HG10003520 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10003520
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr08: 2742645 .. 2747629 (+)
RNA-Seq ExpressionHG10003520
SyntenyHG10003520
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTGTTCCCTTTCGAGGGCTTTCTGTGTCAAGAACAGAAATTGGTGTTCCCCCTCCGTCGGCTAAACGAAGACATTTCGATGCTAGTTTTTCTACTGAGGAGAAATGAAAACAAAAGGTAAGTGCTTCTACCCTAATAATGAACTAATCATGTGGTGTTAGGGGTAGAAATTCATCCAGCAAAGAGAAATCAACTTCAAGTGACTCATCGAGAGTCACATGCATGAGTATATTTCTCTTCCTAGAAACCCTAAGGATAATCTTGAATTGACTTCTGATGTTTAAGAAGAAGTTAGGGTTACCGAGAGCAAGACAATTGGTGATGAGATTTTTGCTTATTTTTGGTGATATTAAGTCTAATTTGTCTAAATCTAGTCTTATTGAGAAAGAAAATGCTTGCCTACCTGAATCTGATGTGTTGAAAAAGGAAGTTGCTAATGTGTTTGATGAGAATATTGTTGGATTTTATGTCCTAAAACTGATGGTTTATAAACAATAAACAAACATATTCTATTTTCAATAAATTTGTTATTGAAGTTTATTCAGGATATTATTGAATATGTGAAATTGCATATAATATAACCCTATATCCAATAAACTAAGAACCCCTGACTATAGTATAAATACTTAGAATTTATGTGGAGACATAAAAATGGATCAAGTTTGAGTAAATAGCCCAAACGGTCTATAGTATAGAGATATGGTTGGGTACCTAATCCTAGGGACACTATGGATGTTCCCACTTTGTATTTCATACAAACGATGTGATCCTAAATCATTCATGTGAAGACATGCGAGTGGGGGCGTCCTATGCATTGAGTTTGTATAAGACCGGACCACGAAGTAGTCACTTTTACTTTATAAATGTCGTTTATTGTTAAGACTGACTATTTTAATACGATGACAAAGGTAACTCGATCTTAATCTTGAGCTGGCTATGAACTCCTGTTTATTTAGGATGATCCTTTGATCTACATGGGTGACAGTGACCCGTGTTTGCTTACTCAATATGCCTGCTATTTTAGTGATAAGATCGGGTAAATAGCTGGAGACATAGTCCTGCAAAATGGAATTGACTCCTACTCGATTCTAGGGATAGTAGATAGGTTGTTTCCTTAAGTACTGACTCCAAGTCGAACAAGGGGTCCCACACTCTCATTGGCCCGAGAGAGACTGGTTTGGTGGTTGAACCACAAATCAATGATCCATTAGAGGATCAATGAGACTTAAGGAATAAGAAGTAATTACAGGGGTAAAATAGTAATTTTGACCCAGTTGTAATTACAAACAACCTGTGAAGAATGGACTTACTAATCATGGTTATATCAGGTGGACAAAATATATCTACAATGAGGAGAGTGCAGCTACTAGGCTATAGTGGAATGTCCCGGTAGTTAACGAATGTTGGTTAGCTAGGTTAAAGAGTTTAGCCGGTTAATCTCGGATCATTGGAGTTCATGATCTGTAAGTCTATTAGGTCCCCCTGCTAGCTCATATCGGACTAAATCTTAGGACAGTGTGCTGATAGAATTTGAATCGTTTGAATTCAGTTTAGGGAGTAAGCGTTAATTATATACGATATACTTAACATATGATTGTTTAAAATTATGAATTAAATGATAAGAAGAGTTGGAAATATTTAAATATGATTTAAAATATCGAATACGTGAATAGGGATTCATGACCGGGATTGGTATAAATTAATTATTAATTTATTATTTGATATTAAATTAGTATTATTAAGGGGAAGTGTCGCTACGGGTTTGCGACGCGGAGCGGTCGACGTTGTTCCTAAGAGGAGGAAAATGGAGTCGCCACCAGTCTTGATTTAGAGAGTGTGACTGGACACCCAAAAGTATGTCAAATTGGTCTGCAAAGAAAAGATAAAGGGTTCGGGGGTCTTTTGTGCATGGGAAAAGTATTAGCACCCCATAACACTTGTTCGAAGAACGAATTTTTATTTTTTTCTCGTGTTATTAAAGAGAGGTCTTTTTATAAGAAAAAATAATTTTTCTTTTGCTTTTAAAATGTCTCATATTTTATTGATCACTATTATTACCAATAATGAACAATAATTATGAGTGGCCAAAGGCCATTAGAAAATTTATTTGAATTTAATTTGGCATCCCAAAATAAATTCTCACCTCAAGAATATTAGGATAGTCAACAACTTGACCTCCTAATCTCCGTCATAGAAAAGTTTTTTCTTAAAAAAAGATTTGGTATAATTATATAAAATATTTATAAAAAAATATTTCGCAAAAATATTTATAATTTTAAAGGAAAGAATTTTTGCCGAAGATGAATTTTGATTAGTTTACTTATTTTTAAAAAAATGGAGAAAATAAAACGTTTTAAAGAAAAATTATTTTTGAAATGAAAGAAATTTTATAGAATCGAGTTTACTTTTAGAAAAATATTTATGAATGATTATAGAAGTATTCAAATTTTATTTTAAAGAAATAAATGTCTTTTCTAAAAAAAGATTTTTTTTTTATGTAATGCATATTTGCAACAAATATATTTTTTTTATACAAGAATAGAATAAAATACATGTGTAAAATGAATTTTTTTTTAAATTAAAAGTTGGTTTAAAAGAAGACATATTAACATCAAATCTGGGCATCCCAAGATATTGATTTCTCACCTCTAGAATCCAAGTAGAGGCATCCCGAGTATTCAAAATTCCGTCATTGGAAAGTTTTAACAATATATATATCTATATATAATACAAATATTAGAAATTTAAACAATTATATCATTAACAATATATCTAAGGGTAATCATGGATGAAATTTTAAATTTAAAGTTTAAGGCAAGGTTAATCAACTAAATAAAGATCTAAAACATTATTCATGCGATTTAAACTTTACAAACAACTCAAAATATAAACAAATAAATTTGTCTATATGAGGCACAAATAAAATTGGTCTAAATATGATGCATAAATGAAATTGATCTAGAATAATATTGCTAAAATATACAAACAAATATGTAATTAAAAATGTCCTATTTAGAAATAGGTAAAACTCACCATTTTCGACAATTTACGATCGTGAACGCTTCTTTTTAAAGAACAAAATGTGGAGAGAAAATTAGGTGGAGTGATTGTTGGAGGAAAAAAAAAAGAAAGAAATTTAGAAAATAAAATCAAACGAGATAAGGAGAGAAAAATTGAGAGAAACCCTAAAATCTTTTTTGGTTTTTAGTCTATGTATTGCATGTGAGAAAGATGAAAAAATCTTTTGAGAGGAAAAGAAAAACTGCGCGAGAGAAAGTGTGTATGTGAGAGAAAAAGAAAAAAGGCTAGGGTTTCTATGCGTGTTGTGTTGATCAAATGTGTCCCAAAAACCTCAAATTTATAGAATTTCCAAACCCTTCTTGATTAGGAAAAAATAAATAAAATCAAATTTAAAAGTAAGAAAAATAATACATATAATTTTAAAAGATTTTTATGATTTAAAAAAATATGTTGGTTTAAATATTTATTCCCAAATTTAATTAAATACAATTTTTTCATAAACAAAAGATTTGATTAATCAAAATTTTATTTTCTCTACAAAAAAAATCTTTTATTTTTATTTGATTAAAACATTAAAAGCTTCAAAATTTTATTCTCCCTAAATCGCAAATATGAGAAAAAAATAATAAAGAAAATCTTTTTTATTTTATGAACATAAAAAAAATTCTAAATTCATTTTCCTAAAACGCAAAAATGAAGAAGATGTTTTATTTATTAATTTTATTTAAATAAAAAGAATGCAAATTAATTTTTTGTTTATTTTTATATAAACGCTAGAGAATTTGAAATTAGTGAGAAAGACACAAAATTACACAAAATAAAAATGATGAAATAAAATTTCAGACAAATTTAGGGGTCTACAGGAAGTTTTAAAAATAGAAAAATAAGGGAAATTATTTACCTAAAATAGCAAATTTTTTAGATAGTTGTGATAGACGCTGATAGAAGTCTATTAGGGTCTATCAGTGATATAAATGATAGAAGTCTATCACTGATAGATGCTGATAGAAATCTATCAATGTCTATCAGTATTTTTTTTGCTATTTTCGGTAAATAGTTTGACATTTTTTCTATCGGTGAAAATTTTCCTATTATTAATTAAATTGTTTAATTAAATTATTTAAAATTAATTGTTAGAATTATTTTTATTTAAAATTAATTAATTTATTTATTTAAAATTAAGAAAAATACATTTAAAATTCAATTTTAGAAATTCAATTTTAATTAAACTTTTTGGAGGTGGTAGGTTTATCCCATTTTAACCTCACTTTGACACACCTAAATCCCACTTAATTTCAAAGTGCATGTTTTCTTCTTTAAATAGAAGAAATAATGCTGAGATTTGCAGCTTGTTCATGAACTTTAGATGTTGTTTTTCCTCTCAAAATCTCCTAAGTTCCAGACTCTCTCAACCTCCAATTTCCCTACAATTTCATCTCAATTTGGATCCCACAATCCATTCTAAAGTTGGAGAATATCATAGAAGACTTTAGTAGTGGTCCACGAAGTGTTCGTGATCAAATTCTACTAAAGAGTTGCTTCAATTTTGAGCTACATCAAGGTTGTATACTCAAACTCTATTTTTTGTTTTGTAAAAAGCATGAATTGATGTAATTAGAGTGCTTTAGATTCAAATTACTTCTGCGTGCACGTTCTTTACTCTTTCAAATGTTTTAAATGAATTTATTGAGAAAGTGGTCTCTGAAACTATTGCTTCGATATCTACTCTTCCTGAGTTTAGTGAAGTAGAACATGTTCCTTTCGATATGAATGTTCAGAGTATTGTTCCTTGTTATGTGTTACAATCTGGTGAAGAGAGTGTTCAAACTCTTCTTGAGACATCTGATATGGCTGAAACTTGGAAGTGGTCTTGATGATCTTGTTGATAACACTAGGATTACTGATGATATTGAGAATAAGGAAGTTGAGGTTGTTGATGACATTGAGTATGTCGCTAGCTAA

mRNA sequence

ATGGTGTTCCCTTTCGAGGGCTTTCTGTGTCAAGAACAGAAATTGGTGTTCCCCCTCCGTCGGCTAAACGAAGACATTTCGATGCTAGTTTTTCTACTGAGGAGAAATGAAAACAAAAGAGTATTGTTCCTTGTTATGTGTTACAATCTGGTGAAGAGAGTGTTCAAACTCTTCTTGAGACATCTGATATGGCTGAAACTTGGAAGTGGTCTTGATGATCTTGTTGATAACACTAGGATTACTGATGATATTGAGAATAAGGAAGTTGAGGTTGTTGATGACATTGAGTATGTCGCTAGCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTGTTCCCTTTCGAGGGCTTTCTGTGTCAAGAACAGAAATTGGTGTTCCCCCTCCGTCGGCTAAACGAAGACATTTCGATGCTAGTTTTTCTACTGAGGAGAAATGAAAACAAAAGAGTATTGTTCCTTGTTATGTGTTACAATCTGGTGAAGAGAGTGTTCAAACTCTTCTTGAGACATCTGATATGGCTGAAACTTGGAAGTGGTCTTGATGATCTTGTTGATAACACTAGGATTACTGATGATATTGAGAATAAGGAAGTTGAGGTTGTTGATGACATTGAGTATGTCGCTAGCTAA

Protein sequence

MVFPFEGFLCQEQKLVFPLRRLNEDISMLVFLLRRNENKRVLFLVMCYNLVKRVFKLFLRHLIWLKLGSGLDDLVDNTRITDDIENKEVEVVDDIEYVAS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10003520.1HG10003520.1mRNA