
HG10004079 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGACAGAGTGGAACATTCCCTTGATCATAGAGAAACTGCCGGAGCAATCGGGATGATTTCAGGAGCTAACGAGTTTCAGCCATTGGAGGAAAACCTAATTGTCAGTCTTCAATCCCAGCTTCGTTTTCTCCAAGGCAGGGTTAAGGTTTGACCGTCTTCTCTCATTTCAACTTCCGTTTGGTTAATGACATAGTGGCGAAGTATTGGGAGAGCCATGACAGATGTTCGATCTCAATCCACTAATCTGACAGGAATTGGAGGAGGAAAATTTGAAGCTATCCTCTCGACTTGCTAGTTGCCGCTGTTCTGAGGTTTGGTCGACTATATTAGAATGAAATCAGAGCTATTTGGTTCTCATGCCGGCCTAGCTAGCCGTATGGTAGACTTTTCGTCAGGGCTAACTAAACATGAATTCGTGCAGAGGAGGATAAACTTTGACGACGGGAGTAGATCGATTGAGAAAAGCAAGGAATCTGGCACTACTAAGAAGAAAACAGTAGAAAAAACTCCAGGCTAGTCATTACTTTATGACCAAATAGAGTCTGTTTGTTTACTCCTCCATATTTGCACACACATATATATATTGGAAATAAGAGGATATCCATGGTAGCATGGTGGAGCAGTAGTAGCTCACATGTATATACGACTAGGAACGCACTTTCATATCTTGTAATGTAATGAGATTATTATGAAATTCAAGATTAAGAGATGATGATTTGTGAGTCCGAACTATAGTCCAATTATGCATTAGCAGATGACGAAATATTCAATGAGGCCGGTACAATGTGTCGGCCTCACCAAATAACTTTCATGTCCCTAATAATCCTACGACACAGAGTAAAAAGTGAAAAATGATGCAACTCAGTCTAAAAATGGCAAGCCTATTTTTTCTTTTTTGCAAAATTTTTAAAATTTATTTTACGAGCAACAGACGTTTGGAATGTTTATGAAATTTAGATGAAATAATTTACGGTAGTTTCATGCATATTATCAACCTTGTTTATAATATATCACAAGAGTCATATTCCATGTTTCTTTTGCGAGGATTATCTTCTGGAATGATTTGGTTGTTTCTACTCTCAAATTTAATTATTTTATGGGTGAAGGTTATAACACAATGATCTTGGAGCACTGTTCGAAGAGATATATTGCTCTAAAAATAATGTATTTCGGGCAGAGGTATGTAATCTTGTCATAATGGGAACAAGACCAGTGTCTTTTAAGTTTTACTTTCCCCTGCTAATTTTCCGTACATCATAGTCCTCCAGTAACTTCTTCTGAAGTAAGGAGAAATCTTATTTAAAAAAGGAAAAAGAAAAAACAAACAAACAAAAGAAGAATCAAAACAAGTTGTCACTAAAACTATTCTGTCTTTGTTGCTCTTTTGATATTGCGAAAATTCAACTTTGTATCAAATAATGCCTGAAGTTCTGGTTACATCATCTGTACAGGTTCTACGGTTTTGCTTCAGAGGCACAAATGGAACCAACAGTTGAAGTACAGTTTCAAATTCAGCTTCTTAAATCTTAACAAATTATTTATGATTTTTCAATTACATTGGTACTGGTGGGAAATGTCAAGATCAAGAACGCACGATATTGGTTCTCAATGTTTACTGGGAGTGCCTAAACATTTAATAATGCATTTAGAGGATCATAATATCAATTTTTTTTCACCTTCCATCTTTTCTAATTGATATTTGATCACACCATCTGTTAGAACTCATCATGCAACTCTCAAAAGTAAATATAAGGTTTTCTTTGTCAACAAATACTCTTCCGCTCCTGCTTGCTAAGGAATAACATTGATATTATTTTGATGCTGTGCTTAATTATGGATTTGGATTATAATTAATAATGCTAGAAAACACAATCAACAATGATTTTGGTCCTTCTGATCAGTAGCATGAGTTTGAGTCATAAATCTCATAAGCATGAATTAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGTCAATTAGTTTGTTATGGAAATAATGAGAATGCTAAGGGGGTGTCAACATAGTTGAGATTCCCGTGTACATCTCTTGATCCCTATTTTCGCTATTTGTTTCTTCTCGTATCTACTTTGTACTTTGAGCATTAGTCTCATTTTATTAATTCAATGAAGAGGCTGGTTTCCATTTCAAAAAAAAAAAAAAAATCTCTTAAGCATGAATTATGAGGTAACCAGACTCCCAAGATTTCAGAGGCTTTGGATGTCTCCTGAGTTTCACTCCAGTAATAGTAATTAGCCCCTCTGACCTTCACCCTTGCAATTCCTTCTTACAGCCACCCTCTCTTCACCTTTCCCTCTCTTTTGTGATTCTCTTGCGATCCCAAAAGAAAACAAAAGGATTAAGAGATAGATGGAGCCAAAGGTGAACTAAAAAGAGAAGGAATAGTCACTGGAAAAGACTTTTGATAGGGTTGATTGGGACATTTGGATACTATATAAAAGTTGAAAGGCTAAGGCAATAGACGAGCATGACTTCATGGTTGGGTGTTACATTTCACATCAATTTGTTTAAGGGAGGGGGTAATGGTAGATATGGTGGTTGTGAGGAATGTTGGGCGAGAAGAAATTTAATTGTTAATTTTTTTATCCATGGATTAATTGTCAATTTGTTATCTCATCTTCCTGCAGTCTGAAATTTTCAGAGCTCTTGAGAAAGCCAGGCTTCTTGGTGTTGGTAGGAAGGAGTCTTGTTATTCAAGATGTGGGAGAACGGACAGGGGAGTCTCATCTGTCGGACAAGTAAGACGTTTCAAATCTGTAGGGAATAACATTGTATGGCTAGAATAACATTGTACGGCTAGAATAACATTGTATAATGATAATGTTATGCTTGTTTCCTGAATACTGAATTAATTCACTTTTGGTTTTCCATTAGCCGTTCAAAATGACATTTCCTGCCACCTCTTACACGTCCTTGGGGGGTTTGGTTGAGGTGTGGAATGGAAACGGAAATCTAATGATACCTCTTTTATGTAGTTGACTAGGACTGTCTTGTAATGTTCTTTATGTGTCCCTCGTTTGTACGAACGCACGAAAAACACATGAAAATATTGCTGAAAAAGCTTAATATTTTTAATATGAAAACCAAAGAGATGAAGATGGACAACATAATTCTTTTAGTTATTTGGGTTTTTCTTCTATGGATTTATTATTATAATTATCAAGGCTACAGTTCGTTGTCCAAATTTGGCTTTTAATTTAAATTTATATTACAAATGCTTTTCTGGTTCCGTAAGTCATTAGTCACCCAGTAGTCAGAGAATCAGAATTAATTGGGCAACTTTGTTGACCTTCCAATCATCATTTGACTTAATTTCCCCTTTCTTAGCATTCACATCACACTATCGTTCCTGCAGGTAATTTCTCTCTATTTGCGGTCAAACCTTAAGGATCCCCCTAATGGTGAAAATAGTGATCATAATGAGGAGCAACATGGTCAGCCAAGTTGATGTTGCCAAAGTTGTTCTCTGTTGTTAATACCTTGCATGCTGAATCATTCTAATGAGCTGAGTGATGACATTGAGTGGGTCATATTTTTTGCTTTCTGTTTTACATGGATGTATTTGACTATTTTAATAGTTGATAGATTTTCATAGCATTAAGTTACTGCAAATGATACAAACTATGTTTTAGTTTACTGTTTTTCCCAAAAATTTAGACTGTCATTTAAAGCATTTTTCTCTAATTAGCTTTACTATAGGGTGATAATATCTCTTTCAACAAGTGTTAACGTTCACATCACCTACTATCTCTTTGCGTTGCTAAACATAACTTTTAATGTTATCTTATTGTAACAAATTAGTTTATGTACAAGCAGACAATTAAGAGCAAAAATCATTCTCGTTGATTCTGTCCTGTTTACATTTGTGTATAGTATTTTAGATAATGGTGGCTCCATTGTCTGATTTTTGTTAGAAATATAAAATATCAATGGAAGAGCCTTCAAAGAATGATAGATTTGATAATGATGGCATTCTTGTTTGAAACTTCAAAATATAACAGAGTCTTTACTGCATTAGGAAAGGAAAGTAGATGGTAGCAAGACCGTATATAGGGAACTGCAGACATATATATATATATAAATAAAAATGTGATCTATTGTTTCATGTGCTTATTTTTTCTGAATTTCATATTCTATAGGGGTAGGTTCTTTTGTGTTCTAATTGGAGTGTTGCATGCTTTTTCCATCTCTGTTATCTTAATTTCACTTTCTTTATTATTTATTCTCAGATGGAGAAATTGATTATGTGAGAGTAATTAATAGAGTCCTTCCTAGTGACATTCGGGTGTTAGGCTGGTGTACTGTTCCTATTGGCTTCAGTGCAAGGTTTGTCTTGCTCTTGTGATTTTTTATAGATTTATTTATTTCCCTTTGGCCTGTTCTTGTGAGCGATGTGTTGTGTAGTTTTTTAATGGGAATTTAGGATCACGAAACCAGCATCCAGCAGATTTAAAAATCAATCTAACTGGCTTTGACTGCAGAGCTGATGTGCCTACATGAAATTTTGAACATAGCCGGGTGCTATGCTTTAACCTTCTAAATGTCAATACACCTCTCTAAGAGTTGCAGTGACCATCAGCATCTCCTTGCACCCCTTACCTTATACAAGCAGCTTTACTTGTGTGTTCTTCTTTTTCTTTGTTAGATACAGCTGGGGCTACATGCTGCTTAAGTTTTTTAGACATGCTTAACATTGCCAATGTATGTATTGCATCATGATCTGGGGATGACATTTTACATTACTTTGGGGCATTGGTTTGAAACCAAGAACCATGTTTGATTTTTGGTTACTTCCTAAAATTTGAGTTTACACATGTATTACCTTTTTGCTAAAGAATAATATTTTTTACAAGGGACTCAGTCAATAGGGATTATGGTTCATAATTATCTTAAAATTAGTTTTGGAAAACCCACGTTGTAACTCATACCCAAACAATTCAAGAATGTTCAAATCCACAATGTTGAGTGTTATACTTGGTAATCAT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