HG10005889 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10005889
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr07: 7734987 .. 7739271 (+)
RNA-Seq ExpressionHG10005889
SyntenyHG10005889
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGGAAGAAAAAGAGCCAAGTTGCACAAAAACAGGGCAGCGTCGGCACTGCGGTGCTCCACAGCGCTGCACCTCGATGCTATTCATAGAAGGGGGCCTTTGGAGTGTTGTTGCAGTGCTGCGGCAATGGGGAAAACATTGTGGCGCTACGATGTTTGACGGAAGACCTGCTACGCGGGTTAAAGACAGCGTCGCGGCGCTGTCCTGTAGCGTCGTGCACACTAGTGTTATTTTAGGAAAGAAAACCTAGTTTTGGAAGATTTCTTATATAAATATTCTAGGGTTGAAAGTTTGCACACTACAAAATTTTTTTAACCTAAAATAGAGGGATAGATTTAGAGGTTTATTAGGAGGTCGTTCATGATCCTAGGGTGAAAATTAAGGTGTTTCTGACGTGTTCGATTGATGGGATTCTTCATGATAATAGTGTTTCCTCTTTCTTTATTCTCTTTACTTTTTCATGGTTGTTGCAATTTATGAGAGTATGTTTGTAGCAACAATGAGTGGTTAAACGTTATAGTTCTAGGATGTTGATGAACTTATTTATGAATGTAAGTTAATGCAGATTATTTTTTATGGATGTTATGTTAAATTAAATGTTCAATTAGAAAGATTGTATGTTTAATTGGATCTATAATATTGGATTGTTATTAATCTATCATGCAAATAGTTAGGTTATAATGAAAGTTGATCATGACTATTCTTAATGTCACACTTCTTAATTTGGTTTCAAGTGATTACCAATCAATTATGTTACATGAGAAAAAATTGTTATTGAAAGATAATAATGCGAAAAATAGTTTCTAGACTTAAACATATAATTAACATAATAATCCATAGGAACGTAACCTTCACATGACTTAATGATGTAATTAAGAAAATCAACACCCTTGAACCCTTTTTATCTCTTGAATTTTGAATTTTCTTTTTACTTTGCTTTTATTTACTTTCAAAAATAAAATATAATCATCATAAGTCTAATCCGCATATAAAAGCAACACAATTCTTCCATAACTAAGCATAAATCCGTAAATTAGATCTCTAGAGGACGATACTCGGCCAATCGTATTACTATAACTTGTCACGTGCACTTGGGTTAACACCCAGATTTTGGCCATCACACTGTCGTTATTCAGCGCTGAAAAAGCCTGATAAACGTTTAGAGCACCATTTTCGGCCACCCTTCAACAACTTTGGGCCTATATAAAGGATGAGTAGCCTCCTTCTTCAACAATCAGCAATCCTAAGGAAAAATCTCACCATTCCATCTAGAATTACTTCAAGAACGAGAGTTCCTCTGAAGAACCTTAGGTCTAGGTCATCCCTATCCCGTGAGAACGTGTGTAGAGAAAGGATATATCCTTGAGAAAGGTGAATTCATCTTAGAGGCTAGAGACTATGAAATTGCTTCAAAGAGTCATCTTTCTTTATTTTTTCAGCATTACTTTAGTTTTCTTTTTGTACTTTTCATTTCTTATTTCTTTATTATTTGAAAGTTGATATTGTAACCATATTCATTCTTTATTAGTTATGAGCTAAATTTCTAAGGGATTCAGTGATGTGGTTACCTTAAGATTTTATGGCTTGAGAAAATGCTAACTCATCATGTCATTTTGATTCTTACATTTCCTTTGTTGAGTTAAATATTAACTTGTTAAGTTAAATTGACCACTTAATTTAACATATTAGTGGAGTCTTAATGCTGAGAAGGTAAAAAATGATTTCACAGAGGAATATGAGACTAAAAGCCTAGAGATAGGATTGTCATTTAGCCTTAGAAATAAGATACACTATAGGATGTAGAAATTGCATGAAAATAATCTAAGATTTAGCTACTCAGAGAGATATAGGATTAGCTATTTAGGCTCCTAAAGGAACTTGATACAAGACCGAATAAGAGAAGTTTTATGTTTATGTTGAGTCACTATCAACCTGATGCAGCCGCATAGCTCAAGACATAAACCTCTTTTGGTTGAAACTAGGCTGTAATTCTTGTTTATCAACTATTGTTTACCGTTTTTACTCCTTCTTTGAAAACAATCATCACTCATTTAACTAGTTATGGTTGGTTTCATTGTTTGCATTGTTTTACAAAATCTAAATAAATCTAGTCTCGCGGGATACGACACTTGAAATACTCTCAAGTTTATTACTTATTGACAGTGTATGCTTGTACTAAGATCGCAATCAAATTACAATTTTATTATTCATACACATCTGGTCGATTAGATACAGTTTTTCCTAATCAAGTTTGGCTACATTTATTTATATATTATATTTTATTATTGTTTTAATTATTCAGTGGACTTATGCTTACAAAATTGTGCATATTGTTTGGGAGCCATACAATAATCTAATCCAATTTTTTCCAAAATATTGTGTTGGCTTTTTGGCCCTTAATCTCAAATTAATTAATTAATTTTAATTAATGAATTAATTAATGTTTTGATGATAACAAACCTGATTTTGTTTACTAACAATTTTATTATTTTGAATAGCCCATAGCGTAGAGCTCGGAACAATGATTCCGATGCCTCTTGAATCACCCTAATCGGAGTTCAAACGAAGAAGTTATCGTCGAAATAAAGTTAACGAAAAAATACTGAGGTGGTGACGTGGCCAAATTAATCATCAAATTAGACTAATTAAGGAGTGCCACTTGGAGCCATAGAGGGAGTGACACAAGGGGCTTTATTTTATAATTGGTGGATTTTAATAAAACTAAAAGATATTGATTTTGAAAATAATAAAAAAATGATTTTAAAAAAGAAATGAATTTAATATTATATATATGTATGAAAACTAACGATGTGTCTAACGACTAGTTGATTTTAAAATTAAAAAGAAAATTACTTTTTTACTTTTAATCTCAACCACTCAATTTGCTTTTTACACAATCCAATGGATCAAAATCAAATTCAATTTTTTAGCCCACTTTCCTCTCTTTTTAAACTTCATCTTCCCCAAAATTATTTTAACTTTTTCACATTTTTCAATTCTTAAAATTAGTAAAAAGGCCACCATTGTTGCTCTCTCTCCAAGCTTCCAATTTTTGTTCTTTTCATCTTATTCTTGAGAGAATTTTCTATTGTATTGTGAGAATCAAAGTGTGTGAGCTCAAATTTGTATACCCACTCTTTTAGAGAGTTTTATTGAGTGATTTAAAGCTTTCAACAACATTATAACGGTTTGATCCTAACTCGTGGAAAGGATCGGGTTAGCTCTTGAACCCGAAAAAGGAGCAAGGTAACGGTTCGGCTCTGATCCGTGGAAAGAGTCAAAAAGAGATTTTTAATCGAAATCCCAAGAGGCACTTGGGAAAGTGGATGTAGGTCGAGTTTGACCGAACCACTATAAAAATTACGGTGTCTTCTTCTCTAACTCTTTCCTAATTATTTTTGCATTTAATTTTAATTGCATATTTTTGTTGGTTGATATTGATTGAGTTTATTGTTACATACTTTTTATCAATCTTGTTATTTGGCATCATTTAGGGTTTTTATTAATTTATTTTAAAAAGTATTTAATTAGTTTAAATTGAGCATATTTCTTAAAAAGTTTAATTAAACTCTATTCACCCCCCTCTAGGGTTGCCACACCGGTCCAACATATTGTAGTTATGGGTTTACATTATGGTCAACTAGAATTTCACTCATATGCTTCTTTATAGTGGATTGACATTATCCAAATCGTGTGATGTGACAATTTGAGTGGGTGCAACCAATTCCTATACTATGAAATACGAACACAAAGCTACACTCACATGATCTTCGAGGAAGGCATGAACGAGAGATTAGGTCAGTTATTTGACTCCACAAGTAACAACTTGAGATAATTGAGAAAATTTTCTTATTTATGGAAACATAATCAATAGAGGAGTAAATGTTGAGCCTAGATATAATGAATGATATTAATACTATTAGTAGATGATATATCACAAAGGTGAGAGCTTCATATCATCGTTTGATGAAAGTTTATTGTTTAATTTTTTTAAACTTAATATTTAGACATAAACATTAACTTGTTCATATTTTTTTTCATTCTTTATTTTAGATGAATTCGCCAAACTTAATGATGTCCGAGAGAATCTCTTTAGGATCTCACATCCATATATTGAGTTCGATATTACGATGAAAATGATCCAATTCAAGATTAAGGTGATCATGTTGGACTTCAAGATGTTCAAGTTCAAGAACTACATGAACATGAAGCTCACCAATTCCAGTCGAACTATTATTTACAGAACAATTTACCCTAGGGTTAATGATGCAAAGTCCTATCTTTGA

mRNA sequence

ATGGAAGAAAAAGAGCCAAGTTGCACAAAAACAGGGCAGCGTCGGCACTGCGGTGCTCCACAGCGCTGCACCTCGATGCTATTCATAGAAGGGGGCCTTTGGAGTGTTGTTGCAGTGCTGCGGCAATGGGGAAAACATTGTGGCGCTACGATGTTTGACGGAAGACCTGCTACGCGGGTTAAAGACAGCGTCGCGGCGCTGTCCTGTAGCGTCGTGCACACTAATGAATTCGCCAAACTTAATGATGTCCGAGAGAATCTCTTTAGGATCTCACATCCATATATTGAGTTCGATATTACGATGAAAATGATCCAATTCAAGATTAAGGTGATCATGTTGGACTTCAAGATGTTCAAGTTCAAGAACTACATGAACATGAAGCTCACCAATTCCAGTCGAACTATTATTTACAGAACAATTTACCCTAGGGTTAATGATGCAAAGTCCTATCTTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAGAAAAAGAGCCAAGTTGCACAAAAACAGGGCAGCGTCGGCACTGCGGTGCTCCACAGCGCTGCACCTCGATGCTATTCATAGAAGGGGGCCTTTGGAGTGTTGTTGCAGTGCTGCGGCAATGGGGAAAACATTGTGGCGCTACGATGTTTGACGGAAGACCTGCTACGCGGGTTAAAGACAGCGTCGCGGCGCTGTCCTGTAGCGTCGTGCACACTAATGAATTCGCCAAACTTAATGATGTCCGAGAGAATCTCTTTAGGATCTCACATCCATATATTGAGTTCGATATTACGATGAAAATGATCCAATTCAAGATTAAGGTGATCATGTTGGACTTCAAGATGTTCAAGTTCAAGAACTACATGAACATGAAGCTCACCAATTCCAGTCGAACTATTATTTACAGAACAATTTACCCTAGGGTTAATGATGCAAAGTCCTATCTTTGA

Protein sequence

MEEKEPSCTKTGQRRHCGAPQRCTSMLFIEGGLWSVVAVLRQWGKHCGATMFDGRPATRVKDSVAALSCSVVHTNEFAKLNDVRENLFRISHPYIEFDITMKMIQFKIKVIMLDFKMFKFKNYMNMKLTNSSRTIIYRTIYPRVNDAKSYL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10005889.1HG10005889.1mRNA