HG10002808 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10002808
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionRetrotrans_gag domain-containing protein
LocationChr11: 13052631 .. 13062812 (-)
RNA-Seq ExpressionHG10002808
SyntenyHG10002808
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTGGAGGGAGCATCCCCATTGAGTGATCGGTCTGCTAGTTCACGCAAATTCGAAGAAGTTATCACGGACGAGCCACATGCAGGCAAACTTGCACCTACTCATCGTCGTATTTGGTTTGGTATTGCTACCGCTCATTCATAAAATTGTACCCTAAGTTTAGATAAGGGTAGCACTCTAGGCCTAAGATTCAAAATCTAGATTTGAAACAGTTGTCTATGACATAGTCTTGAACTATTCTCACAAGTCAATGTGGGTCATGGGTTTTTTCAAAATATGCTTTGGCCCACTTGTGCTTCGTAGGAAAATTTCATGAGGTAATTCAACGTAAGACCACTCTAAATTCGTAAAAGGGTGCACCATGTTGGTATATGTAGTAACTATAATTTTTTTTAGCATTTCTTAATATTATAAATGTAATATATATTATAAATGTAGATATCCATAACCTATAGTGGTTACTAAATATCATTAAGCTTTCATTGAATTTCATGTTACATTGTAACATACACCATCCTAGGTCTTATAAATAGTAGTGTATGGTGCAAGACACACCACAATTGAATCCAATTGTTTTCTCTACCTTCTAATTCTCTCTACTTTACTTCTTGTTCTTTGCATTGTTCTTATTTTACAATCACGATGCTCTCACTTTCATTTACAAAAGGTAGGTTAGTTTTGTTTTGGATTTTGTTTTGTGTTATGAATGTTTTATGTATACAGTGTATATGTATCAAATACATCATATATACACCGTGTATGGTTTAAACGTTGACAACATGTTCTTTTATGCAATATCGACATATTATTTTTACAAAGTTATTGTTTGATTATCATAATATTATGATTAAATTTATCTTATTCGTTAATTTATGTTTTATCTTATTATTCATGTATGATAATAATATATTATTATAATATGACTGTTCATTCCCTATGAGATCTTTTATTCATGTAATTCATTTTACCTAAACTTCTACTTATTTGTGTCATTTATAACATTGATCTAAATGATTATACTACTTTTATCTAAGCATGTTGTTAATCATTTTCTTTATATATATGAGCATGTCATAAAGTTAATATATATATATTGCAATTTATTTATTTGAATTATCATCAATATGTGGATAAAATGTGTATATTTAGATTCCCGTTACTTCATAATTGAATTAAAAAGATTGGTATATTGCTATGAATTATGATATGTTTATAACTTTAATTGACTATTGACATGTATATTTTGATTCACTATGTATTAATTTTGTTGTATTTTGTATTATGTATAGTGTGATTTATTATTATTATTTTTATATATAAATATCATCTTTACAATACAAATATATATTGAGCATGTTATTTATATTGGTTATATACTTTAAAAACATAATACAACATGTGCTAGTTATCTATATTGTCTAAAATGCATGTTTGATATGCTTATTAGAGTAATAATATAAGTACATTTCTTCTTTATAGTTTTACCATGACAAGTCTTGTCAAATTAAAGTTTCTAACTCTTGATATCAATTGTAACAATTATTTATCATGGGTACTTGATGCTGAAATTCATTTGGAAGCCATGAATCTTGGAGAAACGATTAAAGAAGGAAATACGATTTCTAGTCAAGAAAAGGCGAAAGCCATGATTTTCCTTCGACATCATCTTTATGAGGGACTAAAGATTGAATATCTTACCGTAAAAGATCTTTATGTCCTATATCCTATGGCAAAGTTTAAAGGAAAGGTATGATCATAAAAAACAGTAATTCTTCCTAAACCTCGTTTTGATTCGATGCACCTAAGGTTGCAAGATTTTAAATCAGTAAGTGATTATAATTCTGCATTATTTAAAACTAGTTCAAAATTGTTGTTATGTGGAGAAAAAAATTATTGATGAAGATATGTTAGAGAAGACATTTTTCATATTTCATGTCTCGAATATGCTCCTACAGTAGCAATATCAAGAAAGAAGTTTTAAGAAGTATTATGAGCTAATATCATGTCTAACCCTAATTGTTCTAACTCGTAAAATTAGGCAATTTAGAGCCCAATTTCTAATTGCCCTAAGTTGTTAATCAAGAATTTCTTCAAGATTCACTCTAAACTTCATTTAAGCATGTATATCCCTTAGCGATTTTCAATACAAATGAAATTTGCAATAAGAAGTAGGTTTCGTAGTTGCTACAAATTAAAGAACGAATAGCCTATTCGTTAATCCGATTTATTGATTAATTCTAATTAGTTTAACATGCTATGATTTAAAGGAAAATGCTTTAAACGAAGGCATGCATCCCTAATCTTGCAACTTTTTCACAATTTTAGTGCTTAACGCATCATGAATTTGCAATCAAGAATTTGAATCTAAACATGAATCGTCACTTTAATCGATACAAATTCCAAAATTCAACATAAGGATCAATGAAGATTCATGCATCTTAATAAAAATTGAGAAGATAATTATCAAAAAATTGAACTACAACTATCAAATTCCTAAAATTGTTACCTTAGCCTTACATCCTTCAAAAGATCTTCAATGAATTGATGAAAGGATACAAGAGAGTAGGGAGAAAATGCTAAGAGGAAATGAAGAACTCTCTAAAATTTCTACAAAATTGAATTTCTCTCCCGAGCAAAAGATGAAACATGCTATTTAATTACAAACAAGAGCATCACGTCGCTGTTTAGGAGTGTAGCAACGCTGGTCTTCTAAGCCGCAGCATAGCACTATGCTGGGCTGGGCATCGAAACGCTATTGGTTGTTTGCAAAAATGTAGTGCTCTCAGGTGGACTGTGTAATTGGGGTGTAAAGGGACTGTGCATGCTGTCTAGAGGGTCATTTTGGTAATTTTGACCCTTTGTTCAACTTTAAAATTGTTAAACAAATTTGTAACATTTGATTCTTGAGGACGATACTCAGTTCTTCAAGACCGTTTTACTATCATCAAGATTAATGACTTTAGAGATTAATACAATATAGTAAAAGTTTAATGACTTTAAAATTTTCATATCAAGTAAGAAGTTAAAGATATTTTCATATACTTGAAATTGTTCAAATCTATTTTTAAGTGAAGAAATTGTTTAACCTATAATATAGTAAAAGTAATCATTTTTAAGAGAATCTTCAGGTGATCGTGTTTCTTCAATGTCAACATTCTCATGAATTTTTTTTTTCTTTGAATCATTCTCTAATAGAACCTTTTTCTACCAATAAGTTAATAAATCTAGAATCAATATTTTTCCATTTTCTTGGATCATATTATTATATTCAGAATGCACCACACATGTCTCATTATCATTACTAATATCATCATTGTTTTCTCTTTTTTCACTTTCCTCCCCTATCTAGTTTTTTCATTCAAGTTTATTTGTTACATGCTTCATTTTCAACCATATAATTATCTACTATTTTTGTTTCATCTTTCGATTTGTCCATACCTATCATTTCTTCTATTATTTCATCAGTTTTATTACTTTTACTTCCAATAATACATTTATCAAGAGCACCTTTTTGAGATTCAATGATCAATTTTTTTACTCTTCTTTTCTTCTTGAGCTTTTTATATCCAGATTCATATTTTCTTGTAGACATATTGATATTCTATGTATGATAACTCAAATTTTTAGGTAAAATTTAATTTAATTATCTCTAATTATTTGGGATGTATTTAAAAAATTTTAAAGCTTAATTGAATTATTTTGATAAGATAATTCAATTTAAATCAAACTTGATAAAAGATTTGAGTTGAAATTCAGTTGGTGAAAGTTGAATTTTAAATTGAGAGATTTATTTTGTTGAGTTGAATTTGTGGAGGGAAAGAGAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTATAGTTGCCTTTGAAACATATGAAGTAAAAAAAAAAATTATTCTTTTTCTTCAGCCGCGCGCATCGCCGTTCGTTTTCAGCTACGACCATCAACCTGTAGTCCATGGGTTTCGTCTGACGTTCGAATGTTGCTCAGCGTCGTTGTCGGCTACCGCCCGTCCCTCTTTTGTCGTCGCTCCTTTGGGTTTTGCCGGAATCTTGGTTTTAGGGTAAGATTGTATTGTTTTAATTGGGTTTTTCAAGTATTTTCCTGTTACTTATTAAACTTCGGATCCAATTTATTGATACCCATTGTGTTTGGATTTTAGATTCAAGTTTTGGGGAAGTTTTGAGGCAAAAGCGGGTTGTCCAACATCGTTAAGGGTGTTCTCGGCAAGATTTTGGTAAGTTTTCATGGGTTTTCTTGTGGACCTAGATTATCCATCCAATTTACCTTAGATTTTGGGTTCTAATTGTTACATTTTGGTAGGTGGCTTGGAGTCGCATTGATTTGGAAGTTTGGAATTAGTTTTGATTCAAGCCACACTTTGGTTAAAGTTATTTGAATGTAGTTATGGATAATTTGGTGTTTGGTTACAGCCTAAAATTTGAGTGTGGGACTAGATTTATCTTGCAGATTCTATTCAAAATTTTGTTAGGGATTGATTTGCCTCAATATTAATATTTGAGCTTGTTTTTTTTTTTTTAAGTAATCTTACTACTGGAACCGCCCTTGAGTCGAGACTTGATCGACAAAACATATATGAGTAATAAAAATGAGAATGAATATGGTCTAAAGTGCAAGCATATACTGTCGATGAAGTAATAAATCTTGGAGTATTCCAAGAGTCGAATCTCACGAGACTATTTATGCAATTCAATTTTTCTAACAAAGAGATTTTCGATGCAAACCAAGGGGTAACCGGTAAATAAGTGATTTTAAGGTTGAATGTTGATAAAGTAGTAAACAAAAGTGTTAAACAGGGATGCAGTTATGTTCCAACCTTTCGGGTTCTATTCTGTAAGTAGTGTAGCCGACTCATACCAAGACAATGAAATATGCATAAACAAAAAACTACTCCTATTCGGTCTTGTGTCAAGTTCCTTTAGAAGATCTAAGCAGCTAATGTCTAATGCTTCCATGGTTAGCTAGATCTTAGATTAGTTTAAGCTTATATTCTTTATCCTTCGGTGTCCCTTATTTCTAAGGCGACATGACCATCCTATTTCTAGGGTCTTAGTTCCATATTCCTTTGTAACATCGATTTATATCCTAACCTTCTTAGCACTAGAACTCCACTAGATTGCTAAATTAAGTGATCAGTTTAACTTAACAATATTTTTCCATAAACTCATCAAAGGAAATGCATAAGTCAAAGAGGTATGAAACATAAGCATTGCTTAAGCCATAAAATCCTAGGGTATTCACATAACCGAACTCCTTAGAGAATTTAGCTCATGAGTAATGAAAAAATAATGAACTTTATTGAATCAAAAATCATATCTACAAGACGATGTGTCAACGGATGAAAAGAAAAGAGAAAATTACAAGAAATAAATGAATATAAATGATGAAAAAATATAACTCAAGGGGTCTTGGGACAAGTCCTCAATTCTTTAGTCTTTCCCTAGGTTGATTCCCATTTTTCAAGGAAGAATCGTTTCTCACCACACGTTTTCACGGGATGAGATGACCTATAGCTGCTACGCCTTAGAGGAACTTTCGTTTTTAAGGCTACCAACTTAAGAAATTGAATCTGAAAAAACTTGGCTCAATAATGTGGATGCATCACTTTTGATGCGGTTACAACACATTTGACGCGAGTACATCAGACGGTGCTGGTACATCACTTACTGTTGCGGGTACATCACATGAAAAACAGCCAGAAACCCGTCGTACGAGATCAGTACCAAATCCGCAAATAACATCTTGTAAGCATAATTAACCCTCATTAAGCTTATTTGAATATATTAAGACAAAAGTTGTGATAAAATTCATGCAAGAACCCATTTTTCATATTAAAAATGTCCAAATAAAATGATTCCGCACATATTTTTCATGTTTTCATGTTTAAAAATTCTAGTTCTCATGTTTGAATTTAAAATTCTATTATTTGCACTGTTAGACATTTTATATAAATTTTAAGTTTTTTTAAATAATTTTAGGGGTAGATCAAAGTTTTTCAATTCTTGGGAATTTATGAAAATTATTTAATTTATAAAGTTTGTTTGATTTTTAGTTATATTTATGAAAAAGAGTCGTTTGAGATGTATGCATGCATATAGTGACGGCCTAGTACAAGTCTTAGGAAGTCGGGTCGTTACATTAAGTATGCAAATATAATAAAATCTTAGATGTTAAGATATTGAACAATCAATAATATGAAATTTAACTTTTTTTCCAAAAGAAGGTAGAAGAATTTGAACAAAAAAAACCTGGAACTTTGAAGCAATTAGATTGAGTTGAGGAAATGATTTCTGCTCTAGCAATTGATAACCAAACTAGGACTCCCCAGTCCACACAAAATATCAATGACAATCTAAGAGTTGAGAGATATTTAGAGAGAGAATTCAACTTAAAATGAATATAACCTACCATACTTAATAAATTTATGAGGGGAATGAGAAGGGTTTTAATTTTGAAAAAAAATAAATATAAAATAAGAAATATAAAAGGTCTTCAACTCTCCCAACGTAATCTTATGAGAGTTTTGAGGGAGTTATATTAATGATTGAGATTTTTAAGAAATTAGAAAAGAATTATGAATAAAAAAATAAAAAGATAATAAATTTAAAATGTCGGTCAATCAAAATTGGAGAGAGTTTATGAGCTCATTCATTATAAATTTTTTTAGTAATTTGTATTTTCAATATTATAAGAAACATAAAAAGTTTAAGAAAATAAATAGAAATCAACATTAAAGAATTACTTCCAATATAAGGTTTCTACTCTTGGTGAAAATTTGCAACCTTTCATGCATCAAAAGACACATTTTCATCCTAGAGTCACAATGAATCTTAAAATTCAAATTCGTCCACATATTTACTAGTACATGTATTTATTTAATTTTATGTATTTACATTTATGAGAGTAGTTGAACGGTTTTAGATGAATTTAGACAATTTGGTGAAAGGTTGTGTCCTTTCATAGTGCCTTTTCAATTAGTTTAAATAGGGCTGTAATTTCCACATTTTGAGAGAGACCTTTGAATTTAAATGAATTTTTCATAGAGTTAAATCTCTCAAGCTTTTATGCTTTCTTTATATTCTTGTGTTTAGAATGTATATTTAGAACTTTCAATCTAGTTTGATCACTTAGATTGTGGAGAGTTCGAAATCTTGAAGTTAGGAAGAAGTTCTCCTTTCTTCTTGATTTTTGATCAATCTTCCAAGCCAAATTTGTTTAGCTTTCTTAGGGTTATTATCAATTCGTTAATTGGGGTTATTCTTATTAATGTTGTGGGAGTTCACCTTGTTTAAGGGGGAGTTCTCAAACGTGATTGAGGTAGTTTCTTTTATCTATTTTATATTTTAATTTAATTTCATTGAAAAAATAAATTAAATAGATACCAATATTACAATACACATAGAAGTTGGCCCTGCATATCAAACAACAAAATATGGATAAAATTGTATTCTTCTTATTAATGGAATAGAGAGATACAACTAAATATATCAACTTTAAATTACAATATGGATTAAATAAGCTAACTAACTCTTTAGTTAATTAACAACCTCTAATAGGAGGAAAGGGAAACGATGAAGGTGATTAAGAGTACCGTTGAAGAATCACAACCAATTTTAAATTTAATTTTTAAAATTAAATATTTAAGGGTTAAATTTCTTGTAGTTTAAGAACTCTCAATTTTAATAATTGTATAAGTTTAATGGTCTAATTTCTACTATTATATAAGTTTGATGGTCTAATTTTAACATTTATATAAATTTAATAGTTCGATGTTTATCATTAAAAATTTAAGAGTGTAATTACAACTATCATATTTTAGACTGATTTTTAAAATTTACCAAAAAAAAAATAAAAATGAAACGAGGATATAGATTTTGAAAGTTTGAAGAAGTAAAATTTTGTGAAAGTATGAGTGTGAGGAGGTGGTGTTGACTTAATCATAGGGCATCCAGATTCCCATACGAAAGCGGCCTCAAATTATTAATGCGCGTTAGTTTAAAGGCCGTTTAAACTGTCAAGTTGTCAAATTTCTCAAAACCTTGACCCTCCTCCTAGAAACACTGCATTTTGATTTTTTGACCTATTTTACTACCAAATTTACCTCTATACCCCTCCACTTATTCTATCCATGACTTCCTCACCACTCCATTTTTAGGCTTAATCTATCCAGATTTTTCAATATAAATCCTTCCTTAAAAATCATATTATTATTTCTGTTAACATATATTAAACTTTTCATTAAACTTTTGTTATGTTAAGTTCATGTATTTAAACATGTGGACATGTCATAGCTTTGAAAACAAATGAATTATGCTAACGAAAACGTTGAATTTTATATGTCAAGTGGCATTCACATTTTATATATCATTTTTATAAGCTTAAATATATTAATAAAATAATAATTTAATCATAGGTAAAGTTTTTTTAACATAATCATATTAACATTTAATATAAATTTGAGAATTTTAATGACTATATTATTTAAAATATACTTGAACTTTAGAATAGATTTCGATAATGTTCCTATATTTTCAAAAATCTCATTTCACTCTTCAACTTCCAATTTATTTCAAAATGAAATAGGAAAAGTGATGTGTGATGACCAGAAAAAATTATGATACATGTTAGGGGTGATTTTAGACCAAAGGGTATAATTGACATCTAACGCAAATAGAAACGACAAAATCAAGAAAAGAGCATGGAACGGGCCGAAAGTGGCAACTTGGGACCTAATTGGGCCAACGATAAGGGGTTGGCTGCTTGGCCTCGGTCAAGACCAAGGCCGAGGCCGAGCCTTTCCAAACGTCTATCGGGGCATGCTTTATGCATGCCCGACCCAAGAGATCCTTTTAGGTCCAAAATATGGTCTAAGGGAGATGCTCGACCTCAATAATTTGCATACCTTACAAAATATGAGCAAGAGGGACGAGAATAAGAACATGGATGGTGGTGACTCAGACCAAGATCGCCACTCACAAAGGACTAGGAATCCAACACCGCCTTGACCCGAGGAAAAATTGGAGGCATTAGAAAAATAAGTAACTAGAATTGATCGTGATCTGACTCAACTACTTGAGATTTTAGACAAGCAAAACCCTTTAACAATGGTTCATGTGGAACCATTAATATGCGATCCTGTCAAAGGAAAAGCCCCTTTGGTTGAAGATGTAGGAGAAACAGAGTCTCATGTTCAAAAACCAAAAGATTGGTTGATTTTAGGTGGGAACAATCAGGGAAGGAAAACAGATGCTGCTGGACAACCAAAGTGACATGAGGCTACACATAGCAAAACCAATAGAACTAATGGACTAAAATTAGTTGTGCAGACTATGCCGAGGAGTTTGAGCCGAAGCCAAGATGATCTTGGCCGAGGCGACCTAAGTCGAGGTTGAGGAGACTAAGCTGAGGGTAAAAAAATGAGGTCAAGGTCGAGGAGCACCATAAGAGACCGGGGATCAAAATTGAGACAGACCTTAAGAGCTTGATCAAGGAGAAGCGACGAGCCAGGGCTGAGGTTGAGGCCAAGATCAAGAGTCCTCCTTGGAAGGCCTAGTTGATTAGTCCAAGATAAAATAGGAAACATGCAGAAATCTAAGGGAGCAGAAGGATTCAATCTCGAGGCATTGATCGAACAGGTGGACCCCCCATTTACTGATGATATCATGGCAGCAGAACTTCCTCAGAAGTTCAAAGTACCAACCACAAATCCTATGATGGCAATAAGGATTCGGTAGAGCATTTTGACATGTAAGGTCTTGGATGGAACTTCATGGAGTATTTGATGCAATTCGATGCCAAGCATTCTCCTTTACCTTGATATGATCATCTAGGGAATGGTTTCAAAAATTGAAGAGAAGATCAATTAGTTCATTCAAAAAACTCGCTCGGGCCTTTGTCACTCAATTCTTGGGTAGAGACCAACGCAAGCTAAAAATGCATTTGCTGATAGTTAAGCAAGAACAAGATGAAAGTTTACGTGAGTTTGTCGCACGTTTCAACAGTGAAGCCCTACAAGTCGACGGATACAATGATGGGGCAGCATTAATTGCCATAGCGTCTGGGTTACGAGATGAAAGACTCCTTCAATCATTCGTAAGAGGGAACCCAACACTTATGCTGGATTCATAA

