HG10005397 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAGAATAATGATATTTTGGAGCCGTTGGTGGAGCCGGCGGCGAATTCGAAGAAGCATGAGGTAAGCGGCGAGCTGGAGAAGATATTATCGGACACAGAGTTGGCTTATATGGTTCGAATCCGGCGAGCCACTTGGATCGAGCTCAAGCTTTTTGGTTACCTGGCGGCTCCGGCGGTGTTCGTCTACATGATCAATAACTTTATGTCTATGTCCACTCGCATCTTCTCCGGCCACCTTGGCAACCTTCAACTCGCCGCTGCTTCTCTTGGCAACAATGGAGTTCACAGTTTTGCTTATGGTCTAATGGTATTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTGTATTAGATTATTAATTAAAACTACTCATTCAACTACTCTTGAAAATTTTCTTTTGGTTTTATGTTTCAATTTTTTTTTAAAAAAATAAAAAGTACCTTTTTCGTTGTAAAAATTGGAGGTATGTGACTTTATTAACAACTATAACCCATGTATTTCATTTCAAACAAATATAGTTAATAATCATTTTCTCAATTAATTTTGATTCATTAAATAACTATTGATATGAATGATGTCAGGTATGTTTTCCAATTTTTACATACATCACATCAATTTTCATATTATTTTAACTAAAAAACTCTCCTATAAATATTAAAAAAAAAAAAAAAATTCAAACTTCAAATATAGTAGTAGGGTCATAATTGAAACCTAATCCGAAATTTTAATTTATTGTGTATGTGATAGTTAACTAATTGCTTAAACTACACCTTTGTATCTACTTGATCTTTGAATTATAAAAAGATGTCTAATATATAGATCCATAAATTTTTAATTTTGTATCTATACACTTTAAAAAAATATTGTTTTCAATAAGTTCTTAAACTTTTAACTTTGTGTCCAATTAAGGTCACTAACACTAAAAAATTAATGGTTAAAATTAAGATTTATGTTTAATATAACCTTAAGCTAAGATTTTAAAAAATATTAAATGTATTAAGAATGACACAAAATTAAAAGTTTAAGATTTTTTTTTCTTTTTTTAACAATATATGAGATGAGTTAATTGAACCTCTAACTTTGAGAGGTGGATAGTACAAACATTGTTTAAGAATTCATGAGATATTCTTTTGTAGTTGAAAACGACAAAATGCAAAATCAAAGGTTGTTTAGATTTGAATGATATGGTGAATTAATTGGATGAAACAGTTGGGGATGGGGAGTGCGGTGGAGACATTATGCGGACAAGCATACGGAGCGAGAAAATACGAAATGTTAGGGATTTACTTACAAAGATCAACAATATTACTAACAATGGTGGGTTTTCTCTTAACTCTTCTCTACATTTTCTCCAAACCCATTTTACTATTCCTCGGAGAATCCCCAGAAATAGCCTCTTCAGCCGCCATTTTCGTGTACGGATTAATCCCTCAAATCTTTGCCTACGCCATAAACTTCCCAATCCAGAAGTTTCTTCAGGCCCAAAGCGTAGTGCTTCCAAGTGCTTACATTTCCGCCGCCACATTGGTGGTGCATTTATCGCTGAGTTGGGTTGCGGCTTATAAGCTTGGGCTGGGCCTGATTGGGGCGTCGTCGGTGCTCAGCCTGTCGTGGTGGATCATTGTGACGGCTCAATTTGTGTATATTGTGAAAAGTTATAGGTTTAAGCATACTTGGAGAGGGTTTAGCGGGCTGGCTTTTTCTGGCCTGCCGGAGTTCTTCAAGTTGTCGGCGGCCTCCGCGATAATGCTTTGTTTGGAAACTTGGTATTTTCAGATTCTGGTTTTGGTTGCTGGGTTGCTTGAAAATCCTGAGTTGGCTCTCAATTCTCTCTCCATATGGTACTAATCTTCTCTCTCAATTCTTCCATTTTTCTTATTAATTTTAGTATAAATTGCAAATATAGCAAAATTTATAAGTAATATAGTTTAGATTAAAATACCATTTTGATCTCATGCTATAAAATTTAAAGACTAAATTTAAGATATTTTTTTTTTTTAAAAAAAGACTAAATTTAAGATTTATCGATAGTACTGTGAAATATTGAATTAAAAGTTCAAAGGACTATGATTTATTGAGAGTAGTATGAAGTTTAACCTTAGTATGAGGACTAAATTTGAGATTTAACTCATACTATGAATTTGCAAATATAACAAAATCTATCACTTTTTAAGATTAAATTTAAGATTTATTGAAAGTATAGAACTAAAATTGAATAAATTTCAAAATATAGGAACCAAAATTTTATTTTAACTTATAGTTTATCATTGTTAGACTCAGAGAGCTAGATCTAAATTTTGTTATATGTTCTAGTACTTTGGGTCTGATTACCCCTTAGTTTTATATATATTATAGCTTCTTAGGCTTCTCCTACCATGTTTGTTAATATGTAGATTCAAATTTGGAACCATGTGTCTAATAAGTCTATGTTTTTTTAAAAAAATCTGTGACTTTTTAGTTTATGAATTTGAAAAACTATCTAAAATGTTTTAAACTTTCAATTATGTGTGTGATGTATAGATTTTTTAAAATTCAATTTTATGTCAAATAAGCCATTAACCTATTTTACGTTTTGTAAAATTCAACACTAAATTGAAAATTTAGAGTCTTTTTAGACGTAAAAATTCAACCTTATATCTCGTATATTATATATTTATGAGTTAATTTTTAAAATTTTTGAGTGCATCAAGAACCTATTAGATATTAAAGGGAGGATTAAGAAACGTTTATCTAATTTTTTCTTTTAAAAAAACACGTAAATTTTTTCTTTTTAATTCTTATCAATTTTTTTGTAAAAAAAATCTTATCAAATAAATGTAACAAACGAAAAATGTGGACAAAGGGGTAGAAGAAACTTTTGAGTAACATAAAGGGGAAGATGAGAAATTTAAAGACTTGGCCCTTATGGACGGCATTTGTGACTTTTAACATGCAAAAGAGTCTCAATATATATATATTTTTAAAATGGTCTGAAAACTGAAAATCGATTTTTTTTTGTCACTCAAAATTAATTTAATATTTAATGTTACACTTTTAAATATAATTTACATATCATCAAAATTAATCTTAAATGATTAAAAGTATGTTTAAGAGTGATTTTAGAACTAATAAAAAAGATTTTAACTATTCTAGAATCAATCTCAAACATGTCACGAGAAAATTTCTATTAGTACAAAAGTACTATACTCTAGATTTACTTTTTATATATATTCACATTAATGTCACTAAATTCTACTTTAGTACTACCTAACATGGCATAAGTCATATTCTTTTTGTCTTTGACAAAAGTAGTGGAGATTGCTTGGTTGACATAGTCTAAAATAAGATATTCTTTTTGGGTATTAATTGTTATTGTACTATCCCCCGAAGCAATAAACAAGGGTTAACTACTAATAACCTTACATTAAAAAAATTGAATAGGACAAAATTTTTATTGGAATGTGAGATTTAGACCTGTTTGGATTAACTATAAAAAAAAAATGTTTTTCAAAAAATTAATTTTTATTTAAATTCTTTTGATAAAATCTAGTTCAAATACATTTTAAAAGTTATTTTGAATGATTGCTAAATACTTCAATTTTTTCTAAAATAACTTATTTTAAAAAATAAACAATTAAAAAGTTAATCTAAACGCATCTTTACAGTAGTTCATTAACTCACTCTTTTCATTGATAAAATAATTTTAAGATATGATCAAGATAGAGATGAAGGGACTTAATTTTTCATTTCAATTATTGAGATAAGAATGCATTGTTTGCTTTGTTTTATTTGCAGTACGACAATTAATGGATTGGCTTTCATGATTTCTGTGGGCTTCAATGCAGCTGCTAGGTTAGGCTCTCATCTATTTCAATTTTAATATAAAAACTTACCAACATATAATTATTGGTTCTGTTTTGGAAAACACAATATTAATTAGGTTAAATAATATATATCTTGTGTGTAGTTTTCATATTATGTTTATTTAGTATCTAAATATTTTAAAATTTTTACAGACATTCATCCACCTCACTTTTATCATTGGGTCAACCAGTTTTTAACCCAAGCTTCGTCTAAGTCTAAGTCCGGTGGGTCTAAGACATTTTTGGTCTAAATTGGACCGACACAATCTTCAATAGCTAGGTTCATTACACTTGGCTCATTAGATTAAAGTTTGAGCCCATCCATTGAATTAATCATTAAATATTAATTTTTTAAAATTTTTTAAAAAATATTTTATGAATAAATGTAATAAAAATTGTGATTTTTATCTAATTTATTTTAACAATTTAGTTTTTTAATTGCTTTTATTTCATAAAATTATAGGTATTATAAAGATTTATTTGATATATTATTTTCTTATATATATTAGGAACTATATGTACACATACATATTTGGGTTGATCTAATAATAAATCTATAATGTCAATCCAAATATAATCGAAATGAGCCGACCCATAGGCAAACTCAATTTTCAAAATGAAGACTTATTACTTGATTAAATGTTAACTTAATTTGGACTAAGTTTGGATGGAGTTTAGATCAACCTTTGAACTTTGGACCTGTTAATAAGGTTGGTATTGGGCCCTTTGTTTCATCTTTCTTTAAAATAGCTTTTAAATCTTTGGTAAAATTTAAAAACAAAAACAATTTTTTTTTAAAAAAAATTCTTTTCAAAATTTAATTTAGATTTTGAAAACTTCCAAAAAGTAGATAAAAAAAAAGCATGAAACTGATGCAATAATTTTTTTTTTCAAAAACAAGAAATAAATAGTAAATAACTATCAAACAAATGACTTACCTTTCACCTACCTAGAAATTAATATCCTACGAGTTTTCTTGACACCCAAATAAACCATTAGGAGCTTATTTTTAAAAAAAAAAAATCAAAGTTTTTTTTTCACATTGTTTTGGCAGTGTGAGAGTTGGAAATGAACTAGGGCATGGGCATCCAAAATCGGCAGCATTTTCAGTGGTGGTTGTCACAGTAATTTCCACCATTATTTCTATACTCATCGCCTCCACA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ATGGAGAATAATGATATTTTGGAGCCGTTGGTGGAGCCGGCGGCGAATTCGAAGAAGCATGAGGTAAGCGGCGAGCTGGAGAAGATATTATCGGACACAGAGTTGGCTTATATGGTTCGAATCCGGCGAGCCACTTGGATCGAGCTCAAGCTTTTTGGTTACCTGGCGGCTCCGGCGGTGTTCGTCTACATGATCAATAACTTTATGTCTATGTCCACTCGCATCTTCTCCGGCCACCTTGGCAACCTTCAACTCGCCGCTGCTTCTCTTGGCAACAATGGAGTTCACAGTTTTGCTTATGGTCTAATGTTGGGGATGGGGAGTGCGGTGGAGACATTATGCGGACAAGCATACGGAGCGAGAAAATACGAAATGTTAGGGATTTACTTACAAAGATCAACAATATTACTAACAATGGTGGGTTTTCTCTTAACTCTTCTCTACATTTTCTCCAAACCCATTTTACTATTCCTCGGAGAATCCCCAGAAATAGCCTCTTCAGCCGCCATTTTCGTGTACGGATTAATCCCTCAAATCTTTGCCTACGCCATAAACTTCCCAATCCAGAAGTTTCTTCAGGCCCAAAGCGTAGTGCTTCCAAGTGCTTACATTTCCGCCGCCACATTGGTGGTGCATTTATCGCTGAGTTGGGTTGCGGCTTATAAGCTTGGGCTGGGCCTGATTGGGGCGTCGTCGGTGCTCAGCCTGTCGTGGTGGATCATTGTGACGGCTCAATTTGTGTATATTGTGAAAAGTTATAGGTTTAAGCATACTTGGAGAGGGTTTAGCGGGCTGGCTTTTTCTGGCCTGCCGGAGTTCTTCAAGTTGTCGGCGGCCTCCGCGATAATGCTTTGTTTGGAAACTTGGTATTTTCAGATTCTGGTTTTGGTTGCTGGGTTGCTTGAAAATCCTGAGTTGGCTCTCAATTCTCTCTCCATATGTACGACAATTAATGGATTGGCTTTCATGATTTCTGTGGGCTTCAATGCAGCTGCTAGTGTGAGAGTTGGAAATGAACTAGGGCATGGGCATCCAAAATCGGCAGCATTTTCAGTGGTGGTTGTCACAGTAATTTCCACCATTATTTCTATACTCATCGCCTCCACAGTCCTTGCTTTGCGCAATGTCATTAGCTATGTCTTCACCGAAGGTGCCACCGTCGCCGCCGCCGTTTCAGATCTTTGCCCTTTTCTTGCTATCACTCTTCTCCTCAATGGGATTCAGCCTGTTTTATCGGGTGTGGCTGTGGGATGCGGATGGCAATCTTTTGTCGCGTGCGTCAATGTGTGCTGTTATTACATGGTTGGATTGCCTTTGGGAGTTCTTCTAGGCTTCTACTTTAAACTTGGAGCCAAGGGCATATGGCTAGGGATGCTTAGTGGCACAGCCATGCAGACATGCATTTTGTTGTGGGTCACATTTCGTGCTGATTGGAATAAAGAGAATATGGAGTCGAGAGATAAGGAGGTTAAAGTTGCATGGGCCATGGTGTTTGGCTTCGGTGGTAGTTGTGGGGTTGAAGACATTAGATCTGTAGCTTCCAATTTGCAAGATCTCTCTATTAATTAA MENNDILEPLVEPAANSKKHEVSGELEKILSDTELAYMVRIRRATWIELKLFGYLAAPAVFVYMINNFMSMSTRIFSGHLGNLQLAAASLGNNGVHSFAYGLMLGMGSAVETLCGQAYGARKYEMLGIYLQRSTILLTMVGFLLTLLYIFSKPILLFLGESPEIASSAAIFVYGLIPQIFAYAINFPIQKFLQAQSVVLPSAYISAATLVVHLSLSWVAAYKLGLGLIGASSVLSLSWWIIVTAQFVYIVKSYRFKHTWRGFSGLAFSGLPEFFKLSAASAIMLCLETWYFQILVLVAGLLENPELALNSLSICTTINGLAFMISVGFNAAASVRVGNELGHGHPKSAAFSVVVVTVISTIISILIASTVLALRNVISYVFTEGATVAAAVSDLCPFLAITLLLNGIQPVLSGVAVGCGWQSFVACVNVCCYYMVGLPLGVLLGFYFKLGAKGIWLGMLSGTAMQTCILLWVTFRADWNKENMESRDKEVKVAWAMVFGFGGSCGVEDIRSVASNLQDLSIN Homology
BLAST of HG10005397 vs. NCBI nr
Match: XP_038888527.1 (protein DETOXIFICATION 40-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 845.9 bits (2184), Expect = 1.9e-241 Identity = 452/485 (93.20%), Postives = 464/485 (95.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. NCBI nr
