
HG10004085 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCTACTTCTACCTTCTGTTACAGAAATGTTCTTCCTTCTCGCAAATCAAGCAACTCCAAGCGAACCTCATCATCAATGGCCATTTCCAATTCTCTTCCTCTCGCACTAAGCTTCTCGAGCTCTGCGCCATTTCCTCCTTCGGCGACCTTTCTTATGCCCTCCATATTTTCCGCCATATCCGGTACCCTTCGACCAACGATTGGAACGCCGTCATTCGCGGCACCGCCCTGAGCTCCGATCCCGCAAATGCCGTTTTCTGGTACAGGGAAATGGCTGCGTCAAATGGGCCTCACAAAATTGACGCTCTCACATGCTCTTTTGCACTCAAAGGCTGTGCCCGCGCCTTGGCTCGTTTTGAAGCGATGCAATTACATTCGCAGCTTTTTCGATTTGGGTTCAATGCTGATGTTCTCCTACAGACTACATTGCTTGATGCGTATGCGAAAGTTGGGGATCTTGATCTTGCCCAGAAACTGTTCGACGAAATGCCGCAACCAGATATTGCTTCGTGGAACGCCTTGATTGCTGGGTTTGCTCAGGGCAGTCGACCAGGTGATGCTATAATGATGTTTAAGAGAATGAAGGATGATGGAAATTTGAGACCCAATGAAGTAACTGTTCAAGGTGCTCTTTTGGCGTGTTCACAATTGGGTGCTTTGAAAGAAGGGGAAAATGTTCATAAACATATAGTAGAGGAGAATTTAGATATGAATGTGCAGGTTTGTAATGTCGTTATTGATATGTATGCTAAATGTGGATCTGTGGATAAAGCTTATTGGGTGTTTGAGAACATGAGGTGTGACAAAAGTTTGATCACATGGAATACAATGATAATGGCGTTTGCAATGCATGGTGATGGGTACAAAGCGTTGGATCTTTTTGAAAAGTTGGGTCGATCTGTAATGTCCCCCGATGCAGTATCTTATCTAGCCGTGCTATGCGCCTGCAACCATGCAGGGCTTGTAGAGGATGGGCTTAAGCTGTTCAATTCAATGGCGCAAAGGGGGTTGGAGCCAAATATGAAGCATTATGGAGCCATGGTTGATTTGTTAGGTCGAGCGGGGCGTCTCAAAGAAGCTTATGAAAATGTAAATTCAATGCCTTTCCCTAATATGGTACTCTGGCAAACATTGCTTGGTGCTTGCAGGACATATGGGAATGTAGAAATGGCAGAACTGGCATCAAGGAAGCTAGTAGAGATGGGATTTATTAGCTGTGGTGATTTTGTTTTGTTATCGAATGTGTATGCCGCCCGCCAGAGATGGGATGATGTTGGGAGAGTTAGGGACGCCATGAGAAGAAGGGATGTGAAGAAGACACCAGGATTTAGTTACATAGAAGTAAAAGGTAAGATGCACAAATTTGTATATGGTGATCAAAACCACTCGAGTTGCCGTGAGATCTATGCCAAGCTTGATGAGATCAAGTTCAGGATCAAAGCCTATGGATATGCAGCTGAAACTGGCAATGTATTGCATGATATTGGAGATGAGGACAAGGAGAATGCACTGTGTTATCACAGTGAGAAGCTCGCTGTGGCTTTTGGATTGACTTGTACTGAAGAAGGGACCCCAATTCAAGTGATTAAGAATTTAAGGATTTGTGGGGATTGTCATGTTGTTATTAAACTAATATCTAAGTTTTATAATCGAGAAATCATTGTAAGAGACAGAACTCGATTTCATCGATTTAATGAAGGTTTGTGTTCTTGCAAAGATTATTGGTGATACTTATTGGCTCAATACTTCTAAAATCAAGATGAAGCTCTCTCGAAAAATGTCCCATGTCTCCGGTGTAGGAATGTATTCTTTCATTGAGTCAAGATTTAAGGGGCAGCTAAAGTTTCAACTTATCAAGTGTTCAACTTAGAGGTTTGAACTCAAAACCTTGGATGTATCTCCAAACATCTCAAACTCTTACACCAAGATTCTCTAGGAGATTAGAACAACGGCTATCTTTTTAAAAAATGAAATACCATTTTTGAGAGGAGGGTGTGGGATCTTTTCTGAAATGCCTTATATGATGCATCTCGCCTCTTGGTTATACGTTCATTATCTTTTATGAAATGCCTTCTAAATATAATACGACCATTGCTGGCTGCAAGATCATTAAGGCATGAAGTGAATGCGCTTCAAAATGGTAGCAGGCACGTCTTATTCCGTCTTTAATGCTTCTGAAGCTCCAAAAATTTAGTTTGAATAGTATATATTTTAACCTTGCACTTGCAGGACTGTTGTTGTTGTTGCTTTACCACTTTGATGATGATAGCCAGAGTGAAAATTTTGAAGAGGTGGGCAGCATTTCCAGAAATGTAATTCCAATGCCAAAGGTGAATCAATCATGGTAACATTACAAATCTATATTTCTGTTGGATTCTCTGTTTACTTTCTTGTCTGGATTGGATTGAATGGATCACTTTAAGAATGCTTTGTCATTTGCTGGAGCTAATAGAAGTAAGCCGTGACACTGTGAAACATACTTAATGTAAATATTTAGACTTTGCAGATGGGGCGGGTCAAGACCGAGGAAGAAGGCAGCTGTGAAATAATGGAATATCAAATTTCGAACTGGGATTGAGATCTTTAGTAGACTCTCATACAGAAAAATGGCAATGGACAACTACAATGTGTAGTGAATATGGTATGACCTTATTCATTGCTTATAGTTAATAGCTTGGCTTATGTTTTTGGTATAAAATGAAAATCAATTAGGTCATGTTCTTGAGGGATATAGAACTTCAAGAACTGTCAATCTAAAGATGAAATTGAGGGTTAGGCCTGAGAACCCATTCAGTTTTTAATAGTTAAGCTTATAAAACCCACTTTTATTTATGATTAGCTCTTCACTTCTGATTTTTTCTAGCTAATTGAGAACAATAACGAGTTCTTTATTTTTTGTTTTTTTTAAAGACTTGAAATTTATTTATAATTTATTTATCAGTTATAAAAATGACTTTGAGATTAGATTAAGAGGATGGGATGAAGTATAAGTATAATTTTCAAAATCGAAGTACTTGATGGGCTGTTTTATCAAAATATAATGAAAATATGAATTCTTTTTTTTAACACATAATTTGGAGATGAAGGTTTAAATTTTTAATCCCGAAAAAGGAATAGATTTCTTTTTTAACACATGTATGTTCGTTTGAATTGTGATAATTTTTTTATTTTTATTTTTTGATAATATGTTTGGTGAAAGAATTGAACATTTAACCTCGATGTTAATAGGTAATCCAAAAGTTTTTATTTTTTATTTTTTATTTTTATAATTTTTATAATTTTATTTTATTGGAGGCATGATGTTTAGACATGCTTGAAATGGAGAAACATTTTTTTCAACGGGTTGATATTGATTTTTGGGGTTGGAAAATTAACGCGCTTTGTATGAAAATGGACTAGTGAAAGAGATCTCCAACATTATCTATTTCATAACAATTTTATTAGTTTTTATAATAATAATTAAACGAATTTAATATTTAATTAATTTTTAAAATAAATTTATTTAAAAAATATTGTTTCTGTTAGTTATTTTTAAAATATTGTTGAAACGCTAGTCAACTTTTTTAAAAGAAAAATAAAATTCTGAAATAATATTTTTTTTCCTTTTGAGAAATTTAAGCATAGGTAAAATTACAGAGTAAAAGAACAATTAATTAAAAGAGTTTTTTTTTAAAAAAAGATTAAACAACAAAAATATTAAGTAAACTGTATAGTAAAATTTCCAATTTTCTACTTGATCAAAATTAAAATTATAAAAGTTGTAGTAAAATTATATTAAAGGATTTGGTAAAAAGAATTTAAATTCTTCAGTTTTTTAATATATTTTTGTGTGATTGTTAATGGATATTTTAAAAAGATAGTAGATTCAATGAATTATTAACTTTTCGAAAACAATTTCTCCTATTTTATTGCCTCTTTTTTTGTGGTCTGGATTTAATATATTATACTCTAAATTATCGATTTGGTTATTTTCGTCTTTTCCACTTTTTTTAAAAGAGAATTCTTTTAATAAAAAATAGAAATCTTTTAGTCAATTGAAGCTTTATTTTGTTTGAATTTTTAAACCTCGATATATTTTGTTTTAATATTTGAATTTCAAGATTCAAAGTCCAAAATACAATACTAAAATTTGATATCAATGATTAAAATAGATGTTAATATACGATTTTTCTCAAGAAAAAAAATGTTAATATACGATTTTAAGGATGGAAAAAAGCATTTTTAAAATATTAAAATATAAAGCAAATAGATATGAAAGTCAAAGACTTAACTTTTTTTCCTTATTACTTTTTCGTTAAGTATAGGCGACTAAACTAAACGAACAAATAATTTAAATGTTAATTTATCTTCTTTTTACTTTATTATATGTTTGATCAATCATATAATATATAGGGGTGAAAATGTTATTTTAGTCCCTATAGTTTGAAACTTGTTCAATTTAGTCTCTATATTGTCAAATATCCAACTTTAGTTCCTATACCTTCAAAAAAATCTCATATTTAGTCCCTATTGCTTGTTTGTTGTTGATTTTTCAATTTTTGTTATTATATGTTAGCACTTTCACTATAAATTTTGAAAACAAAATCACAAACTATAATTTCTTGCATTAAAATTGTTAATATTAGGAAAATTTTCACAGATAGAAAAAATGTCAAACTATTTACAGAAAATAGCAAAAAAAATACTGATAGATATTGATAGATTTCTATCAACATCTATCCGTTATAAACTTCTATCATTTCTATCACATCTAAAAATTTTGTTATTTTGTGTAAATAGTTTCCTTTATTTTTTTATTTTTAAAATTTTTTCCTATTATTATCTAACTAATTTCAATAAAAATTATTTTTTTATGAACTAAATTTAAGATTGATTAAAAGAGTAAGGACTAAAAGTGAACAATCCCTAAAATATAAGGACCAAAATATATATATATATATATATAGGGTTGTTTTCAAATATAGAAAAATGAGTCAAACTATTTACAAATA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Homology
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Match: KAA0031655.1 (NAC domain-containing protein 17-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK04455.1 NAC domain-containing protein 17-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 963.8 bits (2490), Expect = 1.6e-276 Identity = 477/530 (90.00%), Postives = 498/530 (93.96%), Query Frame = 0
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Match: XP_008456695.1 (PREDICTED: NAC domain-containing protein 17-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 962.6 bits (2487), Expect = 3.6e-276 Identity = 475/526 (90.30%), Postives = 495/526 (94.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. NCBI nr
Match: XP_004140940.1 (NAC domain-containing protein 17 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN46093.1 hypothetical protein Csa_005106 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 932.2 bits (2408), Expect = 5.2e-267 Identity = 461/536 (86.01%), Postives = 486/536 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. NCBI nr
Match: KAB1219921.1 (NAC domain-containing protein 78 [Morella rubra]) HSP 1 Score: 907.1 bits (2343), Expect = 1.8e-259 Identity = 539/942 (57.22%), Postives = 649/942 (68.90%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4FVP6 (NAC domain-containing protein 16 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC016 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 372.9 bits (956), Expect = 1.6e-101 Identity = 231/524 (44.08%), Postives = 314/524 (59.