
HG10004089 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCGACACAATCGTCCGTTTCGGAATCATCGGCGCCGCCGAGATTGCTCGGAAAGTTTCTCGAGCTATTGCTCTTGCTCCTAATGCCACTCTCTCGGCAATCGGCAGTCGTTCAGTGGAAAAGGCCTCGAAATTTGCGTCCGATAATGGGTTCAGTCCTCAAGTCAAAATCTATGGTTCTTACGAAGCTGTACTCGATGATCACGAAATCGACGCCGTCTATATCCCACTTCCGACCAGTCTTCACTTGCGCTGGGCTGTGCTCGCCGCCGAGAAGAAGAAGCACGTGCTCCTCGAGAAGCCTGTGGCTCTTAATGTAGCTGAGTTTGACAAGATTCTCGAAGCGTGTGAGGCCAATGGAGTGCAGTTCATGGACGGTACCATGTGGATGCACAACCCTCGTACGGCCAAGATGAAGGAATTTCTTTCCGATGCAGACAAGTTTGGCCAGCTCAAATCGGTATGTCATTCCAATTCCATTCAGAATGATGTAATTCATCTACTGAACTCTCTGACTTAATCCAATCGTGCTGGAAATTCGAAATATTCGAAAAGTAATTTGAATCAATTATGTTGGTTATATTGTTTCTTGTAAACGGATATGATATAGCTGTGAGCTATTAGGCGTACCACTAGCCTTAAATTTGTTTAGAAAATTTGGATTTAAAACATAGGTTGTTAGCTTAATCAGGTGAGAGATGGAAACTTCTCTGAAAATGACTTCGTTTGGAATAATAATTTACCAACTCTGATCACGATGCACATGGCAACGAGCAAAAAAGTGAGTTGAGTTGCGGTATGATTTCAGACATTGAAGAGAAACAAGATGAAGAACATATGTTTAATTTGTGATATTCTGTATAGTTCTTTGGAGCTTTTGGAAGGAAAGAAAACAGGGTATTTGACAATTTTGATGATGAAATCGATGTGTGATTTCGTTTATTTATAGTTATGGAATATTGAATCTTTTGATGTGATGTTTAGCTGATTGTTTTCTTTTTGCAAGACACATGGGGCTTCTTCTCTGTGTTCTACCTTGTAAATGTTTTCATTGATGATAGTTTGATTCTTTTTGAAAACTTTCAAAAGTAAAATTATTTTTTTTCTTTTTAAAAAGCTTTCAAAAGTATAATAGTTTGTTTCTTTTTATGAACTTTCAAAAGTGTCAAAGGGGTATTTAAACTTTCAATTTTTTGTTAAATGTTCAAGGACTTGAAATTTTTTAAAATTAATTGATATATTAAATATAAATTTGACTTTTATGTCTAATAGAACCTTAAATTTTCAATTTTACATCGAGTAGATTCGTGAATTTTTAAGAAGTATAGGGACTAAATTTATAATCTTAAAAGTTCAAGGACCAAATAGACACAAAGCTCAAAGTTGAGGCCAAATTTTCTTCATTTTCAAAAAGTAGTATAGTTGAAGGATTTTTGTTCTTGTTCGTTGGGTTGTCCTTGTCCATCATTGAGCTCACACGATTCCCATGAAAGCCATTTCATCCTCTTTAAATTCAGTGCCTTTCGTTCTTTTAATAGGACTTGTCAACTGCCTGTCAAGTATATCAAACTTAGTATAGGATGAACTGAGGAAGAGGGAGCAAATGTGCATGACAATTTAGTTAGTATGACAGTGTCGGCATATTTTGTACCGAAGGAGAAGTGGGACCCTTCAAGTTCGGTAGTTGGAGTAAGCACCAAATAGATGATGTTTAAGCAGTGTTCTTCATTCTTTCTCAATGAAAGTCGTTATTTCCATTAAAAAAAAAAATGATGATGTGTCAGCAGTAGGGAGACGTAAGTACTGAACTAAGCAGAGGGTAAACCTCAGAACTCTTGAATAGTCAGAGAACCTTACTTCTTCCATCTTATTTTGCAATTGGCACATCACCTTTCCTTTTTATCTAGATTCCTACCTTCCCCTTATTTCATTTATTCATTTTTTCCTTCAAGGATAAGGATTGTACATATTTTGACTGTTTATATAGCACAGTGCTTCCTTTTTTGCAAACTCTGAGAGTACTAGTTAGGGATATATTGAAAATACTAGTATAATAGTAGTAATGGTGTAGCGGTAATTAGTTAGTGGTATCTTAGTTATAAATAAAGGGAGATCAGCACCTTAGAGGGGAAATGTTTCTTGGTATTGTCCAGTGTGATGACCCTCTCGAAAGGTTATTGATATTGTAATTTCTTCATTGGTATAGCAATATAGTTATATTTGTTATTTTCTTATATTTTACGTACTTAGAATACCTAACAAAAAGGCTCGTGTATGAGCGTCAAGGCTCTACTGTTGCTCATTGTTGGTTGTGGTCATGAACAAGATGAAATGAAATGAAATGGGTTCTCCTTCGGCCTTCACTGTTTGTTGTCATGATCACATCGGTCTTTACTATTCCAAATTTGATGATAACTATATGTTGCATAGATGTTAAAAGGTTTTAGTGAACTAGTTTTTAGATAAAATTATTAAAACAAAATGTTAAACTTTGCAAATGATATGGAGAATATTAAACTCTTATGTAAATGTTATTTTACTTAAGTCAATCAGTTCAAGTTTTCCTCTAAAACTTCGATAGTTCATTACTAAGAGGATTGTTTGTTTTTTCTTTATGAATATCACAGGTAAACAGTGTTTTCTCTTTTGCTGCTGATTCTGACTTCTTAGCTAATGATATTCGCGTGAAACCCGACCTTGATGGTCTTGGTGCTTTGGGTGATGCCGGATGGTATTGTATTCGCTCAATCCTTTTTGCTGCCAACTTTGAATTGCCTAAAAGAGTGCTTGCCTTGCCTAATCCTGTTTTCAATGAATCGGGTGTGATTCTATCATGTGGATGCTCTCTTTTTTGGGATGATGGAAAAGTAGCAACCTTCCATTGCTCTTTCTTGTCAAACTTGACCATGGATATGACTGCCATAGGAACAAATGGGACATTACATCTTAATGATTTCATTATACCTTATGTAGAGAAGGAGGCTTATTTCTCCACTGGTTCGAAATCCGGGTTCACTGAACTCGTGACTGGTTGGGAACCGCTACCAAGCAAACATATCATTCCTACCGATCTTCCTCAGGAGGCTCACATGGTGAGAGAATTTTCTCATTTGGTTAAAGAGATCAAACTAAATGGCTCCAAACCTGAGAAAAAATGGCCAACCATCACTCGAAAGACTCAGCTGGTGCTTGATGCAGTGAAGGCGTCACTCGAACGAGGGTTCAAACCTGTTGAAGTAGGACAGTGATTCCAATGGTCTTTTCTCATTTCTTGTTGCTGTATGATGCTATGTATTGGAACTTTAATTTGTTGGTCTGTTAGTGTGATCATGTTCCTTTGCACTTGAAAAGGTTGGAAAGCTATGCATTGTCTTGAAGAGCTAAAAGCATGAAAAGAAGTCATTCCCTGAAGATCATTGCATGGTTAATTTGTGGCAATTGTGTTTATGTTGTTCAAATGTTCTTGTAATAAATTTAGAATCATCAATTTGGAAGTTTAGATTTTGGATTTCAAACATGGCAGGAATTTTGATAATTTTATTATCAAAATGCTTAAATTTATTATGAATCAAAACCAACATCTTCTCATGCAATGGTAGAAGCTTAATCAGAATTAGAGATAATTAGGTATTAGTTTTTGTTTGAAAGAAACTAATAAATGGTAATACATAGTAAATGAGTTGTTTTCAAATATAGGAAAATGATTTAAAATATTTATAAATATAGCAAAATTTTACTGTATATCTGCGATATATCGCGATAGACTACTATCTGTGTTTATTTGTAGTTTATCATGATATAATAGTCTATCACAGTCTATTGTGATCTATCGCATATAGACAGTGAAATTTTGCTATATTTGTAAATATTTTCAACATTTTGTCATTTAAAATAATTTTCCTAGTAAATATACTTTAATATAGATGTTATTTAGTTTTGCTTGAGGCTTAGATTTTTATACTCCATTTGTTGTACTAAACGAAGAAAAAAGAAGGGACTAAGATGTCTTTTGATAATTATTATTTTTTTAAGAAAAAAATTAGTTAGTTTACTATAGTTGGTTGCTTTAAAGAATATTTTTAAAATGGTAGTGAAGATTTAAAGCTATGTATGTGTGTGTACACACACAATCATATATATATATTTGAGTTTAACAAGTGAGATGAAATGATTTGAATTTCAGTCCTTTTGGTCGAGGACACATGTTTTAGAATAGAGATGTTCATAGTTTTCATCTCTACCTTGCCTCTTATTTTAATTTCCATCTCCATGAAATTTCTCATTTAGTTTTGTGGGGAATCTAAATCGGGTTTCCATAAAAAAATTTCGTTTTGTTTTTTAATTAATTTATTTTTAAAAAGATTTGTTCTCAACCAAATAGATTTTTCAAAATTTTATATATTAAGCGAGTCCTTTTTAATACAATTTTTGTACTTAAATAAAACATTGCATTCTCTTATTAAAAACAATAATATTCAATATGTAAAAGATAATTGAAATATTTAGTTTATATAATTTCTAAAAATTAAAATTTAAATATTACAACAAAACATTTCAATCTTCAACTTAAATCTCTATTTAACTTTCGAGGAGAAAAATCTTCACATTCCCTCTCCTATTTTTCATCTAATTAGAGATTTCTCGTCCTGATGAAGACAACTCTTACGGATTTTAAATGTATCTCTAGTTTGTAATATAGGTGTGGAATTTTAAAAATTATATTTTACAAAAAAAAAATATGCTAAAAAAGCATATATTACAAAGAAAATGTTGGTAAACAAACAACATACGCACAACAAAGCACATGAAATAAAATTTATTGCAAAAAAAAAAAAAAGCACATGAAATAAAATAAAAGAAAAGAAAAGACAAACGAAATCCTTATTTGACGAACTCAATTATTTAATTATATAAAATTTCAATTTATTTCTTTATATAAAAACAAATTATAATTTATTATCCCGTCGATAAGTGCATAATCTCTCTGGAAAA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Homology
BLAST of HG10004089 vs. NCBI nr
Match: KAA0031669.1 (exocyst complex component SEC6 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1386.3 bits (3587), Expect = 0.0e+00 Identity = 733/760 (96.45%), Postives = 738/760 (97.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. NCBI nr
Match: XP_008456686.1 (PREDICTED: exocyst complex component SEC6 [Cucumis melo] >TYK04442.1 exocyst complex component SEC6 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1384.0 bits (3581), Expect = 0.0e+00 Identity = 733/766 (95.69%), Postives = 738/766 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. NCBI nr
Match: XP_004140937.1 (exocyst complex component SEC6 [Cucumis sativus] >KGN46092.2 hypothetical protein Csa_005176 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1382.1 bits (3576), Expect = 0.0e+00 Identity = 731/766 (95.43%), Postives = 739/766 (96.48%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. NCBI nr
Match: XP_023540057.1 (exocyst complex component SEC6 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1379.8 bits (3570), Expect = 0.0e+00 Identity = 730/764 (95.55%), Postives = 735/764 (96.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. NCBI nr
Match: XP_038884614.1 (exocyst complex component SEC6 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1379.4 bits (3569), Expect = 0.0e+00 Identity = 732/766 (95.56%), Postives = 738/766 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94AI6 (Exocyst complex component SEC6 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SEC6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1268.8 bits (3282), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/766 (87.08%), Postives = 704/766 (91.91%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SZ83 (Uncharacterized oxidoreductase At4g09670 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g09670 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 491.9 bits (1265), Expect = 1.9e-137 Identity = 233/354 (65.82%), Postives = 290/354 (81.