HG10003521 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAAAAGTCCCAAACGGCTGAAAATGATGAAGTTACTCAACAGAGTTCTGATAAAGATGGTGATGATGATTCTCCCCTGTCTGAACTGCAATCAAAGAAAAATGAGGATGTCAATGTTGATGTTGATACTTTTCCTGTGACATCGGAACATGAAATTGAGAAATCTCCCTCTGAAGAAGCTTCTGACAGGAGCTTCATAAGCAGTTCTGACAATGAGGACACTGGTCTTGTTCAGATCACTCGTGCCTCAGGTAAAGAAAAAAGCCATCAGACAACCTCTTCCAATGTTTCTCCTGTGCCATTAGATGGATCGAGTGTCTTTCATTATCGAAGAAGGTGCCAAGTTATGGAAGTTTGTTGTTAAAAGAAATATTATTGATGAAAAAGAGCTGCCTAATCGCACTCAAGAATGTACTGAGATTATGAAGTTGCTTATCGATGCTGGTTTGGAAAGAATCGTTTTGAAGTTGAGGCCTTATTATCCCCAGCTGGTGCGAGAGTTCATTGTCAATTTGACTTCAAATTTTGCTGATCCTACTAGCCATGTTTCTAGAAAGTTCATGTTAGACGACATCCCTTTGTCATTTCTCCTACTTTAATCAACTAGTTTTTACATTGGAATATGCTAGAGAATGTGACTGAACAATGTCCTATATTGAGTGATCTAGTGTTTGAGCTAACTGGAGGTGTCAGGTCTTTGTGGCCCAAGAAGGGGCAATTGTCTACAACAGTATTAAGCATGAAGTATGCCCTTCTACACAATACAAAATCTCAAATTGGTGCCCCTCATCTCATAAATTAGGATTGTCTATCTCTCTTTCCACTTTAATTTATCAAATTGGAACTCGGGCTCAGTTCAACTATGGGGTGTTTGTACTGAATCGGATTAAACACCATACTGGGTCAAAAGCTCTTGGTTTACCCATTTGTTATCCCCAGTTGATCTGTGATATCTTGTTGACACACAAACCCGACTTACTTGACTCTACATAATCTATCGGTCCTTTTCCCAGTCTCTTTTATATTCATCCCAAGCTCATGCAAAGTCATCACATTCTTGATATTAACACCCAAGCCTTGACTCTTCATCGTGATGGCCCTAGCCAAGCTTTAATTGAATAATCGATTGGTGCCCGTATGTTGCATCTATTGTCAAATGAGTCTCGGGATATTGCCAAACTTTTGCAGCAGCTTCAGGAATGTAATAGGTTGATGAAGTGTTGTAGGTCTTGAGGATTATTTTGTCTAGATCTGTTGGGAGTTCCTCTTCTCAAAGGAGGTCTTGATATTTTTAAGCCAGAAAGGGGAGACAATGGGAGAGTAGTTTTGGTTTTTGCGGTTTCTACTTTGGTTGTTTGGTAGCTTTGGTTTCCTAGTTTTCGTTTTTGTTGCTTGGCTGGATGACTTTGTTTGATTGATTTGTTGTTGTAAAGACCTTTAAGACCTCTGCCTATTCAATTGTTTCTGTTGATATTTAGACTTTATTTCAGACATCTTGTAATTTTTGTTGATTGGTTGTTGGTTGATTATTCAACTATAAAAATATCAGCCAAAGGAGGAACTTGTTGGAGTTTTGCTGATTGACTCTATATTTTTAGTTAGGCCGCCACGTGTGGTGGCTTTTGGTGCTGTACAAAAATATTATTAACATCTGACTCTGACAATATAAATTCCTACAGTATATTTTCTTTCCTTATCTAGAATTTTCCTGCAAATTTATTTTGCCTGATATTTTCCTTATACGTGGTGCTACATATTATTTTTGATTGAGGAGTTTATTTCCTTTCTTGACCACGGTTTATAAAAGGAGATTAATGGTGTTCATTTATGGATGCCGTATTTGTTTATCGTGAGAGAGTTTCTGTTCTTGGTAGCCAAGTTGTGCAACATCATGTTTTTTATCTTTGCTCACTATATTCTGCTGTAAAATTTTCATCAATTGATAACTACGAAATCTTGAAGATAATTTATATCATAGGAGGAGCCTAAGGCATAGCTGAAGAGAAGAGATTCTCGGTCTTAGGCGAAGCCTAAGACTTCATTCTCGAGAAGAATTTCTCCATCGTAGGGGACTTAAGATTCATCAGTGAAAGGAGTTCGCTGAGTTACAAGGAAAATAATCAAGATGAGATGTGTCTCACACACTGTCAGAGGCCAAAGTGTTCTTCACTAATATTATCACAGTTAGGGGGAGCCTAAGTACAATTGAGAGGGAGTCTCATATCTAGGGGGAGCCTAAGTGTTTAACAAGGTAAACGTCTCTACAAGAGTCACTATAGAAGTCGTTACTTTACAGATTGCTTGTCTGTGCTTGCTGTTTAATATCCATATTTAGAGTGATAAATCACCCTATCGCTTTTTCACTTTCATTTTCATTATATGCCAAATTTTATAAACTATTCTCCTTCCTTAGTTATATTTGATTTTTATCGAATTTTTTCTTCTTTTGAAGTTTATTTCTCATCTCTCTCTTGTTATTTTGTTGGTGTTTATCATTATATTTTTTAGCACAATAATTGTGGGATTCGAACTTTTGACTTTTTTAATCAAAAGTCTGTCTTATGTTAGTTGAACAATTTTCATGTTGGGCATGATTGCTATATTTGTTACAATCTCCTTAATTATATTATACATGTTCTTGAAGTAAAAATGAGAGGTTTTTCAAACACCCGAATGTTCACTCCAAATCAATAGTAATGAGAGGGAAATTTGGAGGAAGGACAGGTTCCCGACATAACTTTTTCTTGTTCACTCCAAATCAATAGAAATGTTTTCCATTTTTCTAATTCGAAAATTGGTCAAAATTACAAATTTTTGTTCTCATTGTTTGGAAAATTTTTAAGGATTTAAGAGGTTTCGACTAAATTTTCATGGTTTGGGCTGAGTTCCATATGATTTATATATGGATTTAAATGTTTCAGTTTCGTCCTACAGTTCCGGCTTTAGTTTCCAAAAAAGAAAAAGATTGTTTTTAAATATAGAAAAATGAACCAAAATATTTACAAATATAGAAAAATTTCACTGTCTATTAACGATAGACTATGTTAAACCGCAATAGACTTCTATCCCACATAAATTTAATAATTTTCCAAAAAAAGAAGAAAAACAAATTATGGATGAATTAAAGTACAATGAGATCATTACCAAAATGTGAATTGATTTTGTCTTATCCACTTGAAAAATCCTACAAAAAGTACCTCATTTGGTTCCAAATAAAGGAATTGAATTTGAAAAAAAAATACATGACAATGGTATAGACTATCTTTGAAGTTTGACTAAATCATATAAACTAGATAAAAATGTTCAAAAATATATGATTGCTAAATTTAAATTAATTCCAAATCACATACGAATGATATTGTAAGCAAGCAAAAACTACGACCTCGTTTATAACAATTTTGTTTTTGAAATTTATGTGTTATTTTCTTCTAATTTCTTTACTATATTTTGTATATTATCTCTCAAAACATTTAAGTTCTTACTTGTCAAATTCAAAAAATAAAAACAAATTTCTAAAACTACTATGGTTAGTTTTCAAAACTTAGATTGGTATTTGAAAATGTGGACAGAAAGAAGATTACGAAACAAAACAAATTTATAGATAAAAGATAGAAAAATTATTGTAAACAGAAAAAAATATCAAATATTTATAAATATAAATTTTTTTTACTATCTATCAGCGATAGACCGCGATAGAATTCTATCGTTGTCTATCGCTCAAGCGATAGTATTCTATCGTGGTCTATCGTTGATAGACAGTTAAATTTTTCTATATTTATAAATAGTTTGGCTCATGAAAACAATCTTAAAAGTTAATGTTTATTTACTTAATTTTCAAAAATCAAACAACTATCCAACAAGCCTACAAAGTCCAAATTGAAACTTTGCCTAAACCCATAGAAAACCAAACTTGTAATTTAACGTGAAAATTTTTGGTATATAGTACATAAAATTCTATGGCAATGCATTAAAATAGTAACATATGAAAAAAAAATATAAGTTGAGCAACCTATATTAAATACTTTTAAAAGTTCAAGATTAAATAGACATAAACTTCAAAGTTAAAAAGACTAAAGTTGTAATTTAAGGAATAATGTTTGTACATTACCTATCTTTTGTTACAACTACTCCGGAGAGATCACCAACTTTTGTCATAGCCCTCCTCCATTGTTGAACCTCCTTCATGTATGTATCTCTTTCCATATAGTCGAGTTCTTGAAGAGCTTCTTCGTGTTTGCGGAAGCTTTTCTCGAAACTCCCCGATTGATATCGAACATCAGAAGGATTCACGTGATAAAATACGGGAAGGAGTACTCGATGCTTTTGTTCAGCCATACAATCTATTATCTTCGCCATTTCTCTCAAACACCACTTTGACGAAGCATAGTTCTCCGATAAAACAACGATGAAAGACCCTGATTTTTCAATTGCTCTAATAAGTTTTTCACTAAGACTATCTCCAATCAAGAGTTTCTTGTCGTCCATAAAAATCGATATTCCTAATTCAACCAACTCTTTGTACAAATATCCGATAAACGTGTTACGGTTATCTTCGCCTCTAAAACTTATGAAAATATCGAAACGCATCTTAAGAGTATTTGATGATGAAGCTTCAATAATGCTAGAAAGCACAGCCTGAAGAAGGAAATGGAAAATAAGAAAAATATGAATGACTTCCTTTGATCATTCGTAAAGTGATAGTTGACCTTGGATAAGGCAAAACCAAGTCAAGTCCGCTATCTCCCCAGCCACTACAAATAATATAATATAATCTATAGACTTTCCTTCTATCAAGAACACGGTGTGTGGAGTCTTCTAATCAATAGCTAGTTGGAATTGTCAGGACTAATTAGAAAATTAGGGTGGCTTTTGGAAAAAAAAATGGGTGAAAATGAGTGGCTTTAAAATTATTTAAGAAAATAATGTAGTTATTTTTGTCTTTTAGTAAAAAGTCTCATTGAAAATTTGAATGACACCTACACAATGAATGAA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MKKSQTAENDEVTQQSSDKDGDDDSPLSELQSKKNEDVNVDVDTFPVTSEHEIEKSPSEEASDRSFISSSDNEDTGLVQITRASGDIGKGDKKSKYEYEKSVSRFIYSVLNKKNRSSVVEELQGWRDAIKKLRSLSKVSVPIHFNVYKTEEITKQIFDKLLHLKLVAQNKYLLEMPLRLNRMKMFFGLSLSSIRFIGIVGMGGIGKTTIAEALYDKFAHKFTNSCFVRIAGHNLVSLQQQLLSQLLTKDIKISDENHGLRMIIDYLTSHKKVFIVFDGIIENRQLEMLVGNPNWFSSRSRIIVTTRNKDILRQSNYQDKVHEYNVELLSDTSASSLFCKHAFGDDPPNENLKDLCNEIIEKIGRHPLALVKIASSLYGQDEQIQMHILNIYMGQEIVRREMGTHRQSRIWLREDVRRLFDENYELKYIQGIVMDLEEEEELVLEAKSLTDMSELKILQINNVRLNEDIECLSNKLTLLNWPGYPSKNLPSTFQPPPLLQLHLPGSNVERLWNGRKKFKNLKEIDVSGSEYLIETPDFSEVRNLRRLILRNCGRLHKVHSSINRLERLVLLDMEGCVSFTSLPVEMSSLSCLKTLILNGCKDLDQIPPSLGNVEPLEELDIGGTSISVIPFLKNLRILNCERLESNIWHSLAGSTHCFRSLKDLNLSDCNLANEDIPDDLDLFSSLEILDLSNNHFESLPESMEQLINLKALYLNDCQKLKQVSKLPESLRYVGGEKSLDMLRISQDHSPSDKNEVCNEIVEKVGRLPLALRTIGSYLHNKELVVWNETLKRLCEVEQDFFGTILDRSQKNLHRQ Homology