Match: XP_004144588.2 (protein DETOXIFICATION 40 [Cucumis sativus] >KGN43522.1 hypothetical protein Csa_020362 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 813.9 bits (2101), Expect = 7.9e-232 Identity = 437/485 (90.10%), Postives = 448/485 (92.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. NCBI nr
Match: XP_011659704.2 (protein DETOXIFICATION 40 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 808.1 bits (2086), Expect = 4.3e-230 Identity = 438/500 (87.60%), Postives = 452/500 (90.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. NCBI nr
Match: XP_038888528.1 (protein DETOXIFICATION 40-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 802.7 bits (2072), Expect = 1.8e-228 Identity = 434/485 (89.48%), Postives = 446/485 (91.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. NCBI nr
Match: KAE8645742.1 (hypothetical protein Csa_020458 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 795.0 bits (2052), Expect = 3.8e-226 Identity = 430/488 (88.11%), Postives = 443/488 (90.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LVD9 (Protein DETOXIFICATION 40 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX40 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 1.6e-190 Identity = 350/484 (72.31%), Postives = 402/484 (83.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SAB0 (Protein DETOXIFICATION 36 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX36 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 583.6 bits (1503), Expect = 2.3e-165 Identity = 303/478 (63.39%), Postives = 389/478 (81.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80695 (Protein DETOXIFICATION 37 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX37 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 1.5e-164 Identity = 303/479 (63.26%), Postives = 381/479 (79.54%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JKB9 (Protein DETOXIFICATION 38 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX38 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 542.3 bits (1396), Expect = 5.8e-153 Identity = 288/484 (59.50%), Postives = 367/484 (75.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q940N9 (Protein DETOXIFICATION 39 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=DTX39 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 537.3 bits (1383), Expect = 1.9e-151 Identity = 281/488 (57.58%), Postives = 366/488 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K5J6 (Protein DETOXIFICATION OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G043640 