HG10004339 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTTTCAGATTCAATTCTGATGATGCAACTGGCTTTAAGCTATTGCTCTGTTTAGCCGTTATGTATGGTCTCATGTCGATGCTGGTTCACTCCATTGTTCACATGAAGTTTGTTAAGCCGCTCCCAATTGATGCGCCTCTTCATCAGTTCTCTGAAGCCAGAGCGGTCGAGCATGTACGAATTTTGTCTCAAGAGATCGACGGTCGCCAGGTATGCCGGCCTTCACATGCATTTCACTTGGTTTCTACCATGAAACTTCATTTCATACGATGATTTGAGTTTTTGCAGTTTGGTTTGTTTCGTTTGGTAAACACTAGTGCGTGCTAGAGACGAAACCTGCGATAGTTTTGTTGTTTTTAATGAGTAAACAGCTTAATGTGTTCGTAAGAATTTGCTTCTGAGTATATTGATATTTCTTTTCATTGTAGGAGGGTCGTCCTGGTATTAAACAAGCTGGTCGGTATATAAAAGGGCAGTTGGAGATGATGAAGGAGCGTGCTAGTGATAAATTTCGGTCAGCGTAGTTTCTCATCTCAACCAATGAAGCTGTTTAATTTTAAATTGGTTCTGTAGTTTTAAACTGACGAAATGGTCCGCTATGTCATACTTGCATGTGCTTCTTGTTAGTTGAAGTTTGATTGCTGTATTGCTGAAGTTGTTATTACGCAGAATCGAGATCGAGGAGACGGTTGTTGATGGTTCCTTTAGTATGATGTTTCTGGGCCACAGCATATCACTGGGATATCGGAACCACACTAATATCTTAATGAGGTAGATTTTATATTTAATTTTTTTAACATATAATTGACTTGGGAACGGCTTATCATCTTTTATATCTGAACTAAACGAGTACGTGATGGAGGATGAATCATTCTTGTATTTTGATTCGTGTTTCAACTTTCGAATAACAAAGCATAGCTTATTGCTAATTTACTATGACTTCACTCTTGATGGATGACAGAATTTCATCAGTAGATTCACAAGACACCGACCCATCAGTTCTAATAAATGGCCATTTTGATAGTCCACTTGGATCGCCGGGTGCTGGTGATTGTGGCACATGTGTTGGTGGGTACTGGAAAACCTTTGTCAAAGAAGAGTAACTTAGCATTCTTTTGATTGATTATGACTCTCTCTTATCATATATTTCACTGTTACAGCATCAATGTTAGAAGTTGCTAGACTTATTGTAGACTCTGGATGGGTTCCTCCACGTCCTGTTATTTTTCTTTTCAACGGTGCAGAAGAGTTGTTTATGTTGGTAGGCATTCAGAATTTTGTCCTTACTGAGAAATAAACTATAACTCTTCCTTATTATTTTATTTTGCGGCAGCCTTCATGATTATAATTTGTGCTTTAGATGTAGGCATAATACAAGAGAGAATAGTTTCTTTTTCTTCTTCCTCTTTCTGCTTGTTTAGATGTTGAAAAATGATGGCTGTTTCAAAGCATTTTGATTTGAATATGTTTCAAACATGTGCTGGGAGTTATTATAGGTTTTATCTTTTTTCAGATGTTACTATTAATCAGTTTTGAAAAATCCTTCTGTCTTGGTGTGGCAATTTGCGATGTTCTCTTGTTGACAGCAAGCATTTACAAATTCTGTACAATGTTTTAGGGTGCACATGGATTTATGGAGAAGCATAGATGGCATGATACAATTGGAGCTTTTGTAAATGTTGAAGCATCTGGTACGGGAGGTTTAGGTAAGAATAATCCATATTGATCATTATGGTACAAGAAACCTTTGAATCTTGCCCGTTTATGGATATCCTACAAAAGAAAATGGGCTACAAATTGACTTTTTCCAGCAATTGACTTGAAGAAAATAGAGTACTTAGATAAAACATAATGGAAATGTTGCTTGAATTATGTGTTTTTTCACAAAATATTTGGACCCTCAAGATTGTTAGAATGGTCCTTGTTGACATCGATGATGAAGTGAAGCATGTATTGACTCTTTTTTATGCCTTTGTATTCTTTCATTTTCTCAATGAAAGTTTAGTTTATCATTAAAAAAAACAGAGAGAGAAAGAAACCTTACCTTTTTCTAGTAAAAAAGAATTAAATTTCAGTGTATCTTGTATGTTATACCACATAATTGGTTCTCTAATTTATTCATTTTTTATTAATAGATTTAGTTTGTCAATCTGGACCTGGCTCTTGGCCTTCACGTGTTTATGCTCAGTCTGCCGTGTACCCCATGGCTCATAGTGCTGCTCAGGTAATCTTCTTCAACTATTATTCTTCTCCATTCTTGTGTTCTTGTATTTTGAAGGAGAATCTTACTTCGAAATTACGATTACCTGTTTGTTTTCATTCCTAGACATCTCCATAAATACACTACTGAGGCTATATTGTTATTTTCATATTTTAACAACTAAATCAAATATCTTCCTTTGTTTTTGAGGCTGTGCACCTAGTTATAAAACTGCTGCATTTTTTATCTGGATACTGTTTATCAGATTTTCTAATTGGTACGCAGGACGTGTTTCCAGTTATTCCTGGAGATACAGATTACAGGATATTTTCTCAGGATTACGGCAACATACCTGGCCTAGATATTATCTTCCTTTTTGGTGGTTACTTTTACCATACCTCATATGATACAGTGGAGAGACTATTGTATGCATTACATCTGCTGTTTTGGTATAGATACATGATTTGTATTTTCATATATGTTTGTTCTTCAATCTTTTCTGAGATATTCAATTGCCTATAGACCTGGAAGCGTCCAAGCACGAGGAGAAAATTTGTTCAGCATAATAAAGGGCTTTACGAATTCTTCGATGCTTCAGAACTTTTATAAGCAAGCATCTCCTGAAATTACTGTCCGTCAGGACAAAGACGATGGGGCTATTTTCTTTGATTACCTCTCATGGTTTATGGTATGCTTTGAATATTATTACACTTTGGCTATTTTATAAGTATGAACTTAATGATTGCTATTACTAGCCATGAATTTTAGGTCTTTTATTCTAGAAGACTAGCTCTGGTACTTCACAGAATTCCAATAGCTGTCTTCCTAGTAATGCCATTCCTTCTGAACTTGCGGAATTTTAGCATGACTTCATGCTTAGCAACATTTTCTGATTTGACTAAAGGTAAAAATTTCTGCTCACGTGTTTTTATTAAAAAAAACAAAAAACTTCTTCAACTTCTCCTCTACTCTGCTTTTTCTATTATACGTCAACATGTTTTGATTTTTCAGTTTGCATTAACTAACTTTTCATTTTGCATAAAATTTAAAGTTTATGTTGAAAGCATGCAAAAATTGTGCTCATTGAATCAGCCCTGTGGACTTTTTGATCTTCAGGTTTTTTGTTTCATGCCTTGGGGGTTTTTCTTGCAATTGTTTCTCCAATTACGTTTTCCATCCTAAGATTGCTTTTCACCAACTATTCCATGAACTGGTGAGTATTTTCCCTGTTTTACTTGTCTGTTAGCTTCTCTCGACATCTTTTATTAATACACACATTCGGATTCAGATATATTATTGTTTGATTTGTTAATAAGTAGTATAATTAAATTTCACTCATGTTGCTATGGTATCAAAGGAGCACAAAGAACTCATGGAGCACCTTTCTGATGGCCATAGTCTGATTTGATCACACCGAAGCAATTTTTATACTCCCATTTGACATTTTGAACTTGGATGCAGGTTTTCACATCCATACTTGGCTTATTTGATGTTCATCCCCTGCTCACTAGTTGGTCTTCTGATTCCAAGAACTTTTTGGAGTTGCTTCCCTCTCTCCCGCGATGGTCCGGTTCTTCAGGCCTCGAAAGAGGTGAAATTCTATTTCTGTATCCCCCCCCCCTTCCTGGTGGCTTGACTATCAATTAGCTCATCCATTCATTCCTCTTCCTTCATCAGACCTTATTATCATTTCAACTAAATGATAAATATCAGGCTAAAATTTGATGAGATATTGTAGTAATTCTTTCCACTATTTAAAATGCTGCACATTTCTTGCATCAGTGAGAGAGTTGGTGAGAGTTCTGAGATGCTTGCAACAGTCATACATTAGTCTTGAAAAAGAAAAGAAAGAAGTGTGATATGCAATGCACTTTAGGTCTTTTTCTTAGTTTTATAGCAGAATCAGCAAAGCAAATAGAATTCTTTTTTTAAAAACATTTATTTTAAGTTTATCCATTGAATTATTCAGTAAATGTGAAGTGTACAGCTAGTGAAACTATATGAAACAAGTGTCAACTGGCTTCTGTATCCTTAAGAAGATATATCTCACTACTCATTTACTCTGTGGGGTCGTGGAACTTATCTGTCTAACGATGGATATGCTATAGGATTTCCTTCAATGCAGAAAATTTATTCATTTCATTTCTTTTCTTCGAAAACTCCTCTAAATTTTTTGATTCCATCTTGGTGTGATTACATTGAGGTTTCGTTGGGAAGGGGAACTTTCTAGAAAGTGTATTGCTACAGAGGGTAATATATAGCATGCCTATATGGGGAGAATACAGAATGCAAGTTTCGTTAAGTGTATTCTAAAAATACCACTAGACCATCTGCTTCTTTATGTTTGTTGGTTTATGAATTCTATGAAATTGGACAATTTGGTGCACCCATCTGTCTTTATTTCTTTTGGTTGAACTGAAAAGCTTTGTACTATATGTGCAATCTTTGGAATGCTCATTTTGATTTCTAAGATGACAATTTTAAAAGCTTAGTGGCATAAAATGTATGTGTAACATCAATCATACTGACATCAGATGCCCCATGTGACTTGTCGAGGTCTAATTTGACATTTAAATCTTACAGGTGTTTTCTGATGAAGCATGGTTTTGGGGCGCATTTGGATTCTTTTCCGGTTTGACAATGGTATGTTGAAGGATATGGTCTATAGGATAATCTTTCCACTATAATGAGCGGCTGTGTAATGGAAGAATTAGTATTAATGTTATTGTAGTTATTATTCTTTAGTATCAAAGATTTGACTGATCAAAGCAGTTTTCTAAATGCAGGCGTA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MAFRFNSDDATGFKLLLCLAVMYGLMSMLVHSIVHMKFVKPLPIDAPLHQFSEARAVEHVRILSQEIDGRQEGRPGIKQAGRYIKGQLEMMKERASDKFRIEIEETVVDGSFSMMFLGHSISLGYRNHTNILMRISSVDSQDTDPSVLINGHFDSPLGSPGAGDCGTCVASMLEVARLIVDSGWVPPRPVIFLFNGAEELFMLGAHGFMEKHRWHDTIGAFVNVEASGTGGLDLVCQSGPGSWPSRVYAQSAVYPMAHSAAQDVFPVIPGDTDYRIFSQDYGNIPGLDIIFLFGGYFYHTSYDTVERLLPGSVQARGENLFSIIKGFTNSSMLQNFYKQASPEITVRQDKDDGAIFFDYLSWFMVFYSRRLALVLHRIPIAVFLVMPFLLNLRNFSMTSCLATFSDLTKGFLFHALGVFLAIVSPITFSILRLLFTNYSMNWFSHPYLAYLMFIPCSLVGLLIPRTFWSCFPLSRDGPVLQASKEVFSDEAWFWGAFGFFSGLTMAYLLAGLSGGFLTFFACISMLAAWLSFSLATKYYGRRSILFYVLPMVPYLAYSVYFGGFLAQFLIEKTGMMGSIPPPYGYFIPDIVVAATIGVVTSVCIGPLIPVCGHWLARSSILQFLLQIIVIGLAVSSQFFPYSMAAPKRVVLQQTYLTSGPNHLENSRYELSVVDSNSLLFLLKHASDVANELQTDLDLSLETANLSGQENWLALFPVSFLFSRSLKFPAKESTSTKDLHFPYLIASRPQTISDDGSRRVYLELSLGSLEEVWVTVLNITGPLSSWSFADNKLPAPEKLDGGPPSYICRLSGASDENWRFWLENTRETAHAIRKLPLAKAKRYLEDVLAHKQAIPFRRFCGGVGRTAQAKNRHSNGQGRWPVKSAKFILDLLKNAESNAEVKGLDVDLLHVSHVQVNQAQKQRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIELILSEKEEPVKKEPETQLATGKPKKGQALRSGASS Homology