BLAST of HG10003521 vs. NCBI nr
Match: XP_038890436.1 (LOW QUALITY PROTEIN: TMV resistance protein N-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 825.1 bits (2130), Expect = 5.3e-235 Identity = 520/1108 (46.93%), Postives = 599/1108 (54.06%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. NCBI nr
Match: KAA0039329.1 (TMV resistance protein N-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 788.1 bits (2034), Expect = 7.2e-224 Identity = 502/1091 (46.01%), Postives = 573/1091 (52.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. NCBI nr
Match: XP_031741454.1 (TMV resistance protein N [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 776.2 bits (2003), Expect = 2.8e-220 Identity = 487/1098 (44.35%), Postives = 585/1098 (53.28%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. NCBI nr
Match: QOL20471.1 (resistance gene-like protein [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 760.0 bits (1961), Expect = 2.1e-215 Identity = 479/1050 (45.62%), Postives = 548/1050 (52.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. NCBI nr
Match: AGH33854.2 (resistance gene-like protein [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 757.7 bits (1955), Expect = 1.0e-214 Identity = 489/1104 (44.29%), Postives = 573/1104 (51.90%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A0A290U7C4 (Disease resistance protein Roq1 OS=Nicotiana benthamiana OX=4100 GN=ROQ1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 270.8 bits (691), Expect = 5.1e-71 Identity = 217/778 (27.89%), Postives = 364/778 (46.79%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: V9M2S5 (Disease resistance protein RPV1 OS=Vitis rotundifolia OX=103349 GN=RPV1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 234.2 bits (596), Expect = 5.3e-60 Identity = 211/758 (27.84%), Postives = 328/758 (43.27%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q40392 (TMV resistance protein N OS=Nicotiana glutinosa OX=35889 GN=N PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 227.6 bits (579), Expect = 4.9e-58 Identity = 212/782 (27.11%), Postives = 335/782 (42.84%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: V9M398 (Disease resistance protein RUN1 OS=Vitis rotundifolia OX=103349 GN=RUN1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 220.7 bits (561), Expect = 6.0e-56 Identity = 196/727 (26.96%), Postives = 311/727 (42.