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 813.9 bits (2101), Expect = 3.8e-232 Identity = 437/485 (90.10%), Postives = 448/485 (92.37%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K3K6 (Protein DETOXIFICATION OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_7G043660 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 806.6 bits (2082), Expect = 6.1e-230 Identity = 432/481 (89.81%), Postives = 446/481 (92.72%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ES28 (Protein DETOXIFICATION OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437051 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 790.0 bits (2039), Expect = 5.9e-225 Identity = 417/484 (86.16%), Postives = 445/484 (91.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EVV4 (Protein DETOXIFICATION OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111437051 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 776.5 bits (2004), Expect = 6.8e-221 Identity = 417/508 (82.09%), Postives = 445/508 (87.60%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JDX2 (Protein DETOXIFICATION OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111485994 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 773.9 bits (1997), Expect = 4.4e-220 Identity = 411/484 (84.92%), Postives = 440/484 (90.91%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. TAIR 10
Match: AT3G21690.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 667.2 bits (1720), Expect = 1.1e-191 Identity = 350/484 (72.31%), Postives = 402/484 (83.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. TAIR 10
Match: AT1G11670.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 583.6 bits (1503), Expect = 1.6e-166 Identity = 303/478 (63.39%), Postives = 389/478 (81.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. TAIR 10
Match: AT1G61890.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 1.0e-165 Identity = 303/479 (63.26%), Postives = 381/479 (79.54%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. TAIR 10
Match: AT4G21903.1 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 542.3 bits (1396), Expect = 4.1e-154 Identity = 288/484 (59.50%), Postives = 367/484 (75.83%), Query Frame = 0
BLAST of HG10005397 vs. TAIR 10
Match: AT4G21903.2 (MATE efflux family protein ) HSP 1 Score: 541.2 bits (1393), Expect = 9.2e-154 Identity = 288/479 (60.13%), Postives = 364/479 (75.99%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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