BLAST of HG10004339 vs. NCBI nr
Match: XP_038886138.1 (endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1568.5 bits (4060), Expect = 0.0e+00 Identity = 787/825 (95.39%), Postives = 802/825 (97.21%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. NCBI nr
Match: XP_038886137.1 (endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1568.5 bits (4060), Expect = 0.0e+00 Identity = 787/825 (95.39%), Postives = 802/825 (97.21%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. NCBI nr
Match: XP_004144197.1 (endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN47615.1 hypothetical protein Csa_019022 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1529.2 bits (3958), Expect = 0.0e+00 Identity = 761/825 (92.24%), Postives = 789/825 (95.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. NCBI nr
Match: XP_023546121.1 (endoplasmic reticulum metallopeptidase 1-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1528.5 bits (3956), Expect = 0.0e+00 Identity = 760/829 (91.68%), Postives = 791/829 (95.42%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. NCBI nr
Match: XP_022997060.1 (endoplasmic reticulum metallopeptidase 1-like isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022997061.1 endoplasmic reticulum metallopeptidase 1-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1526.9 bits (3952), Expect = 0.0e+00 Identity = 761/829 (91.80%), Postives = 790/829 (95.30%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93VI3 (60S ribosomal protein L17-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPL17A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 267.3 bits (682), Expect = 6.8e-70 Identity = 135/167 (80.84%), Postives = 144/167 (86.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P51413 (60S ribosomal protein L17-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPL17B PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 263.8 bits (673), Expect = 7.5e-69 Identity = 133/160 (83.12%), Postives = 141/160 (88.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O48557 (60S ribosomal protein L17 OS=Zea mays OX=4577 GN=RPL17 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 258.1 bits (658), Expect = 4.1e-67 Identity = 127/154 (82.47%), Postives = 139/154 (90.26%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P35266 (60S ribosomal protein L17-1 OS=Hordeum vulgare OX=4513 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 252.7 bits (644), Expect = 1.7e-65 Identity = 123/160 (76.88%), Postives = 138/160 (86.25%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P35267 (60S ribosomal protein L17-2 OS=Hordeum vulgare OX=4513 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 249.2 bits (635), Expect = 1.9e-64 Identity = 122/163 (74.85%), Postives = 139/163 (85.