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54BP6 (Exocyst complex component 3 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=exoc3 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 230.3 bits (586), Expect = 1.0e-58 Identity = 189/779 (24.26%), Postives = 361/779 (46.34%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49305 (Uncharacterized oxidoreductase ORF334 OS=Rhizobium meliloti OX=382 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 126.3 bits (316), Expect = 2.1e-27 Identity = 113/358 (31.56%), Postives = 176/358 (49.16%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D4GP30 (D-xylose 1-dehydrogenase (NADP(+)) 2 OS=Haloferax volcanii (strain ATCC 29605 / DSM 3757 / JCM 8879 / NBRC 14742 / NCIMB 2012 / VKM B-1768 / DS2) OX=309800 GN=HVO_B0029 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 120.6 bits (301), Expect = 1.2e-25 Identity = 92/256 (35.94%), Postives = 121/256 (47.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SQX3 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold139G004500 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1386.3 bits (3587), Expect = 0.0e+00 Identity = 733/760 (96.45%), Postives = 738/760 (97.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BZV5 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold409G00410 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1384.0 bits (3581), Expect = 0.0e+00 Identity = 733/766 (95.69%), Postives = 738/766 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3F1 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496559 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1384.0 bits (3581), Expect = 0.0e+00 Identity = 733/766 (95.69%), Postives = 738/766 (96.34%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HH11 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462863 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1375.9 bits (3560), Expect = 0.0e+00 Identity = 728/764 (95.29%), Postives = 734/764 (96.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JMF6 (Exocyst complex component Sec6 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487186 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1374.4 bits (3556), Expect = 0.0e+00 Identity = 727/764 (95.16%), Postives = 733/764 (95.94%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. TAIR 10
Match: AT1G71820.1 (SEC6 ) HSP 1 Score: 1268.8 bits (3282), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/766 (87.08%), Postives = 704/766 (91.91%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. TAIR 10
Match: AT1G71820.2 (SEC6 ) HSP 1 Score: 1201.4 bits (3107), Expect = 0.0e+00 Identity = 646/810 (79.75%), Postives = 682/810 (84.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. TAIR 10
Match: AT4G09670.1 (Oxidoreductase family protein ) HSP 1 Score: 491.9 bits (1265), Expect = 1.4e-138 Identity = 233/354 (65.82%), Postives = 290/354 (81.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. TAIR 10
Match: AT1G34200.1 (Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase-like family protein ) HSP 1 Score: 406.0 bits (1042), Expect = 9.8e-113 Identity = 199/355 (56.06%), Postives = 258/355 (72.68%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004089 vs. TAIR 10
Match: AT1G66130.1 (NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein ) HSP 1 Score: 283.9 bits (725), Expect = 5.6e-76 Identity = 155/365 (42.47%), Postives = 227/365 (62.19%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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