mRNA sequence

ATGCTGGAGGGAGCATCCCCATTGAGTGATCGGTCTGCTAGTTCACGCAAATTCGAAGAAGTTATCACGGACGAGCCACATGCAGGCAAACTTGCACCTACTCATCGTCGTATTTGGTTTGCGTCGTTGTCGGCTACCGCCCGTCCCTCTTTTGTCGTCGCTCCTTTGGGTTTTGCCGGAATCTTGGTTTTAGGGGAATGGTTTCAAAAATTGAAGAGAAGATCAATTAGTTCATTCAAAAAACTCGCTCGGGCCTTTGTCACTCAATTCTTGGGTAGAGACCAACGCAAGCTAAAAATGCATTTGCTGATAGTTAAGCAAGAACAAGATGAAAGTTTACGTGAGTTTGTCGCACGTTTCAACAGTGAAGCCCTACAAGTCGACGGATACAATGATGGGGCAGCATTAATTGCCATAGCGTCTGGGTTACGAGATGAAAGACTCCTTCAATCATTCGTAAGAGGGAACCCAACACTTATGCTGGATTCATAA

Coding sequence (CDS)

ATGCTGGAGGGAGCATCCCCATTGAGTGATCGGTCTGCTAGTTCACGCAAATTCGAAGAAGTTATCACGGACGAGCCACATGCAGGCAAACTTGCACCTACTCATCGTCGTATTTGGTTTGCGTCGTTGTCGGCTACCGCCCGTCCCTCTTTTGTCGTCGCTCCTTTGGGTTTTGCCGGAATCTTGGTTTTAGGGGAATGGTTTCAAAAATTGAAGAGAAGATCAATTAGTTCATTCAAAAAACTCGCTCGGGCCTTTGTCACTCAATTCTTGGGTAGAGACCAACGCAAGCTAAAAATGCATTTGCTGATAGTTAAGCAAGAACAAGATGAAAGTTTACGTGAGTTTGTCGCACGTTTCAACAGTGAAGCCCTACAAGTCGACGGATACAATGATGGGGCAGCATTAATTGCCATAGCGTCTGGGTTACGAGATGAAAGACTCCTTCAATCATTCGTAAGAGGGAACCCAACACTTATGCTGGATTCATAA

Protein sequence

MLEGASPLSDRSASSRKFEEVITDEPHAGKLAPTHRRIWFASLSATARPSFVVAPLGFAGILVLGEWFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFLGRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEALQVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNPTLMLDS
Homology
[Close]
BLAST of HG10002808 vs. NCBI nr
Match: XP_022158344.1 (uncharacterized protein LOC111024851 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 2.1e-18
Identity = 54/98 (55.10%), Postives = 72/98 (73.47%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFL-GRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WF++LKR SISSFK+LA AFVTQF+ GR + K   +LL +KQ+  ESL+E+VARFN E L
Sbjct: 59  WFRQLKRNSISSFKELAEAFVTQFVGGRVKSKPVTYLLTIKQKATESLKEYVARFNEEKL 118

