HG10001348 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10001348
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr09: 16279370 .. 16285657 (+)
RNA-Seq ExpressionHG10001348
SyntenyHG10001348
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGGATTGGAAAGCAGCGTTGAAGTGGGCATCTCACATGTACGGACATGGACCCGGCGGTTCGGGTGGAGAGTCTTGGTGGATAGGAATCTGTCAGTCTCACACTTTGCTTCTATTTTTTCCAACTTTTTTTTTTTTTTAAATCCTATATTTTAAATATATTATAATATTAATCTATATATATTTATACGTGTATTTATTTATTTTTTTAATTTTAAAGCTGTCCGCCGGTCCCACCTCACACACACGCATTAACTGATTTAACTATCTCAATATTGTAATTTTTTTAAAAAAAAATATATATCAATTTATGCTTCCAAATTTTAGATTTATATCAATTTAAATTATGAATTTTTCTAAGTGTATTAATTTACCCTCTTTATTACGTCCGTTTGAAAAACTTCGAGTAAAATTATAATTATATCAATTAAACTCTTAAATTTTTATAAGTTAATCAAGTTAGATATTTTATTACTATTACTTATGAAAATATCAATGCATTAATGCTCATCATGTGTAAACTTCTTCAAATGTCAGTTTTACAAAATGGACATTTAGAATAAATTAGTGCATAGATTTTCAAAGGAAATTTTGATTAAAAATTTAGGTACAGATTTATATTTGCCCTCTTTTCATTCAACAAAAATAATAAAGATACAAAATAAACCATGTCATAAAACGACAAGGTAATTATGGTAATGTTAATCCAAAATTTGGGCGACATGGTGATGGAGTGGAGCACGAGATGTTTGTTACACGATTATCAACGTCTAACCTTTCACTCTCAATTATCTCTTTAATTTTTTTTTTCAAATTTCGATTATAATTTTTTTTGGGAGAAAATTTTGCTTATAATTTAAGTTCCTGGACTAAAAGGTGATTTAATGTCATATTCTTTTTTTTTATTATTAATTTTTATTGGTTAGATTTTTTACTGTAAAATATTGTTTTAATTAAATTTATCGTAATTCATCCATCATCTTTCGATTATTTTTTAAGACTGTTTTCATATATAGTAAAATAAGTCAATTTATTTATAAATATGATAAAATGGCAAAGAATAGTCTATCACTTCTCTGGGCGATAGACACTAATAGACAGTAATAGATGATAGCTATCAGTTTGACATTTTTTTTACTCTATTTAAAAATATTTCTAGCAATTTTACTATTTAAAATAATTATCCTGTTTTTATTTTATTTTATGTAACATGATTATTCTCTACTAATTTCTAAAATATTAATGTCAACTATTAATTTGTTGTGAACCATAGGGAAGGATAACAATAATTAGACAAGTATTAGAAGGATGTTTTCACCAACTAAAAAAAAAAAAAAACTTTTCATGTATATTATATATGTGTAAATTTCAAATACTTTATTTTATTTTTTTAGTACAACAATTTTGGGATGGGAGATCGAACCTTCGACCTTAAGGGAGGAAGATCATATCAATTACCGTTACTTTTGGCAACATCAAATAGTACTTTATTCAAAACTACTAAATACTAAACTAAATGTAAGTTCATGGAATGCAACACGTTCAACTTTTTTATTCAGCACTTAAATTTACTTAAAGTTAAAACGCATATATATAATTCTTTATAATTTGACCTTGTATGATTTTGAATATTTCATGTGTGAAGGTAGAGATATGAACTTTATACTAATTTTGAATAATTTTATTTATTCTATATTCAAAAGATAGCTACCTTATTTAGATTTCTTTTAAAGAATATTACATGTGTAAATGTAGAGATCTGAACTTATATAGCGTTTGTGTTATAGAAAGGAAGATGCCATAATTAAACTATTAAATTATGCTTAGGTTAACTACCTTATTTGAATTCTATATTTGAATATCCCTCATCTCCCTTGAATTTGTAAATACGTGGAAAAATATCAATATTTCATTAATTATATACACATTATTGGCTAGCTTTACATTTAAAGTATATTTATTAGCTTATTTATGAATAGGCAAAAAGGTTGTACACAAATTCTTGTTCACATTAAAAGAAGTAGTTTAATATTGTTGAAAATTTACTCATTCAAAATTTCCTTTTTCTGTAAGAGATTCATAAATTTGCATACACATAATATAAGAATTATTAAAAGTTTCACATGCGTCTGTATCCTAAATGGTAATATGACAAAATTGAAACAATATTATAGTATATATACTAATTTCTTCTTTATCTTTATTAAATAGTAATGATTAGGTGTAGTCTAAGTTATACACCTAACTCTAATACGTCTCTTTTCTTTATACATAAAAGAAATATTTGTCCTATGACAATTTTTTATTGAACAACTGCTTAGTGTAGACTAAACAGTACTCAAAATTTTCTCTTTATTAAATCAAGCGACCCCTCCTCACATATTGTCAAAAAAGAAAGAAAAAAACTCATTATCATACTCGAACTTCTCAAGATTCATTATAGATGTACCTTCTAAATTTCAAAGTTGAAAACAAAAAAAAAAAATGAAAATACATAACATTAATCATATTTATTTATAATAACGAGTAAAAATATGATTGTCAACATAGGTGTGTGTGTATATATATAATTTATCTGCTCTTAATAAAAAAAGTTTAAGGTTCAAACCATCACTTCTACCTTTATATATGTGTATCAAATAAGTAACATTATAGGGTGTTTGGCTCACCAACATGAGTTGGATTGAATTGGTAAAAATTACAAACTCAATGTTTGGTCCATCCCAAGCCCAACACACATACAATAATTACACTATAAACACAGACTTTTTCAACCAACTCAACTCAACCCAAACACAAATAATTATTACTAACTCAACTAAACTTACCTTTGTGGGCCAAATGCACCCTAAAAGACAACCAAAGAGATTATTTTGGAATCAAATGAAGAGGCAAAACATTCTGAATCTCTAGAAACAAATAATCAAAAGTTAAGACATCGTTTAGTAACCATTTTATTTTTTATTTTTAAAAGTCTATAACCATCACTTTCATATATTGATGTTTTTGTTTAAAAGTTTATTTTTAAAAGTTTTTAAAATCCAAGCTAAATTTTAAAACATGCAAAAAAAAATAATAATAATAATAATAACTTGTTTTTGTTTTAGAATTTGGCTAAGAATTCATATGAACTCCGTGATCAAGAAATTGTGTGACACAAGCATAATTTTTAAAAACCAAAAACCAACAAGCAAAACCACACATTTGGTAACCATTTGGTCTTGGGTTTTTAGTTTATGAAAATTAAGCTTATAAACACTCATTTTACCTCTAAATTTCTTATTTTATTATGTATTTTTACCAATGTTTTAAAAAACAAACAAACCAAGTTTTGAAAACAAAAAACAAAAAACAAGTAGTTTTTAATTTTTAATTTTATTTAATTTAATTTTTTACTCGAGAAATATGCAAACAATCATAAGAAATTGATAGGTAATAGACTTAATTTTCAAAAACCAAAAACGAAAAATCAAATGGCTGCCATACGGAGCCCAAATGATTACTAAACGAGGCTTAAGGTCCTTTTTGGTAATTATTCGGTTTTGAAAATTAAACTTATAAAAATATTACTTCTATTGATAAACTTATTTGTTGTTATCTACTTTCTACCAATGTTATCAAAACCAAACCAAAATTTGAAAATCGAAAAAAATAGTTTTCAAGAAGTAATTTTTGTTTATAGAATTTGATTAAGGAAATGTGACAATAAAAAAAATTAAAAAAAATGAGGAGAAAGCAAACAAAAACTTTAAAAATAAAGGACTAGAAACAACTTCGTTGCCATTAAAGACAATCGAATATATTCAAATATAATCCAAATTAAACATCTTCACATGCTTACCATGTGGCTTAGTTTTTGTTAACTAATGTGGTTAATTTAAAGTTAATCAGTACAGCTTAAACCATTTCACACGTGCATCTTTTCATTTGATCTGGAAAGTTTTGCAAAGCATAATGCAATGCATAATTTGACATTTCTCCCTTCAACTATTGATTAGTTGAATTAACTACTGACCCTTTTCATTGATATCTGTGTTTTTACTTTAAAATCAAATAAAATGTATAATAATATTGTGGTTAAATAATATATAACTAATTAAGTCATGATTTTTTTTAGCTGATTTGAATTTTTTCAAAGTATATGTCTAAACTATTTAAAATTACGTTTAGTTTAGCTATTAGTTCATAGGGTTTTGTTTTTTTTTTTTAAATGTAACAATTTGAGAGTGAAAATTTAAACCTATAATCTTTTAATTAATCTGTGCTTTTTAATCAAATTCGTACTCAAATATATTGAGGATGTGACATTTAAAAAATAGTTATAATACATCTGCTAATATTGTTATTTAATGTTAAATATTTGCCTAATCTTTTTTTATTAAGATAAAACCAGCTAGCTCCACAGCCAAATTAAAAACTCACCTCGAAAATTCACATATCACCCGGCCAGTTACACCAAAAAAAACAACTCATTATTATCTCTGGATTTCAAATTGCATGTCATCATTTATGACAAGAGAGAGAAAATAGAGAGGAAAAAAAAAAGAGAAAAGGAAAAAGAAAATTTGCAAATCACTTATTTTTTTTTCCCTTTTCTTTTGGGAGGTTATTGGTTCAATTTAAGCAACATTATTGAATATAGATTAGATCTAATGATTTTTTTTTTTTAAACATTTTGGTCAAAGTTTATTTATTTATTTATTTATTTTCTTATTTATTGAGAAACATTTGAAGAATTTAAGTTTAAATCTCTATTTTTTTTCAGTTGGATTGGAGGAAAAGGATATTCAATTTGTTGGGTTATAGTTTCAATTAAATAGAATCTTTCTAATGTTGTTTTATATGGGAAACTTTGATTCATCCCCTTTTGAAGTTGATTTAACCTTAGGATTTTGGTGTTACAATGCATGAGTTCTCTTAAGATAACTATTATGGGTTGGCTAGTAGTAAATAGGGGCATAACTTTGATAAAAGGTTAAGAGGTCGTCATTGGTTCAATCT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mRNA sequence

ATGGATTGGAAAGCAGCGTTGAAGTGGGCATCTCACATGTACGGACATGGACCCGGCGGTTCGGGTGGAGAGTCTTGGTGGATAGGAATCTATCAAATCTTTAGGATCGATTATGAGGTTATGGATTGGATTGTGAACATGGGTTTTAAAAAAGATTCCAACTTTCTACTTTTATTCCCTTTCTTGAATTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGATTGGAAAGCAGCGTTGAAGTGGGCATCTCACATGTACGGACATGGACCCGGCGGTTCGGGTGGAGAGTCTTGGTGGATAGGAATCTATCAAATCTTTAGGATCGATTATGAGGTTATGGATTGGATTGTGAACATGGGTTTTAAAAAAGATTCCAACTTTCTACTTTTATTCCCTTTCTTGAATTAA

Protein sequence

MDWKAALKWASHMYGHGPGGSGGESWWIGIYQIFRIDYEVMDWIVNMGFKKDSNFLLLFPFLN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10001348.1HG10001348.1mRNA