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XIC5 (NAC domain-containing protein 17 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC017 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 368.2 bits (944), Expect = 3.9e-100 Identity = 232/537 (43.20%), Postives = 314/537 (58.47%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4IED2 (NAC domain-containing protein 13 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC013 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 314.7 bits (805), Expect = 5.1e-84 Identity = 224/554 (40.43%), Postives = 298/554 (53.79%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M9G6 (Cleavage stimulating factor 64 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CSTF64 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 283.1 bits (723), Expect = 1.7e-74 Identity = 214/502 (42.63%), Postives = 272/502 (54.18%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q84K00 (NAC domain-containing protein 78 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NAC078 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 8.3e-58 Identity = 113/223 (50.67%), Postives = 153/223 (68.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BZ67 (NAC domain-containing protein 17-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold409G00600 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 963.8 bits (2490), Expect = 7.8e-277 Identity = 477/530 (90.00%), Postives = 498/530 (93.96%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3X9 (NAC domain-containing protein 17-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496564 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 962.6 bits (2487), Expect = 1.7e-276 Identity = 475/526 (90.30%), Postives = 495/526 (94.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0K9G3 (NAC domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G052680 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 932.2 bits (2408), Expect = 2.5e-267 Identity = 461/536 (86.01%), Postives = 486/536 (90.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A1W3X6 (NAC domain-containing protein 78 OS=Morella rubra OX=262757 GN=CJ030_MR3G009563 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 907.1 bits (2343), Expect = 8.7e-260 Identity = 539/942 (57.22%), Postives = 649/942 (68.90%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6A1WAT1 (NAC domain-containing protein 78 OS=Morella rubra OX=262757 GN=CJ030_MR3G009562 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 902.9 bits (2332), Expect = 1.6e-258 Identity = 542/967 (56.05%), Postives = 658/967 (68.05%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. TAIR 10
Match: AT1G34180.1 (NAC domain containing protein 16 ) HSP 1 Score: 372.9 bits (956), Expect = 1.1e-102 Identity = 231/524 (44.08%), Postives = 314/524 (59.92%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. TAIR 10
Match: AT1G34190.1 (NAC domain containing protein 17 ) HSP 1 Score: 368.2 bits (944), Expect = 2.8e-101 Identity = 232/537 (43.20%), Postives = 314/537 (58.47%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. TAIR 10
Match: AT1G34180.2 (NAC domain containing protein 16 ) HSP 1 Score: 364.8 bits (935), Expect = 3.1e-100 Identity = 231/536 (43.10%), Postives = 314/536 (58.58%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. TAIR 10
Match: AT1G32870.2 (NAC domain protein 13 ) HSP 1 Score: 317.4 bits (812), Expect = 5.6e-86 Identity = 220/545 (40.37%), Postives = 296/545 (54.31%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004085 vs. TAIR 10
Match: AT1G32870.1 (NAC domain protein 13 ) HSP 1 Score: 314.7 bits (805), Expect = 3.7e-85 Identity = 224/554 (40.43%), Postives = 298/554 (53.79%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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