HG10005819 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGACGGGCTTCAATGATTACAAATTGCGGTGCGAGCTCACTGCCCATGAAGACGACGTAGGAGATGAATTACTCTTTTTTCTCTTTGACCTGTTAATTGCTTTCTTAGTTGCAACAATTTCAAACTCCAGCATTTTTCTTGCACAATCGTCTCTTAGCAATGTCAATGTTATTTGAATTGCGCGTTTTTTTGTAGGTAGAGTCTGACCTTAATCTTACTGAACTTGATCATTAGGTTCGTGGAATTTGTGTGTGCGGAAATGAGGGGATTGCCACTTCGTCGAGGGACAAAACTGTGAGGTTTTGGAATTTGGATGGACGGAAGTATGTAGAATCGAAGATCCTGCTGGGGCATACGAGTTTTGTGGGTCCTTTGGCTTGGATTTCGCCGGATGAGGAGTACCCAGAGGGTGGAATTGTGTCTGGTGGAATGGATACACTTGTCATTGTTTGGGATTTGAGGACGGGTGAGAAGGTGCAGACGCTTAAGGGCCATCAGCAGCAAGTCACTGGCATTACGTTGGATAATGGTGATATTGTGTCATCCTCTGTTGACTGGTAATTTAATTCCCTAGTTGTGATTTTTCACTGGGTTTGGAAGTAGAATTTTCAAGGTGTTGCAAAATGTATGCATTATGAGATTTGGTTGTTTTTTTCAATCGTTTTGGTGAGATCTATATCAACATACTGAGTCTGAAATGTCGAGGTTCTTGCATGATTTACTTGAAAGGATTAGCTTCTAATTTTGATTTTCACCAAAATTGAAGCTGATTTTCCATTAGTGCACAAATCTTTTTGGCTTACTAGGTTTTATGCTTAATGTTTGTGGCCTTTTACTTACTTTATACAAGACAAAACGTGTGATATTGGCTTCTTTACTCCAGTACTTTAAGGAGGTGGAGAAGTGGCCAAGTGGTGGAGTTTTGGGGTGCTCATAATGCTGCAATTCAATCAGTTATAAAGCTTCCATCAGGGGAGCTGGTCACAGGTACTACTTCAAATAGGAACTGGAGTTTGTTTGAGTTATAATTTAGATAAGCTTTGCCCCATTCTCCCTTTGTATATCTTGGTTGAAAAGAGACTAATGCTCGGACAATGGCAGTGCTTTCATTATGATTGAGCATTGATCGAGCAACATTTATGTTATGTTTCAAACCATATGATATTGGTGCAATCTACATTTTGACATTATTGGACTACCGTTTAGCATTTACCTCACTTATCATCATAGTTATTATTTGTTTAAAATTGATCTCTGTTAATCATTTTGATATATATTTTAATTTGTCACAAAGATCCACAAGGAAAATAATTTAGATGGCCTTTAAAGAGAGAACATCTGAGGAATTCTTGGAATGAGTTAGTACTCTCCATCCAAGAGAAGAGGAGCGAGAAGGTGACCATTCTCACCTTTCCTATTTGATTGGTTCGTGTTAGGTCATTTTGTTTCTTGGATCATCCAAGATAAGAACAGAGACAAATGCTTCATCTTAGACATTAAGGATCTTGGTAGATGGGTGTTTGAACTCTGAGATCGGTGGAGAAAAATATTCTTCTATTCTTTTCTTTATAAGGGAATATTGTAATGAACCAAAGGTTAGAAAGAAAAGTTTTTGCCAAAAAGAGAAGAGAAGAGAGGACTCCCCATTGCCTCAACTATGTTCTTCATTGATTCTGTTACAGAGAAATTTTTTTTATGCAAGAGGGCTCTTTTGTGTGTTTACTTAAATTAGAACTGTCGAAAATTATTGTATTTGTCATTTGTGCTTAGATTCTTCCATATGAAATTCTTTTAATACAAGTTATTTACTTTGTTATTCTTATGTATGGCCTGAGCACATTCAAAAGTATTTGACTTTGTCTTAGGCTCTGACATATGATATTGGGTCTGTTCTTGTCTAGGTTCAAGTGATGCAACTTTGAAGCTTTGGAGAGGGAAATCATGTTTAAAGACACTTTTAGGACATACAGGTCTACTCCCTCCATCCCCCTCATGGGTACATGTGTATGCATTTGATTTTTACGTTGCAAGTGGTAGATTTTTTATCTTATATCATTGGGAGCGATGGTACCTTCACTTTTTTTTTCTTCTGCATATGATACATTATTTTTATGGTGTTCTTATCTTGAGTAAATTGATGAAATTTGATTTTTCCATATAAGATGTAACGAATGCCTCTTTACGTCAGGATTTTGGATTTTAAGGTTAGAGGTTTAACTGCAGGAATAATGTTATAAGGATTGCCATGGGGTATTTGATCTGATGTTTTTTTTACTGGGAAAGAGAGTCTGAGGTTTTTCACGACCAAAGATTGCTCTAATATATGTGTTTATTTTTTAACCTTGATTTTTTTTAGCTGCCTCCACCACTCTCAGTTATAACCTTTGATAAATTTCATGACATTTGTCATCCACCTATAATTGACATATATTCCTTCTTATTTCATGGAGCATTGATTTGTTAATTTATCTTTAAGTCACTGCTTTTGCATTAGGACATGGAGCTCAACTTGAAAGATCAATTGTAGAAGTCATGAATTTTTGGCTAAGCAATCCTGCTGTCACAACCTACCTTTCTTAAGTTCTATACTAAATCATGATCTCCGAAGTCTTTATAATATTTTAGGAGTCTTAAAGGATTGTGCACAAAACTATCGAGTATATTTTGTTTTTCTGTTTGGCCCATGATTTATTTGTATCGATTGATATATTTATACCATTCTCGTTTATACTTCTGTTAGCTGGAAAAGTTGATCATGCAAGTAACATGACCTTATGTGTTTTGTTTACATTCTGTAGATACCGTCCGAAGTTTATCAGTGATGTCCGATCTGGGAGTGCTCTCTGCATCTCACGATGGGTAAACCTATACCTGTTTATCAGTGTATATTGTTATTCTTCTTTGTATTTTTATTCTTTTTTTTTTAAGGTTATAATTCTTTTTAAATGAAGAACTTGCACCTATTTATTAATAGATTGAATAAATTAAAATCCATCAGATTATGCTCAAATAAACATGCTTAAAAGCTGCATGTTTCAAAGATACAATATATTCTCTTCTTTTCCTTGTCAAAATAGTATTTTCAGTCAAATGAGTTATGAAATTGAATTTAAGTTAAATTACCATTTTGGTCCCTTCCATGAGGACTTGTTTCATTTTAGTTCCTATAACTTTCAATAAGTCCTAAAATTAGTCGTCATCTCTAGTTTGAAGTTATTTTTATTTGACATTGACAAAAATATGATAAACAATTCTTTTTTCGAGAAAAGACACCTGGTGAATATGTTTATCAAATTTATAGAAGAGAAATACAGGGACTAATTTTTTTTTTTAGCAAAAGCTAATCATAGATTAACAGTTGGGGACTAATTTTAAGGAAATTAAACAATCTCTCTCAATTCTATCCCTCTAGACTGAAAATTGAGGCTAAATGATAGGGTTCTGACCAAGCATACATTTATACGAAGTTTATTCCCTCAAAGCTTATAAAATAGCACGCCAGTTGACATTAAAAATAGGTTGAGTTGTCGACTTTATGATAAAAAGGACTAGTTGGGAAAAGTTTCTTAACCCAACCCATGAACCCCCAGATAAATTTATGTTCCAAGTTGGTTAAGGAGTTACTGAAATAATTCCTTCGAGGTAGTTTGCGTTTGATTATCACTCACATTGAGGAATACAAACGTACATGGCCAATCCAAAATGTCATGTGAGCTAATAATACCACCTTTAGGAACTAGTTTCGTTCTTTCAGAACAAGAATCATAACTTTTCATGGATATGTTAAAAGTTACAAAGTAATTCCAACCTTCAAAAAAACTAAGTATTTAAACAAAAACAACTCTCCCACATACCTTCGTAGAAATTTTTGGAATTAGTTTCACAACAACCTTATATTTTATTTTTGATTGAATACAAGAAATATATTTATGTTTATATACTGAGGAAGCAGGGCTATCCAAGGTAGCTTCTATCTAGTCTAGGATATATTTATGTTTATCGAATGAGAAGAGTTTGGCATCCTAAGGATCCTGAGAAGACGTTAGTCTTTGCTCATTGGGAGATTGCTAATAATGATATATTGTGAAGAATAATGTTGAGAGGAACAGTAGGATCTTGGATAATGTGGAGGATAGACAATCAGCTTAGTATAAAGCCCATTTTCTGGCTTCTTTGGGGTTCTTAAATGTGAAATTTCAGACTATTCCTTCAATTTAATTTTTGTTACCTCTATATAAGTTAGAAAGGACCATTCCTTTGTTCAAACAATTCATTATCTCATTAATTTTGTGGATCCAATGAGAGAAAAAAGAAAAAAGAAGAGAAAAAAAAAAAAGAAAGGATAATTTTTTTGTTCTTTTATTTTTGGATGCGTTATTTCACTGGTATTTTAATAGGAAAATTTTCTCTTTGTTTTATATTCTTGAATCATATCAAATAATTCCACTTCTTTAGCAGGAAAGAAATAGAGCAATAAATTCTATAGGTTGTTGATGAAATATTAAATGTCCATAAAATGAACGATTTCTATTGCCTTTTCTGAATCTGTAGAATTTCATTTCACATGGGAGGAACATCTGTTGTTGAATGAATTTAGGATATTGAATTTGATATTCTTTTCCATTCCGGCAGTTCCATTAGGTTATGGGCACTAAGTGGTGAAACATTGATGGAGATGGTTGGTCATACTTCCATTGTGTATTCAGTGGATTCACATGCTTCCGGACTCATTGTTAGTGGGAGTGAAGATTGTTCAGCAAAGATATGGAAAGGTTACTACTTCTATCTATAGGAGTTTGTTAGTTTTTTTTTTCCTTTTGTAATTTTTCGTTTCATTTTTTTATAAAAAAAGTTAAAAATACAAGGGGATAAGAAAAATTCAACAAAATGATCCCAGTAAGCTACAAAAAAGGGACTCCAATCTAAAAGAATAAAATCTAATTGATAATTCTTAGCCACTGAGCTTCGTTTAAGACCCTCCACTGTGTCC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METGFNDYKLRCELTAHEDDVRGICVCGNEGIATSSRDKTVRFWNLDGRKYVESKILLGHTSFVGPLAWISPDEEYPEGGIVSGGMDTLVIVWDLRTGEKVQTLKGHQQQVTGITLDNGDIVSSSVDCTLRRWRSGQVVEFWGAHNAAIQSVIKLPSGELVTGSSDATLKLWRGKSCLKTLLGHTDTVRSLSVMSDLGVLSASHDGSIRLWALSGETLMEMVGHTSIVYSVDSHASGLIVSGSEDCSAKIWKDGICVQSIEHPGCVWDAKFLENGDIVTACSDGVVRVWTADQGRIAEPQELESFASRLSQYKLKRKRVGGLKLEELPGMDALQIPGTSNGQTKVIREGDNGVAYSWNLKDYKWDKIGEVVDGPDDGGRKPVLDGVEYDYGQHFFNLVTLISFAKVFDVDIGDGEPIRKLPYNLADDPYTAADKWLLKEDLPLVYRQQVVDFILQNSGKKNVVLDPSFRDPYTGSSAYVPGGPSNVSAESRKPVFKHIPKKGVLVFDVAQFDGILKKIVEFNNALLANSEKKNYALPELEVSRLGAIVKILKDTSHYHSTKFADADVVLLLNLLRSWPCESLFPVIDMLRMIVLHPDGAILLLKFIDSDGILLELIQKVTTAPVIAANLLTSIRLIANLFKNSGYYNWLQKHRSEKQEILKEKGPKPTKEKNNLGQRDKKSTLRRKMDLRTIFPFSLLITSRSDRF Homology