ATGGACAGAGTGGAACATTCCCTTGATCATAGAGAAACTGCCGGAGCAATCGGGATGATTTCAGGAGCTAACGAGTTTCAGCCATTGGAGGAAAACCTAATTGTCAGTCTTCAATCCCAGCTTCGTTTTCTCCAAGGCAGGGTTAAGGAATTGGAGGAGGAAAATTTGAAGCTATCCTCTCGACTTGCTAGTTGCCGCTGTTCTGAGTCTGAAATTTTCAGAGCTCTTGAGAAAGCCAGGCTTCTTGGTGTTGGTAGGAAGGAGTCTTGTTATTCAAGATGTGGGAGAACGGACAGGGGAGTCTCATCTGTCGGACAAGTAATTTCTCTCTATTTGCGGTCAAACCTTAAGGATCCCCCTAATGGTGAAAATAGTGATCATAATGAGGAGCAACATGATGGAGAAATTGATTATGTGAGAGTAATTAATAGAGTCCTTCCTAGTGACATTCGGGTGTTAGGCTGGTGTACTGTTCCTATTGGCTTCAGTGCAAGAAATAATTTGGATCTGCATTTTCACCAGGCTATGGAGAGGGCCGGTAAGAAGTTTGTAGGGGAACACGACTTTAGAAACTTCTGCAAAATGAATGCTGCAAATGTTCACAATTATAGGCGACGCATCATGTCGTTTGACATTTCTCCTTGTGATGTGAGGATGGAAGGCAATCTATTATGGGCATTCAACATTGAAGGCAGTGCTTTCCTCTGGCATCAGGTCCGCTGCATGGTTGCTGTAGTATTCATGGTTGGGCAAGGTCTTGAAGATCCTGATGTCGTAGATATTCTACTGGATCCATTAAGTACACCAAGGAAGCCTCAATACGTTATGGCTTCAGAAAGTCCTCTGGTTCTTCATTCTTGTGAATTTGAAGGTGTCAAATTTAGGTGTTCGTCAGATGCTGGAGAAGCTCTTCAGTTGCATTTATCAAATGAAATCCGAACATATGAGCTCCAAGCTGCAATATTCAAAGAAGCTCTTCTAAGCTGTTTGCCAATCACAAATGATGGGAGCTCTTCAGACAAAAGAAAGTTAAAGAAGAAAAATTGCCATGTTGCCCTATTGTCAAGGCCAACTGAGCAAAATTGTGTCTCGTTCTTGTGTTGTGTTGATTTTGCGGTGAAAAATCCATTGGGAAAAATGGAGGCGGCCATGGGATTGATGAGGAGAATGCCTCCAAAGCACTCCGAAACCGCTCTTTCGGCTCTTCTCACTCTCTTGCCCCACCATTCTTCCGATCTACTCTCCCAGGTTGACCAGCCTCTTCAGGTTCTATGTGATGTGGACAATGGGAAGGAATTCATTTTGTGTGAATACAACAGAGATGCAGATTCATATAGATCACCGTGGTCAAACAAATACCATCCACCATTGGAAGATGGAGCTATGCCATCTATAGAGTTGAGGAAACTTGAAATTGAAGCAAATGAAGTATTCACAATCTATCGTGACCAGTATTATGAAGGTGGCATTTCATCTGTGTATATGTGGGAAGATGATGAGGAAAGTTTTGTCGGCTGTTTTTTGATAAAGAAAGATGGCTCAAAGACTGGTCATGGTCGAAGGGGATTTCTACAGGAGGGAGCATGGGATGCCATTCATGTTATTGAGGTGAGGCTAGAAGATGAGGGTACAGCCAGCTATTGTCTAACTAGTACAGTCATGCTGTCCTTGACAACAGATAACAATGCAGCAGGGACTTTCAGTTTGTCCGGTTCAATTAGAAGACAGATGAAGATGAAGCTCTCAGTTGCCGAAGGCCATCTTTGTAACATGGGTCGAATGATCGAAGAAATGGAAAGTAAGCTGAGGAATTCACTCGATCAGGTAATTGTCCCCCGATCCTTCGCCTCTCTCGATTTGTCATCTCTGGATCTGTATGCCCTTTTCAAGGCACAAGGTTTAACCAAAGAAATGAAATTATTCGACGTGGTACCCTTCACAGGTCTATTTTGGGAAAACAAAAGAGATGGTTTGCACCTTGCGGCCACCCTCAGAAGTGGTGCATATGAAATTACCCGACAAGTGACCACGGATTATACAGAAACTGAATCGGCATAG MDRVEHSLDHRETAGAIGMISGANEFQPLEENLIVSLQSQLRFLQGRVKELEEENLKLSSRLASCRCSESEIFRALEKARLLGVGRKESCYSRCGRTDRGVSSVGQVISLYLRSNLKDPPNGENSDHNEEQHDGEIDYVRVINRVLPSDIRVLGWCTVPIGFSARNNLDLHFHQAMERAGKKFVGEHDFRNFCKMNAANVHNYRRRIMSFDISPCDVRMEGNLLWAFNIEGSAFLWHQVRCMVAVVFMVGQGLEDPDVVDILLDPLSTPRKPQYVMASESPLVLHSCEFEGVKFRCSSDAGEALQLHLSNEIRTYELQAAIFKEALLSCLPITNDGSSSDKRKLKKKNCHVALLSRPTEQNCVSFLCCVDFAVKNPLGKMEAAMGLMRRMPPKHSETALSALLTLLPHHSSDLLSQVDQPLQVLCDVDNGKEFILCEYNRDADSYRSPWSNKYHPPLEDGAMPSIELRKLEIEANEVFTIYRDQYYEGGISSVYMWEDDEESFVGCFLIKKDGSKTGHGRRGFLQEGAWDAIHVIEVRLEDEGTASYCLTSTVMLSLTTDNNAAGTFSLSGSIRRQMKMKLSVAEGHLCNMGRMIEEMESKLRNSLDQVIVPRSFASLDLSSLDLYALFKAQGLTKEMKLFDVVPFTGLFWENKRDGLHLAATLRSGAYEITRQVTTDYTETESA Homology
BLAST of HG10004079 vs. NCBI nr
Match: KAG6578858.1 (putative F-actin-capping protein subunit beta, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1018.5 bits (2632), Expect = 2.8e-293 Identity = 536/713 (75.18%), Postives = 559/713 (78.40%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. NCBI nr
Match: XP_038884605.1 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 599.4 bits (1544), Expect = 4.0e-167 Identity = 322/444 (72.52%), Postives = 333/444 (75.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. NCBI nr
Match: XP_038884603.1 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038884604.1 tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 591.3 bits (1523), Expect = 1.1e-164 Identity = 321/447 (71.81%), Postives = 332/447 (74.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. NCBI nr
Match: XP_022992675.1 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022992676.1 tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 573.9 bits (1478), Expect = 1.8e-159 Identity = 307/449 (68.37%), Postives = 326/449 (72.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. NCBI nr
Match: XP_022992677.1 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 571.2 bits (1471), Expect = 1.2e-158 Identity = 306/449 (68.15%), Postives = 325/449 (72.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M9G7 (Probable F-actin-capping protein subunit beta OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g71790 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 384.0 bits (985), Expect = 3.5e-105 Identity = 184/230 (80.00%), Postives = 207/230 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P14315 (F-actin-capping protein subunit beta isoforms 1 and 2 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=CAPZB PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 239.6 bits (610), Expect = 1.1e-61 Identity = 124/236 (52.54%), Postives = 168/236 (71.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P79136 (F-actin-capping protein subunit beta OS=Bos taurus OX=9913 GN=CAPZB PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 239.2 bits (609), Expect = 1.4e-61 Identity = 124/236 (52.54%), Postives = 169/236 (71.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P47756 (F-actin-capping protein subunit beta OS=Homo sapiens OX=9606 GN=CAPZB PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 239.2 bits (609), Expect = 1.4e-61 Identity = 124/236 (52.54%), Postives = 169/236 (71.