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KD51 (Peptidase_M28 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G365160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1529.2 bits (3958), Expect = 0.0e+00 Identity = 761/825 (92.24%), Postives = 789/825 (95.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K8I2 (endoplasmic reticulum metallopeptidase 1-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492099 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1526.9 bits (3952), Expect = 0.0e+00 Identity = 761/829 (91.80%), Postives = 790/829 (95.30%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VBV1 (Endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold82G00380 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1521.1 bits (3937), Expect = 0.0e+00 Identity = 758/826 (91.77%), Postives = 784/826 (94.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BCW5 (endoplasmic reticulum metallopeptidase 1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488498 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1520.0 bits (3934), Expect = 0.0e+00 Identity = 758/825 (91.88%), Postives = 784/825 (95.03%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HG47 (endoplasmic reticulum metallopeptidase 1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462686 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1518.8 bits (3931), Expect = 0.0e+00 Identity = 758/829 (91.44%), Postives = 786/829 (94.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. TAIR 10
Match: AT1G67420.1 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 1036.2 bits (2678), Expect = 1.7e-302 Identity = 509/828 (61.47%), Postives = 639/828 (77.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. TAIR 10
Match: AT1G67420.2 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 1036.2 bits (2678), Expect = 1.7e-302 Identity = 508/828 (61.35%), Postives = 638/828 (77.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. TAIR 10
Match: AT1G27400.1 (Ribosomal protein L22p/L17e family protein ) HSP 1 Score: 267.3 bits (682), Expect = 4.8e-71 Identity = 135/167 (80.84%), Postives = 144/167 (86.23%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. TAIR 10
Match: AT1G67430.1 (Ribosomal protein L22p/L17e family protein ) HSP 1 Score: 263.8 bits (673), Expect = 5.3e-70 Identity = 133/160 (83.12%), Postives = 141/160 (88.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004339 vs. TAIR 10
Match: AT5G20660.1 (Zn-dependent exopeptidases superfamily protein ) HSP 1 Score: 164.5 bits (415), Expect = 4.4e-40 Identity = 127/461 (27.55%), Postives = 222/461 (48.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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