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4J339 (Probable disease resistance protein RPP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=RPP1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 208.8 bits (530), Expect = 2.4e-52 Identity = 217/816 (26.59%), Postives = 340/816 (41.67%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TDI7 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold64G001270 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 788.1 bits (2034), Expect = 3.5e-224 Identity = 502/1091 (46.01%), Postives = 573/1091 (52.52%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A7L9RV91 (Resistance gene-like protein OS=Cucumis melo OX=3656 GN=Prv PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 760.0 bits (1961), Expect = 1.0e-215 Identity = 479/1050 (45.62%), Postives = 548/1050 (52.19%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T8X1 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold64G001250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 4.4e-211 Identity = 467/1021 (45.74%), Postives = 532/1021 (52.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BL21 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold169G001210 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 744.2 bits (1920), Expect = 5.8e-211 Identity = 467/1021 (45.74%), Postives = 532/1021 (52.11%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E2G9 (TMV resistance protein N-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498647 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 736.9 bits (1901), Expect = 9.3e-209 Identity = 467/1041 (44.86%), Postives = 541/1041 (51.97%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. TAIR 10
Match: AT5G17680.1 (disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class), putative ) HSP 1 Score: 224.6 bits (571), Expect = 3.0e-58 Identity = 206/747 (27.58%), Postives = 327/747 (43.78%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. TAIR 10
Match: AT5G36930.1 (Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 224.6 bits (571), Expect = 3.0e-58 Identity = 205/751 (27.30%), Postives = 321/751 (42.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. TAIR 10
Match: AT5G36930.2 (Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 224.6 bits (571), Expect = 3.0e-58 Identity = 205/751 (27.30%), Postives = 321/751 (42.74%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. TAIR 10
Match: AT1G63870.1 (Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) family ) HSP 1 Score: 221.9 bits (564), Expect = 1.9e-57 Identity = 194/706 (27.48%), Postives = 323/706 (45.75%), Query Frame = 0
BLAST of HG10003521 vs. TAIR 10
Match: AT1G72840.1 (Disease resistance protein (TIR-NBS-LRR class) ) HSP 1 Score: 218.8 bits (556), Expect = 1.6e-56 Identity = 214/742 (28.84%), Postives = 331/742 (44.61%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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