HG10005903 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTAAGTCAGAAGCTTCCAATCCGCCTCCGCCACCCTATGCCAAAGTTCACCCCTCAAATGATCCCGATGTTGATCACAATTCATATTCTCTTGAGAAATTCAGACTTTACGAAACCAGAGCGGTAACCTCTGCACTCTCACTCTCTCTTTTTATTTAGTATTTTCTATCATTAGAAAGCACAAATGCAATTCCTTTCCCTGGTCGCCTTCAGGAAACTAGTTCAAAAATTATAATTGATTGCCTGAGTAGTGTGTCAAAACAATCATTTAATTTTTTTTAGGTTGTTTTTCTGTATTTCTCATAACCCTGACCTTTAATTTCAGTAGAACGAGTTAAAACATTAATTCTAACCACCATGAGAAGCTGATTGTTCCCCGATTTTAATTTTATTTTATTGCATCGACTTTTCCTAAGCAGAGGTATTATCTGATTGGGAGCGATCGCTACAAGAGATTCTTCCGAGTGTTGAAGATAGATCGGTCGGAACCATCGGAACTTAATATCAGTGAAGACCCGGTAGTGTATTCCCTGCAAGAAATCAGGAACCTCCGTCAGCGAATTGCTGAAGGGAATCGTGCTACAGGGGGGTTAAACCCGGTGACAAAGGCTTTCGGTATTGCAGGTTGATGTTGGTTCTGCTTTTATGTGCCAATTCATCCTCGAATCTCTTCGCACTTTCCTAATTTTTGTGATATGTTTGATGCTTGTAGGTTGCATTAAATGTTTGGAGTCATATTATTTGATTTTGGTTACTAAGCGTCGGCAAATTGGATGTATATGCGGTCATGCAATATATGGTATAGATGAAACCCAATTGATTACAATTCCACACGTCTCAGTTCAGACTGATGTAGCACATTCTAAAACTGAGGTGAGGTAAGTCTAAGCTGCTCTTGGTACTTTTCTCATACCGTCTCAAGCATGTAACCTTTTCTTTATTGTGACTGAAGTCTAAGTGTTCATAGTTAAATAATTCACTAATTAGGCCCTACAAAATTCAATCTGCATTTACAAATGTAACACTCGAGTTTAGGAAGGGTACATGAATGGAATGTGATCACATCCAAATGAGATGGATCTTGAGGATGTGAAAGTATGGTTAATAAAAGGTTTAAAAGAATTGAAAGTTATTACCTATACCAATGAGGTGCACCTTTCTTTTCGATGACTCAATCATAGGAACATCACTGTAAAGTGTGCTTAGCTTGGAGAAATTCTACGTTGGGTGACCTCCTGGGAATTTTCTTAGGAAGTATGTGAGTGAGAACAAAGCAGGTTAAAAGGACCCATGTTGGTTTGTAGGGATTCCCTCTTGGAAGTACTTTAAGACAAGTCCATGTGGCCAGATTGCAGAGGATGTAGGGGAATGTCGGGGCCATTAGGTGTCAAATCTGGATTTTGGACCCCGGGCATGGGGCGTTACAACAAAAATAAATTGAACCTCCAAGGTGGATTGGTTTTAAAAAGTTTGGAGCATGACGTGTATTTAGATGTTATTTTGGTTGAGTTTGGGGGGTGAAAGAATGGTCAAGTCTTTTAGGAAGTTAGGTCAAGTCTTCCAGGAAGTTTCTCTCTCCCCTCTCTTCCCCTCTTTCCTGAAAAAATTTCTCCTCTCAAATTGAGAAGTCCGTGAGGATCCTTATCCATTCCTTAATCCCTTTTTACTCGCCAGTGAGTTTTAGAACCATTTGCCTTATCTGTTTGTTGTTTCTTCAATTTGATTCAAGTTTGGTTGTTCTAAAAGTTATGTCTCAGTTCTCTCAATGGAAGTTAGGAGTTGTTGTATTCGTGATACTTATTTTTGTATTTGGCATGAAGTGAATGGTTTTTTTTTAAGAAGACACGAACTACAAATAAAAGATTTGCCTTTTTATCTCCCTTCTTTGTTGGTTTGAAGATGGTTTGGTGGAGCTTTTACATTCTTCGGTTCAGTCCTTCTAGAAGAAAGATAGAGATAATCTTGGTATGATTAGGTTATTGAAATTGCTCACTTTGTTTGGATGGTTCTTTGAATGTGTTGTGTGGCCTAGCACTGGTGGAAGGTAGTTGATCCAAGTTCCTGTTGTTTTTGATAAAAAAAAGGTTGGTTGATATTTTGAGAAATGATAAGAGACTTTCTCAATAAGTTTGAAGGGATGAAGAAGTTGAAGTTCAATCCTTACTCTTGTTTGGTGGAAAATGAATGGTCTTCTGAGATTTTGCAGAAAAGTAATTAAAAATTGAGAAGCTTTGCAGATGTGGTTTGCCAAAATCCTTAGCCAGGGTAGATCAATGATCTTGTGGATGAGTCTGTCCGTGTTCCTATTTTTAAGAAGTCATCTTTCTGTGTTTGATAAGAGAGTGAGGTTCTAGATTTGAAGCTTGATTCCATTCTTATTGTTAATAGAATGCTCCCCCATTATACTTGGAAGGAGGTTAAATCCACTTTGGAAGTTTATTCCGTCTCTTATATCGAAAGCCAATCTCCATAACTCACAATGAACTTTGGATGAGAATGTGCTTTGTAAAACCAATTTTCAACCTTCAAATGCAAGGATCCAATTTCTCACCATTTTCCATCGAAATCTTATCAGCAAAACTATCATCAAGTTTTAATAATGCCTTATCAGCCATGAAAGGGTTGATTAGAGCTTTAGACTGAAAATAGTCTTCCAAAGCAAGACGAATATCCTTCCAAGAATAGTAGGCAAACAATCGAGAAACAACAAACAGATTGTTGAAGTTCATTGTCAACACTTCCTTATCTTTTCTAACTGAATAAGAGGAACCAGAGTCGGACAGTTGAGAAACGACCTGAAAGTTTCTAGCCACTTTCAAATCACCTGAGAGAGCTAGAGCTAAAGGCTCACCAAAGTCAGGCTCACCGACACCAAACTGAGGGGAAGACAACAAACAAGAGTCCACTTTGCCCAAAAAATCTCTAATCATTTCCCAGAAAACCATCCAACCTTTCTTCAAAAAACCAGCCGGAACATGTAGATTTTTCGTACCACCAATAGGCAGCCAAGTAGCACATCCGGAAATCTTTCATTGGACGATTTGAATTTAGCCAAACGAATGAATCTAGAGTCATCCCGATCTTTTTTGGAGAAGAACACATGAACTGGATTTTGTAATAACTCCACCAAAGATAGTTCAATTCAACGCAAATGAGAGATTGAAAGGTAAATCTTTTGATTATTACTTGAATTCTCAATAGAAAACATGTTCCTCTTACACTTTATCAAAAAATAAGTGTTCCGAATACAATAACTCATCGCCTCCAAAGTGTTCAAAGACATCTTAAGTGGAGAAGAAACACTACGGATACCAAACTGGTGACTGGAGACACAGCCGAAGAGGCTGAAAGGGTTGAGGTAAAAATTGAGGATGAATGGTGGAGATGTCTAAGATGGATACAAGGGTTTGAAAGATGAACAGAGGTAGGGTGAGGTATCGGGTGATTAGGATTTTCAAAGGAGGTTTTGGGGAGGGAGAGAAGTGGCTAGAGAGGGTGAAGAACGGAAACGCGGCTAGGATTTTGGGAAGAGAGGAGAGAAGATATGAGGAGAGAGAAAAATGGGGTTACCATACAACGATGGCCAAGGGGGAGGTCGAGGATGATCGACGGAGGTCAGTGGTCGAAGATATCGTTGGTCAGAGAAGAAACAGAGGTTGGGGGACGAATGCAAAAAGGGTGGAAGAGAGGGAGGATTCGAGGAGAGAGAGAAATTTCGTTGAAAGGACCACCTAGAAGAGGCGGTCGAGGGTGGCGGTGGATCGATGGTGGTCGGAGTTGGCGATGCTCAGCGATGGGGCCGGTGGTGATCAACGAAGTCTGAGGCAAGAGGCGAAGGGTTGAAGACAGAATGGCTAGGATGGGGAGAGAGAGAGGTTGAAGACAAGAAGAAACCTGCTTTTTCGGATAACAGCTCCATTCTCATTTAGAATTCATTAGAAGTTATGGTGGTTGGATCCGTGTTCAGAATTTACCATTGATTTATTGGAAGAAATCAGTCTTTCAAGCAATAGGAAGGCATTTTGGAGGTTCGGTAAGTATTTCTACTCAAATGTTCAATTGTTTAAATTGTTCTTCAGCAATTATTGAGGTGGAAAAGAATATTTGTGGATATGTCCAGCAGAAATTGTGATTAAAAGATTCAAATTTTAGAGATTTCTCTCTTAGATATGGTGATATTGTGTCTTTGGAAGAACCTAGTATGAAGAAATTAGGGCATGGTGCATTATTTGCAAGGGACTTCTCAAATTCCATTGATTGGATAGAATTCAAAAAGTCATGATTGATGAAGAATTTTCAGTGGAAATTGTTGATTATACGCCAACTGTTAATGGAATGCCTCCATGTGAAAAATTTGAAATTCCAAAGGAAATTCCATACATTCCTATGTTGCATGATCATTGTAGTAATGTGGTGGTTGGGAAAGACAAGTTTGACTTTAATGCTATTGATCTGGTGGGTTCTTTTAATCTAGGCTCTATAGACACTCAATTAATCAGGGAAATCTCTATAAGTATTGAAGATGTAGCTCCTAAAGAAGTTCAATAGATTTTGGTGGTTTTGCCTCTCTCTTCCTAATTTAATGAGGAACCAAATTTACAGATTGCAGATGGACCTCAGTCATGGTTTAATGTTTCTCTCTCTCCTACATTTAAGGAAGCTCCATCAACCAAGTCATTGGTTTTGCCTCTCTCTTCCCAATTTAATGAAGAAGGATCGAATACCTCTTCCCAATTTAATGAGGAATCAAATTTACAAATTGCAAATGGACCTCAGTCACGGTATAATGATTCTCTCTCTCCTACACTTAAGGAAGCTCCATCAACCAAGTTAGTTTTTTATTTTTTTATTTTTTATCTTCTTCCTGGGAAGCTGAAAAGTCAGATCATCATGCCACTGTCGAGTCAGAAGGGGCTTCCTTGAAGCTTCATTGCCTTTGCTTTCGCTGGATCTGAAAAGACAACCGTAGAGAAGAGATTCTTCTGGATTTT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Homology
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BLAST of HG10005903 vs. NCBI nr
Match: XP_031736922.1 (phosphoinositide phosphatase SAC1 isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN63262.2 hypothetical protein Csa_021813 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1628.2 bits (4215), Expect = 0.0e+00 Identity = 859/1174 (73.17%), Postives = 878/1174 (74.79%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. NCBI nr
Match: XP_016899414.1 (PREDICTED: phosphoinositide phosphatase SAC1 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1627.1 bits (4212), Expect = 0.0e+00 Identity = 865/1190 (72.69%), Postives = 879/1190 (73.87%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. NCBI nr
Match: XP_008441141.1 (PREDICTED: phosphoinositide phosphatase SAC1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1626.7 bits (4211), Expect = 0.0e+00 Identity = 866/1194 (72.53%), Postives = 879/1194 (73.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. NCBI nr
Match: XP_038884590.1 (phosphatidylinositol-3-phosphatase SAC1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1625.5 bits (4208), Expect = 0.0e+00 Identity = 862/1174 (73.42%), Postives = 877/1174 (74.70%), Query Frame = 0
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Match: Q7XZU3 (Phosphatidylinositol-3-phosphatase SAC1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SAC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1246.1 bits (3223), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/1161 (56.85%), Postives = 772/1161 (66.49%), Query Frame = 0
