HG10001001 (gene) Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1

Overview
NameHG10001001
Typegene
OrganismLagenaria siceraria cv. Hangzhou Gourd (Bottle gourd (Hangzhou Gourd) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationChr09: 12968050 .. 12973614 (-)
RNA-Seq ExpressionHG10001001
SyntenyHG10001001
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGAATGTAACGCATGAAGAAGGGGTTGAACGGTGGCTACTGATTTTGAGGCAATGGAAGACAAAGGGGAATAGTACAACCCGTTGGTGCCTCCACCACACCGGAAGCCATGGAATCAGCGGTTGGAGAATGAAGGAAGGGAAGAAGATGAGGTCAGTTCTATTATGGGCAATTTTGGAATAATAAACTTTTAATCACGAGGGGAGAATTTTTAACTTTTTTTTCTTTGCCCTTAAATTTTTCAATAATAATAACTCTGCTCTCGCTCTCGCTCTCGCACTCGCACTCACACTCACACTCCTCCATGGTCTTTTACTTATCTAACTTTTTTTCATTTAATTTTACATTCCTTTTTTGTCATTATATCTTTCAACAATTCATATTTTGTCCTCACATCATTTCCTACTTTTTGTACCAAATACTTTTTTTTTTACCTTTTGTTGGCACTCAGATCTCATCTGCGTTGAGCCTTGTTGCGCCCCTTTAGTGGGCTTGACCTCCAACTCGCTTCTCCTTGGTCTGGTCTCAAAATGTTTCGAACTTACCAGCATAAGAGATTTTTGCACCATTGTGATGTAGAGCTTACTGCTTGATGTTTAAGTTAGTACAATGAGTGACTAATTCAGCTAAGCACAAAGGAAGTAAGGTCGAGCCTCTCATTTGGCGATTACTTACTATCCCCTTTAGGGTGGTTAAATTGGCCTATTTGTAAGTCTGTACTGCATATAACACATGCCTCTAGTTATATATAACGATGGTGGGGTCAGGGACGTTTCTGGCGCTTGAGGTTAAAGGGTACCAATCAGGATCTGACTCGGTTATTTCTCGATTAGTATATATTCATTGGCTCAACTGGTCGGCCCAAACCCCGATGAGTTAATATTTCTCTTTTGGGACACATACTTCCCTATGCTTCCTCCCTCTATGATCTTGGGCCCGCCCATAGGTTTTGGTCTTTGCCTTGGACAACCCTAACACCTTTCATTGCCTTTTCTTTTCTTTTAAATTTGCATTCCCTTTTTATCAATAAATATTTCAACAATTTTTATTTTATACTCACATCATTTGTTTTTTTTTTCACTTTTCTGTAAATTTTATTAATAAAGAATTAATAAATTGAAATTTAAAACCATTTATACACATCTTCTAACAAATACATATTTTATACTACAATAACTACACACTTCTCTTTCTTATAACTTTTCACATAATAAATACATATATTTCGTTTTTCTTTCCCCCAAACTTTATTTTATTTAGAGAGCACAAAGTCTTCTAAATGAAAATTAAAAGTCTTTGTTCTCTGTAAGTGACACATTTAAATATGATCCAAGGAAGAGAATTTAGAAATTCATTTTGCTAGATGAAGAGATATGGTTAGATTTTACGAACGTACAATTTTTTCCAACAACAACAAGATTATACATATAAATATAGAAAAATGAGCCAAAATATTTACAAGTATAGAAAAATTTCACTGTTTATCAGTGATAGACTTCTATTACTGGATGATAAAAGTCTTTTATTTCAGTGATAAAAGTCTATCGCGGTCTATAGTTGATAGACAGTAAAAATTTTCTATATTTATAAATAGTTTGATATTTTTTTCATTTATAATAATTTTCTTATAATTCGATTTTTTTTATTTTTTATTTTAAAAAGAATTAATTGTTACTGATAATTTGTCTATATACTATATTAAAAGAGATTAAGAGAAGAGAATTTTAACTTCTCTCTTTGCCCTTAATATTTTTCTTTTGGAGTTATATCTTTCAACATTTCTTACTTTGTCTTCACATCGTTTTCTACTTTTTTGTACCTCTATTTTTTTTATACCTTTCATGCCTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTCATTTAATTTTACCTTCCTCTTTTTTCATTAGATTTTTTTTAATATTCTTTATTTGTTTTAATTTTTGTTAATAAAAAATTAATAAATCAAACTTTAAAATTATTTATACAAATCCTTTTAACAAACACAAATTTCTTTGCACAATAACTACACACTTCTCTTTCTTGCACCTTTTTCATTTGTTTTTCTTTTCTTCAAACTTCATTTTATTAAAAAGCTCAAAGTCTTCTAAATGAAAATTAAAAGTCTTTATTTTTCACAAGAGAAACAATGAAATGTAATTGAAGGAATAGAATTTAAAATTTTATTTTGTTGGATGAAGAGATAAGGTTAGATATTTATGAACGTGGAAATTTATTAGAAGAAACAAAATTTAACTATTAACTTGGGACTTATTCGAAGAAGCATGTAAATATAACTAAAAAAACTATTTAAAGTCCTAAAAAAAAGATAGAGGTTTGTATAAAGTTTATTATTAATTTGTTTTCTCATATAACAATAACAACTTCAATTATGCAAAATGTTAGATTTTATAGATGTTAATTTCTTTTTCATTCCGAATTAAAATTTTGTATTTTATGATTAATATTTTGATAAAGTAAATAATTGAATATTAGTACCTTTGTTTTGAATTGTTAATTTTTTATTGAAAAAATCAAAACAAACAAATAGTAGGTGTCCGATTTATTAAGTTCCACAATGTTCCAAAAGATACAATATTGATTTCAAACTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAGATCTTAAGTGTATTGGTTAATATTTTGATAAAGTAAAAAATTTAATTATAGTAAAATTTAAAAGAATTAAATATTAGTCTTTTGTTAAATTTTTTAATGAAAGAAATCAAACAAAAAAATAATAGTTGTTCAATCTAAAAATTCCACAATATTTTAGAAGAAACAACATGATTTCAAATTTTAGAAAATATATATATTTCAAGTTTATATCGTTATTTAAGTTATTTATAGTTTATTTTTACTCAAGACCATCTAAAATTATGAACGAAAATATGTTACTCTATTTTATCTCTTTAAATATTTTTAAACATCATATTTAATATTTACAAATTTATATTTGTTCAACTATTTATATTTTACTTTATGAAATTATGGTTCAAACTTTTTCAACTGCATCCAATACATTTCGTATTCATTATAAATTAACTAATTAAAACATACATATAGTTTTAGTCATCATCTCTTTCATTATTTTTAAATTTTACGTTAGATATTTACTATTTAAATTTAACTAAAAGTATATTTGTTTAAAATTTTTAAACCCAAGTTCTTTAACTAATCAAAATAAGTATTGTAATGTTTAAAGTTAAACTCAGTTGATAAGACGAGATATGTTAGAGAAATAAAAATAAATGAGAAAAAAGATTGTGGTAAGAGAAAATTCAAAGAAAATGCTTTTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAAAGTTAGAGATATATTTATTAGAGAGAAAAATTACATAGACATAACAATTTTAAAGAGAGAAAGTGAAATTTTGTAAAGGTAGAAAAATCAAAGAGATGACTCAGGACTCCGGAGTACTCTTTTTTTTTCTTCTCTTATCTCTAAAATAGAAGTTTATGTCAATTATCGTTACTAATCTGTTTTAAAAATTAAAAAAATTATTTCTTTTTAGAAAAACAATTGTTTTTAAGATTTCTTCTTATTAAGGTTTAAAAACGTCTTATCAATTTTAAAAACAAAAATAAAAGAATTATCAAACATACCTATTTTATAAAATTAAAAAAAAAAAACTTGTAAAACTATTCGATTACCAGACAACCCTTAAATTATTATCTCTACCTATTGTTCAACTTAAAAAATAAATCCACTTCTCTAAATTCTTACTTAAATTATATTAGTTTATTGTATATTTATATTCTATTTAGTGCTATCAATATATACAATAATAAAATTCTAAAAATATTAAAAGTTTTTATACTCTGAATAAAATTTGGGTTTTTAATTGTTATACTAATGTCTAGATTAAACCACATAAAATTTTAGATTATAGAAGGTCTATCAAATTTATTTATTTATCCTTGTCTCAAAAAAAATTATTCATTTATACACATTTATAATAGATAACTAACTCCAATGATTTTTTTTATTTATTTTTTATTTAGTGAAAAGTTCACTTAACCACTCCACAGTTATATGTTTAAAAGTAAAAAGATTAAAATGTCACAAATAAAAATAAAAATTCTACAGCTTAAATTTATAGATTTAAAAAGAAATATCATATTTTAACTAACATCATATTTTTTCCCCCCTTAATTATAGAAAAATTATTTAGTTATCATTTTATCTTTATCTTTTATCTTTATCTCACTGTATTACAATTGGGATTCTCAGGAATCATTTATGTTCATTTGCCTTTTTAGATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGAGCCTTTTTAGATAATTTTAAATTTTAAATTATATCCCTAATGACCACATCATTTATTCTATTAAAGTAATATACATCCCCATAATTCTTTTATTGGAAAAAAGTTTAAATCTATCTAAAAAAATCCCATGCATTAACTTTTTTTTTAAAAAAAATCTTAATCAATTTCCCAAATAATACCCATTAGGAAATAGATATATCTTAACAATTAAGTTTGTACATCCAAATCATCTAAATTTTGAAAAACAACTTATAAATTTCATCTTTTGGCATCAAACTCTATATTTACATAAGTGTTTATAATTATACCTTTTCTTTTATTTGCTCATTAATATTAACAAAAACAAGATAAAAAAACTCAATTCCAATACTTTTTCTATTCCTAAAAGAAAAATAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATAATTGGAAGAGGAAAGTTGATTGAAGAGAAAGCAGAGCTTGAAAAGAGAGCAATGTTTTTGTCCTTTACTTATTTGCTTTAAGCTGAGACGCCGAATCGTCATCGTCCCATCATCTTCTATTTCCATTCATTTTTTCTATTTCAATAGAAATTTACAGATACCTTCGCTCTGCCCTTTCTACGGCTCTTTATATAAACACCCTTTCAAGCTTCAACATCGCCCTATTTCAAATCCACATCCATTCTTCTTCCTCATCTCTGAACTAAACCTTCTTACTCACACGCAGATACTAATCCGCCCATTAAGTTTCGGTATGTTTCTGTTCCGCCCCACTTTTTTGTGTTTCTCGTAGATGGGTATGTGTTTCTCAGTGGATTAAGATTTTTGGATCTGTTTGTCAATGGAGATGGGGTTTTCTCAGTTATTTGGTTTAGGTTTCTTCCTCTTACCACACCTCTAATCGAGATGGGGTTCTTTGTTTTTGGGTTTTTTTTGTTTTTTTTCATCGCTTCGAACTCCATCCCCTTTTCTTGTGGATGAATTTTATTGGGTTTTCTTTGTTTTCTGGAAACGGCTATGTTTTCTGTGCAGAAGGAAAATTTTCATGCTCTGTTTTTGCTCTGTTTTTTAGAGATGTTTTGTGTAGTGGAGTGTGGGGATGGCTTCATTCCATTGTTTTATTTCGTGCCAAAGATAAATATGCCAATAGAACTTTACTCAAGTGATGAATTACGAAAATCTTGTTTTCTAGGTGTTCTTATTCGTTCTCTTGAATCAAAAGTTCACTATGATTTTCCACCTTTCTGGAAAATTGAAGAGTAG