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNPTLMLDS 164
           QV+G  D  ALIA  SG++DERL+ SF +  P   +++
Sbjct: 119 QVEGLTDAVALIAFVSGVKDERLVFSFGKRTPGTFMEA 156

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. NCBI nr
Match: XP_022158830.1 (uncharacterized protein LOC111025293 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 1.5e-16
Identity = 52/92 (56.52%), Postives = 66/92 (71.74%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFL-GRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WF++LKR SISSFK LARAFVTQF+ GR + +   +LL +KQ   ESLR++VARFN E L
Sbjct: 243 WFRQLKRGSISSFKSLARAFVTQFVGGRCRSRPVAYLLTIKQRTTESLRDYVARFNEEKL 302

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNP 158
           QV+G  D  +L+A  SG+RDE L  SF +  P
Sbjct: 303 QVEGLTDAVSLLAFMSGVRDEHLSFSFGKRTP 334

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. NCBI nr
Match: XP_022147761.1 (uncharacterized protein LOC111016619 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 5.8e-16
Identity = 49/87 (56.32%), Postives = 65/87 (74.71%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFLGRDQRKLKM-HLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WFQ+LKR+SISSFK+LARAFVTQF G   R   + +LL +KQ+  ESL+++VARFN E L
Sbjct: 59  WFQQLKRKSISSFKELARAFVTQFAGGWNRSRPVAYLLTIKQKATESLKDYVARFNKEKL 118

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSF 153
           QV+G  D   L+   SG++DE+L+ SF
Sbjct: 119 QVEGLTDAVVLLVFISGVKDEQLVFSF 145

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. NCBI nr
Match: XP_022159109.1 (uncharacterized protein LOC111025548 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 1.7e-15
Identity = 49/93 (52.69%), Postives = 66/93 (70.97%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFL-GRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WF++LKR SISSFK LARAF+TQF+ GR + +   +LL +KQ   ESL ++VARFN E L
Sbjct: 148 WFRQLKRGSISSFKSLARAFMTQFVGGRCRSRPVAYLLTIKQRTAESLHDYVARFNEEKL 207

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNPT 159
           Q++G  D  +L+A  SG+RDE L  SF +  P+
Sbjct: 208 QLEGLTDAVSLLAFMSGVRDEHLSFSFEKRTPS 240

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. NCBI nr
Match: XP_022150035.1 (uncharacterized protein LOC111018307 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 6.5e-15
Identity = 48/93 (51.61%), Postives = 65/93 (69.89%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFL-GRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WF++LKR SISSFK LA+AFVTQF+ GR + +   +LL +KQ   ESL ++VARFN E L
Sbjct: 63  WFRQLKRGSISSFKSLAKAFVTQFIGGRSRSRPVAYLLTIKQRATESLHDYVARFNEEKL 122

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNPT 159
           QV+G  +  +L+A  S +RDE L  SF +  P+
Sbjct: 123 QVEGLTNAVSLMAFMSDIRDEHLSFSFGKKTPS 155

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ49 (uncharacterized protein LOC111024851 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024851 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 103.2 bits (256), Expect = 1.0e-18
Identity = 54/98 (55.10%), Postives = 72/98 (73.47%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFL-GRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WF++LKR SISSFK+LA AFVTQF+ GR + K   +LL +KQ+  ESL+E+VARFN E L
Sbjct: 59  WFRQLKRNSISSFKELAEAFVTQFVGGRVKSKPVTYLLTIKQKATESLKEYVARFNEEKL 118

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNPTLMLDS 164
           QV+G  D  ALIA  SG++DERL+ SF +  P   +++
Sbjct: 119 QVEGLTDAVALIAFVSGVKDERLVFSFGKRTPGTFMEA 156

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DWY0 (uncharacterized protein LOC111025293 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025293 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 97.1 bits (240), Expect = 7.4e-17
Identity = 52/92 (56.52%), Postives = 66/92 (71.74%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFL-GRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WF++LKR SISSFK LARAFVTQF+ GR + +   +LL +KQ   ESLR++VARFN E L
Sbjct: 243 WFRQLKRGSISSFKSLARAFVTQFVGGRCRSRPVAYLLTIKQRTTESLRDYVARFNEEKL 302