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P47757 (F-actin-capping protein subunit beta OS=Mus musculus OX=10090 GN=Capzb PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 239.2 bits (609), Expect = 1.4e-61 Identity = 124/236 (52.54%), Postives = 169/236 (71.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JWD4 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488950 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 573.9 bits (1478), Expect = 8.7e-160 Identity = 307/449 (68.37%), Postives = 326/449 (72.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JQK1 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488950 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 571.2 bits (1471), Expect = 5.7e-159 Identity = 306/449 (68.15%), Postives = 325/449 (72.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FEX0 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444871 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 569.3 bits (1466), Expect = 2.2e-158 Identity = 307/449 (68.37%), Postives = 326/449 (72.61%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3Y8 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496569 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 562.4 bits (1448), Expect = 2.6e-156 Identity = 310/446 (69.51%), Postives = 322/446 (72.20%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C3V2 (tRNA pseudouridine(38/39) synthase isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496569 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 561.6 bits (1446), Expect = 4.5e-156 Identity = 310/444 (69.82%), Postives = 320/444 (72.07%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. TAIR 10
Match: AT1G71790.1 (Subunits of heterodimeric actin filament capping protein Capz superfamily ) HSP 1 Score: 384.0 bits (985), Expect = 2.5e-106 Identity = 184/230 (80.00%), Postives = 207/230 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. TAIR 10
Match: AT1G34150.1 (Pseudouridine synthase family protein ) HSP 1 Score: 344.0 bits (881), Expect = 2.8e-94 Identity = 190/409 (46.45%), Postives = 243/409 (59.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004079 vs. TAIR 10
Match: AT3G06950.1 (Pseudouridine synthase family protein ) HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 9.6e-10 Identity = 75/267 (28.09%), Postives = 107/267 (40.07%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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