HG10002454 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTTCGCTATGGCGGCTCCTCGATTCCCAATTCTTCTAATGCAGAGCCGCTCCGACTCTAACCCTCGCCGTGGTTTTGGAAACAAGGAAGACAATAAAGTACGTATACATGTTTATGATGCATTTTTAGTTACAACGGTTTCGTATCTCTGCAGATTGGACATGATTACATTCATTTTCCCTGCTTAATGGCAAGATATCATGGTATCCTTTTCCCCGTTGGCGGCACACCTAGATATTCGATACGAAGCTTAGCTTGACTATTGTACATACATAATCATGCATGGTTTAGTAGAAGAATAAGTTGAATTACTTATATGAGTACATAGTGAATTGGTTATTGTAATGAAATTTTATTATAAAACTATTAATTGTTTTGTATAGAAATTTTCTTTTCAAAAGAAGTTTCTAATCTAGAACAATAGAAATACCTCAACTCTCCAATGCACAACCCCACAATTTTGGAAGCAAAAAGCACAACTACAACAGTTAGTTAAGATTTTTTCCATTACAGTAGTCCATGATACACATACACCAATTTAAACAAAGGATAAAAGTTGAGGTTAAGTGTCAATCCTTCCTATAGCTTTGTTCAATATTTCTTTGTTTGTGCTTCTTCTTCTTTTTTTTTATTTTTATTTTTTTATTTTTTTTTTTTATTATCCGTGAGTGTCTAGGTCAGCTTACGCGCACCTCAACTAATCTCACGGGACAACCCGCCTGACCCTACAACATTTGGGTATCAAGGAAACTCATAGGATATTAATTCCTAAGTAGGTGGCCACCATGGATTGAACCCATGACCTCTTATCCATTTTCTTTGTTTGTGCGATTGATTTGTCCTTTTTCATTACTTGTTCCTCCGACTGTTTCCCGTAGGATCTGAGTTAGGCTGATTCTATAGGCCATTGTGAGCAAGTCTTGTGATTTTGCCTTGTGGTTGTTTTGCTATTTTCTGCTATTCTCTCTTTTACATCAATAGACGGAGGTAATGAGCTATATGTTTCCATGGTCCGTCTCTACCCCCACCCAAGTCCGTGTATGCAATTATATAGTTGTGTTGGAATTCCTCTTCCGTGACTTCACATTGTTAACTGAGCTATGACCATGATCATCTGCCATTTTATAGCAATATGGTTGAATTCTTTTTTCTTTTTTTTCCTGTTAATAGATATTATTAATATGTAATTCAATTATTTGTTTAATCCTCCAATTGAGGCATCATTAACTTGTTTTGTTATTTTACACTTAGGCCGACAAAGCTGGCAACTCGGGCAACCAAAAGGGTAGGGTGTCTGAACCAAGGTATTCTAAATTGGTTTAGTTTTTTGAAATTCTGAATTTATCGTTTATTGTGTTTGAAACTTTGTTCTTTGCTGCTTGTTGATTGTTTTCAGTTATTGCACAATGTTGATGCTTTCTACTGTTCTCAGTGCATTTCAAATACAGATACACATTTTTTATTTTTTATTTTATTTTTTCGCATATCTTCATTGCTACACTGTTCTCAGAAATTCTTTTGACATTTTCAAGAGTCAACAGATCTTTCTACTTTTCTGGAACAAATTTTACTCTGCCATTGATGCTAATCCCGCACTATCTTCTCTTCTACAGTTCTACTACTTCTACACTAATTGAAATTATTTTCTTTCTTAAATCATCAACCTTTAAAGTTGCTGACACGCTATAAGAACCTTAAAAAAATGAAGAGCATAACCAAGCAGTCTTTCTTTTTAAAAAAATGTCAAACACTGAAATAGAAATATTTCTGCTCCATCTACCCATTTTTATCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTTTCCAACCACACTTTTTTTTTCCCTCTCCCTTCACACTTCAACTTTCTTTCCAAGTATTTTACCTTAAAGAAAAACACTTTTTTTTTTTTCTTATTTTTGGTTCATAGAAAGCCATCCACCATCAACCTATTGAAAGAAAAGGAGTAGCTCCAACTAAATGTCTGAAGACGCAAGAACACCAACTTGAAGACACAAGATCCCTAAACTTGAACTCCTCTGTATGGGTAAAGATCGACTGCAAACGAAGTGAAAGCCCTTTAAAAGAAGGTATTCAAGAACATATTGAATGTATAAATAAAGAAAATATCCTTCACAAATTACAAACAATTGTGTGTAATGAGTAAAAGTAAAAGGGGTTGTTTGCCAAAGTCGAAGTCAGTTGGATCTGGGAGAACAGGTAACCCCATTGAGCTGCTCTAATACATCAAAAAGAGAAATAAATAAACAAAGAAGAAAGAATGTATCACGTACCTCTTGCCACTTAGCTAGATAGTGATATTGTCACCCTTTAGAATGGAAAGAAACCGGCTAATTGAAAGAATACACTCTAGTAGAAGGGATGACTGGATTAATAACTGCACAAGACTGGACATCCTTTTATTTGACATGCTCTCTGTATGGTGTTTTATTTTACATTCTGTCATCTACGAATGTTCTCTAATCTAATGAATTGGGGATAGAGCTGATCAATTTTTATGTTTTTTCATTTCCAAATTATCTTCTCAATTTATTGAGTTTCACTTTTTGATGACTTTGCTAATATTGTGTTTTCCTCTGCTTTGGACTCACTGCTGATGTAGGAAACCCATTCCAAAACAATCTAGTACAGTACCCACACGTAAGTGTAACTCATTTTTCTGTAAGTTTCTTCATCATTTTCTTATTTTTCTTTTTTGATCTCTTAATCGAAAGGCTTATGTAATTTTTCATTTTTCCTCTACATACTTTAGTTATGAGTGGGCCTGGATAGCAGGGGAGCCTCTATGCTTTCCTTGGTGAGTGAGGGAGAATTGGAACTTTTATTGATAGTGATGTCTCATGGATGCAGAAAGCTAGATTTTTTTTTTAAACGGAAACAAAACTTTTCATTGATATATGAAAAGAGATTAGTGCTCCAAAATACAAGATACCAAAATAAAAATGAATACAAATACAAGGATCAACATGCGCACCCGAATATCTCAACTAGGTTGACACACCCATAGTGCCCTCATCACATTCCAATAATACAAGGCCAAAAATTCCAATTACAGAGGAAAAAGCAAATGGTAAGAAAGCTAAACCAACGAAGGGGCTTGTCTTGAAATATATGCTGGTTTCTTTCAAACCAAATTTGCAGAAAGCTAGATGTTATAGGAACTTGGATTTGAAAGACAAGTTTGAGAGGGAAATTCTCCCTTTTTTTTGTCTAACTACTGTGTTTAGCAAGTGTGTGAGGGTCCAGTAGCCAAAAGCGTCAATAGTTAAATAGAAAAGTAGAATAATCAATGAAATAAAGTGTAGTTGGAGGTTTTGTAGAATTTGCAACTGGAAACTCCTAGGGTATGCTGGGATTTGCGAAAAGCAGCAGGTGGAGCCAACAACCCACCAAAACTAATGTATCTACCACTACTACATCTCTGAACGAAGTCAAATAGAGGTGTGAATGCAAGATGCCGGTGGAATGATCGGTCGAACAGGGGTTAGGGTTGCTTAAACTCTGGAAATTTTAGTGCTATAATGCTTTTCAAATCCTTCTAGCCATCATCCAATTGCACATAGCTATTCAACTATTCCACAATTCCCTTTAGCCATAGGGACTCCTTAATCTTTTTTTTTGAAAAAGGAAACAAGTCTCTTCATTGATATAATGAAATGAGAATAATGCTCAAATTACAAGTAATGATACAAGAGCAAAGGAACGAACAAACAATGAATCAGTGGGTGCACCCGAACATCTCAACTAGGTTGATACCCCCTTAGTACTCTCATCTAAGAAGCACGGACACTCTAGTTTGGCTAGCGTGTCCGTGTCCGACACGTGTCCGACACCCCGACACTTATTGGACACGTATCGGACACTTTTAGTGCAACAAACGTGTTAGACATGCATTGAACACTTGTTGAGTAGACTAAAAAAACACATATATGACGATAATAGTAACTTTTGAGTGTGAAATACATCAAGGTAAGTCTTTTAAGCATATAAATGCATCAATCCATTTACTTTCAATTTTATTTTGGTATGAATATGATATATATTTTAAAAAAAATATATATTTTAATAAATGTGTCCTTGTCGTGTCGTGTCGTGTCTTAGATATTTAAAATATGGCGTGTCGCCGTGTCTGTGTCGTGTCGTATTTGTGTCTCGTATCTGTATCCGTGCTTCTTAGACTCTCATCAACTCCGAACAAAAATCAATCATCCAAATATCAAAGGACAGTCCAACATAACAAAAATACACCCCGAATACAATGAGGCAACCAGAGGAAATACAAGGAACTAAACGAAAATACAGCTATAAACAAAAGCTAAGAATATGGAAAAATGAACGCCTTCCAAATTAAGGAAACATCTTGGATGGAATAATCTGCAAAAGAGCTGGAGAGGGTGCACTAGAAGAAGCATTAAGTCGAGCTATCTCAAACCTATCCAACCAAGGTGTAGATTTATCTTGGAATACTCTTTGGTTCCTCTCAAACCAAATTTCCACTAATAAAGCCTTGATAACATTAAACCAGAGAAGCTTGGAATTTGATTTCATCCTTGGACCCAGCAGAATCTGCAAAATATTGTCTCGAAAAACATTGCCAAATACCCAATTTAAATGAAATAAATCCAATAATTGAGACCAACAATTGTTAGCATAGCAACAATAAAAAAACACATGCTGAAGAGTCTCTTGGTCCGCCAAGCAGAAAGCACATGCCGAAGGTGATAAACATGGAGAAGGAAGTTTCCTTTGCAAGATCGAGGAAACATTTAATGATCCAAAAAGCATGATCCATACCGTGATATTTACTCTTCTTGGGCTCTTTGACTTCTATAATGCTTTCACCAACAATTTATCTAGCAGGTAAGTCAAAGAAAGGTGGGTAACAAGGGACTTTATCGAGAACTTACTGTTGGCCTCAAGAGACCAAATGTGCCTATCGGGGAAAGGGCTCCACCCTTTTGTTTGCAATAAGGCCGAGAAGAGG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Match: XP_004144414.1 (uncharacterized protein LOC101220521 isoform X3 [Cucumis sativus] >KAE8650870.1 hypothetical protein Csa_001713 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 619.4 bits (1596), Expect = 2.7e-173 Identity = 349/491 (71.08%), Postives = 366/491 (74.54%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. NCBI nr
Match: XP_031738479.1 (uncharacterized protein LOC101220521 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 612.1 bits (1577), Expect = 4.3e-171 Identity = 348/496 (70.16%), Postives = 366/496 (73.79%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. NCBI nr
