HG10004043 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGAAAAGCGTAATTGAATCGAAAAAGAGCAGAGTTAATAGGAAGCTCACATTACTCCCTTTCCAAACTTGATAAACGCGCTTGGCCATGATGGCAGGCACGGAGTTTCCCCTCGAAACTAAGCCGGAAGAGAGGCGAATATTTGGAACTTGTGGATGGTCATTTCATCGGCATTCAGACCGACCGAGGTTAAAAAGTCACAGGGGACGATTCACCCCGATCAGTCGACAGCGATTTATGGAGCAAACTGAAGCTCGGATTTAGGATTTTTGCGGCTAATGGCGATTGTTGTTTCCAATTCTGAATGGATTTTGAAAGGGAATGAGGATTCAAGATTTTACAGTGTCGCCCTCTTTCTCCCCAAACTTGTGTGGGAAACTCTTTGCGAACGAAATGACAAACTGAATTAAAGCCTTCGGGGAAAGGAAAAAAACTCTTCGTTCTGGCTGCTCGTTTACTAATGCACTTCTAATTTCGTGCTTTTTTGCTTCCCCCTCCTTTTTTTTTATTTTTATTTTTGATTTTTTCCTTTTCGCGAAATTACGTATTTAACCTTGTATATAGCCTCTCCTTTGACTTGGGTTTTATTGTTCCATTCCATGTGGTGGCTATGGTTTGGTTTCATTTAATATTTGAATGTTTAATTATTTTTCAAAATTAATTAATTTGTTGTCTTATGTAGTATGCTTTTATTTTTGACCAACAATAAGGAAGGAGTTGACATTTAAAATGGGTTGTGTGCAATTTTTTTTCTTCTTTGGACTTCAACCATATTTGGGATTGAAAATTTAAACTACACGTATAGCCTAAATAAATAGATTTATCAAAAAATAAAGTATGGTACATGTGATGTATATTTACATTTTTTAGTATATTATCAGTATATTCGACATATACTTCAGATAATGAGAGAGGATCGATTTTCAGCTGAGAATATGGAGTAAAATAAACGAATTCTCCTAAAATGATGGAAACATTAATTTGAAATATCATGCATTAAATGAATATCAACACAAATTAATAAATAATAAAAACAAAGTCCATTTGAAAATGGTGTTAATAAGGAAAGAATTAAACATTTGAAAATTTATTGATTCTCAATGTACATAATGATATTCTAGAAAATGAAATCTTTATATAATTAATATTAAATCTGAAAATGATATATATTTTTTATTTTAAAATATTATGTAATTAAAATATGAGAGAATGTTAAATCGCCAACCAAAAACTTAAGCTAGTAGGTAAAGACAAATTTAATTATATCATATAATAGAGGATCTATAAAAAAATAAAAATGTCTCAAAATGTTATTGAAATCTAATTATGAAATATTACTAAATTTCAGGATATGTGAAATATTAGTTATGTAGTAAGTTAATTCCTTAAATCTTTCAAATTTAAATCTTTAAATGGGTGTTTGGACCCCCAACTTCTGGTGGGTGAAACACTCAATGTTTGGAGTTCTAATTACAATAGTTAGTGTTTTCAACTATTATAACCTACAATTAACAATAGTATTACTATTTCAAATCTCTATTTGTTATAGTGTTTACTATTTTCTACTCCTCCTATATTTTTCTCCTTGTTACATTGTTTATTATTAACTACTAGACTAAAACAGTCTACACTCAAACACAGAGTATTATAACTCGGACTAAAATAGTTTGCATCCTAAACAATCAAACACGGACTATTACAACTCAAAGACTATAATGACCATAATAATCAACATAGTACCCCCAATACGCCTTAACTTTTTTGTTGTATATATATTCTAATAAGTTAAATTATGCTTCGATTGACATTTGTACATAATAAAAGGCTAAATGTATTTTCGATTGAATGACAAATATAGGGCAAAAGTTCATTTGGACTTGTTCGAAAATTTATATGATTCGACTTTTTTGCATAGATTCAAACCATTATACAAACTTAAAAGGTTGGTTCCTCGACCATTGTGGTGTTTTTTGTTTCGACAAATGTGAGAAGAAGATATTGATCTTCTAACCTCAAGACAGGTAATAGGTATCAATATGGCGTGGGTCATGTTCGGATTGACCTTCAACTATTTATGATGTGTTTAAGATTAAATTACAAGTTTAATAAACTTTTAAGTGTCTAATTTGTGTGTCTACACACATATATATATAGTGTGTGTTGTTATATTGTTAGTCTCTAAAATTTTATATTTGGATTTATTTTGGTCTATATATTTTTTTAAAAATGTATGTTGTTATATTTTTAATCCTATATTTAATAAGTGCTTGAATTTTGAAATATGTCTAATAAATGTTTATACTTTTATTTTTGTTTCCGATAGATTCTCATTTTTTTCAATTTTGTACCCAATATGTCATTAACTGATTTAACCCTTTTAAAAATTTATTGATTTATTAAATACAAATTTAATAAACTAAGAGCATAGCTCAATTGATATAAAATTTGAATTATCAACTTTAATTAAATATTCAATTCTCCCACTCCACGCACGGTGGAAAAAAATAACTTGGCAATGTATCAAGATCATCCCCTTCCGTCCATATATTTGGACTCAAAATCTTAGCTTCAAACATTGAGATGAAAGAAAATCATAACTTACCCTTCCAATTTAAACGCGCTAATAAATAGACCTCTTTCCCAAATCCTAGTAATTTGTGGAGGGTTACCCAAGGCAAGGCTCAAACCCAATGGCGTCTGGGAGCCAATTTAGGGGAATGAGCATCTCCTAAGGGAAAGTCAAATCCTCGAGGCCTGGGTCAACTAGCTGAGCTCGTTTTGTTCACCCCAAGGAAAATGGCAAAGCGAAGTTCTCCCTCTGCACCCCGAAACCGTAAAGGCCATACCAATTCTGATGTTACCAATATTGCATATATCCCAAGCGAATATCAGAAAACATGCCTTATAAATAGTCCCATACCTCCAAACTATTTTCGAATCTTGTAATCTAAATAGTGCAAATTTTAGAAACAACATTTTTATGTTTTTTTTTGTTTGGTATACCCAAATTTGAATTTGAATTTTTAAAATACATAATTATATTGAAATGGATAAAAACAATAAAAATAAATTCTTTATGTTATAAACCCGATTATTTTTGTTAAATTAAAATATGTATTATATAATAATGGAGAATTTTTAAAAATTAAAAAATAAGGGAAACTATTCACACAAAATAGTAAAATTTTTAGATAGTCGTACTATATTTGCTCATATTTTAACCCCGATTGCTATATTTTCAATTGTCCCTTAAAAATATATAAATACATAAATTTAAAACAACATTCTTACAAATATGTAAGCAAATTTACAGTTTGATAGATTCAAAGTTTCGGTTCAGTGGTACTCCAATCCGGTCCGGTTCGGTTCACTGGTTCAATTCGATTTATTTCACCCCTAGAACATACCTATTTTCCTTGCTTTTGCATATTTATAAGTTTTGCAAATAATTTAAAGTTTGATAGGTTAGTTGTTTACTTTGTTAGTTGCTTACTTCTGTTGTTAGTTATTTCTCTTATTAACATTATTCTTATTTCTTATATGTGGTTTTGAGTATTCATTGTAACCACATTTTGTTAAAACTGGAAGAACTTTGTGAGTTTCTTTTTTTGTTGATTGTACTCACAAAGTGTAATTTTGTGCACTAACAACGTAACTTGTTATACTTATTTTGAAAAACTCGTAGATGTTCACTTTGAATTCTAAACTTATTTTTTCTGGAGATATACCAGATTAATTAATATTTTTCATTCTATATTGTTTTGTATTGAAGTGTTATATTTAGGTTCGTTTAAATTATACTTTAATTTTTTAAAAATTAATAAATAACTTTTAGCAAAGTTTTATACGAGGCTAGAAATAGAAATGCACTCACAAAAATTCAATTTTAGTGACATTGGGTATTTAGAATTTGTTGTACTCAACATTTTTGTGATAAAATGTACGTCACTAAAGCTTCTTATTAGTAAAAAGCAAATATATACCTCTTTGAGTATGAGCTTTAGTGACTATAAATGCGTGAGTAAACATTATTTTCACGGGCGGACTTACATTACTGAAAATGAAATTTTAGTGACGTTATTTAGCTTTTACTGGCGTTTATTATTATTTTTTTGTGTCATTTAAAGTGCAATTTGATTCCTTACCAAATCAATTCCTATATCCTAATTTTTTAGGTTGATTGGTTCAATACTACACAAATTTTCATATATATATATATATATATATTAACTTTTAGAAAAAATTGCAACAATACCTATATATATATATATATATATAACATTTTAAATAATTATTTAAAAATATAAATTATCAACAAAAAAAAAAATTATGCAAATTCGAATAGCAAGTCTATTTTGTCATTATTGCTAATCACAACAATTTAGCATTATTTACCAAACAATGTAACCTACTTTTCAGGTTTTAAGCTGAAATTTACCAAACACTAATTTATTTCATTTTATCTTTTTCTAGAAGTACATTTATTTACCATCAATTATTTTAAAAAGTTGATATCCATCAACTTTCGCAAGGTAAAAATAAATTAAAAAAGTGATTATACATAGATTAATAAATAATTTTTCTTATCAAACAATATTAAATGGTGCCTAAGACTGCTCTAATAGTTGGAAATTGGAATAGAAATGAGAAATAATATGTTGTATGTGCTTTGGTTAGGGTGGCTAATCACATAAGTAAAAGAAAAATAAAAACAAATGAAATTGGTAGAAGCAGGCATATTTTAGTCGATAATCCTTAAACTATAATGATTTAGAAATTTGAATTATCTGTTTAGTAATGGAGAGCTTTCAATAAAAGGTAATAAATCTTATTTCGATTACTATGTTTTTACAATTTTAGTGTCAATCCCTTAAATAAAATTACTATTTAAATATCTAAGCATCTAATAAACTATAGAATTTTACGAGTAAAAGAGTAAACATGAAACAAAGAAATTTTTTTATTAAAAAATGGATTATCATCAAAGTTTG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ATGAAGAAAAGCAGTGGAACGATGACATTACAAGTTGTTGCATCGCAAGAAGGCGCTAAGCCTCTTCATGAAAAAGAGATATGTGAACGAATTCTTGGTAAACAATCTAGAATTGTGAAGGGCCTTGGTTGGTGA ATGAAGAAAAGCAGTGGAACGATGACATTACAAGTTGTTGCATCGCAAGAAGGCGCTAAGCCTCTTCATGAAAAAGAGATATGTGAACGAATTCTTGGTAAACAATCTAGAATTGTGAAGGGCCTTGGTTGGTGA MKKSSGTMTLQVVASQEGAKPLHEKEICERILGKQSRIVKGLGW Homology
BLAST of HG10004043 vs. NCBI nr
Match: KAA0067296.1 (formin-like protein 4 isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 9.0e-04 Identity = 23/43 (53.49%), Postives = 33/43 (76.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004043 vs. NCBI nr
Match: KAA0035606.1 (Transposon, En/Spm-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 9.0e-04 Identity = 24/37 (64.86%), Postives = 29/37 (78.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004043 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VLG0 (Formin-like protein 4 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold418G001230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 4.3e-04 Identity = 23/43 (53.49%), Postives = 33/43 (76.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004043 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T089 (Transposon, En/Spm-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold285G002870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 52.8 bits (125), Expect = 4.3e-04 Identity = 24/37 (64.86%), Postives = 29/37 (78.38%), Query Frame = 0
BLAST of HG10004043 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DG01 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold523G00020 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 9.7e-04 Identity = 22/35 (62.86%), Postives = 29/35 (82.86%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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