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNP 158
           QV+G  D  +L+A  SG+RDE L  SF +  P
Sbjct: 303 QVEGLTDAVSLLAFMSGVRDEHLSFSFGKRTP 334

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D3B7 (uncharacterized protein LOC111016619 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016619 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 95.1 bits (235), Expect = 2.8e-16
Identity = 49/87 (56.32%), Postives = 65/87 (74.71%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFLGRDQRKLKM-HLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WFQ+LKR+SISSFK+LARAFVTQF G   R   + +LL +KQ+  ESL+++VARFN E L
Sbjct: 59  WFQQLKRKSISSFKELARAFVTQFAGGWNRSRPVAYLLTIKQKATESLKDYVARFNKEKL 118

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSF 153
           QV+G  D   L+   SG++DE+L+ SF
Sbjct: 119 QVEGLTDAVVLLVFISGVKDEQLVFSF 145

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E1E7 (uncharacterized protein LOC111025548 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025548 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 93.6 bits (231), Expect = 8.2e-16
Identity = 49/93 (52.69%), Postives = 66/93 (70.97%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFL-GRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WF++LKR SISSFK LARAF+TQF+ GR + +   +LL +KQ   ESL ++VARFN E L
Sbjct: 148 WFRQLKRGSISSFKSLARAFMTQFVGGRCRSRPVAYLLTIKQRTAESLHDYVARFNEEKL 207

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNPT 159
           Q++G  D  +L+A  SG+RDE L  SF +  P+
Sbjct: 208 QLEGLTDAVSLLAFMSGVRDEHLSFSFEKRTPS 240

[Close]
BLAST of HG10002808 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D7D2 (uncharacterized protein LOC111018307 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018307 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 3.1e-15
Identity = 48/93 (51.61%), Postives = 65/93 (69.89%), Query Frame = 0 

Query: 67  WFQKLKRRSISSFKKLARAFVTQFL-GRDQRKLKMHLLIVKQEQDESLREFVARFNSEAL 126
           WF++LKR SISSFK LA+AFVTQF+ GR + +   +LL +KQ   ESL ++VARFN E L
Sbjct: 63  WFRQLKRGSISSFKSLAKAFVTQFIGGRSRSRPVAYLLTIKQRATESLHDYVARFNEEKL 122

Query: 127 QVDGYNDGAALIAIASGLRDERLLQSFVRGNPT 159
           QV+G  +  +L+A  S +RDE L  SF +  P+
Sbjct: 123 QVEGLTNAVSLMAFMSDIRDEHLSFSFGKKTPS 155

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of HG10002808 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022158344.12.1e-1855.10uncharacterized protein LOC111024851 [Momordica charantia][more]
XP_022158830.11.5e-1656.52uncharacterized protein LOC111025293 [Momordica charantia][more]
XP_022147761.15.8e-1656.32uncharacterized protein LOC111016619 [Momordica charantia][more]
XP_022159109.11.7e-1552.69uncharacterized protein LOC111025548 [Momordica charantia][more]
XP_022150035.16.5e-1551.61uncharacterized protein LOC111018307 [Momordica charantia][more]
BLAST of HG10002808 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10002808 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1DZ491.0e-1855.10uncharacterized protein LOC111024851 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024... [more]
A0A6J1DWY07.4e-1756.52uncharacterized protein LOC111025293 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025... [more]
A0A6J1D3B72.8e-1656.32uncharacterized protein LOC111016619 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111016... [more]
A0A6J1E1E78.2e-1652.69uncharacterized protein LOC111025548 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111025... [more]
A0A6J1D7D23.1e-1551.61uncharacterized protein LOC111018307 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018... [more]
BLAST of HG10002808 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
IPR005162Retrotransposon gag domainPFAMPF03732Retrotrans_gagcoord: 66..144
e-value: 2.6E-11
score: 43.6

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10002808.1HG10002808.1mRNA