HG10001667 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATGCTAATGTACGAGCTCGTTTCACACTCGGCAAACAGTCCTCGCTCAAGCCAGAACGTGAAGGTTCGCCTGTGGTTACCGACGAGCTTGATGATTCGATCGCGATTCATCCTGGGATTAAGCTTATGTACTTGGCCAATGATGGTGACTTGGATGGGATTAGGGAGCTACTGGATTCGGGTACCGACGTCAATTTTCACGACACTGATGGCCGAACCTCTTTGCATGTTGCTGCTTGTCAGGGCCGGCCGGATGTCGTTAAGTTGCTACTCGAAAGGGGTGCGGATGTCGACGTTCAGGACCAATGGGGCAGCACGGTGAGTTTGGGATCCATATCTATTTTTAAATTTTGGATGATTATCATTTGATATTTGGTTGAAGTTGAATCAGTTTATGGTTTAATTTCTTAGTTTTTTTCATTAGGGAAGTTGGTTATTGTTTTAATTAGTACTATTACTTCGGCCTCGTAACTGAACTAATACCTCTCTTGTTATAAAATGAGGTTAGCAGTGTCTTAGTTTCTGATTGGTTCTTTAAGGTGCAGCTAGATATCCACAGATGTTAGATACTTGAAACAATGTCTGAATAAAGTCCCTTAAGGTCCTTTACACGGAGGTGATTCGTAAGGAGACCTGTAGCTGGAGGCAAAAAGTGAAGTCGGAGTGGGCTAAGGATGGGGATTGCAACTCTGCTCTTTTCCATCGGGTGGCAAGCGGCCGTAAGAGTAGGAATAGAATTGGCCCTCTAGTCTCTGATTCTGGAGAGGTGTTTAAGGAGGATAAGGAGATTGAGGAGGAAGTTATTAGTTTCTTCTCCAGGTTTATGGTCTGGAGGTTTCTGCCAAACCCTTTGTTTAAGGGATTGAGTGGAACCTAATATCTGAAGGGGATAAGGATAGTGTTTCCAAGCCTTTTTCTGTTGAGGAGATCAAAAGGGGCGTTTTTGGAAGTGATTGTTCAAAATCTCCAGGGGCGGATGGGTTTACAATGGCTTTTTATCAAGAGAATTGGTCCCTTGTGAAGGAGGATTTGGTCAAAGTGTTCCAAGAGTTTTACGAAAGGGGGATTTTAAATAGTTCTATGTCGGAAACTTATGTCTGTTTGATCCCAAAGGAGTATGTAACAAAAGTTAAGGACTTTTGCCCAATTAGTCTCATCACAAGTGTGTACAAAATTTTGGCGAAAGTGTTAGCGAATCGTCTGAAAAGGGTGCTCCCGTCGACTATCTCGGATGTGCAAGGGGCCTTTGTGGCAGGAAGGCAAATTCAGGATCAAGCCCTTGTTGCCAATGAGGCGATTGAGGACTATAGAGCTAAAAAGAAGGAAGGGTTGTTGTTTAAGATTGACTTTGAAAAAGCCTATGACCATGTGGATTGGAACTTCTTGGATAAGGTTTTAGATAGGAAAGGCTTTGGTTACAAGTGGTGTATGTGGATGTGGGGTTGTTTGAGGAATGTGAGCTACTCCTTTCTTATCAACGGGAGCGCTAGAGATAAGGTGGCGGCGTCGAGAGGTTTGAGGCAGGGAGATCCTCTTTCTCCTTTTCTTTTTCTCCTGGTTGTGGACGTGCTCAGCAGAATGGTGAGCAAGTGTGTTGAAGGTAACCTGATTGAGCCCTTTGAGGTGGGTAAGGATAAGATTCCCTCTCCCATCTTTAATTTGCGGATGACACTCTTTTCTTTTGCTTGGGAAGTGATCGTTCCTTCTTGATCTTGAATCATGTCCTTGCTTTCTTTGAGGAGATGTCAGGCCTCAAGATTAATAGGGGTAAGTGTTGCGTCATGGGTATTAATAGCGAGGAAGATAAGATTAGAAGGTGGGCAGAGTGGACTGGTTGTGAGGTGGGAAGTCTCCCCTCTTCGTGTTGTGTCATGGGTATTAATAACGAGGAAGATAAGATTAGAAGGTGGGCGGAGTGGACTGGTTGTGAGGTGGGAAGTCTCCCCTCTTCGTGTTGCGTCATGGGTATTAATAGCGAGGAAGATAAGATTAGAAGGTGGGCGGAGTGGACTGGTTGTGAGGTGGGAAGTCTCCCCTCTTCTTACCTTGGCCTCTTGTTAGGTACTTAAGCACCTTGGAGAACCACATCTTAAAAGCTAGCTATTGAGGTAGGAGAGCCAAGCCACTTAAGTACCACATTGGTCATCCCATTCTAACCAATGTGGGACAAAGGTAGCCCATACTACCTTGGTTCCTAACAGCCTCCCTCTTGGGACTAGTCCGAAGTGTGATTCTCTTTGGGGCCCTGTGATTGACAAAGTTAGAAGTAGGCTGGCTTCTTGGAAAAAGAGTTTCTTTTCTAAAGCGGGCCGTCTTACTCTCATTAAGTTTGTCCTGAGTGGCATTCCGGTCTATTTCTTTTCTCTCTTTAGAGCTCCGGGGGAGGTGTGCAAGTGTTTAGAGAGGTTGATGCGAGATTTCCTTTGGAAAGATGTTGATGAAGGGAAAGGAAAAGGTTCACATCTTAGATGGGAGGTTATCGAAAAGTCGGTGTCTTTAGGGGGTCTTGAAATTGGGAATCTTAGGGACCAAAACAAAGCCCTCTTAGCCAATTGGCTTTGGCGCTTTTACTCTGAGCCCAATTCTCTGTGGCGTAGGGTTATTGCTAGTAAACATGTCCCCCATCCTTTTGAGTGGTTAGCTAAAGGGGTTAATGGCACTTACCAAAATCTGAGGAGAGATCTTACGAAAGAGCTCCCTGCTTTTGTTCCTTGGGTTTGTTGTGTGATGGGGGATGGGAGAGAGACGTATTTTTGGGAAGATCACTGGGTGGGGGAGAAACCTCTTTCTGGTGCTTTCCCTCGGTTGTATCATTTTTCGTCTCTTAAAAATCATTTTGTGTTTGATTTTCTTGTGTGGTCAGGGAGCTCTTGTTCTTTTTCCTTTGGGTTCCGTCGTATCCTTTCCGATAGGGAAACGATGGATGTGGTTGCCCTCCTTTCTCTTCTTGAGAGTCACCCCTTTCGCCTTGGGAGGAGAGATGCGAGAGTCTGGAGCCCTAATCCTTTGGAAGGGTTCTCGTGCAAATCCTTTTTTCAGTATTTGGTGAACCTTTCTCCTGTGGGAGAGTCCGTCTTCTCGTCGTTGTGGATGATTAAGATTCCTAGAAAGGTGAGATTCTTTACTTGGCAGGTTCTCCACGGTCGTATTAGTACACTGGATAGGCTTGTTAGGAAGCTGCCGTCGTTGGTTGGACCTTTTTGTTGCATCCTGTGCAGGAAGGTGGAGGAAGGCCTGGATCATATTTTGTGGTACTGTGACTTTGCCAGCGGTGTCTGGGATTCTTTTTTCCAGACGTTTGGGTTGATGTGTGCTCGTCAGAGATATGTTCGAGGAGTTCCTCCTCAATCCCCCGTTCGGGGAGAAAGGTCGTTTTCTTTGGCTTGCTAGTGTGTGCGCCATTGTTTGGGTGTTGTGGGATGAGAGGAATAGAAGGGTGTTTAGGGGCTTTAGGAGGGATGTTAGAGAAACGTGGTCTCATATTCGTTTTCATATTTCTCATTGGGCTTCGATTTTGAAGACGTTTTGTAATTATCCTTTGAACTTGATTCTTATAGTTAGAGCCCTTCTTGTAGCAGGGTTCCCCTTTTTTGTGGGCTTGGTTTTTTGTATGTCCGTGTATTCTTTCATTTTTTCTCAATGAAAGTTGTTGTTCTTATTAAAAAAAAAAAACAATGTCTCGAAAAAAGTCAAATTGGAATGTTGGACACTGCATAATCGGTTGGTCTATTCAATACCTACAATATAAATTTTCTTTTCATTGCAAACAATGTCAAGCGGGGCGGAGATTTGAGCCATGGCAAGTCTTTCTAATGAGAATGTAATGGATTGTAACTTCTAACAGCAGTTAATGCATTCTGTCAATTGAAGTCTTGTTCCACTTTTTAAGAGAAACAGTTTCATAGTTGGTTACCATCCTATTTACTCATGGTACCTATTATCCATTTTTCTGTTTATATTTAACACTCTGGGTTAAGAAATGGGAATGGTAGAAGAATTTGAAATTGTAGGATCCGAAAATTGGAATTTATTTTGTGTTTAATAGCCTCTTGCAGATGCTATATATTACAAGAATCATGATGTGATCAAGCTCTTAGAGAAACACGGTGCAAAGCTACCGGTAAGAAACTGTACTCAGCACAGGTGATGTGCAATTGCTTTTCTTCTGTATGTACTTCTCACCTTACGATGTTCTCATTGTACTTACAAGTTGCTGGGAACGTTCCCTCCTGTATATCTCAGATGGCTCCAATGCTCGTGCAAAATGCTCGTGAAGTTCCAGAATATGAGATCAATCCAAATGAGCTTGATTTTTCTAAGAGTGTGAACATTACAAAAGTATGTTTTTGCCTGCTCCTTGTATTCACGCAATGTTATCAAATTTCTTTAATACATTTTCTATTTTATGATGTATTTTCTTTGTTTATTAATATGAAAACAAATTCAACAGTTTAGGCAAAATTGAGGAAACTCTAAATGAATTAACTATTTAAAAGTTCAGTTTAATATTAATACTACTTTAAGGATTCTGAAATAGAAAGAACAAAAGAATTTCAATCACTTTTTTAATCCTGCAAATTCGAAACACACTATCAAAAGTCTCTCTCCTGGTCTAAGCATGGTGGCAAAGATTTGGCTTGCTAAGATCAGGAAGCTTCCATGCTTGGACATCAATTAAAACTATGTCAATATTATCAAGCTTATGATCCTTCATACTTGCGGTTTGATTTTTGCTGACACGCCCCATCCTCAAGTTATCCTACCCACCATTGGACGTGACGTGCCGAATAGATCCCAATTAAACTATGGAACCTATAGTCAAACTTAGAAAAACTAAACACTTTTCAAAATCAATAGGTGGCTTACGCATTGATGAAACCTATTACAGTTCGAAGAAAAAATTGAAGGATGTGGCCAATTTATTCTAGTTCTCTCTTAATGTAGAACCTTGTTGATGCGTACTTAGTAAATTTGGGTGTTTATATATGTGT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Homology
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Match: KAG6570564.1 (Elongation factor 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG6570566.1 Elongation factor 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1675.2 bits (4337), Expect = 0.0e+00 Identity = 832/842 (98.81%), Postives = 839/842 (99.64%), Query Frame = 0
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Match: XP_022985899.1 (elongation factor 2 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1674.8 bits (4336), Expect = 0.0e+00 Identity = 831/844 (98.46%), Postives = 841/844 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. NCBI nr
Match: XP_022944338.1 (elongation factor 2 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1674.8 bits (4336), Expect = 0.0e+00 Identity = 831/844 (98.46%), Postives = 841/844 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. NCBI nr
Match: XP_023512756.1 (elongation factor 2 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1674.4 bits (4335), Expect = 0.0e+00 Identity = 831/844 (98.46%), Postives = 841/844 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ASR1 (Elongation factor 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LOS1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1604.0 bits (4152), Expect = 0.0e+00 Identity = 789/842 (93.71%), Postives = 818/842 (97.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O23755 (Elongation factor 2 OS=Beta vulgaris OX=161934 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1586.2 bits (4106), Expect = 0.0e+00 Identity = 779/842 (92.52%), Postives = 818/842 (97.