATAAAAAATAATTAAACTATTTACTAATATAGCAAAAAATATACATTAAGATGAGTAAACTTTTTGCTATATTTGTAAATAATTTTATTATTTTATTATTTACGAAAAAAAACCCCTAAAAATGACCTAAATCAAACATAATTTAAAAATTCAACCGTACCAAATACGGTTTCTACACCTACAAAAAAATCACTTTCTTCTTCATTCTTCCACCCGTCTCCATCTCAGAGGAGCTTCTAGTAACCAGCATCCAAATTCACAGCCTCCTTCAGCTTAGCTGAACAGAAAGAAGCTCACTTCACTTCTGGGAGCCATGCTTGGAGGAGGCGGAAGAGGATTTCTCCCTCTTCCATGTTTCGGGTCCCGAAAGCCCGAATCCGAACCCGATCGCGACCCGGTCCTGCTCGTCACCGGCATTGGGGGCTCCATTATTCACGCCAAGAACAAGAAATTCTTCGGCTTACAGACCCGTGTATGGGTACGAATCTTCTTGTCCGACCTAATGTTTCGTGAGAAGCTCATTTCCCTCTACAATCCCGACACAGGTCATTCCTTACTCATTCCCCTTCCAATCTATTCCTAATTGTCTGTGGGTTTCTTCGCTAGGTTGTAGTTTTAGGCGTCTGGGTGCTGCTATGGAAGTGATGGAATCTTGATGGTGTTAGATTATTCCATGTGCACGTGTTTTGGGGCTTTTTTTTAGGGTCGGTGAAGTTTGAAAGCACTTTTTTCTTCTGTTTATAAAAAGGGAAAGTGTTTTTAATGGGTTTAATTTATTTTGTTGCATTTAATCATTTCCAAAAGTGATTCTATTCTTCATATTTTTTTTCCTTTCCTTCTTTTCTTAAAAGTGTTTTTAATCAAATTTTGTTCTGTTTAATTTATTTTGTTGCATTTAGTGGGTTTAATTTATTTTGTTGCATTTAATCATTACCAAAAGTGATTCTATTCTTCATATATTTTTTTCTTTCCTTCTTTTCTCAAAAGTGTTTTTAATCAAATTTTGTTTTGCACTTAAGTTTCTTTTTTTCCTTTTAGAATAATCTGTTAAATGTTTTTTTTTGAAAATTTTCACCGATAGAAAAAATGTCAAACTATTTACAGAAAATAGCAAAAAAAACATTGATAGATTCTAAGTCTATCAGAATCTATCAATGATAGACTTCCATCATTTCTATCACTGATAGACCTTGATAGACTTCTATCAACGTCTATCACAACTATCTAAAAATTTTGCTATTTTGTGTAAATAGTTTACCTTATTTTTCTATTTTAAAAAATTCTCCAATAATTTAATGCATAAAAATGTAAAAAAAGAATTTTTAGTTGTCTAAATAATTTCTTATTTAGCACCATTCTGTGTTCCAAGTCAAACTGCTGGCAGTAAAATTATGATTATCACCTCTTTTAGAGAAACATTTGAATTCTTAGGCAAATTTAAAAAACAAATCACTTTTTAAAAACAACTTTTGTTTTTATTTTTTTAAAACTTGGATTGGATTTTGAAAATATCTTTAGAAATAGATAACAAAACAAAGAAACTTATGTAAAAAAAGAGACAAAGTCTCAATATATGGCTAAGAGATTATGGGTTCAATCCATGGTGGCCACCTACTTAGGAATAAATTTCCTACGAGTTTCCTTGATACCCAAATGTTGTAGGGTTAGGTGGGTTGTCCCGTGAGATTAGTCGAGGTGCGCGTAAGCTGACCCGGACACTCACGGATATTAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAACTTATTGACTAAGGTCTGGCTAGTTCAATTAATAATAACTTATAGATTAACTTTTCTTAAAACTATTCCAAATTTGATTTGGCTAGTTGTACTCTCTATTAGATGGTTTGATTTAAGAGCTGAGAACATTATTAATTGAACGATAGAAGAGGATCCAAACAATTACAGAGACGATCAAATTTGGAATCTATATCCATCATGGAAGATTTAAGTTACATCTTCATTCAATATACTGATGGCTGAAGGGGGACAAGAGTCTTTGAAGGGTGACATTATGCAAGCTTTTTAAGAAAAGGAAGAATTAGAGAATTAACATAGAAAACATAAATTCATTCAAGCAGATGTCCAAGACTTTTCTTAAACCTAATTGGTTTAATTCTCTAAAGAAGCTAAATAAAAACAAGCTCATTCATTCTTCAATCATGCACATAACAGGAAAGGTTAAGCATCATTAGTGTTAGAATTGGGCTGAGTTCGAAATTGAAAGAGAAGAGAGAAAGCTGGAGTTGTGTGAAAATGTTTTGATTGATTGTATTTCCTGTACATGGTCTCATATATAAAGAACTACATATATAAGGAAAGGAATAAAAATCTCCTAAATTGTTACAGAATATTACAAGTATGGAAATAAATCAATAATCAAATTTCAACCATATTCCATGATTCAAGGAAGAAGATATACAGGCAATCGGTGCTAGAATCTTGGATTAATCAATCAATGCTGAAATCTTGGATCAATTATACAACAAACCTAACATCCCCCCCTCAAACGAGTGGCCACGAAGGTTCGCAAATATTGCTTCAGAGAGTGGTTTGGTTAAACAGTCAAGTTGGCGTGCTAGAACTTTATCACGAATAAAATGAACATCTAATTCAATGTGCTTTGTTCGTGAGTGGAAAACAGG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MILRLRVVDADSNGDFASLEPESVASRSALGCSTAVVVKKLNRKKLTSLLGAMLGGGGRGFLPLPCFGSRKPESEPDRDPVLLVTGIGGSIIHAKNKKFFGLQTRVWVRIFLSDLMFREKLISLYNPDTGYTECVDDNIEILVPGDDDGLYAIDILDPSAVVKCLHVDDVYHFHDMIDMLVGCGYKKGTTLFGFGYDFRQSNRIGKAMDGLKAKLETVSKASGGRKLVECPSIYEMLANLGFNWHAQPQIQVWQKSSVDGKTSVDLKSYGPTDSIALFEEALRNNEIKFHGKTIPLPFNFDILKWATGTRQVIDSARLPDGISFYNIYGTSIDTPFDVCYGTESLPIEDLSEICQTL Homology
BLAST of HG10005996 vs. NCBI nr
Match: XP_023546771.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 559.3 bits (1440), Expect = 2.4e-155 Identity = 283/384 (73.70%), Postives = 296/384 (77.08%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. NCBI nr
Match: XP_022973913.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 555.4 bits (1430), Expect = 3.5e-154 Identity = 280/377 (74.27%), Postives = 291/377 (77.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. NCBI nr
Match: XP_022933151.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 555.4 bits (1430), Expect = 3.5e-154 Identity = 280/380 (73.68%), Postives = 292/380 (76.84%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. NCBI nr
Match: XP_004138893.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 554.3 bits (1427), Expect = 7.7e-154 Identity = 276/378 (73.02%), Postives = 292/378 (77.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. NCBI nr