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BLAST of HG10005903 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XZU2 (Phosphoinositide phosphatase SAC3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SAC3 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 558.1 bits (1437), Expect = 2.3e-157 Identity = 319/815 (39.14%), Postives = 439/815 (53.87%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XZU1 (Phosphoinositide phosphatase SAC4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SAC4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 555.8 bits (1431), Expect = 1.1e-156 Identity = 358/1015 (35.27%), Postives = 498/1015 (49.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RW97 (Phosphoinositide phosphatase SAC5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SAC5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 493.8 bits (1270), Expect = 5.3e-138 Identity = 294/803 (36.61%), Postives = 408/803 (50.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B2R9 (phosphoinositide phosphatase SAC1 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1638.6 bits (4242), Expect = 0.0e+00 Identity = 866/1174 (73.76%), Postives = 879/1174 (74.87%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DTU9 (phosphoinositide phosphatase SAC1 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1627.1 bits (4212), Expect = 0.0e+00 Identity = 865/1190 (72.69%), Postives = 879/1190 (73.87%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3H2 (phosphoinositide phosphatase SAC1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1626.7 bits (4211), Expect = 0.0e+00 Identity = 866/1194 (72.53%), Postives = 879/1194 (73.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DHN8 (phosphoinositide phosphatase SAC1 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020157 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1619.0 bits (4191), Expect = 0.0e+00 Identity = 856/1174 (72.91%), Postives = 873/1174 (74.36%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JUR6 (phosphoinositide phosphatase SAC1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111489082 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1617.1 bits (4186), Expect = 0.0e+00 Identity = 854/1174 (72.74%), Postives = 871/1174 (74.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. TAIR 10
Match: AT1G22620.1 (Phosphoinositide phosphatase family protein ) HSP 1 Score: 1246.1 bits (3223), Expect = 0.0e+00 Identity = 660/1161 (56.85%), Postives = 772/1161 (66.49%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. TAIR 10
Match: AT3G14205.1 (Phosphoinositide phosphatase family protein ) HSP 1 Score: 608.6 bits (1568), Expect = 1.0e-173 Identity = 355/871 (40.76%), Postives = 475/871 (54.54%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. TAIR 10
Match: AT3G43220.1 (Phosphoinositide phosphatase family protein ) HSP 1 Score: 558.1 bits (1437), Expect = 1.6e-158 Identity = 319/815 (39.14%), Postives = 439/815 (53.87%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. TAIR 10
Match: AT3G43220.2 (Phosphoinositide phosphatase family protein ) HSP 1 Score: 558.1 bits (1437), Expect = 1.6e-158 Identity = 319/815 (39.14%), Postives = 439/815 (53.87%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005903 vs. TAIR 10
Match: AT5G20840.1 (Phosphoinositide phosphatase family protein ) HSP 1 Score: 555.8 bits (1431), Expect = 8.0e-158 Identity = 358/1015 (35.27%), Postives = 498/1015 (49.06%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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