mRNA sequence

ATGAATGTAACGCATGAAGAAGGGGTTGAACGGTGGCTACTGATTTTGAGGCAATGGAAGACAAAGGGGAATAGTACAACCCGTTGGTGCCTCCACCACACCGGAAGCCATGGAATCAGCGGTTGGAGAATGAAGGAAGGGAAGAAGATGAGAAATTTACAGATACCTTCGCTCTGCCCTTTCTACGGCTCTTTATATAAACACCCTTTCAAGCTTCAACATCGCCCTATTTCAAATCCACATCCATTCTTCTTCCTCATCTCTGAACTAAACCTTCTTACTCACACGCAGATACTAATCCGCCCATTAAGTTTCGAGATGTTTTGTGTAGTGGAGTGTGGGGATGGCTTCATTCCATTGTTTTATTTCGTGCCAAAGATAAATATGCCAATAGAACTTTACTCAAGTGATGAATTACGAAAATCTTGTTTTCTAGGTGTTCTTATTCGTTCTCTTGAATCAAAAGTTCACTATGATTTTCCACCTTTCTGGAAAATTGAAGAGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGAATGTAACGCATGAAGAAGGGGTTGAACGGTGGCTACTGATTTTGAGGCAATGGAAGACAAAGGGGAATAGTACAACCCGTTGGTGCCTCCACCACACCGGAAGCCATGGAATCAGCGGTTGGAGAATGAAGGAAGGGAAGAAGATGAGAAATTTACAGATACCTTCGCTCTGCCCTTTCTACGGCTCTTTATATAAACACCCTTTCAAGCTTCAACATCGCCCTATTTCAAATCCACATCCATTCTTCTTCCTCATCTCTGAACTAAACCTTCTTACTCACACGCAGATACTAATCCGCCCATTAAGTTTCGAGATGTTTTGTGTAGTGGAGTGTGGGGATGGCTTCATTCCATTGTTTTATTTCGTGCCAAAGATAAATATGCCAATAGAACTTTACTCAAGTGATGAATTACGAAAATCTTGTTTTCTAGGTGTTCTTATTCGTTCTCTTGAATCAAAAGTTCACTATGATTTTCCACCTTTCTGGAAAATTGAAGAGTAG

Protein sequence

MNVTHEEGVERWLLILRQWKTKGNSTTRWCLHHTGSHGISGWRMKEGKKMRNLQIPSLCPFYGSLYKHPFKLQHRPISNPHPFFFLISELNLLTHTQILIRPLSFEMFCVVECGDGFIPLFYFVPKINMPIELYSSDELRKSCFLGVLIRSLESKVHYDFPPFWKIEE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of HG10001001 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10001001 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10001001 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of HG10001001 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
HG10001001.1HG10001001.1mRNA