BLAST of HG10005819 vs. NCBI nr
Match: XP_038887808.1 (phospholipase A-2-activating protein [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1256.5 bits (3250), Expect = 0.0e+00 Identity = 621/655 (94.81%), Postives = 629/655 (96.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. NCBI nr
Match: XP_031744253.1 (phospholipase A-2-activating protein isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8645890.1 hypothetical protein Csa_017692 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1247.6 bits (3227), Expect = 0.0e+00 Identity = 618/655 (94.35%), Postives = 629/655 (96.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. NCBI nr
Match: XP_031744254.1 (phospholipase A-2-activating protein isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1247.6 bits (3227), Expect = 0.0e+00 Identity = 618/655 (94.35%), Postives = 629/655 (96.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. NCBI nr
Match: XP_008454875.1 (PREDICTED: phospholipase A-2-activating protein [Cucumis melo] >KAA0031249.1 phospholipase A-2-activating protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1237.2 bits (3200), Expect = 0.0e+00 Identity = 612/655 (93.44%), Postives = 623/655 (95.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. NCBI nr
Match: TYK06700.1 (phospholipase A-2-activating protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1203.0 bits (3111), Expect = 0.0e+00 Identity = 599/655 (91.45%), Postives = 610/655 (93.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P27612 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Mus musculus OX=10090 GN=Plaa PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 355.1 bits (910), Expect = 1.8e-96 Identity = 223/649 (34.36%), Postives = 335/649 (51.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P54319 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Plaa PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 7.0e-93 Identity = 229/692 (33.09%), Postives = 344/692 (49.71%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y263 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLAA PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 338.6 bits (867), Expect = 1.7e-91 Identity = 214/648 (33.02%), Postives = 327/648 (50.46%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6GM65 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=plaa PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 338.2 bits (866), Expect = 2.3e-91 Identity = 222/688 (32.27%), Postives = 347/688 (50.44%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O94289 (Ubiquitin homeostasis protein lub1 