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P28996 (Elongation factor 2 OS=Parachlorella kessleri OX=3074 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1372.8 bits (3552), Expect = 0.0e+00 Identity = 671/844 (79.50%), Postives = 758/844 (89.81%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P29691 (Elongation factor 2 OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=eef-2 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 1100.5 bits (2845), Expect = 0.0e+00 Identity = 547/856 (63.90%), Postives = 665/856 (77.69%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O14460 (Elongation factor 2 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=eft201 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1096.3 bits (2834), Expect = 0.0e+00 Identity = 538/844 (63.74%), Postives = 659/844 (78.08%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JEK6 (elongation factor 2 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483814 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1674.8 bits (4336), Expect = 0.0e+00 Identity = 831/844 (98.46%), Postives = 841/844 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXY7 (elongation factor 2 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448808 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1674.8 bits (4336), Expect = 0.0e+00 Identity = 831/844 (98.46%), Postives = 841/844 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1J9I4 (elongation factor 2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483814 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1674.1 bits (4334), Expect = 0.0e+00 Identity = 831/842 (98.69%), Postives = 839/842 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FWI7 (elongation factor 2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448808 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1674.1 bits (4334), Expect = 0.0e+00 Identity = 831/842 (98.69%), Postives = 839/842 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7ULS6 (Elongation factor 2-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold519G00140 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1672.1 bits (4329), Expect = 0.0e+00 Identity = 829/842 (98.46%), Postives = 839/842 (99.64%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. TAIR 10
Match: AT1G56070.1 (Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein ) HSP 1 Score: 1604.0 bits (4152), Expect = 0.0e+00 Identity = 789/842 (93.71%), Postives = 818/842 (97.15%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. TAIR 10
Match: AT3G12915.1 (Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein ) HSP 1 Score: 1514.2 bits (3919), Expect = 0.0e+00 Identity = 745/822 (90.63%), Postives = 786/822 (95.62%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. TAIR 10
Match: AT3G12915.2 (Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein ) HSP 1 Score: 1374.4 bits (3556), Expect = 0.0e+00 Identity = 693/822 (84.31%), Postives = 731/822 (88.93%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. TAIR 10
Match: AT3G58760.1 (Integrin-linked protein kinase family ) HSP 1 Score: 610.9 bits (1574), Expect = 2.3e-174 Identity = 305/432 (70.60%), Postives = 352/432 (81.48%), Query Frame = 0
BLAST of HG10001667 vs. TAIR 10
Match: AT1G06220.2 (Ribosomal protein S5/Elongation factor G/III/V family protein ) HSP 1 Score: 594.7 bits (1532), Expect = 1.7e-169 Identity = 334/931 (35.88%), Postives = 536/931 (57.57%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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