Match: XP_031738478.1 (uncharacterized protein LOC101220521 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 609.4 bits (1570), Expect = 2.8e-170 Identity = 348/503 (69.18%), Postives = 366/503 (72.76%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. NCBI nr
Match: XP_022980644.1 (uncharacterized protein LOC111479948 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 593.6 bits (1529), Expect = 1.6e-165 Identity = 336/492 (68.29%), Postives = 362/492 (73.58%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CN41 (uncharacterized protein LOC103502794 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103502794 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 620.9 bits (1600), Expect = 4.5e-174 Identity = 350/491 (71.28%), Postives = 366/491 (74.54%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IZV0 (uncharacterized protein LOC111479948 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479948 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 593.6 bits (1529), Expect = 7.6e-166 Identity = 336/492 (68.29%), Postives = 362/492 (73.58%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GWF7 (uncharacterized protein LOC111457503 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457503 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 589.0 bits (1517), Expect = 1.9e-164 Identity = 334/493 (67.75%), Postives = 359/493 (72.82%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IX11 (uncharacterized protein LOC111479948 isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111479948 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 585.5 bits (1508), Expect = 2.1e-163 Identity = 334/492 (67.89%), Postives = 360/492 (73.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GV96 (uncharacterized protein LOC111457503 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457503 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 580.9 bits (1496), Expect = 5.1e-162 Identity = 332/493 (67.34%), Postives = 357/493 (72.41%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. TAIR 10
Match: AT1G78915.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 373.6 bits (958), Expect = 2.4e-103 Identity = 221/482 (45.85%), Postives = 290/482 (60.17%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. TAIR 10
Match: AT1G78915.2 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 2.5e-100 Identity = 221/499 (44.29%), Postives = 290/499 (58.12%), Query Frame = 0
BLAST of HG10002454 vs. TAIR 10
Match: AT1G78915.3 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 360.5 bits (924), Expect = 2.1e-99 Identity = 220/502 (43.82%), Postives = 289/502 (57.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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