HG10003759 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCATTCCCTCTTCATCAGCGGCCCAAGCCACCAATTGTTGATGGGGAAGATGGAGATGATATCAATATCGATGTTTATAATGCTGGAACTCCGATTCGGTACCTTTCTCTTGATCATGTCTACTCCACTACCTCTCCGTTTGTTAGTACAAGTGGGTCTTCCAATGTTATGTCCAAGAAGGTGAAAGCCCGGAGGCTTATGGTGAATCACTTCGACGATCTTAATTTCAAGCCGCCTCGTTTGCTTCATGTCTATTCTCGCCGCCGGAAGAAACCCCGCCACTCCTCTGCTAGTTCCTCTGTCTACGACTCTTTGGATGAACAGGTCGAATTGGGCTCCAAAACTGTTTTGAATTCTGAAGCTCGCGAGATTGATGAGATGGTGAATGGTGTGGACGACCATGCAGGAGAATTTGAAGTCGATAGAACGCCGAAGAAGAAGAAAAAGAGGAAGGATAAGTTTGGGTGTAATGAGCTTGTTAAACTGGAGGTTGATTCCAGTGTTATTCGTGCGATGAATGGTCCTAGGTTGAGAGACTGCCGCACTCATAGCAATAACAATAATAATCCTGGACAGAGAAAGAAACGCAATTCTTCACAGATTTCTGAGAAGACCATGTTCAAATCTCCTACTGCTAAGAGATGGGTCAGGTACTGGTTTCTGGTTTTCGAGTTGCATTTAAGGGCTCGGAGGGGTTGTGGCTTCTTCGGAGTTGTATTGTGCCGTTTGAAGCATTTGCTATATAAATTTTCTATTTTGATTTTTGTGTAGTTGTTTCTCACTTAGTCAGTTCTATTTACTGGTATATACTCAATTATCAACTCACAGGTTAAGTTTTGAGGATGTTGATCCGAAGGTGTATATTGGATTACAATGCAAGGCAAGTCATTCTGTCTATACCTCTGATTTGAATCATCTTCTTGGGATATGTTTGAAATGATATGGTACTTCGCAACATCACAGGTTTATTGGCCATTGGACGCTGAGTGGTACTGTGGTCGTGTTGTGGGCTATAATTCAGAGACTAGTCGTCATCATGTATGTTCTCACATATATAATTTTTAAACCTCACAGTGGGTGTTTGATATAAGTACTTACTGTTAACTGTAAATTATGTGTCTTCTCTTTTATTGATCGTACCAGTTGGCTTTTGGTTGTTGGTGATACCATTTATTCTTACGTACAAAATTCAATGTAGATTGAATATGAAGATGAGGACAGAGAAGAGTTGATTCTTTCAAATGAGAAAGTCAAATTCCATATCTCTGGCGAAGAGATGCAGTCTTTGAACTTGAATTTTGGTGTTGATAGCGTAGATAGCGATGCTTATGATTACAATGAGATGCTAGTGTTAGCAGCAACGTTGGATGACTGCCTGGAACCTGAACCTGGAGATATTGTTTGGGCCAAACTTACTGGTCTGTGCTTCATCTCTTCCCTTTTCCCTTTTTCCCTATTTTTTTCCTCCTCTTTGTGATTTTAAAAGTGGAAAAAAGAAAAACGGTAATGTTTTATAAATAGAAGAACGAACGTCTTAAAAAACTTAGTAAAAGAGAGAGAGGGAGTGCTGGTTATTCCTGAAATAGAAGAAGACATGAAGGAAATAAGCACCACCTTGGAGTCCTCCGTTGCGAAAACAAATGGCTCTTGGAGCAAACGTATTGTGCTTCTTATGGTGAATGCATTTCTCTGTTTCTTAACATATTGTGAGAGGCTGAAAATCAAAATTTGAACAAAAATAAAATGGAAATAGGAAAACATGAACGTGTTGTACCTTTTTATCATTCTTCAAGCTTCAAAGTGTTGCTATGGAGAGTATTAAATCAAGGGGTGGGGCGGTTCATGTATGGGTTTTGTTCAAAGTTTGAGAATTTGTTGTGTCTGCCAGCACCATCTTCTCTAAAATTGAAGGTAAGTTGCGAAGAAAGCCGAAGAAATCACTAAACTACAGTTGAGAGTTGATGTTGAAATTGTATAGGGAGAAGAAGCCAGAGTTGAAGAAAGAATAGAATTGTTGGGCTAGAACTGAAGCAGGAAGCAAAATTAAGGATTAAATTAGGAAGATGAAAGGAATTATTGAGCAAAATGACATACCTTCCTTCAGGCCGAGTGCTTTTGTTACCATTATCAAATTGTAAGATGATAGAAATGCAAATATGGCGAACTCCTTGTTTCTCACAATAAAAGTTGGTTTCTTATAACAATTGATAATTCTTGCAAGGGATGATTTATTTAATCGAATATGTTTTTATTACCTCTTTTGTTAGTTAAATGCAGGTCATGCTATGTGGCCAGCAATTATAGTGGATGAATCACTCATTGGTGATCGTAAGGGGTTAAGGAATATTTCAGGAGGAAGGACAGTCCCTGTTCAATTTTTTGGTACACACGACTTTGCGAGGTTTGTGAGCTTTCTGGTTCAAAATGAACTATATTTGTCTGGTATAATGTATCAGAACTTTGAAACAAAAAATGCAGAAATTCTTTGTTGGGAATGTGCACGCTGACTAGTTTCTCTATTGTCCAGGATTAAAGTAAAACAGGCCATCTCGTTTCTTAAAGGTCTTCTTTCTTTTTTCCACCAGAAATGCAAGAAACCACACTTCATGCGGAGCCTAGAAGAGGCAAAAATGTAATGCTAGATTGCTTTGGCTTCTTATATAAAAAAAGAAATGATTATGACATTTCTTACTCCCAAGTCCCTATAATTGTTTATCCCAAATTAAACTCATTCGACTACCTGACTGCTGATTGTTGTTTGCGGTATCACCTCTGTCAATTTTTAGTTACCATGCTAAGGACGTGATCAGACCAACTTTGAGTTGGCAGATTTCTATTGAGATATAGTTGTTCCTGTGTATCCGTAATGAAATGTTGAAAAAATTGCTGTGGTCTGTGAAATTTAATTTTATATAGGTATTTTGACAGCATGGTTCTATGCCTATCTATCTCCATTTCAATGTAATACTAGCCTCATGGAGAATCCAATAACGTAAAATGAAACTGAGTATGATGATCTCGGAGGGGCTTTGTTGGTCCTTGTTACTTCTTGCTAGGCCGTATTCTCTTTTTAAGGTGGTCACTGGTAGAAATTTACTGACTTACCCGTTGAAAGCAGGTATCTAAGTGAGCAGAAACTTCCCCCAAGTATGTTACAGTTGCAAAATGGAATTGAAGTGGATGATTTTGCAAGTGCAAGTGGAGAGGAAGAAGGGACAACAGATTCAGGGGAAGAATGCCTAAATGGAGGAGGAGGGATGCATTGTCCACTCAATGGATATGGATCTTCTCCATTTATAGTTGGGGATTTGGAAATAATAAGCCTTGGTAAGATTTCAATCACTACTTTTCCTAATGTATTATAGGATATCTTGAAATGTTGAATTTCATGCGCTGATTTTGAAAATTTTGAAATCTTCATTTTACTTGTGCCACATAACATACCTTTGAGGTAGGTATAGTCTTTTGATATGAAGTAACATTGCTATTAGTCTTTTCTACGAGCAAACTTTCCAAATATAAAAGAAGTTCCTCCCTTTGGCAAGCTATCGTAGTTCTTTCTGTGAGTAGCACACACCCACAAAGACACATTTATTTGGCAAGCTATCACTAATCCTACTGAGAGCAACTCTCTGAACAAAACAACGTTGATCTTTCTTTGGTGCCTTTGTTCGCCAAATCATCAATTAAGAAAAATTGATTACTCACCTTTTTTGCCTTACCATCTTTATGATTTTTTTCCTTCTTGTGTTACTTACATGGCATTTAATTGGTGTAAATTGGTTTCTCCTTTTTGTAATTATGACTTAAACTCCCTTATAGCCCATTGGAAAAGTTTTTTTTTTTTGTAATCCTTTGGACAGCCTCTCATTTTGTAATTTCATTTATATCAATGAAATTCTCCGTTTCTTATGAAAAAAAAATCTTTATGAATGTGGTGGTATCTGTATGGCTAGTTGTCAAAGTATGTGGGAAATCAAGGGTTAATTGACTAATTGTATTTTAATCTTAAGCAACCTGTTTATTGATGTTTATGAGCACTCTTTTTGTTGTTCTTAGGGAAGATCGTCAAAGATTCTAAATATTTCCAGAATGATGGTTCTGTATGGCCCGAAGGGTATACAGCTGTGAGGAAATTTTCTTCTTTAACTGGTGGATATTTGAACTTTTGTAATTATTATTTTTGAAATTATCTTTGTTTTGCAGATATTTATAGTTTACCTTTTCAACGTGATGATTTCTAACACTATTGTTGTCATCTCTTTTGCTTGTTTCCAGATCCCAATGTCTGTACCTTATATAGAATGGAAGTTTTGAGAGATTTTGAATCAAAATTTCGACCTCTATTTAGAGTAACTTTGGATAATGGAGAGCAGGTTAGTTCGTTAAATTGGGTAGATATACTTGGCATGTTTTTTCTTTTGATGAGAAACAATTTGCATCTTAATTCTCTGCTTACTCCAGTATATGATGGCTTCTTTGGTGCTTTAAAGTTACAACTATAAATTTATTTTTCTGGCTATTAGATTAATCAGTTATATATATATATATATATTATAGTAATTGCTATTAATTGGATGGAAGCCAGATACTGTAATCACTAGTAAACTCAGATCAAATAGCCCTTCCAATGGAAAATCATTATGGAAGAACAGTCTATTCGAGAAATGTAAATATTTTAAGAAACCGTTAATGTTTTGCATTCTGACAATATTGAACCTTATCTTCCATTGCTCTTGAAGTTTAACATCTTAGCCGTACATTACTTTTTGATTAATCCACAATTTTTTAACCACATATACTGCCAAGGCCGTCATTATATATATATATTTTCATGTGGTGTTCTTCATCTCCTTAATTTTTTTTGTTAGCCTTGTATTAATCTTGTAATTTCTTAAATCACTCGCTTGTCTTAACTAGATTTTTTCTGTAGCGGGTTTTCAATTGCCTTCTTTCCTATTAAAAGATGTTAAGGGTTATTAATGCAAGCC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Homology
BLAST of HG10003759 vs. NCBI nr
Match: XP_038884706.1 (histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like [Benincasa hispida] >XP_038884708.1 histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 2028.1 bits (5253), Expect = 0.0e+00 Identity = 997/1104 (90.31%), Postives = 1017/1104 (92.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. NCBI nr
Match: XP_011656480.1 (histone-lysine N-methyltransferase ATX2 [Cucumis sativus] >KGN45919.1 hypothetical protein Csa_005420 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2012.7 bits (5213), Expect = 0.0e+00 Identity = 995/1103 (90.21%), Postives = 1011/1103 (91.66%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. NCBI nr
Match: XP_008464329.1 (PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 [Cucumis melo] >XP_008464330.1 PREDICTED: histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2011.1 bits (5209), Expect = 0.0e+00 Identity = 993/1103 (90.03%), Postives = 1010/1103 (91.57%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. NCBI nr
Match: KAA0043134.1 (histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2009.6 bits (5205), Expect = 0.0e+00 Identity = 993/1107 (89.70%), Postives = 1010/1107 (91.24%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. NCBI nr
Match: XP_023004925.1 (histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1960.3 bits (5077), Expect = 0.0e+00 Identity = 967/1104 (87.59%), Postives = 1007/1104 (91.21%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CB22 (Histone-lysine N-methyltransferase ATX2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATX2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1143.3 bits (2956), Expect = 0.0e+00 Identity = 609/1095 (55.62%), Postives = 743/1095 (67.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C5X4 (Histone H3-lysine(4) N-trimethyltransferase ATX1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATX1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1098.6 bits (2840), Expect = 0.0e+00 Identity = 596/1109 (53.74%), Postives = 740/1109 (66.