Match: KAG6598962.1 (Phospholipase A(1) LCAT3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 552.7 bits (1423), Expect = 2.2e-153 Identity = 281/384 (73.18%), Postives = 293/384 (76.30%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93V61 (Phospholipase A(1) LCAT3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LCAT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 381.3 bits (978), Expect = 1.2e-104 Identity = 198/375 (52.80%), Postives = 241/375 (64.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q71N54 (Lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LCAT4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 245.0 bits (624), Expect = 1.3e-63 Identity = 136/361 (37.67%), Postives = 200/361 (55.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8NCC3 (Phospholipase A2 group XV OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLA2G15 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 48.9 bits (115), Expect = 1.4e-04 Identity = 48/190 (25.26%), Postives = 86/190 (45.26%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VEB4 (Phospholipase A2 group XV OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pla2g15 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 47.0 bits (110), Expect = 5.2e-04 Identity = 37/142 (26.06%), Postives = 71/142 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q675A5 (Phospholipase A2 group XV OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Pla2g15 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 46.6 bits (109), Expect = 6.8e-04 Identity = 35/137 (25.55%), Postives = 66/137 (48.18%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IEK6 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472543 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 555.4 bits (1430), Expect = 1.7e-154 Identity = 280/377 (74.27%), Postives = 291/377 (77.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EYB8 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439951 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 555.4 bits (1430), Expect = 1.7e-154 Identity = 280/380 (73.68%), Postives = 292/380 (76.84%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LHR5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G093800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 554.3 bits (1427), Expect = 3.7e-154 Identity = 276/378 (73.02%), Postives = 292/378 (77.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3Q4 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485824 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 545.8 bits (1405), Expect = 1.3e-151 Identity = 275/378 (72.75%), Postives = 289/378 (76.46%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRS5 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014171 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 4.0e-140 Identity = 245/373 (65.68%), Postives = 277/373 (74.26%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. TAIR 10
Match: AT3G03310.1 (lecithin:cholesterol acyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 381.3 bits (978), Expect = 8.3e-106 Identity = 198/375 (52.80%), Postives = 241/375 (64.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. TAIR 10
Match: AT4G19860.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 245.0 bits (624), Expect = 9.3e-65 Identity = 136/361 (37.67%), Postives = 200/361 (55.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. TAIR 10
Match: AT3G03370.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DegP protease 7 (TAIR:AT3G03380.1); Has 55 Blast hits to 55 proteins in 11 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 54.7 bits (130), Expect = 1.8e-07 Identity = 37/96 (38.54%), Postives = 49/96 (51.04%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005996 vs. TAIR 10
Match: AT3G03370.2 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DegP protease 7 (TAIR:AT3G03380.1). ) HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 4.0e-07 Identity = 28/50 (56.00%), Postives = 35/50 (70.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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