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=lub1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 312.0 bits (798), Expect = 1.7e-83 Identity = 202/647 (31.22%), Postives = 320/647 (49.46%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SPK0 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold139G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1237.2 bits (3200), Expect = 0.0e+00 Identity = 612/655 (93.44%), Postives = 623/655 (95.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C0S7 (phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495187 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1237.2 bits (3200), Expect = 0.0e+00 Identity = 612/655 (93.44%), Postives = 623/655 (95.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C5T3 (Phospholipase A-2-activating protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold13G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1203.0 bits (3111), Expect = 0.0e+00 Identity = 599/655 (91.45%), Postives = 610/655 (93.13%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EZ65 (phospholipase A-2-activating protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437774 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1188.3 bits (3073), Expect = 0.0e+00 Identity = 582/655 (88.85%), Postives = 604/655 (92.21%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C3A1 (phospholipase A-2-activating protein OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007968 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1182.9 bits (3059), Expect = 0.0e+00 Identity = 582/655 (88.85%), Postives = 603/655 (92.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. TAIR 10
Match: AT3G18860.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 917.9 bits (2371), Expect = 4.9e-267 Identity = 437/673 (64.93%), Postives = 539/673 (80.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. TAIR 10
Match: AT3G18860.2 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 917.9 bits (2371), Expect = 4.9e-267 Identity = 437/673 (64.93%), Postives = 539/673 (80.09%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. TAIR 10
Match: AT3G49660.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 110.5 bits (275), Expect = 5.4e-24 Identity = 80/254 (31.50%), Postives = 126/254 (49.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. TAIR 10
Match: AT1G48630.1 (receptor for activated C kinase 1B ) HSP 1 Score: 92.8 bits (229), Expect = 1.2e-18 Identity = 77/260 (29.62%), Postives = 128/260 (49.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005819 vs. TAIR 10
Match: AT4G02730.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 4.9e-17 Identity = 78/240 (32.50%), Postives = 118/240 (49.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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