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6K431 (Histone-lysine N-methyltransferase TRX1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=TRX1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 906.0 bits (2340), Expect = 4.0e-262 Identity = 513/1061 (48.35%), Postives = 659/1061 (62.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GZ42 (Histone-lysine N-methyltransferase ATX5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATX5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 1.8e-49 Identity = 148/486 (30.45%), Postives = 206/486 (42.39%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SUE7 (Histone-lysine N-methyltransferase ATX4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ATX4 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 196.4 bits (498), Expect = 1.6e-48 Identity = 145/484 (29.96%), Postives = 206/484 (42.56%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KAQ5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G022310 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2012.7 bits (5213), Expect = 0.0e+00 Identity = 995/1103 (90.21%), Postives = 1011/1103 (91.66%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CLC3 (histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502242 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2011.1 bits (5209), Expect = 0.0e+00 Identity = 993/1103 (90.03%), Postives = 1010/1103 (91.57%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TIG7 (Histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold332G00200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2009.6 bits (5205), Expect = 0.0e+00 Identity = 993/1107 (89.70%), Postives = 1010/1107 (91.24%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KVZ1 (histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111498085 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1960.3 bits (5077), Expect = 0.0e+00 Identity = 967/1104 (87.59%), Postives = 1007/1104 (91.21%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H5D6 (histone-lysine N-methyltransferase ATX2-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460646 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1958.3 bits (5072), Expect = 0.0e+00 Identity = 966/1104 (87.50%), Postives = 1006/1104 (91.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. TAIR 10
Match: AT1G05830.1 (trithorax-like protein 2 ) HSP 1 Score: 1143.3 bits (2956), Expect = 0.0e+00 Identity = 609/1095 (55.62%), Postives = 743/1095 (67.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. TAIR 10
Match: AT1G05830.2 (trithorax-like protein 2 ) HSP 1 Score: 1143.3 bits (2956), Expect = 0.0e+00 Identity = 609/1095 (55.62%), Postives = 743/1095 (67.85%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. TAIR 10
Match: AT2G31650.1 (homologue of trithorax ) HSP 1 Score: 1098.6 bits (2840), Expect = 0.0e+00 Identity = 596/1109 (53.74%), Postives = 740/1109 (66.73%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. TAIR 10
Match: AT5G53430.1 (SET domain group 29 ) HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 1.3e-50 Identity = 148/486 (30.45%), Postives = 206/486 (42.39%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003759 vs. TAIR 10
Match: AT4G27910.1 (SET domain protein 16 ) HSP 1 Score: 196.4 bits (498), Expect = 1.1e-49 Identity = 145/484 (29.96%), Postives = 206/484 (42.56%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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